Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2011 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2011
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156354 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Chellapandi, P. 2019-06-18T11:55:52Z 2019-06-18T11:55:52Z 2011 Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000113 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354 577.325 The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability. The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant interest in synthetic enzyme biotechnology. Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти. Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед яких основну зацікавленість представляють металоферменти через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації, однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів. Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. The author is thankful to the University Grants Commission, New Delhi, India, for financial assistance (32-559/2006) to carry out the work. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Reviews Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing Сучасний сценарій комп’ютерного конструювання металоферментів Современный сценарий компьютерного конструирования металлоферментов Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| spellingShingle |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing Chellapandi, P. Reviews |
| title_short |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| title_full |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| title_fullStr |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| title_full_unstemmed |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| title_sort |
current scenario on computer-aided metalloenzymes designing |
| author |
Chellapandi, P. |
| author_facet |
Chellapandi, P. |
| topic |
Reviews |
| topic_facet |
Reviews |
| publishDate |
2011 |
| language |
English |
| container_title |
Вiopolymers and Cell |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Сучасний сценарій комп’ютерного конструювання металоферментів Современный сценарий компьютерного конструирования металлоферментов |
| description |
The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites
to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational
methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or
peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the
field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability.
The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the
evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant
interest in synthetic enzyme biotechnology.
Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation.
Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
яких основну зацікавленість представляють металоферменти
через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність.
Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
яких основну зацікавленість представляють металоферменти
через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність.
|
| issn |
0233-7657 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354 |
| citation_txt |
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ. |
| work_keys_str_mv |
AT chellapandip currentscenariooncomputeraidedmetalloenzymesdesigning AT chellapandip sučasniiscenaríikompûternogokonstruûvannâmetalofermentív AT chellapandip sovremennyiscenariikompʹûternogokonstruirovaniâmetallofermentov |
| first_indexed |
2025-12-01T00:31:14Z |
| last_indexed |
2025-12-01T00:31:14Z |
| _version_ |
1850858847424479232 |