Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing

The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites
 to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational
 methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Вiopolymers and Cell
Datum:2011
1. Verfasser: Chellapandi, P.
Format: Artikel
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2011
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862638705299161088
author Chellapandi, P.
author_facet Chellapandi, P.
citation_txt Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Вiopolymers and Cell
description The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites
 to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational
 methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or
 peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the
 field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability.
 The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the
 evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant
 interest in synthetic enzyme biotechnology.
 Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
 Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
 забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
 описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
 консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
 яких основну зацікавленість представляють металоферменти
 через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
 однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
 це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
 Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність. Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
 Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
 забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
 описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
 консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
 яких основну зацікавленість представляють металоферменти
 через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
 однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
 це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
 Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність.
first_indexed 2025-12-01T00:31:14Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156354
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language English
last_indexed 2025-12-01T00:31:14Z
publishDate 2011
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Chellapandi, P.
2019-06-18T11:55:52Z
2019-06-18T11:55:52Z
2011
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing / P. Chellapandi // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 6. — С. 432-435. — Бібліогр.: 36 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000113
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354
577.325
The metalloenzymes are proteins with enzymatic activity which contain metals tightly bound in their active sites
 to display a chemical action. This review describes the recent developments and success of using computational
 methods and algorithmsfor designing industrial enzymes. A recent approach based on functional amino acids or
 peptides as characteristic molecular moieties and their conservations, has led to a significant expansion of the
 field of enzyme designing or enzyme mimics. Evolutionary conservation is accounted to consider designing enzymes while the metalloenzymes are a major concern due to their extensive role in catalytic activity and stability.
 The enzymes from methanogens may provide useful biocatalysts and may be even more valuable for biotransformation reactions, but their biotechnological applications are restricted. Therefore, a method based on the
 evolutionary hypothesis of conserved domain ofsequences obtained from methanogens would make a significant
 interest in synthetic enzyme biotechnology.
 Keywords: metalloenzymes designing, methanogens, evolutionary conservation.
Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
 Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
 забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
 описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
 консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
 яких основну зацікавленість представляють металоферменти
 через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
 однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
 це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
 Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність.
Металоферменти – це білки, що функціонують як ферменти.
 Вони містять метали, які взаємодіють в активних сайтах, що
 забезпечує їхню хімічну активність. У представленому огляді
 описано останні розробки та успішне застосування комп’ютерних методів і алгоритмів для конструювання промислових ферментів. Використання сучасного підходу на основі функціональних амінокислот або пептидів як характерних молекулярних компонентів та їхньої консервативності дозволило значно розширити сферу конструювання або імітування ферментів. Еволюційна
 консервативність важлива при конструюванні ферментів, серед
 яких основну зацікавленість представляють металоферменти
 через їхню суттєву роль у каталітичній активності та стабільності. Ферменти метаногенів можуть слугувати біокаталізаторами і навіть бути ціннішими для реакцій біотрансформації,
 однак їхнє застосування у біотехнології обмежене. Зважаючи на
 це, метод, оснований на еволюційній гіпотезі про консервативний домен послідовностей, отриманих із метаногенів, може стати корисним у сфері біотехнології синтетичних ферментів.
 Ключові слова: комп’ютерне конструювання металоферменти, метаногени, еволюційна консервативність.
The author is thankful to the
 University Grants Commission, New Delhi, India, for financial assistance (32-559/2006) to carry out the work.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Reviews
Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
Сучасний сценарій комп’ютерного конструювання металоферментів
Современный сценарий компьютерного конструирования металлоферментов
Article
published earlier
spellingShingle Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
Chellapandi, P.
Reviews
title Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_alt Сучасний сценарій комп’ютерного конструювання металоферментів
Современный сценарий компьютерного конструирования металлоферментов
title_full Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_fullStr Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_full_unstemmed Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_short Current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
title_sort current scenario on computer-aided metalloenzymes designing
topic Reviews
topic_facet Reviews
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156354
work_keys_str_mv AT chellapandip currentscenariooncomputeraidedmetalloenzymesdesigning
AT chellapandip sučasniiscenaríikompûternogokonstruûvannâmetalofermentív
AT chellapandip sovremennyiscenariikompʹûternogokonstruirovaniâmetallofermentov