Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной
 ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование
 (м...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2011 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2011
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156376 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Энергия интеркаляции ароматических
 гетероциклических лигандов в ДНК
 и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862702698111959040 |
|---|---|
| author | Костюков, В.В. |
| author_facet | Костюков, В.В. |
| citation_txt | Энергия интеркаляции ароматических
 гетероциклических лигандов в ДНК
 и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной
ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование
(молекулярная динамика, квантово-механические расчеты). Результаты. Вычислены энергетические
вклады различных физических факторов, выполнен их сравнительный анализ. Выводы. Показано, что
основными факторами, стабилизирующими интеркаляционные комплексы ароматических соединений
при связывании с ДНК, являются гидрофобные и ван-дер-ваальсовы взаимодействия. Вклады электростатических взаимодействий, водородных связей в целом и энтропийных факторов являются энергетически невыгодными. Перенос электрона от ДНК к лиганду представляется маловероятным.
Ключевые слова: двуспиральная ДНК, интеркаляция, ароматический лиганд, энергетические вклады.
Aim. Partition of experimental Gibbs energy of complexation with
double-stranded DNA into separate energy components for heterocyclic compounds: fascaplysin, ellipticine, trioxatriangulenum (TOTA),
thionine (TH), and phenosafranine (PS). Methods. Molecular modeling (molecular dynamics simulation, quantum-mechanical calculations). Results. The energy contributions from different physical factors
were calculated, a comparative analysis was performed. Conclusions.
It was shown that the major factors stabilizing the intercalation complexes of aromatic compounds with DNA are hydrophobic and van der
Waals interactions. The contributions from electrostatic interactions
and hydrogen bonds in total and the entropic factors are energetically
unfavorable. Electron transfer from DNA to ligand appears to be unlikely.
Keywords: double-stranded DNA, intercalation, aromatic ligand,
energy contribution.
Мета. Розділення експериментальної енергії Гіббса реакції комплексоутворення з двоспіральною ДНК на окремі енергетичні
складові для гетероциклічних сполук фаскаплізину, еліптицину,
триоксатриангулену, тіоніну і феносафраніну. Методи. Молекулярне моделювання (молекулярна динаміка, квантово-механічні
розрахунки). Результати. Обчислено енергетичні внески від різних фізичних чинників, зроблено їхній порівняльний аналіз. Висновки. Показано, що основними факторами, які стабілізують інтеркаляційні комплекси ароматичних сполук при зв’язуванні з
ДНК, є гідрофобні і ван-дер-ваальсові взаємодії. Внески електростатичних взаємодій, водневих зв’язків у цілому та ентропійних чинників є енергетично невигідними. Перенесення електрона від ДНК до ліганда видається малоймовірним.
Ключові слова: двоспіральна ДНК, інтеркаляція, ароматичний ліганд, енергетичні внески.
|
| first_indexed | 2025-12-07T16:45:55Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156376 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T16:45:55Z |
| publishDate | 2011 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Костюков, В.В. 2019-06-18T12:19:55Z 2019-06-18T12:19:55Z 2011 Энергия интеркаляции ароматических
 гетероциклических лигандов в ДНК
 и ее разделение на аддитивные составляющие / В.В. Костюков // Вiopolymers and Cell. — 2011. — Т. 27, № 4. — С. 264-272. — Бібліогр.: 29 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000108 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156376 577.113:577.32 Цель. Разделение экспериментальной энергии Гиббса реакции комплексообразования с двуспиральной
 ДНК на отдельные энергетические составляющие для гетероциклических соединений фаскаплизина, эллиптицина, триоксатриангулена, тионина и феносафранина. Методы. Молекулярное моделирование
 (молекулярная динамика, квантово-механические расчеты). Результаты. Вычислены энергетические
 вклады различных физических факторов, выполнен их сравнительный анализ. Выводы. Показано, что
 основными факторами, стабилизирующими интеркаляционные комплексы ароматических соединений
 при связывании с ДНК, являются гидрофобные и ван-дер-ваальсовы взаимодействия. Вклады электростатических взаимодействий, водородных связей в целом и энтропийных факторов являются энергетически невыгодными. Перенос электрона от ДНК к лиганду представляется маловероятным.
 Ключевые слова: двуспиральная ДНК, интеркаляция, ароматический лиганд, энергетические вклады. Aim. Partition of experimental Gibbs energy of complexation with
 double-stranded DNA into separate energy components for heterocyclic compounds: fascaplysin, ellipticine, trioxatriangulenum (TOTA),
 thionine (TH), and phenosafranine (PS). Methods. Molecular modeling (molecular dynamics simulation, quantum-mechanical calculations). Results. The energy contributions from different physical factors
 were calculated, a comparative analysis was performed. Conclusions.
 It was shown that the major factors stabilizing the intercalation complexes of aromatic compounds with DNA are hydrophobic and van der
 Waals interactions. The contributions from electrostatic interactions
 and hydrogen bonds in total and the entropic factors are energetically
 unfavorable. Electron transfer from DNA to ligand appears to be unlikely.
 Keywords: double-stranded DNA, intercalation, aromatic ligand,
 energy contribution. Мета. Розділення експериментальної енергії Гіббса реакції комплексоутворення з двоспіральною ДНК на окремі енергетичні
 складові для гетероциклічних сполук фаскаплізину, еліптицину,
 триоксатриангулену, тіоніну і феносафраніну. Методи. Молекулярне моделювання (молекулярна динаміка, квантово-механічні
 розрахунки). Результати. Обчислено енергетичні внески від різних фізичних чинників, зроблено їхній порівняльний аналіз. Висновки. Показано, що основними факторами, які стабілізують інтеркаляційні комплекси ароматичних сполук при зв’язуванні з
 ДНК, є гідрофобні і ван-дер-ваальсові взаємодії. Внески електростатичних взаємодій, водневих зв’язків у цілому та ентропійних чинників є енергетично невигідними. Перенесення електрона від ДНК до ліганда видається малоймовірним.
 Ключові слова: двоспіральна ДНК, інтеркаляція, ароматичний ліганд, енергетичні внески. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Structure and Function of Biopolymers Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие Energy of intercalation of aromatic heterocyclic ligands into DNA and its partition into additive components Енергія інтеркаляції ароматичних гетероциклічних лігандів у ДНК та її розділення на адитивні складові Article published earlier |
| spellingShingle | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие Костюков, В.В. Structure and Function of Biopolymers |
| title | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие |
| title_alt | Energy of intercalation of aromatic heterocyclic ligands into DNA and its partition into additive components Енергія інтеркаляції ароматичних гетероциклічних лігандів у ДНК та її розділення на адитивні складові |
| title_full | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие |
| title_fullStr | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие |
| title_full_unstemmed | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие |
| title_short | Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие |
| title_sort | энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в днк и ее разделение на аддитивные составляющие |
| topic | Structure and Function of Biopolymers |
| topic_facet | Structure and Function of Biopolymers |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156376 |
| work_keys_str_mv | AT kostûkovvv énergiâinterkalâciiaromatičeskihgeterocikličeskihligandovvdnkieerazdelenienaadditivnyesostavlâûŝie AT kostûkovvv energyofintercalationofaromaticheterocyclicligandsintodnaanditspartitionintoadditivecomponents AT kostûkovvv energíâínterkalâcííaromatičnihgeterociklíčnihlígandívudnktaíírozdílennânaaditivnískladoví |