Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці

Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці

Проведено комп'ютерний аналіз розповсюдження мобільних генетичних елементів (МГЕ) в гені ТР53 людини та його 5'-фланкованій ділянці. Не виявлено суттєвої різниці для SINE- і LINE-елементів, однак з'ясовано, що LINE J-елементи присутні винятково в межах гена, тоді як LINE2 — переважно...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2006
Hauptverfasser: Підпала, О.В., Яцишина, А.П., Лукаш, Л.Л.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2006
Schlagworte:
Біоінформатика
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156488
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці / О.В. Підпала, А.П. Яцишина, Л.Л. Лукаш // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 1. — С. 75-81. — Бібліогр.: 53 назв. — укр., англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156488
record_format dspace
spelling Підпала, О.В.
Яцишина, А.П.
Лукаш, Л.Л.
2019-06-18T14:42:02Z
2019-06-18T14:42:02Z
2006
Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці / О.В. Підпала, А.П. Яцишина, Л.Л. Лукаш // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 1. — С. 75-81. — Бібліогр.: 53 назв. — укр., англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00071E
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156488
575.113 + 577.2 + 599.89
Проведено комп'ютерний аналіз розповсюдження мобільних генетичних елементів (МГЕ) в гені ТР53 людини та його 5'-фланкованій ділянці. Не виявлено суттєвої різниці для SINE- і LINE-елементів, однак з'ясовано, що LINE J-елементи присутні винятково в межах гена, тоді як LINE2 — переважно у 5'-фланкованій ділянці. Серед МГЕ найчастіше зустрічаються Alu-повтори. Зовсім не знайдено LTR-елементів, а ДНК-транспозони у незначній кількості представлені лише в гені. Як у межах гена, так і його 5'-фланкованій ділянці МГЕ переважно формують кластерні мозаїчні структури, до складу яких входять елементи різних родин та підродин.
Computational analysis of distribution of mobile genetic elements within the human TP53 gene and its 5’-flanking region has been performed. There was no difference revealed for SINE and LINE repeats, but it has been shown that the LINE elements are preferentially present within the TP53 gene and the LINE2 elements are preferentially distributed within 5’-flanking region of the TP53 gene. Alu repeats have been found to be the most common repeats within the TP53 gene and its 5’-flanking region. LTR repeats have been absent at all and DNA transposons have been determined only within the TP53 gene. It has been revealed that mobile genetic elements within TP53 gene and its 5’-flanking region preferentially form clusters, which contain mobile genetic elements from different repeat families and subfamilies
Проведен компьютерный анализ распространения мобильных генетических элементов (МГЭ) в гене ТР53 человека и его 5'-фланкирующем участке. Не выявлено существенной разни­цы для SINE- и LINE-элементов, однако показано, что LINE1-элементы присутствуют исключительно в гене, тогда как LINE2 — преимущественно в 5'-фланкирующем участке. Среди МГЭ чаще всего встречаются Alu-повторы Совсем не обнаружено LTR-элементов, а ДНК-транспозоны в незначи­тельном количестве представлены лишь в гене. Как в гене, так и его 5' -фланкирующем участке МГЭ преимущественно формируют кластерные мозаичные структуры, в состав ко­торых входят элементы разных семейств и подсемейств.
Висловлюємо щиру подяку С. М. Кваші за методичну та консультативну допомогу.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Біоінформатика
Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
Анализ распределения мобильных генетических элементов в гене ТР53 человека и его 5'-фланкирующем участке
Analysis of distribution of mobile genetic elements within the human TP53 gene and its 5'-flanking region
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
spellingShingle Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
Підпала, О.В.
Яцишина, А.П.
Лукаш, Л.Л.
Біоінформатика
title_short Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
title_full Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
title_fullStr Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
title_full_unstemmed Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці
title_sort аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені тр53 людини та його 5-фланкованій ділянці
author Підпала, О.В.
Яцишина, А.П.
Лукаш, Л.Л.
author_facet Підпала, О.В.
Яцишина, А.П.
Лукаш, Л.Л.
topic Біоінформатика
topic_facet Біоінформатика
publishDate 2006
language Ukrainian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Анализ распределения мобильных генетических элементов в гене ТР53 человека и его 5'-фланкирующем участке
Analysis of distribution of mobile genetic elements within the human TP53 gene and its 5'-flanking region
description Проведено комп'ютерний аналіз розповсюдження мобільних генетичних елементів (МГЕ) в гені ТР53 людини та його 5'-фланкованій ділянці. Не виявлено суттєвої різниці для SINE- і LINE-елементів, однак з'ясовано, що LINE J-елементи присутні винятково в межах гена, тоді як LINE2 — переважно у 5'-фланкованій ділянці. Серед МГЕ найчастіше зустрічаються Alu-повтори. Зовсім не знайдено LTR-елементів, а ДНК-транспозони у незначній кількості представлені лише в гені. Як у межах гена, так і його 5'-фланкованій ділянці МГЕ переважно формують кластерні мозаїчні структури, до складу яких входять елементи різних родин та підродин. Computational analysis of distribution of mobile genetic elements within the human TP53 gene and its 5’-flanking region has been performed. There was no difference revealed for SINE and LINE repeats, but it has been shown that the LINE elements are preferentially present within the TP53 gene and the LINE2 elements are preferentially distributed within 5’-flanking region of the TP53 gene. Alu repeats have been found to be the most common repeats within the TP53 gene and its 5’-flanking region. LTR repeats have been absent at all and DNA transposons have been determined only within the TP53 gene. It has been revealed that mobile genetic elements within TP53 gene and its 5’-flanking region preferentially form clusters, which contain mobile genetic elements from different repeat families and subfamilies Проведен компьютерный анализ распространения мобильных генетических элементов (МГЭ) в гене ТР53 человека и его 5'-фланкирующем участке. Не выявлено существенной разни­цы для SINE- и LINE-элементов, однако показано, что LINE1-элементы присутствуют исключительно в гене, тогда как LINE2 — преимущественно в 5'-фланкирующем участке. Среди МГЭ чаще всего встречаются Alu-повторы Совсем не обнаружено LTR-элементов, а ДНК-транспозоны в незначи­тельном количестве представлены лишь в гене. Как в гене, так и его 5' -фланкирующем участке МГЭ преимущественно формируют кластерные мозаичные структуры, в состав ко­торых входят элементы разных семейств и подсемейств.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156488
citation_txt Аналіз розподілу мобільних генетичних елементів у гені ТР53 людини та його 5-фланкованій ділянці / О.В. Підпала, А.П. Яцишина, Л.Л. Лукаш // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 1. — С. 75-81. — Бібліогр.: 53 назв. — укр., англ.
work_keys_str_mv AT pídpalaov analízrozpodílumobílʹnihgenetičnihelementívugenítr53lûdinitaiogo5flankovaníidílâncí
AT âcišinaap analízrozpodílumobílʹnihgenetičnihelementívugenítr53lûdinitaiogo5flankovaníidílâncí
AT lukašll analízrozpodílumobílʹnihgenetičnihelementívugenítr53lûdinitaiogo5flankovaníidílâncí
AT pídpalaov analizraspredeleniâmobilʹnyhgenetičeskihélementovvgenetr53čelovekaiego5flankiruûŝemučastke
AT âcišinaap analizraspredeleniâmobilʹnyhgenetičeskihélementovvgenetr53čelovekaiego5flankiruûŝemučastke
AT lukašll analizraspredeleniâmobilʹnyhgenetičeskihélementovvgenetr53čelovekaiego5flankiruûŝemučastke
AT pídpalaov analysisofdistributionofmobilegeneticelementswithinthehumantp53geneandits5flankingregion
AT âcišinaap analysisofdistributionofmobilegeneticelementswithinthehumantp53geneandits5flankingregion
AT lukašll analysisofdistributionofmobilegeneticelementswithinthehumantp53geneandits5flankingregion
first_indexed 2025-12-01T15:28:39Z
last_indexed 2025-12-01T15:28:39Z
_version_ 1850860595788644352

Ähnliche Einträge