2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектроскопии (500 МГц). Двухмерные экспе...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Дата: | 2003 |
| Автори: | , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2003
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования 
 феноксазонового антибиотика 
 актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида 
 с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) 
 в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 
 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862735982486355968 |
|---|---|
| author | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Лантушенко, А.О. Рогова, О.В. Эрнандес, Сантьяго А. Дэвис, Д.Б. |
| author_facet | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Лантушенко, А.О. Рогова, О.В. Эрнандес, Сантьяго А. Дэвис, Д.Б. |
| citation_txt | 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования 
 феноксазонового антибиотика 
 актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида 
 с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) 
 в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 
 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектроскопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК.
Представлено результати дослідження комплексоутворення синтетичної феноксазонової сполуки актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил)аміду (ActII) з самокомплементарним дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині методом двовимірної 1Н ЯМР спектроскопії (500 МГц). Двовимірні екперименти 2M-TOCSY і 2M-NOESY використано для повного віднесення сигналів протонів феноксазонової сполуки і нуклеотидів у змішаному розчині та для визначення інтеркальованого комплексу ActII з дуплексом тетрамеру. На основі аналізу міжмолекулярних NOE-контактів зроблено висновок щодо переважної інтеркаляції ActII у термінальний d(TG)-сайт олігонуклеотиду та побудовано найвірогідніші просторові структури комплексів ActII з 5'-d(TpGpCpA). З аналізу випливає, що бічні аміноалкільні ланцюги феноксазонового ліганду розміщуються в малій борозенці дуплексу ДНК.
Complexation of a synthetic phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide (ActII) with self-complementary deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution has been studied by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy (500 MHz). Two-dimensional homonuclear correlation NMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) has been used for complete assignment of proton signals of phenoxazone compound and nucleotides in the mixed solution and for determining the structure of the intercalated complex of ActII with the tetramer duplex. Analysis of inter-molecular NOE-contacts enables to conclude that ActII preferentially intercalates into the terminal d(TG)-site of the tetranucleotide and to propose the most favourable spatial structures of ActII-d(TpGpCpA) complexes. It follows that aminoalkyl side chains of ActII are situated in the minor groove of the tetramer duplex.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:52:11Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156681 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T19:52:11Z |
| publishDate | 2003 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Лантушенко, А.О. Рогова, О.В. Эрнандес, Сантьяго А. Дэвис, Д.Б. 2019-06-18T19:28:26Z 2019-06-18T19:28:26Z 2003 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования 
 феноксазонового антибиотика 
 актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида 
 с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) 
 в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 
 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.00067B https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681 577.113 Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектроскопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК. Представлено результати дослідження комплексоутворення синтетичної феноксазонової сполуки актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил)аміду (ActII) з самокомплементарним дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині методом двовимірної 1Н ЯМР спектроскопії (500 МГц). Двовимірні екперименти 2M-TOCSY і 2M-NOESY використано для повного віднесення сигналів протонів феноксазонової сполуки і нуклеотидів у змішаному розчині та для визначення інтеркальованого комплексу ActII з дуплексом тетрамеру. На основі аналізу міжмолекулярних NOE-контактів зроблено висновок щодо переважної інтеркаляції ActII у термінальний d(TG)-сайт олігонуклеотиду та побудовано найвірогідніші просторові структури комплексів ActII з 5'-d(TpGpCpA). З аналізу випливає, що бічні аміноалкільні ланцюги феноксазонового ліганду розміщуються в малій борозенці дуплексу ДНК. Complexation of a synthetic phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide (ActII) with self-complementary deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution has been studied by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy (500 MHz). Two-dimensional homonuclear correlation NMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) has been used for complete assignment of proton signals of phenoxazone compound and nucleotides in the mixed solution and for determining the structure of the intercalated complex of ActII with the tetramer duplex. Analysis of inter-molecular NOE-contacts enables to conclude that ActII preferentially intercalates into the terminal d(TG)-site of the tetranucleotide and to propose the most favourable spatial structures of ActII-d(TpGpCpA) complexes. It follows that aminoalkyl side chains of ActII are situated in the minor groove of the tetramer duplex. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе 2М ¹Н ЯМР аналіз комплексоутворення феноксазонового антибіотика актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил) аміду з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині 2D ¹H-NMR analysis of complexation of phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution Article published earlier |
| spellingShingle | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе Веселков, А.Н. Итон, Р.Дж. Лантушенко, А.О. Рогова, О.В. Эрнандес, Сантьяго А. Дэвис, Д.Б. Структура та функції біополімерів |
| title | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе |
| title_alt | 2М ¹Н ЯМР аналіз комплексоутворення феноксазонового антибіотика актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил) аміду з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині 2D ¹H-NMR analysis of complexation of phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution |
| title_full | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе |
| title_fullStr | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе |
| title_full_unstemmed | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе |
| title_short | 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе |
| title_sort | 2м ¹н ямр анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(tpgpcpa) в водном растворе |
| topic | Структура та функції біополімерів |
| topic_facet | Структура та функції біополімерів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681 |
| work_keys_str_mv | AT veselkovan 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT itonrdž 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT lantušenkoao 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT rogovaov 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT érnandessantʹâgoa 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT dévisdb 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore AT veselkovan 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT itonrdž 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT lantušenkoao 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT rogovaov 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT érnandessantʹâgoa 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT dévisdb 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní AT veselkovan 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT itonrdž 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT lantušenkoao 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT rogovaov 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT érnandessantʹâgoa 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution AT dévisdb 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution |