2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе

2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе

Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные экспе...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Біополімери і клітина
Дата:2003
Автори: Веселков, А.Н., Итон, Р.Дж., Лантушенко, А.О., Рогова, О.В., Эрнандес, Сантьяго А., Дэвис, Д.Б.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2003
Теми:
Структура та функції біополімерів
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156681
record_format dspace
spelling Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
2019-06-18T19:28:26Z
2019-06-18T19:28:26Z
2003
2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.00067B
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681
577.113
Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК.
Представлено результати дослідження комплексоутворення синтетичної феноксазонової сполуки актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил)аміду (ActII) з самокомплементарним дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині мето­дом двовимірної 1Н ЯМР спектроскопії (500 МГц). Двовимірні екперименти 2M-TOCSY і 2M-NOESY використано для повно­го віднесення сигналів протонів феноксазонової сполуки і нуклеотидів у змішаному розчині та для визначення інтеркальованого комплексу ActII з дуплексом тетрамеру. На основі аналізу міжмолекулярних NOE-контактів зроблено вис­новок щодо переважної інтеркаляції ActII у термінальний d(TG)-сайт олігонуклеотиду та побудовано найвірогідніші просторові структури комплексів ActII з 5'-d(TpGpCpA). З аналізу випливає, що бічні аміноалкільні ланцюги феноксазоно­вого ліганду розміщуються в малій борозенці дуплексу ДНК.
Complexation of a synthetic phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide (ActII) with self-complementary deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution has been studied by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy (500 MHz). Two-dimensional homonuclear correlation NMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) has been used for complete assignment of proton signals of phenoxazone compound and nucleotides in the mixed solution and for determining the structure of the intercalated complex of ActII with the tetramer duplex. Analysis of inter-molecular NOE-contacts enables to conclude that ActII preferentially intercalates into the terminal d(TG)-site of the tetranucleotide and to propose the most favourable spatial structures of ActII-d(TpGpCpA) complexes. It follows that aminoalkyl side chains of ActII are situated in the minor groove of the tetramer duplex.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
2М ¹Н ЯМР аналіз комплексоутворення феноксазонового антибіотика актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил) аміду з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині
2D ¹H-NMR analysis of complexation of phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
spellingShingle 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
Структура та функції біополімерів
title_short 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_full 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_fullStr 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_full_unstemmed 2М ¹Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе
title_sort 2м ¹н ямр анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(tpgpcpa) в водном растворе
author Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
author_facet Веселков, А.Н.
Итон, Р.Дж.
Лантушенко, А.О.
Рогова, О.В.
Эрнандес, Сантьяго А.
Дэвис, Д.Б.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2003
language Russian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt 2М ¹Н ЯМР аналіз комплексоутворення феноксазонового антибіотика актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил) аміду з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині
2D ¹H-NMR analysis of complexation of phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution
description Представлены результаты исследования комплексообразования синтетического феноксазонового соединения актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида (ActII) с самокомплементарным дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом двухмерной 1Н ЯМР спектро­скопии (500 МГц). Двухмерные эксперименты 2M-TOCSY и 2M-NOESY использованы для полного отнесения сигналов протонов феноксазонового соединения и нуклеотидов в смешанном растворе и для установления структуры интеркалированного комплекса ActII с дуплексом тетрамера На основании анализа межмолекулярных NOE-контактов сделан вывод о преимущественной интеркаляции ActII в терминальный d(TG)-сайт олигонуклеотида и построены наиболее вероятные пространственные структуры комплексов ActII с 5'-d(TpGpCpA). Анализ показывает, что боковые аминоалкильные цепи феноксазонового лиганда располагаются в малой канавке дуплекса ДНК. Представлено результати дослідження комплексоутворення синтетичної феноксазонової сполуки актиноцил-біс-(2-диметиламіноетил)аміду (ActII) з самокомплементарним дезок­ситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водному розчині мето­дом двовимірної 1Н ЯМР спектроскопії (500 МГц). Двовимірні екперименти 2M-TOCSY і 2M-NOESY використано для повно­го віднесення сигналів протонів феноксазонової сполуки і нуклеотидів у змішаному розчині та для визначення інтеркальованого комплексу ActII з дуплексом тетрамеру. На основі аналізу міжмолекулярних NOE-контактів зроблено вис­новок щодо переважної інтеркаляції ActII у термінальний d(TG)-сайт олігонуклеотиду та побудовано найвірогідніші просторові структури комплексів ActII з 5'-d(TpGpCpA). З аналізу випливає, що бічні аміноалкільні ланцюги феноксазоно­вого ліганду розміщуються в малій борозенці дуплексу ДНК. Complexation of a synthetic phenoxazone compound actinocyl-bis-(2-dimethylaminoethyl) amide (ActII) with self-complementary deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous solution has been studied by two-dimensional 1H-NMR spectroscopy (500 MHz). Two-dimensional homonuclear correlation NMR spectroscopy (2D-TOCSY and 2D-NOESY) has been used for complete assignment of proton signals of phenoxazone compound and nucleotides in the mixed solution and for determining the structure of the intercalated complex of ActII with the tetramer duplex. Analysis of inter-molecular NOE-contacts enables to conclude that ActII preferentially intercalates into the terminal d(TG)-site of the tetranucleotide and to propose the most favourable spatial structures of ActII-d(TpGpCpA) complexes. It follows that aminoalkyl side chains of ActII are situated in the minor groove of the tetramer duplex.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156681
citation_txt 2М 1Н ЯМР анализ комплексообразования феноксазонового антибиотика актиноцил-бис-(2-диметиламиноэтил)амида с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе / А.Н. Веселков, Р.Дж. Итон, А.О. Лантушенко, О.В. Рогова, А. Сантьяго Эрнандес, Д.Б. Дэвис // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 504-512. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT veselkovan 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT itonrdž 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT lantušenkoao 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT rogovaov 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT érnandessantʹâgoa 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT dévisdb 2m1nâmranalizkompleksoobrazovaniâfenoksazonovogoantibiotikaaktinocilbis2dimetilaminoétilamidasdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpavvodnomrastvore
AT veselkovan 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT itonrdž 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT lantušenkoao 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT rogovaov 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT érnandessantʹâgoa 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT dévisdb 2m1nâmranalízkompleksoutvorennâfenoksazonovogoantibíotikaaktinocilbís2dimetilamínoetilamíduzdezoksitetranukleotidom5dtpgpcpauvodnomurozčiní
AT veselkovan 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
AT itonrdž 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
AT lantušenkoao 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
AT rogovaov 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
AT érnandessantʹâgoa 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
AT dévisdb 2d1hnmranalysisofcomplexationofphenoxazonecompoundactinocylbis2dimethylaminoethylamidewithdeoxytetranucleotide5dtpgpcpainaqueoussolution
first_indexed 2025-12-07T19:52:11Z
last_indexed 2025-12-07T19:52:11Z
_version_ 1850880432970661888

Схожі ресурси