A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens

A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens

A specific detection method was developed to discriminate Klebsiella oxytoca between other species of the genus Klebsiella on the basis of PCR amplification of the unique DNA sequences within the polygalacturonase-encoding (pehX) gene. Four primers have been designed for performing PCRs gaining ampl...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Біополімери і клітина
Дата:2003
Автори: Kovtunovych, G.L., Lytvynenko, T.L., Negrutska, V.V., Lar, O.V., Koltukova, N.V, Kozyrovska, N.O.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2003
Теми:
Молекулярна та клітинна біотехнології
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156684
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens / G.L. Kovtunovych, T. L. Litvinenko, V.V. Negrutska, O.V. Lar, N.V. Koltukova, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 520-524. — Бібліогр.: 21 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156684
record_format dspace
spelling Kovtunovych, G.L.
Lytvynenko, T.L.
Negrutska, V.V.
Lar, O.V.
Koltukova, N.V
Kozyrovska, N.O.
2019-06-18T19:29:57Z
2019-06-18T19:29:57Z
2003
A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens / G.L. Kovtunovych, T. L. Litvinenko, V.V. Negrutska, O.V. Lar, N.V. Koltukova, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 520-524. — Бібліогр.: 21 назв. — англ.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.00067D
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156684
577.21
A specific detection method was developed to discriminate Klebsiella oxytoca between other species of the genus Klebsiella on the basis of PCR amplification of the unique DNA sequences within the polygalacturonase-encoding (pehX) gene. Four primers have been designed for performing PCRs gaining amplicons of 282, 344, 451 and 513 bp. The specificity of the test was verified by the lack of PCR products in case of related K. pneumoniae, K. planticola, and polygalacturonate-degrading species of the genus Erwinia. The PCR-mediated test gives a rapid answer, concerning the presence of K. oxytoca in a sample, or in differentiating this bacterium from other species, such as K. pneumoniae, with which they can be confused. The diagnostic test can be used in ecological monitoring of K. oxytoca as well as in medical laboratories.
На основі ПЛР-ампліфікації унікальних послідовностей ДНК гена, що кодує фермент полігалактуроназу (pehX), розроблено специфічний метод для вирізнення бактерії K. oxytoca серед інших бактерій роду Klebsiella. Чотири пари праймерів створе­но для отримання ампліконів 282, 344, 451 та 513 п. н. Специфічність тесту підтверджено відсутністю продуктів ПЛР у близьких бактерій K. pneumoniae, K. planticola та видів роду Erwinia, що розкладають полігалактуронат ПЛР-тест дозволяє швидко визначити наявність K. oxytoca у зразку або відрізнити цю бактерію від представників інших видів, на­приклад, від К. pneumoniae, яка дуже схожа на неї. Діагно­стичний тест може бути використано в екологічному моні­торингу K. oxytoca, а також у медичних лабораторіях.
На основе ПЦР-амплификации уникальних последовательно­стей ДНК гена, кодирующего фермент полигалактуроназу (pehX), разработан метод для выявления бактерии K. oxytoca среди других бактерий рода Klebsiella. Четыре пары праймеров созданы для получения ампликонов размером 282, 344, 451 и 513 пар нуклеотидов. Специфичность теста подтверждена отсутствием продуктов ПЦР у близких бактерий K. pneu­moniae, K. planticola и видов рода Erwinia, разлагающих полигалактуронат ПЦР-тест позволяет быстро определить наличие К. oxytoca в образцах или отличить эту бактерию от представителей других видов, например, от K. pneumoniae, которая очень на нее похожа. Диагностический тест может быть использован в экологическом мониторинге K. oxytoca, а также в медицинских лабораториях.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Молекулярна та клітинна біотехнології
A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
ПЦР-опосредованный метод для определения Klebsiella oxytoca среди близких бактерий в природных и медицинских образца
ПЛР-опосередкований метод визначення Klebsiella oxytoca серед близьких бактерій у природних та медичних зразках
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
spellingShingle A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
Kovtunovych, G.L.
Lytvynenko, T.L.
Negrutska, V.V.
Lar, O.V.
Koltukova, N.V
Kozyrovska, N.O.
Молекулярна та клітинна біотехнології
title_short A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
title_full A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
title_fullStr A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
title_full_unstemmed A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
title_sort pcr-mediated method for discrimination of klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens
author Kovtunovych, G.L.
Lytvynenko, T.L.
Negrutska, V.V.
Lar, O.V.
Koltukova, N.V
Kozyrovska, N.O.
author_facet Kovtunovych, G.L.
Lytvynenko, T.L.
Negrutska, V.V.
Lar, O.V.
Koltukova, N.V
Kozyrovska, N.O.
topic Молекулярна та клітинна біотехнології
topic_facet Молекулярна та клітинна біотехнології
publishDate 2003
language English
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt ПЦР-опосредованный метод для определения Klebsiella oxytoca среди близких бактерий в природных и медицинских образца
ПЛР-опосередкований метод визначення Klebsiella oxytoca серед близьких бактерій у природних та медичних зразках
description A specific detection method was developed to discriminate Klebsiella oxytoca between other species of the genus Klebsiella on the basis of PCR amplification of the unique DNA sequences within the polygalacturonase-encoding (pehX) gene. Four primers have been designed for performing PCRs gaining amplicons of 282, 344, 451 and 513 bp. The specificity of the test was verified by the lack of PCR products in case of related K. pneumoniae, K. planticola, and polygalacturonate-degrading species of the genus Erwinia. The PCR-mediated test gives a rapid answer, concerning the presence of K. oxytoca in a sample, or in differentiating this bacterium from other species, such as K. pneumoniae, with which they can be confused. The diagnostic test can be used in ecological monitoring of K. oxytoca as well as in medical laboratories. На основі ПЛР-ампліфікації унікальних послідовностей ДНК гена, що кодує фермент полігалактуроназу (pehX), розроблено специфічний метод для вирізнення бактерії K. oxytoca серед інших бактерій роду Klebsiella. Чотири пари праймерів створе­но для отримання ампліконів 282, 344, 451 та 513 п. н. Специфічність тесту підтверджено відсутністю продуктів ПЛР у близьких бактерій K. pneumoniae, K. planticola та видів роду Erwinia, що розкладають полігалактуронат ПЛР-тест дозволяє швидко визначити наявність K. oxytoca у зразку або відрізнити цю бактерію від представників інших видів, на­приклад, від К. pneumoniae, яка дуже схожа на неї. Діагно­стичний тест може бути використано в екологічному моні­торингу K. oxytoca, а також у медичних лабораторіях. На основе ПЦР-амплификации уникальних последовательно­стей ДНК гена, кодирующего фермент полигалактуроназу (pehX), разработан метод для выявления бактерии K. oxytoca среди других бактерий рода Klebsiella. Четыре пары праймеров созданы для получения ампликонов размером 282, 344, 451 и 513 пар нуклеотидов. Специфичность теста подтверждена отсутствием продуктов ПЦР у близких бактерий K. pneu­moniae, K. planticola и видов рода Erwinia, разлагающих полигалактуронат ПЦР-тест позволяет быстро определить наличие К. oxytoca в образцах или отличить эту бактерию от представителей других видов, например, от K. pneumoniae, которая очень на нее похожа. Диагностический тест может быть использован в экологическом мониторинге K. oxytoca, а также в медицинских лабораториях.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156684
citation_txt A PCR-mediated method for discrimination of Klebsiella oxytoca between closely related bacteria in environmental and clinical specimens / G.L. Kovtunovych, T. L. Litvinenko, V.V. Negrutska, O.V. Lar, N.V. Koltukova, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2003. — Т. 19, № 6. — С. 520-524. — Бібліогр.: 21 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT kovtunovychgl apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT lytvynenkotl apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT negrutskavv apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT larov apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT koltukovanv apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT kozyrovskano apcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT kovtunovychgl pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT lytvynenkotl pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT negrutskavv pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT larov pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT koltukovanv pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT kozyrovskano pcroposredovannyimetoddlâopredeleniâklebsiellaoxytocasrediblizkihbakteriivprirodnyhimedicinskihobrazca
AT kovtunovychgl plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT lytvynenkotl plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT negrutskavv plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT larov plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT koltukovanv plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT kozyrovskano plroposeredkovaniimetodviznačennâklebsiellaoxytocaseredblizʹkihbakteríiuprirodnihtamedičnihzrazkah
AT kovtunovychgl pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT lytvynenkotl pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT negrutskavv pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT larov pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT koltukovanv pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
AT kozyrovskano pcrmediatedmethodfordiscriminationofklebsiellaoxytocabetweencloselyrelatedbacteriainenvironmentalandclinicalspecimens
first_indexed 2025-12-07T15:17:00Z
last_indexed 2025-12-07T15:17:00Z
_version_ 1850863120170352640

Схожі ресурси