Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії
Не каталітичний С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців має подвійну функцію: бере участь у зв' язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від каталітичного кора синтетази проявляє иитокінову активність подібно до цитокіну ЕМАР II. С-модуль TyrRS містить залишок триптофану...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2006 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2006
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156780 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 4. — С. 283-289. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862541292217565184 |
|---|---|
| author | Кордиш, М.О. Корнелюк, О.І. |
| author_facet | Кордиш, М.О. Корнелюк, О.І. |
| citation_txt | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 4. — С. 283-289. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Не каталітичний С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців має подвійну функцію: бере участь у зв' язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від каталітичного кора синтетази проявляє иитокінову активність подібно до цитокіну ЕМАР II. С-модуль TyrRS містить залишок триптофану Trp144, який є флуоресцентним зондом у структурі білка, однак локалізований поза сайтом зв'язування РНК. Для дослідження взаємодії ізольованого С-модуля з тРНК консервативний ароматичний залишок (Phe) 127 у РНК-зв' язу вальному центрі методами сайт-спрямованого мутагенезу було замінено на флуорофор Trp127. Це дозволило суттєво підвищити квантовий вихід флуоресценції білка та визначити параметри зв'язування С-модуля з тРНК. На основі даних спектрофлуориметричного титрування визначено величину константи дисоціації комплексу С-модуля з тPHK (Phe), яка складає 2,9-10⁻⁸ М, та стехіометрію комплексу (n = 1,2).
The non-catalytic COOH-terminal module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase manifests a dual function: involvement in tRNA binding as a cis-factor and cytokine activity after proteolytic cleavage from synthetase catalytic core similar to EMAP II cytokine. The C-module of TyrRS contains a single Trp144 which is an intrinsic fluorescent probe in protein structure, but it is localized outside of RNA binding site. To explore the interaction between C-module and tRNA in solution the conservative aromatic (Phe) 127 residue was substituted for Trp127 fluorophore by site-directed mutagenesis. This replacement allowed enhancing the protein quantum yield and determining the binding parameters of tRNA and C-module. The dissociation constant of the complex between C-module and tRNA (Phe) was calculated on the basis of spectrofluorometric titrations data. It was about 2,9-10⁻⁸ M, and stoichiometry of the complex n=1.2.
Некаталитический С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих выполняет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и при протеолитическом расщеплении от каталитического кора синтетазы проявляет цитокиновую активность подобно цитокину ЕМАР II. С-модуль TyrRS содержит остаток триптофана Trp144, который является флуоресцентним зондом в структуре белка, однако локализован вне сайта связывания РНК. Для исследования взаимодействия изолированного С-модуля с тРНК консервативный ароматический остаток (Phe) 127 в РНК-связывающем центре был заменен на флуорофор Trp127 методами сайт-направленного мутагенеза. Это позволило существенно повысить квантовый выход флуоресценции белка и определить параметры связывания С-модуля с тРНК. На основе данных спектрофлуориметрического титрования определены величина константы диссоциации комплекса С-модуля с тPHK (Phe), которая составляет 2,9-10⁻⁸ М, и стехиометрия комплекса (n = 1,2).
|
| first_indexed | 2025-11-24T16:49:08Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156780 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-24T16:49:08Z |
| publishDate | 2006 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Кордиш, М.О. Корнелюк, О.І. 2019-06-18T20:24:11Z 2019-06-18T20:24:11Z 2006 Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 4. — С. 283-289. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. 0233-7657 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156780 577.322 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00073A Не каталітичний С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців має подвійну функцію: бере участь у зв' язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від каталітичного кора синтетази проявляє иитокінову активність подібно до цитокіну ЕМАР II. С-модуль TyrRS містить залишок триптофану Trp144, який є флуоресцентним зондом у структурі білка, однак локалізований поза сайтом зв'язування РНК. Для дослідження взаємодії ізольованого С-модуля з тРНК консервативний ароматичний залишок (Phe) 127 у РНК-зв' язу вальному центрі методами сайт-спрямованого мутагенезу було замінено на флуорофор Trp127. Це дозволило суттєво підвищити квантовий вихід флуоресценції білка та визначити параметри зв'язування С-модуля з тРНК. На основі даних спектрофлуориметричного титрування визначено величину константи дисоціації комплексу С-модуля з тPHK (Phe), яка складає 2,9-10⁻⁸ М, та стехіометрію комплексу (n = 1,2). The non-catalytic COOH-terminal module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase manifests a dual function: involvement in tRNA binding as a cis-factor and cytokine activity after proteolytic cleavage from synthetase catalytic core similar to EMAP II cytokine. The C-module of TyrRS contains a single Trp144 which is an intrinsic fluorescent probe in protein structure, but it is localized outside of RNA binding site. To explore the interaction between C-module and tRNA in solution the conservative aromatic (Phe) 127 residue was substituted for Trp127 fluorophore by site-directed mutagenesis. This replacement allowed enhancing the protein quantum yield and determining the binding parameters of tRNA and C-module. The dissociation constant of the complex between C-module and tRNA (Phe) was calculated on the basis of spectrofluorometric titrations data. It was about 2,9-10⁻⁸ M, and stoichiometry of the complex n=1.2. Некаталитический С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих выполняет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и при протеолитическом расщеплении от каталитического кора синтетазы проявляет цитокиновую активность подобно цитокину ЕМАР II. С-модуль TyrRS содержит остаток триптофана Trp144, который является флуоресцентним зондом в структуре белка, однако локализован вне сайта связывания РНК. Для исследования взаимодействия изолированного С-модуля с тРНК консервативный ароматический остаток (Phe) 127 в РНК-связывающем центре был заменен на флуорофор Trp127 методами сайт-направленного мутагенеза. Это позволило существенно повысить квантовый выход флуоресценции белка и определить параметры связывания С-модуля с тРНК. На основе данных спектрофлуориметрического титрования определены величина константы диссоциации комплекса С-модуля с тPHK (Phe), которая составляет 2,9-10⁻⁸ М, и стехиометрия комплекса (n = 1,2). Роботу виконано за фінансової підтримки гранту № 5.07/200 Державного фонду фундаментальних досліджень Міністерства освіти та науки України. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії Исследование взаимодействия изолированного С-модуля тирозил-тРНК синтетазы с тРНК методом флуоресцентной спектроскопии Investigation of the interaction between isolated C-module of tyrosyl-tRNA synthetase and tRNA by fluorescence spectroscopy Article published earlier |
| spellingShingle | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії Кордиш, М.О. Корнелюк, О.І. Структура та функції біополімерів |
| title | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії |
| title_alt | Исследование взаимодействия изолированного С-модуля тирозил-тРНК синтетазы с тРНК методом флуоресцентной спектроскопии Investigation of the interaction between isolated C-module of tyrosyl-tRNA synthetase and tRNA by fluorescence spectroscopy |
| title_full | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії |
| title_fullStr | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії |
| title_full_unstemmed | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії |
| title_short | Дослідження взаємодії ізольованого С-модуля тирозил-тРНК синтетази з тРНК методом флуоресцентної спектроскопії |
| title_sort | дослідження взаємодії ізольованого с-модуля тирозил-трнк синтетази з трнк методом флуоресцентної спектроскопії |
| topic | Структура та функції біополімерів |
| topic_facet | Структура та функції біополімерів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156780 |
| work_keys_str_mv | AT kordišmo doslídžennâvzaêmodííízolʹovanogosmodulâtiroziltrnksintetaziztrnkmetodomfluorescentnoíspektroskopíí AT kornelûkoí doslídžennâvzaêmodííízolʹovanogosmodulâtiroziltrnksintetaziztrnkmetodomfluorescentnoíspektroskopíí AT kordišmo issledovanievzaimodeistviâizolirovannogosmodulâtiroziltrnksintetazystrnkmetodomfluorescentnoispektroskopii AT kornelûkoí issledovanievzaimodeistviâizolirovannogosmodulâtiroziltrnksintetazystrnkmetodomfluorescentnoispektroskopii AT kordišmo investigationoftheinteractionbetweenisolatedcmoduleoftyrosyltrnasynthetaseandtrnabyfluorescencespectroscopy AT kornelûkoí investigationoftheinteractionbetweenisolatedcmoduleoftyrosyltrnasynthetaseandtrnabyfluorescencespectroscopy |