Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи

• Published in: Вiopolymers and Cell
• Date: 2012
• Main Authors: Сліщук, Г.І., Волкова, Н.Е., Сиволап, Ю.М.
• Format: Article
• Language: Ukrainian
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2012
• Subjects: Bioinformatics
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156830
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи / Г.І. Сліщук, Н.Е. Волкова, Ю.М. Сиволап // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 2. — С. 156–160. — Бібліогр.: 13 назв. — укр.

Цель. Анализ вторичной структуры транскриптов интрона 1 гена whp1 кукурузы. Методы. Выравнивание, фолдинг in silico. Результаты. Найдены сложные микросателлиты. Исследована вторичная структура 74 транскриптов интрона 1 гена whp1. Выводы. Сделано предположение о влиянии транскриптов интрона 1 гена whp1 на восстановление фертильности кукурузы с S-типом цитоплазматической мужской стерильности.
 Ключевые слова: биоинформатика, ген whp1, ЦМС, кукуруза, интрон, вторичная структура. Мета. Аналіз вторинної структури транскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи. Методи. Вирівнювання, фолдинг in silico. Результати. Знайдено складні мікросателіти. Досліджено вторинну структуру 74 транскриптів інтрона 1 гена whp1. Висновки. Зроблено припущення щодо впливу транскриптів інтрона 1 гена whp1 на відновлення фертильності кукурудзи з S-типом цитоплазматичної чоловічої стерильності.
 Ключові слова: біоінформатика, ген whp1, ЦЧС, кукурудза, інтрон, вторинна структура. Aim. Analysis of the secondary structure of maize whp1 gene intron 1 transcripts. Methods. Alignment, in silico folding. Results. Novel complex microsatellites of the whp1 gene were discovered. 74 whp1 intron 1 transcripts secondary structures were predicted. Conclusions. The influence of whp1 gene intron 1 transcripts on restoration of CMS- S sterile maize fertility has been proposed.
 Keywords: bioinformatics, whp1 gene, CMS, maize, intron, secondary structure.