Структурна біоінформатика в постгеномну еру
Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модулятор...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2004 |
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2004
|
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156874 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862715756670615552 |
|---|---|
| author | Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. |
| author_facet | Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. |
| citation_txt | Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модуляторів функціональної активності білків як нових лікарських препаратів. Прогрес структурної біоінформатики обумовлений бурхливим розвитком геноміки – розишфровкою декількох сотень геномів про- та еукаріотних організмів і переходом біології в постгеномну еру. В огляді розглянуто такі питання, як моделювання просторової структури білків, протеоміка та інтерактоміка, біоінформатика при аналізі транскриптому, молекулярна динаміка білків, моделювання взаємодій з лігандами, комп'ютерний дизайн лікарських препаратів тощо. Описано застосування цих підходів при дослідженні тирозил-тРНК синтетази ссавців та протеази вірусу імунодефіциту людини. Подано інформацію про перший український біоінформаційний web-портал BioUA, який створено для проведення досліджень у галузі геноміки та структурної біоінформатики.
Structural bioinformatics is a novel branch of biology which uses the computational methods of analysis with the aim of modeling the 3D structures of proteins and macromolecular complexes. The goal of structural bioinformatics research is also the creation of novel modulators of functional activities of proteins, such as novel drugs (drug design). Progress in structural bioinformatics is determined by the rapid growth in the deciphering of several hundreds of genomes of both prokaryotic and eukaryotic organisms and transition to post-genomic era. In this review some aspects of structural bioinformatics such as 3D structure modeling, proteomics and interactomics, bioinformatics in transcriptome analysis, molecular dynamics of proteins, protein-ligand interactions modeling and computer aided drug design are discussed. The development and applications of these methods for mammalian tyrosyl-tRNA synthetase and viral HIV-protease are discussed. The first Ukrainian web-portal BioUA devoted to the genomics and structural bioinformatics investigations is described in this review.
Структурная биоинформатика – новая область биологии, использующая методы компьютерного анализа для моделирования пространственной структуры белков и макромолекулярных комплексов для выяснения их функций. Целью структурной биоинформатики является также создание селективных модуляторов функциональной активности белков как новых лекарственных препаратов. Прогресс структурной биоинформатики обусловлен бурным развитием геномики – расшифровкой нескольких сотен геномов про- и эукариотических организмов и переходом биологии в постгеномную эру. В обзоре рассмотрены такие вопросы, как моделирование пространственной структуры белков, протеомика и интерактомика, биоинформатика при анализе транскриптома, молекулярная динамика белков, моделирование взаимодействий с лигандами, компьютерный дизайн лекарственных препаратов. Описано применение этих подходов при исследовании тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих и протеазы вируса иммунодефицита человека. Для проведения исследований в области геномики и структурной биоинформатики создан первый украинский биоинформационный web-портал BioUA.
|
| first_indexed | 2025-12-07T18:00:19Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156874 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T18:00:19Z |
| publishDate | 2004 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. 2019-06-19T08:17:27Z 2019-06-19T08:17:27Z 2004 Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.000695 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156874 577.322:577.332 Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модуляторів функціональної активності білків як нових лікарських препаратів. Прогрес структурної біоінформатики обумовлений бурхливим розвитком геноміки – розишфровкою декількох сотень геномів про- та еукаріотних організмів і переходом біології в постгеномну еру. В огляді розглянуто такі питання, як моделювання просторової структури білків, протеоміка та інтерактоміка, біоінформатика при аналізі транскриптому, молекулярна динаміка білків, моделювання взаємодій з лігандами, комп'ютерний дизайн лікарських препаратів тощо. Описано застосування цих підходів при дослідженні тирозил-тРНК синтетази ссавців та протеази вірусу імунодефіциту людини. Подано інформацію про перший український біоінформаційний web-портал BioUA, який створено для проведення досліджень у галузі геноміки та структурної біоінформатики. Structural bioinformatics is a novel branch of biology which uses the computational methods of analysis with the aim of modeling the 3D structures of proteins and macromolecular complexes. The goal of structural bioinformatics research is also the creation of novel modulators of functional activities of proteins, such as novel drugs (drug design). Progress in structural bioinformatics is determined by the rapid growth in the deciphering of several hundreds of genomes of both prokaryotic and eukaryotic organisms and transition to post-genomic era. In this review some aspects of structural bioinformatics such as 3D structure modeling, proteomics and interactomics, bioinformatics in transcriptome analysis, molecular dynamics of proteins, protein-ligand interactions modeling and computer aided drug design are discussed. The development and applications of these methods for mammalian tyrosyl-tRNA synthetase and viral HIV-protease are discussed. The first Ukrainian web-portal BioUA devoted to the genomics and structural bioinformatics investigations is described in this review. Структурная биоинформатика – новая область биологии, использующая методы компьютерного анализа для моделирования пространственной структуры белков и макромолекулярных комплексов для выяснения их функций. Целью структурной биоинформатики является также создание селективных модуляторов функциональной активности белков как новых лекарственных препаратов. Прогресс структурной биоинформатики обусловлен бурным развитием геномики – расшифровкой нескольких сотен геномов про- и эукариотических организмов и переходом биологии в постгеномную эру. В обзоре рассмотрены такие вопросы, как моделирование пространственной структуры белков, протеомика и интерактомика, биоинформатика при анализе транскриптома, молекулярная динамика белков, моделирование взаимодействий с лигандами, компьютерный дизайн лекарственных препаратов. Описано применение этих подходов при исследовании тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих и протеазы вируса иммунодефицита человека. Для проведения исследований в области геномики и структурной биоинформатики создан первый украинский биоинформационный web-портал BioUA. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структурна біоінформатика в постгеномну еру Structural bioinformatics in post-genomic era Структурная биоинформатика в постгеномную эру Article published earlier |
| spellingShingle | Структурна біоінформатика в постгеномну еру Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. |
| title | Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| title_alt | Structural bioinformatics in post-genomic era Структурная биоинформатика в постгеномную эру |
| title_full | Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| title_fullStr | Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| title_full_unstemmed | Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| title_short | Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| title_sort | структурна біоінформатика в постгеномну еру |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156874 |
| work_keys_str_mv | AT odinecʹko strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT ívahnoss strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT kovalʹsʹkiidb strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT tokovenkobt strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT kornelûkoí strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT odinecʹko structuralbioinformaticsinpostgenomicera AT ívahnoss structuralbioinformaticsinpostgenomicera AT kovalʹsʹkiidb structuralbioinformaticsinpostgenomicera AT tokovenkobt structuralbioinformaticsinpostgenomicera AT kornelûkoí structuralbioinformaticsinpostgenomicera AT odinecʹko strukturnaâbioinformatikavpostgenomnuûéru AT ívahnoss strukturnaâbioinformatikavpostgenomnuûéru AT kovalʹsʹkiidb strukturnaâbioinformatikavpostgenomnuûéru AT tokovenkobt strukturnaâbioinformatikavpostgenomnuûéru AT kornelûkoí strukturnaâbioinformatikavpostgenomnuûéru |