Зображення обкладинки

Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation

Here we report a study of molecular dynamics of a YCD2 fragment of mammalian tyrosyl-tRNA synthethase (Asp322-Ser528), which includes the COOH-terminal cytokine-like domain, intermodular flexible linker, and H5-α-helix of catalytic core of synthetase. Our calculations show that while compact C-termi...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :	Біополімери і клітина
Дата:	2006
Автори:	Pydiura, N.A., Tereshchenko, F.A., Kornelyuk, A.I.
Формат:	Стаття
Мова:	Англійська
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2006
Теми:	Структура та функції біополімерів
Онлайн доступ:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156882
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation / N.A. Pydiura, F.A. Tereshchenko, A.I. Kornelyuk // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 6. — С. 433-438. — Бібліогр.: 29 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: N. A. Pydiura, та інші
Опубліковано: (2012)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Leucyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus. Purification and some properties of the crystallizing enzyme
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2001)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Yu. Grom, та інші
Опубліковано: (2015)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Grom, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Kornelyuk, A., та інші
Опубліковано: (1999)

Homology modeling of structure of NH₂-terminal module of mammalian (Bos taurus) tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Odynets, K.A., та інші
Опубліковано: (2002)

Molecular cloning, sequencing and sequence analysis of Thermus thermophilus tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2004)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNA Pro
за авторством: A. D. Yaremchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2016)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Computational modeling of molecular dynamics of G41R mutant form of human tyrosyl-tRNA synthetase, assosiated with Charcot-Marie-Tooth neuropathy
за авторством: O. V. Savytskyi, та інші
Опубліковано: (2015)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: M. A. Tukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: Tukalo, M.A., та інші
Опубліковано: (2013)

The immunochemical cross-reactivity between cytoplasmic and mitochondrial mammalian lysyl-tRNA synthetases
за авторством: Sidorik, L.L., та інші
Опубліковано: (2000)

Expression and purification of full-length Alanyl-tRNA-synthetase from Thermus thermophilus HB27
за авторством: Rybak, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2018)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNAPro
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2012)

Association of mitochondrial lysyl-tRNA synthetase with HIV-1 GagPol involves catalytic domain of the synthetase and transframe and integrase domains of Pol
за авторством: Kobbi, L., та інші
Опубліковано: (2011)

Insertion intermediate of annexin B12 is prone to aggregation on membrane interfaces
за авторством: Ladokhin, A.S.
Опубліковано: (2008)

On the interpretation of decay-associated fluorescence spectra in proteins
за авторством: Ladokhin, A.S.
Опубліковано: (2001)

Development of molecularly imprinted polymer membranes with specificity to triazine herbicides, prepared by the "surface photografting" technique
за авторством: Sergeyeva, T.A., та інші
Опубліковано: (2004)

Interaction of different tRNAs with translation elongation factors 1A from lower and higher eukaryotes
за авторством: Futernyk, P.V., та інші
Опубліковано: (2009)

Auxiliary elements of mammalian pre-mRNAs polyadenylation signals
за авторством: Zarudnaya, M.I., та інші
Опубліковано: (2002)

Identification of phosphate transporter NaPi2b as MX35 cancer antigen by modified SEREX approach
за авторством: Kiyamova, R.G., та інші
Опубліковано: (2008)

Использование метода Far Western гибридизации для определения рибосомных белков, взаимодействующих с фактором элонгации трансляции 1А
за авторством: Будкевич, Т.В., та інші
Опубліковано: (2007)

Відновлення активності аміноацил-тРНК синтетаз вищих еукаріотів та їхня стабілізація у присутності рибосом
за авторством: Лукаш, Т.О., та інші
Опубліковано: (2004)

Исследование структурно-функциональных взаимодействий полиэдрина вируса ядерного полиэдроза тутового шелкопряда (Bombyx mori) с протеазой и РНК полиэдров. Влияние протеазы на диссоциацию полиэдрина в процессе гель-фильтрации через сефарозу 6В
за авторством: Козлов, Э.А., та інші
Опубліковано: (2006)

Кинетические свойства каталазы Penicillium vitale. Каталазная реакция фермента
за авторством: Гудкова, Л.В., та інші
Опубліковано: (2003)

Creation of cellular models for the analysis of sodium-dependent phosphate transporter NaPi2b, a potential marker for ovarian cancer
за авторством: Gryshkova, V.S., та інші
Опубліковано: (2009)

Природа и возможные механизмы образования потенциальных мутаций, возникающих при появлении тиминовых димеров после облучения двухцепочечной ДНК ультрафиолетовым светом
за авторством: Гребнева, Е.А.
Опубліковано: (2002)

Модели электронного строения флавопротеидов и механизм действия оксидаз
за авторством: Минаев, Б.Ф., та інші
Опубліковано: (2004)

Исследование структурно-функциональных взаимодействий полиэдрина вируса ядерного полиэдроза тутового шелкопряда (Bombyx mori) с протеазой и РНК полиэдров. 3. Полиэдры включают малую РНК
за авторством: Козлов, Э.А., та інші
Опубліковано: (2007)

Хитин- и хитозансодержащие комплексы из мицелиальных грибов: получение, свойства, применение
за авторством: Унрод, В.И., та інші
Опубліковано: (2001)

Роль нуклеотидов в позициях 1 и 72 акцепторного стебля тРНКTyr в аминоацилировании тирозил-тРНК синтетазой из печени быка
за авторством: Найденов, В.Г., та інші
Опубліковано: (2002)

Ампліфікація випадково поліморфної ДНК американських тютюнів підроду Petunioides
за авторством: Комарницький, С.І., та інші
Опубліковано: (2002)

Особенности процесса самоассоциации дезоксигексануклеотида 5'-d(GpCpApTpGpC) и его комплексообразования с антрациклиновым антибиотиком дауномицином в водном растворе
за авторством: Веселков, А.Н., та інші
Опубліковано: (2004)

Динаміка зміни вмісту білків теплового шоку в лізаті клітин слизової оболонки шлунка щурів під час розвитку експериментального хронічного атрофічного гастриту
за авторством: Мандрик, С.Я., та інші
Опубліковано: (2008)