Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation

• Published in: Біополімери і клітина
• Date: 2006
• Main Authors: Pydiura, N.A., Tereshchenko, F.A., Kornelyuk, A.I.
• Format: Article
• Language: English
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2006
• Subjects: Структура та функції біополімерів
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156882
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation / N.A. Pydiura, F.A. Tereshchenko, A.I. Kornelyuk // Біополімери і клітина. — 2006. — Т. 22, № 6. — С. 433-438. — Бібліогр.: 29 назв. — англ.

Here we report a study of molecular dynamics of a YCD2 fragment of mammalian tyrosyl-tRNA synthethase (Asp322-Ser528), which includes the COOH-terminal cytokine-like domain, intermodular flexible linker, and H5-α-helix of catalytic core of synthetase. Our calculations show that while compact C-termi...