Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate
Цель. 8-оксоаденин – распространенное поврежденное основание, ассоциированное с онкологическими и нейродегенеративными заболеваниями. Оно может возникать вследствие непосредственного окисления аденина в ДНК или при включении окисленного dNTP. Методы. Разработан эффективный способ синтеза 8-оксо-2�...
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2012 |
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2012
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156932 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate / I.R. Grin, S.V. Vasilyeva, A.P. Dovgerd, V.N. Silnikov, D.O. Zharkov // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 306-309. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862548656168632320 |
|---|---|
| author | Grin, I.R. Vasilyeva, S.V. Dovgerd, A.P. Silnikov, V.N. Zharkov, D.O. |
| author_facet | Grin, I.R. Vasilyeva, S.V. Dovgerd, A.P. Silnikov, V.N. Zharkov, D.O. |
| citation_txt | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate / I.R. Grin, S.V. Vasilyeva, A.P. Dovgerd, V.N. Silnikov, D.O. Zharkov // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 306-309. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Цель. 8-оксоаденин – распространенное поврежденное основание, ассоциированное с онкологическими и нейродегенеративными заболеваниями. Оно может возникать вследствие непосредственного окисления аденина в ДНК или при включении окисленного dNTP. Методы. Разработан эффективный способ синтеза 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфата и изучено его включение в ДНК разными ДНК-полимеразами. Результаты. Фрагмент Кленова ДНК-полимеразы I с невысокой эффективностью включал oA напротив гуанина. Для ДНК-полимеразы наблюдалось ограниченное включение oA напротив гуанина и аденина, а для ДНК-полимеразы b – напротив аденина, тимина и гуанина. Выводы. Как источник oA в геноме окисление аденина в ДНК может иметь большее значение, чем окисление dATP.
Kлючевые слова: мутагенез, повреждение ДНК, оксидативный стресс, 8-оксоаденин, ДНК полимеразы.
Мета. 8-оксоаденін – розповсюджена пошкоджена основа, асо- ційована з онкологічними і нейродегенеративними захворюваннями. Воно може виникати внаслідок безпосереднього окиснення аденіну в ДНК або при вбудовуванні окисненого dNTP. Методи. Розроблено ефективний спосіб синтезу 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфату і вивчено його включення в ДНК різними ДНК- полімеразами. Результати. Фрагмент Кленова ДНК-полі- мерази I з невисокою ефективністю включав oA навпроти гуаніну. Для ДНК-полімерази спостерігалося обмежене включення oA навпроти гуаніну і аденіну, а для ДНК-полімерази b – навпроти аденіну, тиміну і гуаніну. Висновки. Як джерело oA в геномі окиснення аденіну в ДНК може мати більше значення, ніж окиснення dATP.
Ключові слова: мутагенез, пошкодження ДНК, оксидативний стрес, 8-оксоаденін, ДНК-полімерази.
Aim. 8-Oxoadenine is an abundant DNA lesion associated with cancer and neurodegeneration. It may appear through direct oxidation of adenine in DNA or by incorporation from the oxidized dNTP pool. Methods. We developed an efficient method of synthesizing 8-oxo-2'-deoxyadenosine-5'-triphosphate and studied its incorporation by various DNA polymerases. Results. oA was weakly misincorporated opposite guanine by the DNA polymerase I Klenow fragment. Limited incorporation of oA was observed opposite guanine and adenine with DNA polymerase a, and opposite adenine, thymine and guanine with DNA polymerase b. Conclusions. Adenine oxidation in DNA may outweigh damage to dATP as a source of genomic oA.
Keywords: mutagenesis, DNA damage, oxidative stress, 8-oxoadenine, DNA polymerases.
|
| first_indexed | 2025-11-25T19:05:24Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156932 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-11-25T19:05:24Z |
| publishDate | 2012 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Grin, I.R. Vasilyeva, S.V. Dovgerd, A.P. Silnikov, V.N. Zharkov, D.O. 2019-06-19T10:58:49Z 2019-06-19T10:58:49Z 2012 Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate / I.R. Grin, S.V. Vasilyeva, A.P. Dovgerd, V.N. Silnikov, D.O. Zharkov // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 306-309. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. 0233-7657 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156932 577.213.38 Цель. 8-оксоаденин – распространенное поврежденное основание, ассоциированное с онкологическими и нейродегенеративными заболеваниями. Оно может возникать вследствие непосредственного окисления аденина в ДНК или при включении окисленного dNTP. Методы. Разработан эффективный способ синтеза 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфата и изучено его включение в ДНК разными ДНК-полимеразами. Результаты. Фрагмент Кленова ДНК-полимеразы I с невысокой эффективностью включал oA напротив гуанина. Для ДНК-полимеразы наблюдалось ограниченное включение oA напротив гуанина и аденина, а для ДНК-полимеразы b – напротив аденина, тимина и гуанина. Выводы. Как источник oA в геноме окисление аденина в ДНК может иметь большее значение, чем окисление dATP.
 Kлючевые слова: мутагенез, повреждение ДНК, оксидативный стресс, 8-оксоаденин, ДНК полимеразы. Мета. 8-оксоаденін – розповсюджена пошкоджена основа, асо- ційована з онкологічними і нейродегенеративними захворюваннями. Воно може виникати внаслідок безпосереднього окиснення аденіну в ДНК або при вбудовуванні окисненого dNTP. Методи. Розроблено ефективний спосіб синтезу 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфату і вивчено його включення в ДНК різними ДНК- полімеразами. Результати. Фрагмент Кленова ДНК-полі- мерази I з невисокою ефективністю включав oA навпроти гуаніну. Для ДНК-полімерази спостерігалося обмежене включення oA навпроти гуаніну і аденіну, а для ДНК-полімерази b – навпроти аденіну, тиміну і гуаніну. Висновки. Як джерело oA в геномі окиснення аденіну в ДНК може мати більше значення, ніж окиснення dATP.
 Ключові слова: мутагенез, пошкодження ДНК, оксидативний стрес, 8-оксоаденін, ДНК-полімерази. Aim. 8-Oxoadenine is an abundant DNA lesion associated with cancer and neurodegeneration. It may appear through direct oxidation of adenine in DNA or by incorporation from the oxidized dNTP pool. Methods. We developed an efficient method of synthesizing 8-oxo-2'-deoxyadenosine-5'-triphosphate and studied its incorporation by various DNA polymerases. Results. oA was weakly misincorporated opposite guanine by the DNA polymerase I Klenow fragment. Limited incorporation of oA was observed opposite guanine and adenine with DNA polymerase a, and opposite adenine, thymine and guanine with DNA polymerase b. Conclusions. Adenine oxidation in DNA may outweigh damage to dATP as a source of genomic oA.
 Keywords: mutagenesis, DNA damage, oxidative stress, 8-oxoadenine, DNA polymerases. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Short Communications Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate Дискримінація 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфату ДНК-полімеразами бактерій і людини Дискриминация 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфата ДНК-полимеразами бактерий и человека Article published earlier |
| spellingShingle | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate Grin, I.R. Vasilyeva, S.V. Dovgerd, A.P. Silnikov, V.N. Zharkov, D.O. Short Communications |
| title | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| title_alt | Дискримінація 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфату ДНК-полімеразами бактерій і людини Дискриминация 8-оксо-2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфата ДНК-полимеразами бактерий и человека |
| title_full | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| title_fullStr | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| title_full_unstemmed | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| title_short | Human and bacterial DNA polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| title_sort | human and bacterial dna polymerases discriminate against 8-oxo-2'-deoxyadenosine- 5'-triphosphate |
| topic | Short Communications |
| topic_facet | Short Communications |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156932 |
| work_keys_str_mv | AT grinir humanandbacterialdnapolymerasesdiscriminateagainst8oxo2deoxyadenosine5triphosphate AT vasilyevasv humanandbacterialdnapolymerasesdiscriminateagainst8oxo2deoxyadenosine5triphosphate AT dovgerdap humanandbacterialdnapolymerasesdiscriminateagainst8oxo2deoxyadenosine5triphosphate AT silnikovvn humanandbacterialdnapolymerasesdiscriminateagainst8oxo2deoxyadenosine5triphosphate AT zharkovdo humanandbacterialdnapolymerasesdiscriminateagainst8oxo2deoxyadenosine5triphosphate AT grinir diskrimínacíâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatudnkpolímerazamibakteríiílûdini AT vasilyevasv diskrimínacíâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatudnkpolímerazamibakteríiílûdini AT dovgerdap diskrimínacíâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatudnkpolímerazamibakteríiílûdini AT silnikovvn diskrimínacíâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatudnkpolímerazamibakteríiílûdini AT zharkovdo diskrimínacíâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatudnkpolímerazamibakteríiílûdini AT grinir diskriminaciâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatadnkpolimerazamibakteriiičeloveka AT vasilyevasv diskriminaciâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatadnkpolimerazamibakteriiičeloveka AT dovgerdap diskriminaciâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatadnkpolimerazamibakteriiičeloveka AT silnikovvn diskriminaciâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatadnkpolimerazamibakteriiičeloveka AT zharkovdo diskriminaciâ8okso2dezoksiadenozin5trifosfatadnkpolimerazamibakteriiičeloveka |