Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure

Инсуляторы были открыты как геномные элементы, способные прерывать связь между промотором и энхансером (энхансер-блокирующая активность) и ограничивать распространение гетерохроматина (барьерная активность). У дрозофилы существует несколько типов инсуляторов, работающих посредством привлечения разли...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Вiopolymers and Cell
Date:2012
Main Authors: Ulianov, S.V., Markova, E.N., Gavrilov, A.A., Razin, S.V.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2012
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156938
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure / S.V. Ulianov, E.N. Markova, A.A. Gavrilov, S.V. Razin // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 252-260. — Бібліогр.: 89 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156938
record_format dspace
spelling Ulianov, S.V.
Markova, E.N.
Gavrilov, A.A.
Razin, S.V.
2019-06-19T11:04:10Z
2019-06-19T11:04:10Z
2012
Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure / S.V. Ulianov, E.N. Markova, A.A. Gavrilov, S.V. Razin // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 252-260. — Бібліогр.: 89 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000057
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156938
577.21
Инсуляторы были открыты как геномные элементы, способные прерывать связь между промотором и энхансером (энхансер-блокирующая активность) и ограничивать распространение гетерохроматина (барьерная активность). У дрозофилы существует несколько типов инсуляторов, работающих посредством привлечения различных белков. Все описанные инсуляторы у позвоночных животных работают при участии многофункционального транскрипционного фактора CTCF. Биологические функции инсуляторов позвоночных животных не вполне ясны. Хотя принято считать, что они разграничивают хроматиновые домены, прямых свидетельств этому практически нет. Наиболее показательным является участие инсуляторов в работе центров установления импринтинга (imprinting choice regions). Результаты ряда недавно опубликованных работ свидетельствуют о том, что для установления импринтинга существенным является встраивание инактивированного гена в отдельный топологический домен (петлю). В этом и многих других случаях инсуляторы работают в качестве архитектурных элементов, поддерживающих трехмерную организацию генома. Взаимодействие между парами инсуляторов, в котором наряду с CTCF значительную роль играет когезин, организует геном в различного рода петли. Ключевые слова: хроматиновый домен, барьерный элемент, энхансер-блокирующий элемент, CTCF, импринтинг.
Інсулятори було відкрито як геномні елементи, здатні переривати зв’язок між промотором і енхансером (активність, яка блокує функціонування енхансера), та обмежувати поширення гетерохроматину (бар’єрна активність). У дрозофіли існує декілька типів інсуляторів, які працюють із залученням різних білків. Всі описані інсулятори у ссавців працюють за участі багатофункціонального транскрипційного фактора CTCF. Біологічні функції інсуляторів ссавців не до кінця з’ясовані. Хоча багато хто вважає, що вони розмежовують хроматинові домени, прямих свідчень цьому практично немає. Найпоказовішою є участь інсуляторів у роботі центрів встановлення імпринтингу (imprinting choice regions). Результати низки недавно опублікованих робіт свідчать про те, що для встановлення імпринтингу суттєвим є вбудовування інактивованого гена в окремий топологічний домен (петлю). В цьому та в багатьох інших випадках інсулятори працюють як архітектурні елементи, які підтримують тривимірну організацію геному. Взаємодія між парами інсуляторів, у яких поряд з CTCF істотну роль відіграє когезин, організує геном у різного роду петлі. Ключові слова: хроматиновий домен, бар’єрний елемент, енхансер-блокуючий елемент, CTCF, імпринтинг.
Insulators were first identified as genomic elements either blocking communication between promoters and enhancers (enhancerblocking activity) or restricting heterochromatin spreading (barrier activity). There are several types of insulators in Drosophila which utilize different proteins. All insulators identified in vertebrates work with the help of the multifunctional transcription factor CTCF. Biological functions of vertebrate insulators are not clear yet. They are supposed to separate chromatin domains albeit there is almost none direct evidence of this fact. The most significant is the participation of insulators in maintenance of centers of imprinting (imprinting choice regions). The results of a number of recently published articles indicate that isolation of a gene by placement of this gene into a separate topological domain (loop) is crucial to establishing imprinting. In this particular case as well as in many other cases insulators serve as architectural elements supporting the three-dimensional structure of genome. Moreover, interaction between pairs of insulators where cohesin plays a pivotal role along with CTCF folds genome into various loops. Keywords: chromatin domain, barrier element, enhancer-blocking element, CTCF, imprinting.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Reviews
Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
Інсулятори ссавців: регуляторні механізми і структура хроматину
Инсуляторы позвоночных животных: регуляторные механизмы и структура хроматина.
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
spellingShingle Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
Ulianov, S.V.
Markova, E.N.
Gavrilov, A.A.
Razin, S.V.
Reviews
title_short Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
title_full Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
title_fullStr Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
title_full_unstemmed Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
title_sort insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
author Ulianov, S.V.
Markova, E.N.
Gavrilov, A.A.
Razin, S.V.
author_facet Ulianov, S.V.
Markova, E.N.
Gavrilov, A.A.
Razin, S.V.
topic Reviews
topic_facet Reviews
publishDate 2012
language English
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Інсулятори ссавців: регуляторні механізми і структура хроматину
Инсуляторы позвоночных животных: регуляторные механизмы и структура хроматина.
description Инсуляторы были открыты как геномные элементы, способные прерывать связь между промотором и энхансером (энхансер-блокирующая активность) и ограничивать распространение гетерохроматина (барьерная активность). У дрозофилы существует несколько типов инсуляторов, работающих посредством привлечения различных белков. Все описанные инсуляторы у позвоночных животных работают при участии многофункционального транскрипционного фактора CTCF. Биологические функции инсуляторов позвоночных животных не вполне ясны. Хотя принято считать, что они разграничивают хроматиновые домены, прямых свидетельств этому практически нет. Наиболее показательным является участие инсуляторов в работе центров установления импринтинга (imprinting choice regions). Результаты ряда недавно опубликованных работ свидетельствуют о том, что для установления импринтинга существенным является встраивание инактивированного гена в отдельный топологический домен (петлю). В этом и многих других случаях инсуляторы работают в качестве архитектурных элементов, поддерживающих трехмерную организацию генома. Взаимодействие между парами инсуляторов, в котором наряду с CTCF значительную роль играет когезин, организует геном в различного рода петли. Ключевые слова: хроматиновый домен, барьерный элемент, энхансер-блокирующий элемент, CTCF, импринтинг. Інсулятори було відкрито як геномні елементи, здатні переривати зв’язок між промотором і енхансером (активність, яка блокує функціонування енхансера), та обмежувати поширення гетерохроматину (бар’єрна активність). У дрозофіли існує декілька типів інсуляторів, які працюють із залученням різних білків. Всі описані інсулятори у ссавців працюють за участі багатофункціонального транскрипційного фактора CTCF. Біологічні функції інсуляторів ссавців не до кінця з’ясовані. Хоча багато хто вважає, що вони розмежовують хроматинові домени, прямих свідчень цьому практично немає. Найпоказовішою є участь інсуляторів у роботі центрів встановлення імпринтингу (imprinting choice regions). Результати низки недавно опублікованих робіт свідчать про те, що для встановлення імпринтингу суттєвим є вбудовування інактивованого гена в окремий топологічний домен (петлю). В цьому та в багатьох інших випадках інсулятори працюють як архітектурні елементи, які підтримують тривимірну організацію геному. Взаємодія між парами інсуляторів, у яких поряд з CTCF істотну роль відіграє когезин, організує геном у різного роду петлі. Ключові слова: хроматиновий домен, бар’єрний елемент, енхансер-блокуючий елемент, CTCF, імпринтинг. Insulators were first identified as genomic elements either blocking communication between promoters and enhancers (enhancerblocking activity) or restricting heterochromatin spreading (barrier activity). There are several types of insulators in Drosophila which utilize different proteins. All insulators identified in vertebrates work with the help of the multifunctional transcription factor CTCF. Biological functions of vertebrate insulators are not clear yet. They are supposed to separate chromatin domains albeit there is almost none direct evidence of this fact. The most significant is the participation of insulators in maintenance of centers of imprinting (imprinting choice regions). The results of a number of recently published articles indicate that isolation of a gene by placement of this gene into a separate topological domain (loop) is crucial to establishing imprinting. In this particular case as well as in many other cases insulators serve as architectural elements supporting the three-dimensional structure of genome. Moreover, interaction between pairs of insulators where cohesin plays a pivotal role along with CTCF folds genome into various loops. Keywords: chromatin domain, barrier element, enhancer-blocking element, CTCF, imprinting.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156938
citation_txt Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure / S.V. Ulianov, E.N. Markova, A.A. Gavrilov, S.V. Razin // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 4. — С. 252-260. — Бібліогр.: 89 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT ulianovsv insulatorsinvertebratesregulatorymechanismsandchromatinstructure
AT markovaen insulatorsinvertebratesregulatorymechanismsandchromatinstructure
AT gavrilovaa insulatorsinvertebratesregulatorymechanismsandchromatinstructure
AT razinsv insulatorsinvertebratesregulatorymechanismsandchromatinstructure
AT ulianovsv ínsulâtorissavcívregulâtornímehanízmiístrukturahromatinu
AT markovaen ínsulâtorissavcívregulâtornímehanízmiístrukturahromatinu
AT gavrilovaa ínsulâtorissavcívregulâtornímehanízmiístrukturahromatinu
AT razinsv ínsulâtorissavcívregulâtornímehanízmiístrukturahromatinu
AT ulianovsv insulâtorypozvonočnyhživotnyhregulâtornyemehanizmyistrukturahromatina
AT markovaen insulâtorypozvonočnyhživotnyhregulâtornyemehanizmyistrukturahromatina
AT gavrilovaa insulâtorypozvonočnyhživotnyhregulâtornyemehanizmyistrukturahromatina
AT razinsv insulâtorypozvonočnyhživotnyhregulâtornyemehanizmyistrukturahromatina
first_indexed 2025-11-30T03:03:36Z
last_indexed 2025-11-30T03:03:36Z
_version_ 1850856157678141440