Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, я...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Дата: | 2007 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2007
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та
 його комплексу з тРНК методами часороздільної
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862672785998872576 |
|---|---|
| author | Кордиш, М.О. Кирюшко, Г.В. Мелі, І. Корнелюк, О.І. |
| author_facet | Кордиш, М.О. Кирюшко, Г.В. Мелі, І. Корнелюк, О.І. |
| citation_txt | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та
 його комплексу з тРНК методами часороздільної
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, який, однак, локалізований поза РНК-зв' язувальним сайтом. Методом сайт-спрямованого мутагенезу в РНК-зв'язувальний сайт було введено додатковий флюорофор за рахунок заміни консервативного ароматичного залишку Phe27 на Trp127. Досліджено взаємодію С-модуля з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії. Порівняльний аналіз параметрів затухання флуоресценції мутантного С-модуля із заміною Phe127→ Trp та його комплексу з тРНК дозволив виявити додаткову короткоіснуючу компоненту триптофанової флуоресценції за присутності нуклеїнової кислоти без суттєвих змін інших параметрів. Отримані дані свідчать про поліморфність мікрооточення залишку Trp 127 у комплексі, обумовлену динамічним механізмом взаємодії білка з нуклеїновою кислотою
The non-catalytic C-module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase displays both RNA-binding ability and cytokine activity. C-module contains a unique tryptophan residue (Trpl44), located out of RNA-binding site and a conservative aromatic residue Phe127 located inside of its RNA-binding site. Phe127 was replaced by fluorophore Trp 127 using the method of site-directed mutagenesis. The interaction of C-module with tRNA was investigated by time-resolved fluorescence spectroscopy. Obtained fluorescence decay parameters of Trp144 and Trp127 of C-module and its complex with tRNA are characterized by the additional short-lived component without any significant changing of other fluorescence parameters in the presence of nucleic acid. These data indicate the existence of the polymorphism of Trp 127 microenvironment that is conditioned by the dynamic protein-nucleic acid interaction mechanism.
С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих проявляет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и после протеолитического отщепления от N-концевого каталитического кора синтетазы проявляет ЕМ АР Н-подобную цитокиновую активность. В его структуру входит природный флюорофор Trp 144, который, однако, локализован вне РНК-связывающего сайта. Методом сайт-направленного мутагенеза в РНК-связывающий сайт был введен дополнительный флюорофор за счет замещения консервативного ароматического остатка Phel27 на Тгр127. Проведено исследование взаимодействия С-модуля с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением. Сравнительный анализ параметров затухания флуоресценции мутантного С-модуля с заменой Phe127→Trp и его комплекса с тРНК позволил обнаружить дополнительную короткоживущую компоненту триптофановой флуоресценции в присутствии нуклеиновой кислоты без существенных изменений других параметров. Полученные данные свидетельствуют о полиморфности микроокружения остатка Trp127 в комплексе, обуловленной динамическим механизмом взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой
|
| first_indexed | 2025-12-07T15:37:29Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156981 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T15:37:29Z |
| publishDate | 2007 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Кордиш, М.О. Кирюшко, Г.В. Мелі, І. Корнелюк, О.І. 2019-06-19T12:17:23Z 2019-06-19T12:17:23Z 2007 Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та
 його комплексу з тРНК методами часороздільної
 флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ. 0233-7657 http://dx.doi.org/10.7124/bc.00075F https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981 577.322 С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, який, однак, локалізований поза РНК-зв' язувальним сайтом. Методом сайт-спрямованого мутагенезу в РНК-зв'язувальний сайт було введено додатковий флюорофор за рахунок заміни консервативного ароматичного залишку Phe27 на Trp127. Досліджено взаємодію С-модуля з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії. Порівняльний аналіз параметрів затухання флуоресценції мутантного С-модуля із заміною Phe127→ Trp та його комплексу з тРНК дозволив виявити додаткову короткоіснуючу компоненту триптофанової флуоресценції за присутності нуклеїнової кислоти без суттєвих змін інших параметрів. Отримані дані свідчать про поліморфність мікрооточення залишку Trp 127 у комплексі, обумовлену динамічним механізмом взаємодії білка з нуклеїновою кислотою The non-catalytic C-module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase displays both RNA-binding ability and cytokine activity. C-module contains a unique tryptophan residue (Trpl44), located out of RNA-binding site and a conservative aromatic residue Phe127 located inside of its RNA-binding site. Phe127 was replaced by fluorophore Trp 127 using the method of site-directed mutagenesis. The interaction of C-module with tRNA was investigated by time-resolved fluorescence spectroscopy. Obtained fluorescence decay parameters of Trp144 and Trp127 of C-module and its complex with tRNA are characterized by the additional short-lived component without any significant changing of other fluorescence parameters in the presence of nucleic acid. These data indicate the existence of the polymorphism of Trp 127 microenvironment that is conditioned by the dynamic protein-nucleic acid interaction mechanism. С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих проявляет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и после протеолитического отщепления от N-концевого каталитического кора синтетазы проявляет ЕМ АР Н-подобную цитокиновую активность. В его структуру входит природный флюорофор Trp 144, который, однако, локализован вне РНК-связывающего сайта. Методом сайт-направленного мутагенеза в РНК-связывающий сайт был введен дополнительный флюорофор за счет замещения консервативного ароматического остатка Phel27 на Тгр127. Проведено исследование взаимодействия С-модуля с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением. Сравнительный анализ параметров затухания флуоресценции мутантного С-модуля с заменой Phe127→Trp и его комплекса с тРНК позволил обнаружить дополнительную короткоживущую компоненту триптофановой флуоресценции в присутствии нуклеиновой кислоты без существенных изменений других параметров. Полученные данные свидетельствуют о полиморфности микроокружения остатка Trp127 в комплексе, обуловленной динамическим механизмом взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой Автори висловлюють щиру подяку д-ру Г. Дюпорталю та д-ру Е. Пьємону за надану технічну допомогу у проведенні флуоресцентних вимірювань, а також Д. Б. Ковальському — за побудову моделі комплексу С-модуля з тРНК та обговорення результатів. Роботу виконано за фінансової підтримки гранта № 5.07/200 Державного фонду фундаментальних досліджень Міністерства освіти та науки України. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Молекулярна біофізика Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії Исследование конформационной подвижности С-модуля тирозил-тРНК синтетазы и его комплекса с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением Conformational mobility investigation of tyrosyl-tRNA synthetase C-module and its complex with tRNA using the methods of time-resolved fluorescence spectroscopy Article published earlier |
| spellingShingle | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії Кордиш, М.О. Кирюшко, Г.В. Мелі, І. Корнелюк, О.І. Молекулярна біофізика |
| title | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| title_alt | Исследование конформационной подвижности С-модуля тирозил-тРНК синтетазы и его комплекса с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением Conformational mobility investigation of tyrosyl-tRNA synthetase C-module and its complex with tRNA using the methods of time-resolved fluorescence spectroscopy |
| title_full | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| title_fullStr | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| title_full_unstemmed | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| title_short | Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| title_sort | дослідження конформаційної рухливості с-модуля тирозил-трнк синтетази та його комплексу з трнк методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії |
| topic | Молекулярна біофізика |
| topic_facet | Молекулярна біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981 |
| work_keys_str_mv | AT kordišmo doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí AT kirûškogv doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí AT melíí doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí AT kornelûkoí doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí AT kordišmo issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem AT kirûškogv issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem AT melíí issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem AT kornelûkoí issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem AT kordišmo conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy AT kirûškogv conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy AT melíí conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy AT kornelûkoí conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy |