Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії

Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії

С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, я...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2007
Hauptverfasser: Кордиш, М.О., Кирюшко, Г.В., Мелі, І., Корнелюк, О.І.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2007
Schlagworte:
Молекулярна біофізика
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-156981
record_format dspace
spelling Кордиш, М.О.
Кирюшко, Г.В.
Мелі, І.
Корнелюк, О.І.
2019-06-19T12:17:23Z
2019-06-19T12:17:23Z
2007
Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ.
0233-7657
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00075F
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981
577.322
С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, який, однак, локалізований поза РНК-зв' язувальним сайтом. Методом сайт-спрямованого мутагенезу в РНК-зв'язувальний сайт було введено додатковий флюорофор за рахунок заміни консервативного ароматичного залишку Phe27 на Trp127. До­сліджено взаємодію С-модуля з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії. Порівняльний аналіз параметрів затухання флуоресценції мутантного С-модуля із заміною Phe127→ Trp та його комплексу з тРНК дозволив виявити додаткову короткоіснуючу компонен­ту триптофанової флуоресценції за присутності нуклеїнової кислоти без суттєвих змін інших параметрів. Отримані дані свідчать про поліморфність мікрооточення залишку Trp 127 у комплексі, обумовлену динамічним механізмом взаємодії білка з нуклеїновою кислотою
The non-catalytic C-module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase displays both RNA-binding ability and cytokine activity. C-module contains a unique tryptophan residue (Trpl44), located out of RNA-binding site and a conservative aromatic residue Phe127 located inside of its RNA-binding site. Phe127 was replaced by fluorophore Trp 127 using the method of site-directed mutagenesis. The interaction of C-module with tRNA was investigated by time-resolved fluorescence spectroscopy. Obtained fluorescence decay parameters of Trp144 and Trp127 of C-module and its complex with tRNA are characterized by the additional short-lived component without any significant changing of other fluorescence parameters in the presence of nucleic acid. These data indicate the existence of the polymorphism of Trp 127 microenvironment that is conditioned by the dynamic protein-nucleic acid interaction mechanism.
С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих прояв­ляет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и после протеолитического отщепления от N-концевого каталитического кора синтетазы проявляет ЕМ АР Н-подобную цитокиновую активность. В его структуру вхо­дит природный флюорофор Trp 144, который, однако, локали­зован вне РНК-связывающего сайта. Методом сайт-направ­ленного мутагенеза в РНК-связывающий сайт был введен дополнительный флюорофор за счет замещения консерватив­ного ароматического остатка Phel27 на Тгр127. Проведено исследование взаимодействия С-модуля с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением. Сравнительный анализ параметров затухания флуоресценции мутантного С-модуля с заменой Phe127→Trp и его комплекса с тРНК позволил обнаружить дополнительную короткоживущую компоненту триптофановой флуоресценции в присутст­вии нуклеиновой кислоты без существенных изменений других параметров. Полученные данные свидетельствуют о полиморфности микроокружения остатка Trp127 в комплексе, обуловленной динамическим механизмом взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой
Автори висловлюють щиру подяку д-ру Г. Дюпорталю та д-ру Е. Пьємону за надану технічну допомогу у проведенні флуоресцентних вимірювань, а також Д. Б. Ковальському — за побудову моделі комплексу С-модуля з тРНК та обговорення результатів. Роботу виконано за фінансової підтримки гранта № 5.07/200 Державного фонду фундаментальних досліджень Міністерства освіти та науки України.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Молекулярна біофізика
Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
Исследование конформационной подвижности С-модуля тирозил-тРНК синтетазы и его комплекса с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением
Conformational mobility investigation of tyrosyl-tRNA synthetase C-module and its complex with tRNA using the methods of time-resolved fluorescence spectroscopy
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
spellingShingle Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
Кордиш, М.О.
Кирюшко, Г.В.
Мелі, І.
Корнелюк, О.І.
Молекулярна біофізика
title_short Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
title_full Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
title_fullStr Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
title_full_unstemmed Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
title_sort дослідження конформаційної рухливості с-модуля тирозил-трнк синтетази та його комплексу з трнк методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
author Кордиш, М.О.
Кирюшко, Г.В.
Мелі, І.
Корнелюк, О.І.
author_facet Кордиш, М.О.
Кирюшко, Г.В.
Мелі, І.
Корнелюк, О.І.
topic Молекулярна біофізика
topic_facet Молекулярна біофізика
publishDate 2007
language Ukrainian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Исследование конформационной подвижности С-модуля тирозил-тРНК синтетазы и его комплекса с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением
Conformational mobility investigation of tyrosyl-tRNA synthetase C-module and its complex with tRNA using the methods of time-resolved fluorescence spectroscopy
description С-модуль тирозил-тРНК синтетази ссавців виконує подвійну функцію: бере участь у зв'язуванні тРНК як цис-фактор та після протеолітичного відщеплення від N-кінцевого каталітичного кора синтетази проявляє ЕМАР ІІ-подібну цитокінову активність. У його структуру входить природний флюорофор Тгр144, який, однак, локалізований поза РНК-зв' язувальним сайтом. Методом сайт-спрямованого мутагенезу в РНК-зв'язувальний сайт було введено додатковий флюорофор за рахунок заміни консервативного ароматичного залишку Phe27 на Trp127. До­сліджено взаємодію С-модуля з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії. Порівняльний аналіз параметрів затухання флуоресценції мутантного С-модуля із заміною Phe127→ Trp та його комплексу з тРНК дозволив виявити додаткову короткоіснуючу компонен­ту триптофанової флуоресценції за присутності нуклеїнової кислоти без суттєвих змін інших параметрів. Отримані дані свідчать про поліморфність мікрооточення залишку Trp 127 у комплексі, обумовлену динамічним механізмом взаємодії білка з нуклеїновою кислотою The non-catalytic C-module of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase displays both RNA-binding ability and cytokine activity. C-module contains a unique tryptophan residue (Trpl44), located out of RNA-binding site and a conservative aromatic residue Phe127 located inside of its RNA-binding site. Phe127 was replaced by fluorophore Trp 127 using the method of site-directed mutagenesis. The interaction of C-module with tRNA was investigated by time-resolved fluorescence spectroscopy. Obtained fluorescence decay parameters of Trp144 and Trp127 of C-module and its complex with tRNA are characterized by the additional short-lived component without any significant changing of other fluorescence parameters in the presence of nucleic acid. These data indicate the existence of the polymorphism of Trp 127 microenvironment that is conditioned by the dynamic protein-nucleic acid interaction mechanism. С-модуль тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих прояв­ляет двойную функцию: участвует в связывании тРНК как цис-фактор и после протеолитического отщепления от N-концевого каталитического кора синтетазы проявляет ЕМ АР Н-подобную цитокиновую активность. В его структуру вхо­дит природный флюорофор Trp 144, который, однако, локали­зован вне РНК-связывающего сайта. Методом сайт-направ­ленного мутагенеза в РНК-связывающий сайт был введен дополнительный флюорофор за счет замещения консерватив­ного ароматического остатка Phel27 на Тгр127. Проведено исследование взаимодействия С-модуля с тРНК методами флуоресцентной спектроскопии с временным разрешением. Сравнительный анализ параметров затухания флуоресценции мутантного С-модуля с заменой Phe127→Trp и его комплекса с тРНК позволил обнаружить дополнительную короткоживущую компоненту триптофановой флуоресценции в присутст­вии нуклеиновой кислоты без существенных изменений других параметров. Полученные данные свидетельствуют о полиморфности микроокружения остатка Trp127 в комплексе, обуловленной динамическим механизмом взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/156981
citation_txt Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії / М.О. Кордиш, Г.В. Кирюшко, І. Мелі, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 2. — С. 130-136. — Бібліогр.: 17 назв. — укр., англ.
work_keys_str_mv AT kordišmo doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí
AT kirûškogv doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí
AT melíí doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí
AT kornelûkoí doslídžennâkonformacíinoíruhlivostísmodulâtiroziltrnksintetazitaiogokompleksuztrnkmetodamičasorozdílʹnoífluorescentnoíspektroskopíí
AT kordišmo issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem
AT kirûškogv issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem
AT melíí issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem
AT kornelûkoí issledovaniekonformacionnoipodvižnostismodulâtiroziltrnksintetazyiegokompleksastrnkmetodamifluorescentnoispektroskopiisvremennymrazrešeniem
AT kordišmo conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy
AT kirûškogv conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy
AT melíí conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy
AT kornelûkoí conformationalmobilityinvestigationoftyrosyltrnasynthetasecmoduleanditscomplexwithtrnausingthemethodsoftimeresolvedfluorescencespectroscopy
first_indexed 2025-12-07T15:37:29Z
last_indexed 2025-12-07T15:37:29Z
_version_ 1850864408333385728

Ähnliche Einträge