Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека

Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека

Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движе...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2007
Hauptverfasser: Каниболоцкий, Д.С., Новосильная, А.В., Негруцкий, Б.С., Ельская, А.В.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2007
Schlagworte:
Структура та функції біополімерів
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157495
record_format dspace
spelling Каниболоцкий, Д.С.
Новосильная, А.В.
Негруцкий, Б.С.
Ельская, А.В.
2019-06-20T04:13:13Z
2019-06-20T04:13:13Z
2007
Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00076E
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495
577.152.61
Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движения атомов. Определено, что взаимные движения первого и второго доменов могут приводить к закрытию щели между доменами и образованию новой «закрытой» конформации. Описаны аминокислотные остатки, обладающие наибольшей подвижностью Ca-атомов.
Методом моделювання за гомологією побудовано модель ізоформи eEF1A1 фактора елонгації трансляції людини. Конформаційну рухливість eEF1A1 вивчено методом багаторазового моделювання молекулярної динаміки. З використанням коваріаційного аналізу виділено найістотніші узгоджені рухи атомів. Визначено, що взаємні рухи першого и другого доменів можуть призводити до закриття щілини між доменами та до утворення нової «замкненої» конформації. Описано амінокислотні залишки з найбільшою рухливістю Ca-атомів.
A model of the eEF1A1 isoform of human translation elongation factor 1A has been proposed using a homology modelling method. The conformational mobility of eEF1A1 has been studied by means of multiple molecular dynamics simulation. The most essential coordinated motions in the protein have been identified using the covariance analysis of atom trajectories. It has been determined that reciprocal flexibility of domains I and II can lead to disappearance of the gap between the domains and to formation of a «closed» conformation of the protein. The amino acid residues, which are characterised by maximal flexibility of C6-atoms, have been described.
The in ves ti ga tion was par tially spon sored by Wellcome Trust Foun da tion (UK) and State Foun da - tion for Fun da men tal Re search, Min is try of Sci ence and Ed u ca tion of Ukraine.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
Конформаційна рухливість фактора елонгації трансляції eEF1A1 людини
Conformational mobility of human translation elongation factor A1
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
spellingShingle Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
Каниболоцкий, Д.С.
Новосильная, А.В.
Негруцкий, Б.С.
Ельская, А.В.
Структура та функції біополімерів
title_short Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
title_full Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
title_fullStr Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
title_full_unstemmed Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
title_sort конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eef1a1 человека
author Каниболоцкий, Д.С.
Новосильная, А.В.
Негруцкий, Б.С.
Ельская, А.В.
author_facet Каниболоцкий, Д.С.
Новосильная, А.В.
Негруцкий, Б.С.
Ельская, А.В.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2007
language Russian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Конформаційна рухливість фактора елонгації трансляції eEF1A1 людини
Conformational mobility of human translation elongation factor A1
description Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движения атомов. Определено, что взаимные движения первого и второго доменов могут приводить к закрытию щели между доменами и образованию новой «закрытой» конформации. Описаны аминокислотные остатки, обладающие наибольшей подвижностью Ca-атомов. Методом моделювання за гомологією побудовано модель ізоформи eEF1A1 фактора елонгації трансляції людини. Конформаційну рухливість eEF1A1 вивчено методом багаторазового моделювання молекулярної динаміки. З використанням коваріаційного аналізу виділено найістотніші узгоджені рухи атомів. Визначено, що взаємні рухи першого и другого доменів можуть призводити до закриття щілини між доменами та до утворення нової «замкненої» конформації. Описано амінокислотні залишки з найбільшою рухливістю Ca-атомів. A model of the eEF1A1 isoform of human translation elongation factor 1A has been proposed using a homology modelling method. The conformational mobility of eEF1A1 has been studied by means of multiple molecular dynamics simulation. The most essential coordinated motions in the protein have been identified using the covariance analysis of atom trajectories. It has been determined that reciprocal flexibility of domains I and II can lead to disappearance of the gap between the domains and to formation of a «closed» conformation of the protein. The amino acid residues, which are characterised by maximal flexibility of C6-atoms, have been described.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495
citation_txt Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ.
work_keys_str_mv AT kanibolockiids konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka
AT novosilʹnaâav konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka
AT negruckiibs konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka
AT elʹskaâav konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka
AT kanibolockiids konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini
AT novosilʹnaâav konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini
AT negruckiibs konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini
AT elʹskaâav konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini
AT kanibolockiids conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1
AT novosilʹnaâav conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1
AT negruckiibs conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1
AT elʹskaâav conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1
first_indexed 2025-11-28T17:37:46Z
last_indexed 2025-11-28T17:37:46Z
_version_ 1850854020346806272

Ähnliche Einträge