Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека
Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движе...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Дата: | 2007 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2007
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862609050353532928 |
|---|---|
| author | Каниболоцкий, Д.С. Новосильная, А.В. Негруцкий, Б.С. Ельская, А.В. |
| author_facet | Каниболоцкий, Д.С. Новосильная, А.В. Негруцкий, Б.С. Ельская, А.В. |
| citation_txt | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движения атомов. Определено, что взаимные движения первого и второго доменов могут приводить к закрытию щели между доменами и образованию новой «закрытой» конформации. Описаны аминокислотные остатки, обладающие наибольшей подвижностью Ca-атомов.
Методом моделювання за гомологією побудовано модель ізоформи eEF1A1 фактора елонгації трансляції людини. Конформаційну рухливість eEF1A1 вивчено методом багаторазового моделювання молекулярної динаміки. З використанням коваріаційного аналізу виділено найістотніші узгоджені рухи атомів. Визначено, що взаємні рухи першого и другого доменів можуть призводити до закриття щілини між доменами та до утворення нової «замкненої» конформації. Описано амінокислотні залишки з найбільшою рухливістю Ca-атомів.
A model of the eEF1A1 isoform of human translation elongation factor 1A has been proposed using a homology modelling method. The conformational mobility of eEF1A1 has been studied by means of multiple molecular dynamics simulation. The most essential coordinated motions in the protein have been identified using the covariance analysis of atom trajectories. It has been determined that reciprocal flexibility of domains I and II can lead to disappearance of the gap between the domains and to formation of a «closed» conformation of the protein. The amino acid residues, which are characterised by maximal flexibility of C6-atoms, have been described.
|
| first_indexed | 2025-11-28T17:37:46Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157495 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-28T17:37:46Z |
| publishDate | 2007 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Каниболоцкий, Д.С. Новосильная, А.В. Негруцкий, Б.С. Ельская, А.В. 2019-06-20T04:13:13Z 2019-06-20T04:13:13Z 2007 Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека / Д.С. Каниболоцкий, А.В. Новосильная, Б.С. Негруцкий, А.В. Ельская // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 4. — С. 307-317. — Бібліогр.: 33 назв. — рос., англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00076E https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495 577.152.61 Методом моделирования по гомологии построена модель изоформы eEF1A1 фактора элонгации трансляции человека. Конформационная подвижность eEF1A1 изучена методом многократного моделирования молекулярной динамики. С использованием ковариационного анализа выделены наиболее существенные согласованные движения атомов. Определено, что взаимные движения первого и второго доменов могут приводить к закрытию щели между доменами и образованию новой «закрытой» конформации. Описаны аминокислотные остатки, обладающие наибольшей подвижностью Ca-атомов. Методом моделювання за гомологією побудовано модель ізоформи eEF1A1 фактора елонгації трансляції людини. Конформаційну рухливість eEF1A1 вивчено методом багаторазового моделювання молекулярної динаміки. З використанням коваріаційного аналізу виділено найістотніші узгоджені рухи атомів. Визначено, що взаємні рухи першого и другого доменів можуть призводити до закриття щілини між доменами та до утворення нової «замкненої» конформації. Описано амінокислотні залишки з найбільшою рухливістю Ca-атомів. A model of the eEF1A1 isoform of human translation elongation factor 1A has been proposed using a homology modelling method. The conformational mobility of eEF1A1 has been studied by means of multiple molecular dynamics simulation. The most essential coordinated motions in the protein have been identified using the covariance analysis of atom trajectories. It has been determined that reciprocal flexibility of domains I and II can lead to disappearance of the gap between the domains and to formation of a «closed» conformation of the protein. The amino acid residues, which are characterised by maximal flexibility of C6-atoms, have been described. The in ves ti ga tion was par tially spon sored by
 Wellcome Trust Foun da tion (UK) and State Foun da -
 tion for Fun da men tal Re search, Min is try of Sci ence
 and Ed u ca tion of Ukraine. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Структура та функції біополімерів Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека Конформаційна рухливість фактора елонгації трансляції eEF1A1 людини Conformational mobility of human translation elongation factor A1 Article published earlier |
| spellingShingle | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека Каниболоцкий, Д.С. Новосильная, А.В. Негруцкий, Б.С. Ельская, А.В. Структура та функції біополімерів |
| title | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека |
| title_alt | Конформаційна рухливість фактора елонгації трансляції eEF1A1 людини Conformational mobility of human translation elongation factor A1 |
| title_full | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека |
| title_fullStr | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека |
| title_full_unstemmed | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека |
| title_short | Конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eEF1A1 человека |
| title_sort | конформационная подвижность фактора элонгации трансляции eef1a1 человека |
| topic | Структура та функції біополімерів |
| topic_facet | Структура та функції біополімерів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157495 |
| work_keys_str_mv | AT kanibolockiids konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka AT novosilʹnaâav konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka AT negruckiibs konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka AT elʹskaâav konformacionnaâpodvižnostʹfaktoraélongaciitranslâciieef1a1čeloveka AT kanibolockiids konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini AT novosilʹnaâav konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini AT negruckiibs konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini AT elʹskaâav konformacíinaruhlivístʹfaktoraelongacíítranslâcííeef1a1lûdini AT kanibolockiids conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1 AT novosilʹnaâav conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1 AT negruckiibs conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1 AT elʹskaâav conformationalmobilityofhumantranslationelongationfactora1 |