Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с ДНК

• Date: 2007
• Main Authors: Ермак, Е.Л., Круглова, Е.Б., Пальчиковская, Л.И., Алексеева, И.В.
• Format: Article
• Language: Russian
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2007
• Series: Біополімери і клітина
• Subjects: Молекулярна біофізика
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157523
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с ДНК / Е.Л. Ермак, Е.Б. Круглова, Л.И. Пальчиковская, И.В. Алексеева // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 6. — С. 529-537. — Бібліогр.: 32 назв. — рос., англ.

Для выяснения механизмов связывания цитидина и его биологически активных производных с ДНК исследовано их взаимодействие с ДНК в присутствии интеркалятора бромистого этидия (ЭБ). Проведен спектрофотометрический анализ электронных спектров поглощения смесей ЭБ–ДНК в присутствии цитидина и его аналогов в широкой области длин волн и концентраций ДНК. Аналоги цитидина, содержащие дополнительный атом азота в гетероцикле (6AZC, AZAfur и AZAxyl), конкурируют с ЭБ за места связывания на ДНК. Константы ассоциации и параметры мест связывания образующихся комплексов для этих производных рассчитаны с помощью программ оптимизации спектров поглощения смесей ЭБ–ДНК–нуклеозид COMP и DALSMOD. Немодифицированные по цитозиновому кольцу нуклеозиды (цитидин и Ara-C) не являются конкурентами ЭБ за места связывания на ДНК, однако в их присутствии изменяются концентрационные зависимости кривых титрования ЭБ в области низких концентраций ДНК. Это можно объяснить влиянием упомянутых нуклеозидов на структурные или конформационные изменения матрицы ДНК в присутствии ЭБ в области низких значений P/DЭБ, где P/DЭБ – отношение общих концентраций ДНК и ЭБ.