The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation
It was unknown whether a synthetic Shine-Dalgarno (SD) oligonucleotide labelled with ³²P at its 5'-end ([³²P]oct) would be able to reach the anti-SD sequence of 16S rRNA at the early stages of translation only or during elongation. To verify this, [³²P]oct was incubated with 30S ribosomal subun...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Дата: | 2007 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2007
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157528 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation / D. Maraschio, Teana La, P. Volpe // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 3. — С. 243-249. — Бібліогр.: 18 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862533443973283840 |
|---|---|
| author | Maraschio, D. La Teana, A. Volpe, P. |
| author_facet | Maraschio, D. La Teana, A. Volpe, P. |
| citation_txt | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation / D. Maraschio, Teana La, P. Volpe // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 3. — С. 243-249. — Бібліогр.: 18 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Біополімери і клітина |
| description | It was unknown whether a synthetic Shine-Dalgarno (SD) oligonucleotide labelled with ³²P at its 5'-end ([³²P]oct) would be able to reach the anti-SD sequence of 16S rRNA at the early stages of translation only or during elongation. To verify this, [³²P]oct was incubated with 30S ribosomal subunits (RSUs), 70S ribosomes and polysomes, separately, while the SD/anti-SD binding was checked in them through sucrose gradients. The anti-SD sequence resulted highly available in 30S RSUs and sufficiently available in ribosomes. In both 30S RSUs and ribosomes, the addition of a model 002 mRNA in equimolar proportions displaced [³²P]oct for about 50 %. However, in ribosomes the presence of initiation factors (IFs) and fMet-tRNA influence neither the binding of [³²P]oct nor the competition coming from mRNA. In polysomes, [³²P]oct was unable to hybridize the anti-SD sequence, in agreement with the hypothesis that mRNA and 16S rRNA are involved in the SD/anti-SD interaction also during elongation.
Невідомо, чи будуть синтетичні олігонуклеотиди Шайна-Дальгарно (SD) мічені ³² P по 5'-кінця ([ ³² P]-окт) досягати анти-SD послідовності 16S рРНК на ранній стадії трансляції або тільки під час елонгації. Дла перевірки даної гіпотези, [ ³² P] окт інкубували з 30S субодиницями рибосом (RSUs) і 70S рибосом і полісом, окремо, SD / анти-SD зв'язування детектувати в градієнти сахарози. Анти-SD послідовності призвело високої доступності в 30-і RSUs і досить доступні в рибосоми. В обох 30S RSUs і рибосом, додавання модель 002 мРНК в еквімолярних кількостей зміщені [ ³² P] окт близько 50%. Тим не менш, в рибосомах присутність факторів ініціації (МФ) і fMet-тРНК не впливають на зв'язування [ ³² P] окт і не конкурують з мРНК. У полісоми, [ ³² P] окт не зміг провести гібридизацію анти-SD послідовності, відповідно до гіпотезою, що мРНК і 16S рРНК беруть участь в SD / анти-SD взаємодія також під час елонгації.
Неизвестно, будут ли синтетические олигонуклеотиды Шайна-Дальгарно (SD) меченные ³²P по 5'-концу ([³²P]-окт) достигать анти-SD последовательности 16S рРНК на ранней стадии трансляции или только во время элонгации. Дла проверки данной гипотезы, [³²P] окт инкубировали с 30S субъединицами рибосом (RSUs) и 70S рибосом и полисом, по отдельности, SD / анти-SD связывание детектировали в градиенты сахарозы. Анти-SD последовательности привело высокой доступности в 30-е RSUs и достаточно доступны в рибосомы. В обоих 30S RSUs и рибосом, добавление модель 002 мРНК в эквимолярных количеств смещены [³²P] окт около 50%. Тем не менее, в рибосомах присутствие факторов инициации (МФ) и fMet-тРНК не влияют на связывание [³²P] окт и не конкурируют с мРНК. В полисоме, [³²P] окт не смог провести гибридизацию анти-SD последовательности, в соответствии с гипотезой, что мРНК и 16S рРНК участвуют в SD / анти-SD взаимодействие также во время элонгации.
|
| first_indexed | 2025-11-24T06:36:24Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157528 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-11-24T06:36:24Z |
| publishDate | 2007 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Maraschio, D. La Teana, A. Volpe, P. 2019-06-20T04:21:31Z 2019-06-20T04:21:31Z 2007 The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation / D. Maraschio, Teana La, P. Volpe // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 3. — С. 243-249. — Бібліогр.: 18 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000768 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157528 It was unknown whether a synthetic Shine-Dalgarno (SD) oligonucleotide labelled with ³²P at its 5'-end ([³²P]oct) would be able to reach the anti-SD sequence of 16S rRNA at the early stages of translation only or during elongation. To verify this, [³²P]oct was incubated with 30S ribosomal subunits (RSUs), 70S ribosomes and polysomes, separately, while the SD/anti-SD binding was checked in them through sucrose gradients. The anti-SD sequence resulted highly available in 30S RSUs and sufficiently available in ribosomes. In both 30S RSUs and ribosomes, the addition of a model 002 mRNA in equimolar proportions displaced [³²P]oct for about 50 %. However, in ribosomes the presence of initiation factors (IFs) and fMet-tRNA influence neither the binding of [³²P]oct nor the competition coming from mRNA. In polysomes, [³²P]oct was unable to hybridize the anti-SD sequence, in agreement with the hypothesis that mRNA and 16S rRNA are involved in the SD/anti-SD interaction also during elongation. Невідомо, чи будуть синтетичні олігонуклеотиди Шайна-Дальгарно (SD) мічені ³² P по 5'-кінця ([ ³² P]-окт) досягати анти-SD послідовності 16S рРНК на ранній стадії трансляції або тільки під час елонгації. Дла перевірки даної гіпотези, [ ³² P] окт інкубували з 30S субодиницями рибосом (RSUs) і 70S рибосом і полісом, окремо, SD / анти-SD зв'язування детектувати в градієнти сахарози. Анти-SD послідовності призвело високої доступності в 30-і RSUs і досить доступні в рибосоми. В обох 30S RSUs і рибосом, додавання модель 002 мРНК в еквімолярних кількостей зміщені [ ³² P] окт близько 50%. Тим не менш, в рибосомах присутність факторів ініціації (МФ) і fMet-тРНК не впливають на зв'язування [ ³² P] окт і не конкурують з мРНК. У полісоми, [ ³² P] окт не зміг провести гібридизацію анти-SD послідовності, відповідно до гіпотезою, що мРНК і 16S рРНК беруть участь в SD / анти-SD взаємодія також під час елонгації. Неизвестно, будут ли синтетические олигонуклеотиды Шайна-Дальгарно (SD) меченные ³²P по 5'-концу ([³²P]-окт) достигать анти-SD последовательности 16S рРНК на ранней стадии трансляции или только во время элонгации. Дла проверки данной гипотезы, [³²P] окт инкубировали с 30S субъединицами рибосом (RSUs) и 70S рибосом и полисом, по отдельности, SD / анти-SD связывание детектировали в градиенты сахарозы. Анти-SD последовательности привело высокой доступности в 30-е RSUs и достаточно доступны в рибосомы. В обоих 30S RSUs и рибосом, добавление модель 002 мРНК в эквимолярных количеств смещены [³²P] окт около 50%. Тем не менее, в рибосомах присутствие факторов инициации (МФ) и fMet-тРНК не влияют на связывание [³²P] окт и не конкурируют с мРНК. В полисоме, [³²P] окт не смог провести гибридизацию анти-SD последовательности, в соответствии с гипотезой, что мРНК и 16S рРНК участвуют в SD / анти-SD взаимодействие также во время элонгации. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Біополімери і клітина Матеріали семінару The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation Последовательность Шайна — Дальгарно во время инициации и элонгации трансляции Послідовність Шайна — Дальгарно під час ініціації та елонгації трансляції Article published earlier |
| spellingShingle | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation Maraschio, D. La Teana, A. Volpe, P. Матеріали семінару |
| title | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| title_alt | Последовательность Шайна — Дальгарно во время инициации и элонгации трансляции Послідовність Шайна — Дальгарно під час ініціації та елонгації трансляції |
| title_full | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| title_fullStr | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| title_full_unstemmed | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| title_short | The Shine-Dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| title_sort | shine-dalgarno hybrid during initiation of translation and elongation |
| topic | Матеріали семінару |
| topic_facet | Матеріали семінару |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157528 |
| work_keys_str_mv | AT maraschiod theshinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation AT lateanaa theshinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation AT volpep theshinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation AT maraschiod posledovatelʹnostʹšainadalʹgarnovovremâiniciaciiiélongaciitranslâcii AT lateanaa posledovatelʹnostʹšainadalʹgarnovovremâiniciaciiiélongaciitranslâcii AT volpep posledovatelʹnostʹšainadalʹgarnovovremâiniciaciiiélongaciitranslâcii AT maraschiod poslídovnístʹšainadalʹgarnopídčasínícíacíítaelongacíítranslâcíí AT lateanaa poslídovnístʹšainadalʹgarnopídčasínícíacíítaelongacíítranslâcíí AT volpep poslídovnístʹšainadalʹgarnopídčasínícíacíítaelongacíítranslâcíí AT maraschiod shinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation AT lateanaa shinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation AT volpep shinedalgarnohybridduringinitiationoftranslationandelongation |