Clustering Monte Carlo simulations of the hierarchical protein folding on a simple lattice model
A role of specific collective motions and clustering behavior in protein folding was investigated using simple 2D lattice models. Two model peptides, which have the sequences of hierarchical and non-hierarchical design, were studied comparatively. Simulations were performed using three methods: Metr...
Saved in:
| Published in: | Біополімери і клітина |
|---|---|
| Date: | 2004 |
| Main Authors: | Yesylevskyy, S.O., Demchenko, A.P. |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2004
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157607 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Clustering Monte Carlo simulations of the hierarchical protein folding on a simple lattice model / S.O. Yesylevskyy, A.P. Demchenko // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 3. — С. 244-254. — Бібліогр.: 29 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineSimilar Items
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009)
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009)
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009)
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009)
Monte Carlo simulation of anisotropic Shastry–Sutherland lattice in the framework of classical Heisenberg model
by: V. V. Slavin, et al.
Published: (2011)
by: V. V. Slavin, et al.
Published: (2011)
Monte Carlo simulation of anisotropic Shastry–Sutherland lattice in the framework of classical Heisenberg model
by: Slavin, V.V., et al.
Published: (2011)
by: Slavin, V.V., et al.
Published: (2011)
Дослідження впливу мікрохвильового опромінення на деякі гідробіонти
by: Григорьева, О.О., et al.
Published: (2004)
by: Григорьева, О.О., et al.
Published: (2004)
Самоасоціація цитозину у зневодненому ДМСО за допомогою двох еквівалентних Н-зв'язків N1H...O=C2 знижує бар'єр повертання аміногрупи: дані ¹Н ЯМР спектроскопії
by: Самійленко, С.П., et al.
Published: (2003)
by: Самійленко, С.П., et al.
Published: (2003)
Possible electronic mechanisms of generation and quenching of luminescence of singlet oxygen in the course of photodynamic therapy: ab initio study
by: Minaev, B.F., et al.
Published: (2006)
by: Minaev, B.F., et al.
Published: (2006)
Влияние ионов Ni²⁺ на конформационное равновесие полинуклеотидов полиA·полиU, полиА и полиU в условиях, близких к физиологическим
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2008)
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2008)
The collective vibration modes of hydrogen bonds as a gauge of water states in fruits and leaves
by: Kornienko, M.E., et al.
Published: (2006)
by: Kornienko, M.E., et al.
Published: (2006)
Дослідження інфрачервоного спектра молекули Fe(II)-порфіну в різних спінових станах квантово-хімічним методом функціоналу густини
by: Мінаєв, Б.П., et al.
Published: (2007)
by: Мінаєв, Б.П., et al.
Published: (2007)
Электрофоретическое исследование конформационных переходов в поли(G) под действием моновалентных катионов
by: Зарудная, М.И., et al.
Published: (2007)
by: Зарудная, М.И., et al.
Published: (2007)
Фіксація прототропних таутомерів ксантину метальною групою практично не впливає на їхню відносну енергію: квантово-хімічне дослідження методом DFT
by: Платонов, М.О., et al.
Published: (2003)
by: Платонов, М.О., et al.
Published: (2003)
Влияние хлороформа на состояние воды, адсорбированной сывороточным альбумином
by: Нечипор, О.В., et al.
Published: (2006)
by: Нечипор, О.В., et al.
Published: (2006)
Возможный механизм стабилизации одной из двух форм двуспирального поли(А)
by: Зарудная, М.И.
Published: (2008)
by: Зарудная, М.И.
Published: (2008)
The molecular mechanism of the spontaneous substitution mutations caused by tautomerism of bases: Post Hartree-Fock study of the DNA rare base pairs
by: Danilov, V.I., et al.
Published: (2005)
by: Danilov, V.I., et al.
Published: (2005)
Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини
by: Мінаєв, Б.П., et al.
Published: (2009)
by: Мінаєв, Б.П., et al.
Published: (2009)
Фазовая диаграмма комплексов ионов Ni2+ c полиUполиAполиU
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2009)
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2009)
Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
by: Кордиш, М.О., et al.
Published: (2007)
by: Кордиш, М.О., et al.
Published: (2007)
Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного
by: Щечкин, И.Е., et al.
Published: (2006)
by: Щечкин, И.Е., et al.
Published: (2006)
Связывание антибиотиков актиноцинового ряда с матрицей полифосфата
by: Круглова, Е.Б., et al.
Published: (2005)
by: Круглова, Е.Б., et al.
Published: (2005)
Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с ДНК
by: Ермак, Е.Л., et al.
Published: (2007)
by: Ермак, Е.Л., et al.
Published: (2007)
Исследование инфракрасного спектра 17β-эстрадиола квантово-химическим методом функционала плотности
by: Минаев, Б.Ф., et al.
Published: (2006)
by: Минаев, Б.Ф., et al.
Published: (2006)
Исследование комплексообразования бромистого этидия с ДНК методом спектроскопии комбинационного рассеяния света
by: Близнюк, Ю.Н., et al.
Published: (2009)
by: Близнюк, Ю.Н., et al.
Published: (2009)
Неэмпирическое квантово-химическое исследование различных структурных форм алкалоида берберина
by: Данилов, В.И., et al.
Published: (2007)
by: Данилов, В.И., et al.
Published: (2007)
Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2008)
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2008)
Возможный молекулярный механизм нелинейности мышечного сокращения и его экспериментальное обоснование
by: Ноздренко, Д.Н., et al.
Published: (2005)
by: Ноздренко, Д.Н., et al.
Published: (2005)
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2007)
by: Сорокин, В.А., et al.
Published: (2007)
Які внутрішньомолекулярні водневі зв’язки стабілізують конформери дезоксиаденозину? Результати квантово-хімічного аналізу топології електронної густини
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2007)
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2007)
О молекулярных механизмах сокращения мышечного волокна при переходе к новому равновесному состоянию: анализ экспериментальных данных с использованием трехкомпонентного электростимулирующего сигнала
by: Ноздренко, Д.Н., et al.
Published: (2005)
by: Ноздренко, Д.Н., et al.
Published: (2005)
Гидратация мембран эритроцитов и их взаимодействие с высокодисперсным кремнеземом
by: Туров, В.В., et al.
Published: (2006)
by: Туров, В.В., et al.
Published: (2006)
Исследование спектра комбинационного рассеяния Fe(II)-порфина методом функционала плотности
by: Минаева, В.А., et al.
Published: (2009)
by: Минаева, В.А., et al.
Published: (2009)
Утворення негативних іонів молекули цитозину при електронному ударі та його можливе біофізичне значення
by: Суховія, М.І., et al.
Published: (2005)
by: Суховія, М.І., et al.
Published: (2005)
Повний конформаційний аналіз дезоксиаденозину квантово-хімічним методом функціоналу густини
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2007)
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2007)
Гидрофобный вклад в свободную энергию комплексообразования ароматических лигандов с ДНК
by: Костюков, В.В., et al.
Published: (2009)
by: Костюков, В.В., et al.
Published: (2009)
Вичерпний конформаційний аналіз 2-дезоксиуридину квантово-хімічним методом функціоналу густини
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2006)
by: Жураківський, Р.О., et al.
Published: (2006)
Физические факторы стабильности трехспиральных структур коллагенового типа
by: Борискина, Е.П., et al.
Published: (2006)
by: Борискина, Е.П., et al.
Published: (2006)
Влияние высокодисперсных материалов на физиологическую активность дрожжевых клеток
by: Крупская, Т.В., et al.
Published: (2009)
by: Крупская, Т.В., et al.
Published: (2009)
Сендвічоподібна самоасоціація цитозину та її прояви в оптичних спектрах
by: Петрушко, І.А., et al.
Published: (2005)
by: Петрушко, І.А., et al.
Published: (2005)
Связывание производного актиноцина с фрагментами ДНК: моделирование методом Монте Карло
by: Шестопалова, A.V.
Published: (2007)
by: Шестопалова, A.V.
Published: (2007)
Квантово-химическое моделирование радиационных повреждений компонентов ДНК при неупругом взаимодействии с медленными электронами. Облучение дезоксирибозы
by: Минаев, Б.Ф., et al.
Published: (2005)
by: Минаев, Б.Ф., et al.
Published: (2005)
Similar Items
-
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009) -
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating
by: Kharkyanen, V.N., et al.
Published: (2009) -
Monte Carlo simulation of anisotropic Shastry–Sutherland lattice in the framework of classical Heisenberg model
by: V. V. Slavin, et al.
Published: (2011) -
Monte Carlo simulation of anisotropic Shastry–Sutherland lattice in the framework of classical Heisenberg model
by: Slavin, V.V., et al.
Published: (2011) -
Дослідження впливу мікрохвильового опромінення на деякі гідробіонти
by: Григорьева, О.О., et al.
Published: (2004)