Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ

Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ

Лізил-тРНК синтетаза разом з аспартил- і аспарагіл-тРНК синтетазами належить до ІІб підкласу і має низку характерних особливостей. Всі АРСази ІІб підкласу включають N-кінцеві антикодон-зв’язувальні домени (близько 140 амінокислотних залишків), функціонують як гомодимер α2 і для кожної АРСази антикод...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2008
Hauptverfasser: Крикливий, І.А., Коваленко, О.П., Гудзера, О.Й., Яремчук, Г.Д., Тукало, М.А.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2008
Schlagworte:
Структура та функції біополімерів
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157659
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Виділення і очищення індивідуальної тРНКLys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ / І.А. Крикливий, О.П. Коваленко, О.Й. Гудзера, Г.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 1. — С. 21-27. — Бібліогр.: 107 назв. — укр., англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157659
record_format dspace
spelling Крикливий, І.А.
Коваленко, О.П.
Гудзера, О.Й.
Яремчук, Г.Д.
Тукало, М.А.
2019-06-20T16:14:58Z
2019-06-20T16:14:58Z
2008
Виділення і очищення індивідуальної тРНКLys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ / І.А. Крикливий, О.П. Коваленко, О.Й. Гудзера, Г.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 1. — С. 21-27. — Бібліогр.: 107 назв. — укр., англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00078C
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157659
581.557.2 +577.126
Лізил-тРНК синтетаза разом з аспартил- і аспарагіл-тРНК синтетазами належить до ІІб підкласу і має низку характерних особливостей. Всі АРСази ІІб підкласу включають N-кінцеві антикодон-зв’язувальні домени (близько 140 амінокислотних залишків), функціонують як гомодимер α2 і для кожної АРСази антикодонові триплети гомологічних тРНК є головними, але недостатніми елементами упізнавання. При цьому для всіх тРНК, гомологічних АРСазам ІІб підкласу, центральною основою антикодону є уридин, і дискримінація цих антикодонів залежить лише від їхньої першої літери. Виникають закономірні запитання щодо структурних основ і механізмів дискримінації цих антикодонів структурно близькими зв’язувальними доменами АРСаз та можливої ролі мінорних основ тРНК у цих процесах. Наведено розроблені методичні підходи до отримання високоочищеної тРНК Lys із T. thermophilus і визначення мінорних основ у її структурі.
Lysyl-tRNA synthetase along with aspartyl- and asparagyl-tRNA synthetase belong to subclass IIb and have a number of specific features. On the one hand, subclass IIb synthetases have N-terminal anticodon-linking domains (~140 residues), function as homodimers a2, and anticodon triplets for each ARSase are the main but insufficient identity elements. On the other hand, all tRNA anticodons, corresponding to each synthetase, contain a central U, and discrimination between them often depends on one nucleotide only. Thus, the questions are posed, concerning the structural basis and the mechanisms for discrimination between these anticodons by a homologous binding domain, as well as the possible role of modified bases in this respect. In this paper we described methodological approach to obtaining pure Thermus thermophilus tRNALys and the determination of modified bases in its structure.
Лизил-тРНК синтетаза вместе с аспартил- и аспарагил- тРНК синтетазами принадлежит к ІІб подкласу и имеет ряд характерных особенностей. Все АРСазы подкласса ІІб имеют N-концевые антикодон-связывающие домены (около 140 аминокислотных остатков), функционируют в виде гомодимера α2 и для каждой АРСазы антикодоновые триплеты являются главными, но недостаточными элементами узнавания. При этом для всех тРНК, гомологичных этим АРСазам, центральным основанием антикодона является уридин, и дискриминация этих антикодонов зависит только от первой буквы антикодона. Возникают закономерные вопросы относительно структурных основ и механизмов дискриминации этих антикодонов структурно близкими связывающими доменами АРСаз и возможной роли минорных оснований в этих процессах. Приведены разработанные методические подходы к получению высокоочищенной тРНКLys из T. thermophilus и определению минорных оснований в ее структуре.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
Выделение и очистка индивидуальной тРНК Lys из Thermus thermophilus и определение ее минорных оснований
Isolation and purification of Thermus thermophilus tRNA Lys and determination of its modified nucleotides
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
spellingShingle Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
Крикливий, І.А.
Коваленко, О.П.
Гудзера, О.Й.
Яремчук, Г.Д.
Тукало, М.А.
Структура та функції біополімерів
title_short Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
title_full Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
title_fullStr Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
title_full_unstemmed Виділення і очищення індивідуальної тРНК Lys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
title_sort виділення і очищення індивідуальної трнк lys із thermus thermophilus та визначення її мінорних основ
author Крикливий, І.А.
Коваленко, О.П.
Гудзера, О.Й.
Яремчук, Г.Д.
Тукало, М.А.
author_facet Крикливий, І.А.
Коваленко, О.П.
Гудзера, О.Й.
Яремчук, Г.Д.
Тукало, М.А.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2008
language Ukrainian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Выделение и очистка индивидуальной тРНК Lys из Thermus thermophilus и определение ее минорных оснований
Isolation and purification of Thermus thermophilus tRNA Lys and determination of its modified nucleotides
description Лізил-тРНК синтетаза разом з аспартил- і аспарагіл-тРНК синтетазами належить до ІІб підкласу і має низку характерних особливостей. Всі АРСази ІІб підкласу включають N-кінцеві антикодон-зв’язувальні домени (близько 140 амінокислотних залишків), функціонують як гомодимер α2 і для кожної АРСази антикодонові триплети гомологічних тРНК є головними, але недостатніми елементами упізнавання. При цьому для всіх тРНК, гомологічних АРСазам ІІб підкласу, центральною основою антикодону є уридин, і дискримінація цих антикодонів залежить лише від їхньої першої літери. Виникають закономірні запитання щодо структурних основ і механізмів дискримінації цих антикодонів структурно близькими зв’язувальними доменами АРСаз та можливої ролі мінорних основ тРНК у цих процесах. Наведено розроблені методичні підходи до отримання високоочищеної тРНК Lys із T. thermophilus і визначення мінорних основ у її структурі. Lysyl-tRNA synthetase along with aspartyl- and asparagyl-tRNA synthetase belong to subclass IIb and have a number of specific features. On the one hand, subclass IIb synthetases have N-terminal anticodon-linking domains (~140 residues), function as homodimers a2, and anticodon triplets for each ARSase are the main but insufficient identity elements. On the other hand, all tRNA anticodons, corresponding to each synthetase, contain a central U, and discrimination between them often depends on one nucleotide only. Thus, the questions are posed, concerning the structural basis and the mechanisms for discrimination between these anticodons by a homologous binding domain, as well as the possible role of modified bases in this respect. In this paper we described methodological approach to obtaining pure Thermus thermophilus tRNALys and the determination of modified bases in its structure. Лизил-тРНК синтетаза вместе с аспартил- и аспарагил- тРНК синтетазами принадлежит к ІІб подкласу и имеет ряд характерных особенностей. Все АРСазы подкласса ІІб имеют N-концевые антикодон-связывающие домены (около 140 аминокислотных остатков), функционируют в виде гомодимера α2 и для каждой АРСазы антикодоновые триплеты являются главными, но недостаточными элементами узнавания. При этом для всех тРНК, гомологичных этим АРСазам, центральным основанием антикодона является уридин, и дискриминация этих антикодонов зависит только от первой буквы антикодона. Возникают закономерные вопросы относительно структурных основ и механизмов дискриминации этих антикодонов структурно близкими связывающими доменами АРСаз и возможной роли минорных оснований в этих процессах. Приведены разработанные методические подходы к получению высокоочищенной тРНКLys из T. thermophilus и определению минорных оснований в ее структуре.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157659
citation_txt Виділення і очищення індивідуальної тРНКLys із Thermus thermophilus та визначення її мінорних основ / І.А. Крикливий, О.П. Коваленко, О.Й. Гудзера, Г.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 1. — С. 21-27. — Бібліогр.: 107 назв. — укр., англ.
work_keys_str_mv AT krikliviiía vidílennâíočiŝennâíndivídualʹnoítrnklysízthermusthermophilustaviznačennâíímínornihosnov
AT kovalenkoop vidílennâíočiŝennâíndivídualʹnoítrnklysízthermusthermophilustaviznačennâíímínornihosnov
AT gudzeraoi vidílennâíočiŝennâíndivídualʹnoítrnklysízthermusthermophilustaviznačennâíímínornihosnov
AT âremčukgd vidílennâíočiŝennâíndivídualʹnoítrnklysízthermusthermophilustaviznačennâíímínornihosnov
AT tukaloma vidílennâíočiŝennâíndivídualʹnoítrnklysízthermusthermophilustaviznačennâíímínornihosnov
AT krikliviiía vydelenieiočistkaindividualʹnoitrnklysizthermusthermophilusiopredelenieeeminornyhosnovanii
AT kovalenkoop vydelenieiočistkaindividualʹnoitrnklysizthermusthermophilusiopredelenieeeminornyhosnovanii
AT gudzeraoi vydelenieiočistkaindividualʹnoitrnklysizthermusthermophilusiopredelenieeeminornyhosnovanii
AT âremčukgd vydelenieiočistkaindividualʹnoitrnklysizthermusthermophilusiopredelenieeeminornyhosnovanii
AT tukaloma vydelenieiočistkaindividualʹnoitrnklysizthermusthermophilusiopredelenieeeminornyhosnovanii
AT krikliviiía isolationandpurificationofthermusthermophilustrnalysanddeterminationofitsmodifiednucleotides
AT kovalenkoop isolationandpurificationofthermusthermophilustrnalysanddeterminationofitsmodifiednucleotides
AT gudzeraoi isolationandpurificationofthermusthermophilustrnalysanddeterminationofitsmodifiednucleotides
AT âremčukgd isolationandpurificationofthermusthermophilustrnalysanddeterminationofitsmodifiednucleotides
AT tukaloma isolationandpurificationofthermusthermophilustrnalysanddeterminationofitsmodifiednucleotides
first_indexed 2025-12-07T20:39:29Z
last_indexed 2025-12-07T20:39:29Z
_version_ 1850883408254730240

Ähnliche Einträge