Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток

Исследована кинетика выхода ДНК при кометном электрофорезе изолированных лимфоцитов человека. Электрофорез проводили при нейтральных рН в отсутствие или в присутствии различных концентраций бромистого этидия. Продемонстрированная зависимость эффективности выхода ДНК от концентрации бромистого этидия...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Біополімери і клітина
Дата:2008
Автори: Афанасьева, К.С., Шувалова, Т.А., Зажицкая, М.О., Сиволоб, А.В.
Формат: Стаття
Мова:Російська
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2008
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157670
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток / К.С. Афанасьева, Т.А. Шувалова, М.О. Зажицкая, А.В. Сиволоб // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 105-111. — Бібліогр.: 13 назв. — рос., англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862601647607250944
author Афанасьева, К.С.
Шувалова, Т.А.
Зажицкая, М.О.
Сиволоб, А.В.
author_facet Афанасьева, К.С.
Шувалова, Т.А.
Зажицкая, М.О.
Сиволоб, А.В.
citation_txt Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток / К.С. Афанасьева, Т.А. Шувалова, М.О. Зажицкая, А.В. Сиволоб // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 105-111. — Бібліогр.: 13 назв. — рос., англ.
collection DSpace DC
container_title Біополімери і клітина
description Исследована кинетика выхода ДНК при кометном электрофорезе изолированных лимфоцитов человека. Электрофорез проводили при нейтральных рН в отсутствие или в присутствии различных концентраций бромистого этидия. Продемонстрированная зависимость эффективности выхода ДНК от концентрации бромистого этидия свидетельствует о том, что хвост кометы представляет собой растянутые в электрическом поле петлевые домены. При условии релаксации петель выход ДНК существенно облегчается, а при наличии в вытянутой петле определенного уровня торсионных напряжений наблюдается исчезновение «комет» после выключения электрического поля. Обсуждаются возможности использования обнаруженных эффектов для усовершенствования методики кометного электрофореза. Досліджено кінетику виходу ДНК при кометному електрофорезі ізольованих лімфоцитів людини. Електрофорез проводили за нейтральних рН у відсутності чи присутності різних концентрацій бромистого етидію. Продемонстрована залежність ефективності виходу ДНК від концентрації останнього свідчить про те, що хвіст комети являє собою розтягнуті в електричному полі петельні домени. За умови релаксації петель вихід ДНК суттєво полегшується, а за збереження певного рівня торсійних напружень у витягнутій петлі спостерігається зникнення комет після вимкнення електричного поля. Обговорюються можливості викори- стання виявлених ефектів для вдосконалення методики кометного електрофорезу. The kinetics of DNA exit during single cell gel electrophoresis (comet assay) of human lymphocytes has been investigated. The electrophoresis was performed at neutral pH in the absence/presence of different ethidium bromide concentrations. The dependence demonstrated of DNA exit efficiency on ethidium bromide concentration points out that the comet tail consists of DNA loop domains extended by the electric field. The loop exit is facilitated significantly by relaxed DNA torsional constraint. However, the disappearance of comets was observed after switching off the electric field at the condition of some constraint in the extended loops. Several possibilities of applications of discovered effects to improve the comet assay were discussed.
first_indexed 2025-11-28T02:28:42Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157670
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language Russian
last_indexed 2025-11-28T02:28:42Z
publishDate 2008
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Афанасьева, К.С.
Шувалова, Т.А.
Зажицкая, М.О.
Сиволоб, А.В.
2019-06-20T16:42:42Z
2019-06-20T16:42:42Z
2008
Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток / К.С. Афанасьева, Т.А. Шувалова, М.О. Зажицкая, А.В. Сиволоб // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 2. — С. 105-111. — Бібліогр.: 13 назв. — рос., англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000797
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157670
577.323:576.08
Исследована кинетика выхода ДНК при кометном электрофорезе изолированных лимфоцитов человека. Электрофорез проводили при нейтральных рН в отсутствие или в присутствии различных концентраций бромистого этидия. Продемонстрированная зависимость эффективности выхода ДНК от концентрации бромистого этидия свидетельствует о том, что хвост кометы представляет собой растянутые в электрическом поле петлевые домены. При условии релаксации петель выход ДНК существенно облегчается, а при наличии в вытянутой петле определенного уровня торсионных напряжений наблюдается исчезновение «комет» после выключения электрического поля. Обсуждаются возможности использования обнаруженных эффектов для усовершенствования методики кометного электрофореза.
Досліджено кінетику виходу ДНК при кометному електрофорезі ізольованих лімфоцитів людини. Електрофорез проводили за нейтральних рН у відсутності чи присутності різних концентрацій бромистого етидію. Продемонстрована залежність ефективності виходу ДНК від концентрації останнього свідчить про те, що хвіст комети являє собою розтягнуті в електричному полі петельні домени. За умови релаксації петель вихід ДНК суттєво полегшується, а за збереження певного рівня торсійних напружень у витягнутій петлі спостерігається зникнення комет після вимкнення електричного поля. Обговорюються можливості викори- стання виявлених ефектів для вдосконалення методики кометного електрофорезу.
The kinetics of DNA exit during single cell gel electrophoresis (comet assay) of human lymphocytes has been investigated. The electrophoresis was performed at neutral pH in the absence/presence of different ethidium bromide concentrations. The dependence demonstrated of DNA exit efficiency on ethidium bromide concentration points out that the comet tail consists of DNA loop domains extended by the electric field. The loop exit is facilitated significantly by relaxed DNA torsional constraint. However, the disappearance of comets was observed after switching off the electric field at the condition of some constraint in the extended loops. Several possibilities of applications of discovered effects to improve the comet assay were discussed.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
Оборотність виходу петель ДНК при кометному електрофорезі ізольованих клітин
Reversibility of DNA loops exit during single cell gel electrophoresis
Article
published earlier
spellingShingle Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
Афанасьева, К.С.
Шувалова, Т.А.
Зажицкая, М.О.
Сиволоб, А.В.
Структура та функції біополімерів
title Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
title_alt Оборотність виходу петель ДНК при кометному електрофорезі ізольованих клітин
Reversibility of DNA loops exit during single cell gel electrophoresis
title_full Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
title_fullStr Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
title_full_unstemmed Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
title_short Обратимость выхода петель ДНК при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
title_sort обратимость выхода петель днк при «кометном» электрофорезе изолированных клеток
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157670
work_keys_str_mv AT afanasʹevaks obratimostʹvyhodapetelʹdnkprikometnomélektroforezeizolirovannyhkletok
AT šuvalovata obratimostʹvyhodapetelʹdnkprikometnomélektroforezeizolirovannyhkletok
AT zažickaâmo obratimostʹvyhodapetelʹdnkprikometnomélektroforezeizolirovannyhkletok
AT sivolobav obratimostʹvyhodapetelʹdnkprikometnomélektroforezeizolirovannyhkletok
AT afanasʹevaks oborotnístʹvihodupetelʹdnkprikometnomuelektroforezíízolʹovanihklítin
AT šuvalovata oborotnístʹvihodupetelʹdnkprikometnomuelektroforezíízolʹovanihklítin
AT zažickaâmo oborotnístʹvihodupetelʹdnkprikometnomuelektroforezíízolʹovanihklítin
AT sivolobav oborotnístʹvihodupetelʹdnkprikometnomuelektroforezíízolʹovanihklítin
AT afanasʹevaks reversibilityofdnaloopsexitduringsinglecellgelelectrophoresis
AT šuvalovata reversibilityofdnaloopsexitduringsinglecellgelelectrophoresis
AT zažickaâmo reversibilityofdnaloopsexitduringsinglecellgelelectrophoresis
AT sivolobav reversibilityofdnaloopsexitduringsinglecellgelelectrophoresis