Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека

Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека

Исследование асимметрий нуклеотидного состава (АНС), связанных с транскрипцией, проведено в различных функциональных участках генов человека. Охарактеризованы четыре типа АНС: аденин-тиминовая, цитозин-гуаниновая, пурин-пиримидиновая и кето-аминовая. Обнаружены существенные различия в типах АНС в эк...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Біополімери і клітина
Datum:2008
Hauptverfasser: Дуплий, Д.Р., Калашников, В.В., Чащин, Н.А., Толсторуков, М.Е.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2008
Schlagworte:
Структура та функції біополімерів
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157739
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека / Д.Р. Дуплий, В.В. Калашников, Н.А. Чащин, М.Е. Толсторуков // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 5. — С. 368-376. — Бібліогр.: назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-157739
record_format dspace
spelling Дуплий, Д.Р.
Калашников, В.В.
Чащин, Н.А.
Толсторуков, М.Е.
2019-06-20T20:29:35Z
2019-06-20T20:29:35Z
2008
Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека / Д.Р. Дуплий, В.В. Калашников, Н.А. Чащин, М.Е. Толсторуков // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 5. — С. 368-376. — Бібліогр.: назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007B4
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157739
577.3
Исследование асимметрий нуклеотидного состава (АНС), связанных с транскрипцией, проведено в различных функциональных участках генов человека. Охарактеризованы четыре типа АНС: аденин-тиминовая, цитозин-гуаниновая, пурин-пиримидиновая и кето-аминовая. Обнаружены существенные различия в типах АНС в экзонах и интронах, выражающиеся системами соотношений: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C≥ G + T для экзонов и A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T для интронов. В нетранскрибируемых областях генома величины АНС близки к нулю, а наибольших значений достигают в интронах генов «домашнего хозяйства». В среднем более высокие значения АНС наблюдаются в группе генов «домашнего хозяйства» по сравнению с тканеспецифическими. Полученные результаты демонстрируют, что подробная информация об АНС может быть использована для дальнейшего понимания генной струтуры и организации генома в целом.
Дослідження асиметрій нуклеотидного складу (АНС), пов’язаних з транскрипцією, здійснено в різних функціональних ділянках генів людини. Охарактеризовано чотири типи АНС: аденін-тимінова, цитозин-гуанінова, пурин-піримідинова і кето-амінова. Виявлено істотні відмінності в типах АНС в екзонах та інтронах. Екзони можна охарактеризувати такою системою співвідношень: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C ≥ G + T, а інтрони – A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T. У ділянках геному, що не транскрибуються, величини АНС близькі до нуля, а найбільших значень вони досягають в інтронах генів «домашнього господарства». В середньому вищі величини АНС спостерігаються у групі генів «домашнього господарства» порівняно з тканиноспецифічними. Одержані результати демонструють, що докладна інформація щодо асиметрії нуклеотидного складу може бути використана для подальшого розуміння генної структури і організації геному в цілому.
An analysis of transcription-related bias of base-pair composition was performed in different functional regions of human genes. Four types of the bias (skew indexes) were considered: AT-skew, GC-skew, Purine-skew, and Keto-skew. Our results show the essential differences between base-pair composition of exons and introns. On average, exons are characterized by the following rules: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C ≥ G + T, while the rules for introns are: A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T. The indexes reach the highest values in the internal introns and are close to zero in nontranscribed regions of the genome. We also observed that the bias is pronouncedly stronger in the housekeeping genes than in the analyzed groups of tissue-specific genes. Our results suggest that the detailed knowledge of the base-pair compositional bias may help to further our understanding of the overall gene organization.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Біополімери і клітина
Структура та функції біополімерів
Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
Comparative analysis of nucleotide composition skew in exons and introns of human genes
Порівняльний аналіз нуклеотидного складу екзонно-інтронних послідовностей генів людини
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
spellingShingle Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
Дуплий, Д.Р.
Калашников, В.В.
Чащин, Н.А.
Толсторуков, М.Е.
Структура та функції біополімерів
title_short Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
title_full Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
title_fullStr Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
title_full_unstemmed Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
title_sort cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека
author Дуплий, Д.Р.
Калашников, В.В.
Чащин, Н.А.
Толсторуков, М.Е.
author_facet Дуплий, Д.Р.
Калашников, В.В.
Чащин, Н.А.
Толсторуков, М.Е.
topic Структура та функції біополімерів
topic_facet Структура та функції біополімерів
publishDate 2008
language Russian
container_title Біополімери і клітина
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Comparative analysis of nucleotide composition skew in exons and introns of human genes
Порівняльний аналіз нуклеотидного складу екзонно-інтронних послідовностей генів людини
description Исследование асимметрий нуклеотидного состава (АНС), связанных с транскрипцией, проведено в различных функциональных участках генов человека. Охарактеризованы четыре типа АНС: аденин-тиминовая, цитозин-гуаниновая, пурин-пиримидиновая и кето-аминовая. Обнаружены существенные различия в типах АНС в экзонах и интронах, выражающиеся системами соотношений: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C≥ G + T для экзонов и A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T для интронов. В нетранскрибируемых областях генома величины АНС близки к нулю, а наибольших значений достигают в интронах генов «домашнего хозяйства». В среднем более высокие значения АНС наблюдаются в группе генов «домашнего хозяйства» по сравнению с тканеспецифическими. Полученные результаты демонстрируют, что подробная информация об АНС может быть использована для дальнейшего понимания генной струтуры и организации генома в целом. Дослідження асиметрій нуклеотидного складу (АНС), пов’язаних з транскрипцією, здійснено в різних функціональних ділянках генів людини. Охарактеризовано чотири типи АНС: аденін-тимінова, цитозин-гуанінова, пурин-піримідинова і кето-амінова. Виявлено істотні відмінності в типах АНС в екзонах та інтронах. Екзони можна охарактеризувати такою системою співвідношень: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C ≥ G + T, а інтрони – A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T. У ділянках геному, що не транскрибуються, величини АНС близькі до нуля, а найбільших значень вони досягають в інтронах генів «домашнього господарства». В середньому вищі величини АНС спостерігаються у групі генів «домашнього господарства» порівняно з тканиноспецифічними. Одержані результати демонструють, що докладна інформація щодо асиметрії нуклеотидного складу може бути використана для подальшого розуміння генної структури і організації геному в цілому. An analysis of transcription-related bias of base-pair composition was performed in different functional regions of human genes. Four types of the bias (skew indexes) were considered: AT-skew, GC-skew, Purine-skew, and Keto-skew. Our results show the essential differences between base-pair composition of exons and introns. On average, exons are characterized by the following rules: A > T; G ≥ C; A + G > C + T; A + C ≥ G + T, while the rules for introns are: A < T; C ≤ G; A + G ≤ C + T; A + C < G + T. The indexes reach the highest values in the internal introns and are close to zero in nontranscribed regions of the genome. We also observed that the bias is pronouncedly stronger in the housekeeping genes than in the analyzed groups of tissue-specific genes. Our results suggest that the detailed knowledge of the base-pair compositional bias may help to further our understanding of the overall gene organization.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/157739
fulltext
citation_txt Cравнительный анализ нуклеотидного состава экзонно-интронных последовательностей генов человека / Д.Р. Дуплий, В.В. Калашников, Н.А. Чащин, М.Е. Толсторуков // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 5. — С. 368-376. — Бібліогр.: назв. — рос.
work_keys_str_mv AT dupliidr cravnitelʹnyianaliznukleotidnogosostavaékzonnointronnyhposledovatelʹnosteigenovčeloveka
AT kalašnikovvv cravnitelʹnyianaliznukleotidnogosostavaékzonnointronnyhposledovatelʹnosteigenovčeloveka
AT čaŝinna cravnitelʹnyianaliznukleotidnogosostavaékzonnointronnyhposledovatelʹnosteigenovčeloveka
AT tolstorukovme cravnitelʹnyianaliznukleotidnogosostavaékzonnointronnyhposledovatelʹnosteigenovčeloveka
AT dupliidr comparativeanalysisofnucleotidecompositionskewinexonsandintronsofhumangenes
AT kalašnikovvv comparativeanalysisofnucleotidecompositionskewinexonsandintronsofhumangenes
AT čaŝinna comparativeanalysisofnucleotidecompositionskewinexonsandintronsofhumangenes
AT tolstorukovme comparativeanalysisofnucleotidecompositionskewinexonsandintronsofhumangenes
AT dupliidr porívnâlʹniianalíznukleotidnogoskladuekzonnoíntronnihposlídovnosteigenívlûdini
AT kalašnikovvv porívnâlʹniianalíznukleotidnogoskladuekzonnoíntronnihposlídovnosteigenívlûdini
AT čaŝinna porívnâlʹniianalíznukleotidnogoskladuekzonnoíntronnihposlídovnosteigenívlûdini
AT tolstorukovme porívnâlʹniianalíznukleotidnogoskladuekzonnoíntronnihposlídovnosteigenívlûdini
first_indexed 2025-11-24T06:37:01Z
last_indexed 2025-11-24T06:37:01Z
_version_ 1850844235697225728

Ähnliche Einträge