The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors

We have analyzed the putative value of the pattern of relative expression (RE) of several genes that might be involved
 in a response to anti-cancer therapy, namely AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR, and CTLA4, in samples of
 prostate adenoma, adenocarcinoma, and the paired conventio...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Доповіді НАН України
Date:2019
Main Authors: Gerashchenko, G.V., Chashchina, L.I., Rynditch, A.V., Kashuba, V.I.
Format: Article
Language:English
Published: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2019
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/158098
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors / G.V. Gerashchenko, L.I. Chashchina, A.V. Rynditch, V.I. Kashuba // Доповіді Національної академії наук України. — 2019. — № 4. — С. 86-93. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862656958617616384
author Gerashchenko, G.V.
Chashchina, L.I.
Rynditch, A.V.
Kashuba, V.I.
author_facet Gerashchenko, G.V.
Chashchina, L.I.
Rynditch, A.V.
Kashuba, V.I.
citation_txt The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors / G.V. Gerashchenko, L.I. Chashchina, A.V. Rynditch, V.I. Kashuba // Доповіді Національної академії наук України. — 2019. — № 4. — С. 86-93. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Доповіді НАН України
description We have analyzed the putative value of the pattern of relative expression (RE) of several genes that might be involved
 in a response to anti-cancer therapy, namely AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR, and CTLA4, in samples of
 prostate adenoma, adenocarcinoma, and the paired conventional normal tissues. We could propose three subtypes of
 adenocarcinomas that show the distinct pattern of expression of the above-mentioned genes, characteristics for (1)
 cancer-associated fibroblasts (CAFs), (2) tumor-associated macrophages (TAMs), and (3) markers of immune response.
 These groups correlate with the prostate cancer subtypes, that were determined earlier, based on the analysis
 of RE of the epithelial-to-mesenchymal cell transition (EMT) genes and prostate cancer-associated genes. Noteworthy,
 the highest correlation was found for genes characteristic of CAFs. This emphasizes the importance of the
 simultaneous analysis of genes, involved in various intercellular interactions between tumor cells and cells of tumor
 microenvironment, in prediction of efficacy of anti-cancer therapy. To confirm the presented data, the additional
 studies on a larger cohort of the prostate cancer patients are required. Проаналізoвано потенційні значення діапазонів відносної експресії ряду генів, які можуть бути залучені у
 відповідь на протиракову терапію, а саме AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR і CTLA4, у зразках аденом,
 аденокарцином і парних умовно-нормальних тканин передміхурової залози. Визначено три підтипи аденокарцином, які показують чітку картину експресії досліджуваних генів, які характеризують: 1) пухлино-асоційовані фібробласти; 2) пухлиноасоційовані макрофаги; 3) маркери імунної відповіді. Ці групи корелюють з підтипами раку передміхурової залози, які були визначені раніше на основі аналізу відносної
 експресії генів, асоційованих з епітеліально-мезенхімальним переходом, і генів, пов’язаних з раком передміхурової залози. Звертає на себе увагу, що найбільша кореляція була знайдена для цих підтипів раку й
 групи генів пухлиноасоційованих фібробластів. Це підкреслює важливість одночасного аналізу генів, залучених до різних міжклітинних взаємодій між клітинами пухлин і клітинами пухлинного мікрооточення,
 в прогнозуванні ефективності протиракової терапії. Для підтвердження одержаних даних необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці хворих на рак передміхурової залози. Проанализированы потенциальные значения диапазонов относительной экспрессии ряда генов, которые
 могут быть вовлечены в ответ на противораковую терапию, а именно AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR,
 LDLR и CTLA4, в образцах аденом, аденокарцином и парных условно-нормальных тканей простаты. Определены три подтипа аденокарцином, показывающие четкую картину экспрессии исследуемых генов, которые характеризуют: 1) опухолеассоциированные фибробласты; 2) опухолеассоциированные макрофаги;
 3) маркеры имунного ответа. Эти группы коррелируют с подтипами рака простаты, которые были детектированы ранее на основе анализа относительной экспрессии генов, ассоциированных с эпителиально-мезенхимальным переходом, и генов, связанных с раком простаты. Важно отметить, что наибольшая корреляция была найдена для этих подтипов рака и группы генов опухолеассоциированных фибробластов.
 Это подчеркивает важность одновременного анализа генов, участвующих в различных межклеточных
 взаимодействиях между клетками опухолей и клетками опухолевого микроокружения, в прогнозировании эффективности противораковой терапии. Для подтверждения полученных данных необходимы дополнительные исследования на большей выборке больных раком простаты.
first_indexed 2025-12-02T05:43:08Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-158098
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 1025-6415
language English
last_indexed 2025-12-02T05:43:08Z
publishDate 2019
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
record_format dspace
spelling Gerashchenko, G.V.
Chashchina, L.I.
Rynditch, A.V.
Kashuba, V.I.
2019-07-12T19:35:09Z
2019-07-12T19:35:09Z
2019
The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors / G.V. Gerashchenko, L.I. Chashchina, A.V. Rynditch, V.I. Kashuba // Доповіді Національної академії наук України. — 2019. — № 4. — С. 86-93. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
1025-6415
DOI: doi.org/10.15407/dopovidi2019.04.086
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/158098
577.218+616.65
We have analyzed the putative value of the pattern of relative expression (RE) of several genes that might be involved
 in a response to anti-cancer therapy, namely AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR, and CTLA4, in samples of
 prostate adenoma, adenocarcinoma, and the paired conventional normal tissues. We could propose three subtypes of
 adenocarcinomas that show the distinct pattern of expression of the above-mentioned genes, characteristics for (1)
 cancer-associated fibroblasts (CAFs), (2) tumor-associated macrophages (TAMs), and (3) markers of immune response.
 These groups correlate with the prostate cancer subtypes, that were determined earlier, based on the analysis
 of RE of the epithelial-to-mesenchymal cell transition (EMT) genes and prostate cancer-associated genes. Noteworthy,
 the highest correlation was found for genes characteristic of CAFs. This emphasizes the importance of the
 simultaneous analysis of genes, involved in various intercellular interactions between tumor cells and cells of tumor
 microenvironment, in prediction of efficacy of anti-cancer therapy. To confirm the presented data, the additional
 studies on a larger cohort of the prostate cancer patients are required.
Проаналізoвано потенційні значення діапазонів відносної експресії ряду генів, які можуть бути залучені у
 відповідь на протиракову терапію, а саме AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR і CTLA4, у зразках аденом,
 аденокарцином і парних умовно-нормальних тканин передміхурової залози. Визначено три підтипи аденокарцином, які показують чітку картину експресії досліджуваних генів, які характеризують: 1) пухлино-асоційовані фібробласти; 2) пухлиноасоційовані макрофаги; 3) маркери імунної відповіді. Ці групи корелюють з підтипами раку передміхурової залози, які були визначені раніше на основі аналізу відносної
 експресії генів, асоційованих з епітеліально-мезенхімальним переходом, і генів, пов’язаних з раком передміхурової залози. Звертає на себе увагу, що найбільша кореляція була знайдена для цих підтипів раку й
 групи генів пухлиноасоційованих фібробластів. Це підкреслює важливість одночасного аналізу генів, залучених до різних міжклітинних взаємодій між клітинами пухлин і клітинами пухлинного мікрооточення,
 в прогнозуванні ефективності протиракової терапії. Для підтвердження одержаних даних необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці хворих на рак передміхурової залози.
Проанализированы потенциальные значения диапазонов относительной экспрессии ряда генов, которые
 могут быть вовлечены в ответ на противораковую терапию, а именно AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR,
 LDLR и CTLA4, в образцах аденом, аденокарцином и парных условно-нормальных тканей простаты. Определены три подтипа аденокарцином, показывающие четкую картину экспрессии исследуемых генов, которые характеризуют: 1) опухолеассоциированные фибробласты; 2) опухолеассоциированные макрофаги;
 3) маркеры имунного ответа. Эти группы коррелируют с подтипами рака простаты, которые были детектированы ранее на основе анализа относительной экспрессии генов, ассоциированных с эпителиально-мезенхимальным переходом, и генов, связанных с раком простаты. Важно отметить, что наибольшая корреляция была найдена для этих подтипов рака и группы генов опухолеассоциированных фибробластов.
 Это подчеркивает важность одновременного анализа генов, участвующих в различных межклеточных
 взаимодействиях между клетками опухолей и клетками опухолевого микроокружения, в прогнозировании эффективности противораковой терапии. Для подтверждения полученных данных необходимы дополнительные исследования на большей выборке больных раком простаты.
en
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Доповіді НАН України
Біологія
The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
Патерни експресії генів як засіб для оцінки компонентів мікрооточення та відповіді на антиракову терапію пухлин передміхурової залози
Паттерны экспрессии генов как способ оценки компонентов микроокружения и ответа на антираковую терапию опухолей простаты
Article
published earlier
spellingShingle The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
Gerashchenko, G.V.
Chashchina, L.I.
Rynditch, A.V.
Kashuba, V.I.
Біологія
title The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
title_alt Патерни експресії генів як засіб для оцінки компонентів мікрооточення та відповіді на антиракову терапію пухлин передміхурової залози
Паттерны экспрессии генов как способ оценки компонентов микроокружения и ответа на антираковую терапию опухолей простаты
title_full The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
title_fullStr The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
title_full_unstemmed The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
title_short The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
title_sort gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors
topic Біологія
topic_facet Біологія
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/158098
work_keys_str_mv AT gerashchenkogv thegeneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT chashchinali thegeneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT rynditchav thegeneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT kashubavi thegeneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT gerashchenkogv paterniekspresíígenívâkzasíbdlâocínkikomponentívmíkrootočennâtavídpovídínaantirakovuterapíûpuhlinperedmíhurovoízalozi
AT chashchinali paterniekspresíígenívâkzasíbdlâocínkikomponentívmíkrootočennâtavídpovídínaantirakovuterapíûpuhlinperedmíhurovoízalozi
AT rynditchav paterniekspresíígenívâkzasíbdlâocínkikomponentívmíkrootočennâtavídpovídínaantirakovuterapíûpuhlinperedmíhurovoízalozi
AT kashubavi paterniekspresíígenívâkzasíbdlâocínkikomponentívmíkrootočennâtavídpovídínaantirakovuterapíûpuhlinperedmíhurovoízalozi
AT gerashchenkogv patternyékspressiigenovkaksposobocenkikomponentovmikrookruženiâiotvetanaantirakovuûterapiûopuholeiprostaty
AT chashchinali patternyékspressiigenovkaksposobocenkikomponentovmikrookruženiâiotvetanaantirakovuûterapiûopuholeiprostaty
AT rynditchav patternyékspressiigenovkaksposobocenkikomponentovmikrookruženiâiotvetanaantirakovuûterapiûopuholeiprostaty
AT kashubavi patternyékspressiigenovkaksposobocenkikomponentovmikrookruženiâiotvetanaantirakovuûterapiûopuholeiprostaty
AT gerashchenkogv geneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT chashchinali geneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT rynditchav geneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors
AT kashubavi geneexpressionpatternasatoolforassessmentofcomponentsofmicroenvironmentandresponsetoanticancertherapyofprostatetumors