Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів
З використанням розроблених регресійної і класифікаційної QSAR-моделей для прогнозування антибластичної активності сполук щодо клітин лінії Hep-2 проаналізовано базу віртуальних структур Z- та E-ізомерних тіазоловмісних похідних N-метил-, N-бензил- і N-фенілетилзаміщених роданінів. Методом молекуля...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2020 |
| Main Authors: | , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2020
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/170506 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів / О.Л. Кобзар, Д.М. Година, В.О. Синенко, В.В. Ковалішин, О.П. Трохименко, С.Р. Сливчук, О.В. Музичка // Доповіді Національної академії наук України. — 2020. — № 5. — С. 70-77. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-170506 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Кобзар, О.Л. Година, Д.М. Синенко, В.О. Ковалішин, В.В. Трохименко, О.П. Сливчук, С.Р. Музичка, О.В. 2020-07-17T16:40:32Z 2020-07-17T16:40:32Z 2020 Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів / О.Л. Кобзар, Д.М. Година, В.О. Синенко, В.В. Ковалішин, О.П. Трохименко, С.Р. Сливчук, О.В. Музичка // Доповіді Національної академії наук України. — 2020. — № 5. — С. 70-77. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 DOI: doi.org/10.15407/dopovidi2020.05.070 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/170506 547.789:615.277.3 З використанням розроблених регресійної і класифікаційної QSAR-моделей для прогнозування антибластичної активності сполук щодо клітин лінії Hep-2 проаналізовано базу віртуальних структур Z- та E-ізомерних тіазоловмісних похідних N-метил-, N-бензил- і N-фенілетилзаміщених роданінів. Методом молекулярного докінгу оцінено відносну спорідненість 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів до АТФ-зв'язувального центру потенційної білкової мішені — протеїнкінази Pim-1. За результатами віртуального скринінгу із бази даних відібрано десять сполук, які було синтезовано шляхом взаємодії N-заміщених роданінів з тіазол-2-карбоксальдегідами, тіазол-4-карбоксальдегідами та тіазол-5-карбоксальдегідами. На підставі in vitro досліджень сполук з N-заміщеним роданіновим скафолдом встановлено, що їх цитотоксична дія на культуру клітин аденокарциноми гортані людини Hер-2 у 2,7–10 разів поступається впливу цисплатину як референс-препарату. Найбільш вираженою дією характеризувались роданінова похідна з 5-заміщеним тіазол-2-ільним і N-(4-метоксифеніл)етильним замісниками та сполука з 2-заміщеним тіазол-4-ільним і N-4-метилбензильним замісниками. При цьому їх токсичність, визначена на моделі гідробіонта D. magna, була приблизно на два порядки меншою, ніж у цисплатину. The virtual screening of a database of Z- and E-isomeric thiazole-containing derivatives of N-methyl-, N-ben zyland N-phenylethyl-substuted rhodanines is performed by regression and classification QSAR models for predicting the antiblastic activity of compounds against Hep-2 cells. The molecular docking method is used to evaluate the affinity of 3-substituted 5-thiazolylmethylene rhodanines to the ATP-binding site of potential target protein, the protein kinase Pim-1. According to the virtual screening results, ten compounds from the database were selected and synthesized by the reaction of N-substituted rhodanines with thiazol-2-carboxaldehydes, thiazol-4-carboxaldehydes and thiazol-5-carboxaldehydes. In vitro study of the compounds with N-substituted rhodanine scaffold showed the cytotoxic activity on the cell culture of human laryngeal adenocarcinoma Hep-2 which was 2.7-10 times lower in comparison with the effect of cisplatin as a reference. The results indicated that the rhodanine derivative with thiazol-2-yl and N-(4-methoxyphenyl)ethyl substituents, as well as rhodanine compound bearing thiazol-4-yl and N-4-methylbenzyl groups, exhibited the most pronounced effects. The toxicity of these compounds evaluated on hydrobiont D. magna was two orders of magnitude lower than that of cisplatin. С использованием разработанных регрессионной и классификационной QSAR-моделей для прогнозирования антибластической активности соединений по отношению к клеткам линии Hep-2 проанализирована база виртуальных структур Z- и E-изомерных тиазолсодержащих производных N-метил, N-бензил- и N-фенилэтилзамещенных роданинов. Методом молекулярного докинга оценено относительное сродство 3-замещенных 5-тиазолилметиленроданинов к АТФ-связывающему центру потенциальной белковой мишени — протеинкиназы Pim-1. На основании виртуального скрининга из базы данных было отобрано десять соединений, которые затем были синтезированы путем взаимодействия N-замещенных роданинов с тиазол-2-карбоксальдегидами, тиазол-4-карбоксальдегидами и тиазол-5-карбоксальдегидами. Результаты исследования in vitro соединений с N-замещенным роданиновым скаффолдом свидетельствуют о том, что их цитотоксическое действие на культуру клеток аденокарценомы гортани человека Hep-2 в 2,7— 10 раз уступает влиянию цисплатина как референс-препарата. Наиболее выраженным действием характеризируются роданиновое производные с 5-замещенным тиазол-2-ильным и N-(4-метоксифенил)этильным заместителями, а также соединение с 2-замещенным тиазол-4-ильным и N-4-метилбензильным заместителями. При этом токсичность этих соединений, которую оценивали на модели гидробионта D. magna, была приблизительно на два порядка меньшей, чем у цисплатина. Дослідження виконано за фінансової підтримки цільової програми “Науково-дослідні роботи молодих учених НАН України 2019—2020 рр.”. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Хімія Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів Bioactivity prediction and synthesis of new 3-substituted 5-thiazolylmethylene rhodanines Прогнозирование биоактивности и синтез новых 3-замещенных 5-тиазолилметиленроданинов Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| spellingShingle |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів Кобзар, О.Л. Година, Д.М. Синенко, В.О. Ковалішин, В.В. Трохименко, О.П. Сливчук, С.Р. Музичка, О.В. Хімія |
| title_short |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| title_full |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| title_fullStr |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| title_full_unstemmed |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| title_sort |
прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів |
| author |
Кобзар, О.Л. Година, Д.М. Синенко, В.О. Ковалішин, В.В. Трохименко, О.П. Сливчук, С.Р. Музичка, О.В. |
| author_facet |
Кобзар, О.Л. Година, Д.М. Синенко, В.О. Ковалішин, В.В. Трохименко, О.П. Сливчук, С.Р. Музичка, О.В. |
| topic |
Хімія |
| topic_facet |
Хімія |
| publishDate |
2020 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Bioactivity prediction and synthesis of new 3-substituted 5-thiazolylmethylene rhodanines Прогнозирование биоактивности и синтез новых 3-замещенных 5-тиазолилметиленроданинов |
| description |
З використанням розроблених регресійної і класифікаційної QSAR-моделей для прогнозування антибластичної активності сполук щодо клітин лінії Hep-2 проаналізовано базу віртуальних структур Z- та
E-ізомерних тіазоловмісних похідних N-метил-, N-бензил- і N-фенілетилзаміщених роданінів. Методом молекулярного докінгу оцінено відносну спорідненість 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів до АТФ-зв'язувального центру потенційної білкової мішені — протеїнкінази Pim-1. За результатами віртуального скринінгу із бази даних відібрано десять сполук, які було синтезовано шляхом взаємодії N-заміщених роданінів з
тіазол-2-карбоксальдегідами, тіазол-4-карбоксальдегідами та тіазол-5-карбоксальдегідами. На підставі in
vitro досліджень сполук з N-заміщеним роданіновим скафолдом встановлено, що їх цитотоксична дія на
культуру клітин аденокарциноми гортані людини Hер-2 у 2,7–10 разів поступається впливу цисплатину як
референс-препарату. Найбільш вираженою дією характеризувались роданінова похідна з 5-заміщеним
тіазол-2-ільним і N-(4-метоксифеніл)етильним замісниками та сполука з 2-заміщеним тіазол-4-ільним і
N-4-метилбензильним замісниками. При цьому їх токсичність, визначена на моделі гідробіонта D. magna,
була приблизно на два порядки меншою, ніж у цисплатину.
The virtual screening of a database of Z- and E-isomeric thiazole-containing derivatives of N-methyl-, N-ben zyland
N-phenylethyl-substuted rhodanines is performed by regression and classification QSAR models for predicting
the antiblastic activity of compounds against Hep-2 cells. The molecular docking method is used to evaluate
the affinity of 3-substituted 5-thiazolylmethylene rhodanines to the ATP-binding site of potential target
protein, the protein kinase Pim-1. According to the virtual screening results, ten compounds from the database
were selected and synthesized by the reaction of N-substituted rhodanines with thiazol-2-carboxaldehydes,
thiazol-4-carboxaldehydes and thiazol-5-carboxaldehydes. In vitro study of the compounds with N-substituted
rhodanine scaffold showed the cytotoxic activity on the cell culture of human laryngeal adenocarcinoma Hep-2
which was 2.7-10 times lower in comparison with the effect of cisplatin as a reference. The results indicated
that the rhodanine derivative with thiazol-2-yl and N-(4-methoxyphenyl)ethyl substituents, as well as rhodanine
compound bearing thiazol-4-yl and N-4-methylbenzyl groups, exhibited the most pronounced effects.
The toxicity of these compounds evaluated on hydrobiont D. magna was two orders of magnitude lower
than that of cisplatin.
С использованием разработанных регрессионной и классификационной QSAR-моделей для прогнозирования антибластической активности соединений по отношению к клеткам линии Hep-2 проанализирована
база виртуальных структур Z- и E-изомерных тиазолсодержащих производных N-метил, N-бензил- и
N-фенилэтилзамещенных роданинов. Методом молекулярного докинга оценено относительное сродство
3-замещенных 5-тиазолилметиленроданинов к АТФ-связывающему центру потенциальной белковой
мишени — протеинкиназы Pim-1. На основании виртуального скрининга из базы данных было отобрано
десять соединений, которые затем были синтезированы путем взаимодействия N-замещенных роданинов
с тиазол-2-карбоксальдегидами, тиазол-4-карбоксальдегидами и тиазол-5-карбоксальдегидами. Результаты исследования in vitro соединений с N-замещенным роданиновым скаффолдом свидетельствуют о том,
что их цитотоксическое действие на культуру клеток аденокарценомы гортани человека Hep-2 в 2,7—
10 раз уступает влиянию цисплатина как референс-препарата. Наиболее выраженным действием характеризируются роданиновое производные с 5-замещенным тиазол-2-ильным и N-(4-метоксифенил)этильным заместителями, а также соединение с 2-замещенным тиазол-4-ильным и N-4-метилбензильным заместителями. При этом токсичность этих соединений, которую оценивали на модели гидробионта
D. magna, была приблизительно на два порядка меньшей, чем у цисплатина.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/170506 |
| citation_txt |
Прогнозування біоактивності і синтез нових 3-заміщених 5-тіазолілметиленроданінів / О.Л. Кобзар, Д.М. Година, В.О. Синенко, В.В. Ковалішин, О.П. Трохименко, С.Р. Сливчук, О.В. Музичка // Доповіді Національної академії наук України. — 2020. — № 5. — С. 70-77. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT kobzarol prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT godinadm prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT sinenkovo prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT kovalíšinvv prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT trohimenkoop prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT slivčuksr prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT muzičkaov prognozuvannâbíoaktivnostíísinteznovih3zamíŝenih5tíazolílmetilenrodanínív AT kobzarol bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT godinadm bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT sinenkovo bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT kovalíšinvv bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT trohimenkoop bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT slivčuksr bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT muzičkaov bioactivitypredictionandsynthesisofnew3substituted5thiazolylmethylenerhodanines AT kobzarol prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT godinadm prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT sinenkovo prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT kovalíšinvv prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT trohimenkoop prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT slivčuksr prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov AT muzičkaov prognozirovaniebioaktivnostiisinteznovyh3zameŝennyh5tiazolilmetilenrodaninov |
| first_indexed |
2025-11-28T05:37:34Z |
| last_indexed |
2025-11-28T05:37:34Z |
| _version_ |
1850853413198233600 |