Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів
За допомогою RAPD маркерів досліджено генетичний поліморфізм двох ендемічних видів деревію Achillea glaberrima Кlok. та Achillea leptophilla Bieb. Рівень поліморфізму у A. leptophilla склав 75% і 46% - у A. glaberrima. В цілому отримані дані свідчать про значно більший рівень поліморфізму у A. le...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Дата: | 2009 |
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2009
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/176876 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів / Я.В. Пірко, Л.П. Таранець, О.О. Шакула, І.І. Коршиков, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2009. — Т. 7. — С. 34-36. — Бібліогр.: 3 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859591268609294336 |
|---|---|
| author | Пірко, Я.В. Таранець, Л.П. Шакула, О.О. Коршиков, І.І. Блюм, Я.Б. |
| author_facet | Пірко, Я.В. Таранець, Л.П. Шакула, О.О. Коршиков, І.І. Блюм, Я.Б. |
| citation_txt | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів / Я.В. Пірко, Л.П. Таранець, О.О. Шакула, І.І. Коршиков, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2009. — Т. 7. — С. 34-36. — Бібліогр.: 3 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description | За допомогою RAPD маркерів досліджено генетичний поліморфізм двох ендемічних
видів деревію Achillea glaberrima Кlok. та Achillea leptophilla Bieb. Рівень поліморфізму
у A. leptophilla склав 75% і 46% - у A. glaberrima. В цілому отримані дані свідчать про
значно більший рівень поліморфізму у A. leptophilla, який має більш широкий, хоча і
диз'юнктивний ареал, у порівнянні з вузьколокальним ендеміком A. glaberrima.
При помощи RAPD маркеров исследован генетический полиморфизм двух эндемичных
видов тысячелистника Achillea glaberrima Кlok. и Achillea leptophilla Bieb. Уровень
полиморфизма у A. leptophilla составил 75% и 46% - у A. glaberrima. В целом,
полученные данные свидетельствуют о значительно большем уровне полиморфизма A.
leptophilla, который имеет более широкий, хотя и дизъюнктивный ареал, по сравнению
с узколокальным эндемиком A. glaberrima.
Genetic polymorphism of the two endemic species Achillea glaberrima Кlok. and Achillea
leptophilla Bieb. have been studied using RAPD markers. The level of genetic polymorphism
of A. leptophilla is 75% and A. glaberrima - 46%. Obtained data indicate that the endemic A.
leptophilla with wide disjunctive area have march more level of genetic polymorphism than
the narrow-local A. glaberrima.
|
| first_indexed | 2025-11-27T16:02:58Z |
| format | Article |
| fulltext |
34
Karyological analysis of 16 spruce species and interspecific hybrid have been carried out.
Diploid complements of these species include 24 chromosomes (2n=24). In karyotypes of 11
species supernumerous (B-) chromosomes occur: P. schrenkiana, P. jezoensis, P. pungens, P.
x fennica и P. breweriana – 2n=24+1B, P. koyamae and P. engelmannii – 2n=24+1-2B, P.
ajanensis and P. meyeri – 2n=24+1-3B, P. obovata – 2n=24+1-4B, P. glehnii – 2n=24+1-5B.
Morphology of B-chromosomes mainly is metacentric or submetacentric. Geographical
distribution and possible significance of B-chromosome in Picea representatives are
presented.
ПІРКО Я.В. 1, ТАРАНЕЦЬ Л. П. 2, ШАКУЛА О.О. 3, КОРШИКОВ І.І. 3,
БЛЮМ Я.Б. 1
1Державна установа «Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України»,
Україна, 04123, м. Київ, вул. Осиповського, 2а, e-mail: yavp@mail.ru
2Національний університет Києво-Могилянська академія, Україна, 04070, м. Київ,
вул. Г. Сковороди, 2, e-mail: itillia@rambler.ru
3Донецький ботанічний сад НАН України,Україна, 83059, м. Донецьк, пр. Ілліча, 110, e-
mail:herb@herb.dn.ua
ДОСЛІДЖЕННЯ ГЕНЕТИЧНОЇ МІНЛИВОСТІ ACHILLEA GLABERRIMA
KLOK. ТА ACHILLEA LEPTOPHILLA BIEB. ЗА ДОПОМОГОЮ RAPD
МАРКЕРІВ
Збереження та прогнозування існування природних популяцій окремих видів
рослин, які знаходяться під загрозою зникнення, вимагає проведення комплексних
біологічних досліджень щодо визначення динаміки чисельності, просторової, вікової та
генетичної структури популяцій. Оцінку генетичної різноманітності популяцій все
частіше проводять із застосуванням молекулярно- генетичних методів аналізу, які
базуються на використанні різного роду генетичних маркерів.
Achillea glaberrima (деревій голий) та Achillea leptophilla (деревій тонколистий
(м'яколистий)) належать до жовтоквіткових таксонів секції Filipendulinae (DC.) Afan. Ці
два види поширені в Україні на порівняно невеликій території. Зокрема, A. leptophilla є
причорноморським ендеміком кам'янистих оголень, а A. glaberrima відноситься до
стенотопних ендеміків Приазов’я, який зустрічається тільки на гранітних оголеннях
заповіднику «Кам’яні могили» (занесений до Червоної книги України). Слід зауважити,
що деякі дослідники вважають A. glaberrima похідною від A. leptophilla расою, яка
повністю втратила опушення. Обидва ці види заслуговують на всебічне вивчення та
охорону [1].
Матеріали та методи
Для вивчення генетичної мінливості A. leptophilla та A. glaberrima був
використаний RAPD-метод (Random Amplified Polymorphic DNA), перевагою якого є
технічна простота та швидкість проведення аналізу. Метод не потребує будь-якої
інформації про послідовність ДНК, яка, до речі, для аналізу може бути взята в
невеликій кількості.
Для аналізу використовували рослини A. glaberrima та A. leptophilla, що були
отримані в результаті пророщування насіння, яке було зібране в популяціях обох видів
на території заповідника «Кам’яні могили». ДНК з листя кожної рослини виділяли за
допомогою кіта (Gene EluteTM Plant Genomic DNA Miniprep Kit) фірми Sigma.
Ампліфікацію проводили з використанням чотирьох ОРР праймерів фірми
Operon,USA (ОРР 1, ОРР 2, ОРР 3, ОРР 5). Реакційна суміш для проведення
полімеразної ланцюгової реакції об’ємом 25 мкл містила: 50 нг геномної ДНК, 0,2 мкМ
праймера, 200 мкМ кожного: dATP, dCTP, dGTP та dTTP, 2,5 мМ МgCl2, 2,5 одиниці
35
Taq полімерази («Реплікон», Росія). Ампліфікацію проводили на ампліфікаторі АВ
2700 за наступною програмою: початкова денатурація при 95 ºС, 5 хв; ампліфікація - 45
циклів (95 ºС - 1 хв, 35 ºС - 1 хв, 72 ºС - 2 хв); кінцеве подовження - 72 ºС на протязі 7
хв. Продукти ампліфікації розділяли за допомогою електрофорезу в 2% агарозному гелі
в 1Х ТВЕ-буфері в присутності етидій броміду. Візуалізацію фрагментів проводили в
ультрафіолетовому світлі. Для визначення довжини фрагментів використовували ДНК-
маркер (GeneRuler™ 100 bp Plus DNA Ladder, ready-to-use) фірми Fermentas (Литва).
Для кількісної оцінки генетичного поліморфізму досліджуваних видів отримані
дані були представлені у вигляді матриці бінарних ознак, у якій наявність чи
відсутність RAPD-однакових фрагментів розглядалася відповідно як стан 1 чи 0, при
цьому враховувалися тільки відтворювані в повторних експериментах фрагменти.
Кожний RAPD-фрагмент розглядався як окремий генетичний локус [2].
Результати та обговорення
У результаті проведеного аналізу двох досліджуваних видів деревію виявлено 41
фрагмент, 32 з яких були поліморфними. Кількість ампліфікованих фрагментів ДНК у
сумарній вибірці залежала від праймера і складала в цілому від 7 (ОРР-3) до 13 (ОРР-5).
У середньому кожен з праймерів ініціював синтез 10 фрагментів ДНК. При аналізі
RAPD фрагментів двох видів деревію встановлено, що кількість поліморфних
фрагментів варіювала від 4 до 9 у A. leptophilla та від 4 до 12 у A. glaberrima. Загальна
кількість RAPD фрагментів у A. leptophilla становила 36, у A. glaberrima – 37. Рівень
поліморфізму ампліфікованих фрагментів ДНК, отриманих у результаті ПЛР зі всіма
використаними RAPD праймерами, становив відповідно у A. leptophilla - 75% і 46% - у
A. glaberrima. Кількість поліморфних фрагментів у сумарній вибірці варіювала від 5 до
12. Відповідно, залежно від RAPD праймера, рівень поліморфізму варіював від 66,7%
до 100%, склавши в цілому для двох видів 78%. Слід зазначити, що при дослідженні
одного з видів деревію – A. fragrantissima (Forssk.) SCH. BIP. – рівень поліморфізму за 6
RAPD праймерами, що утворюють 34 фрагменти, склав 65% [3]. В цілому отримані
дані свідчать про значно більший рівень поліморфізму у A. leptophilla, який має більш
широкий, хоча і диз'юнктивний ареал, у порівнянні з вузьколокальним ендеміком A.
glaberrima. Це може свідчити про звуження генетичного різноманіття у
вузькоареального виду A. glaberrima, високий ступінь адаптованості цього виду до
специфічних умов зростання (мова йдеться про сформований в процесі еволюції
генетичний оптимум виду), а також слабкий обмін генами між A. glaberrima та A.
leptophilla, хоча на межі своїх ареалів ці два види здатні утворювати міжвидові гібриди.
Слід також враховувати і деякі особливості виду A. glaberrima, а саме, значний внесок
вегетативного розмноження. Не виключено, що низький рівень поліморфізму в
майбутньому може стати однією з причин зникнення виду під все зростаючим
антропогенним тиском. В той же час не слід поки-що робити якісь однозначні
висновки, оскільки інформацію про генетичну мінливість виду не можна вважати
повною без відомостей про рівень гетерозиготності видів. Така інформація може бути
отримана завдяки залученню до популяційно-генетичного аналізу кодомінантних
маркерів, зокрема, ізоферментів, мікросателлітів. Використання як можна більшої
кількості різноманітних генетичних маркерів дасть можливість отримати більш
ґрунтовну інформацію стосовно генетичних процесів, що відбуваються в популяціях
досліджуваних видів, а також вивчити питання, пов’язані з філогенією представників
роду Achillea.
Література
1. Сытник К.М., Андрощук А.Ф., Клоков М.В. и др. Тысячелистники. – К.: Наук.
думка, 1984. – 272с.
2. Бронникова С.В., Кокаева З.Г., Гостимский С.А., Дрибноходова О.П.,
Тихомирова Н.Н. Анализ ДНК-полиморфизма реликтововго вида Урала
36
наперстянки крупноцветковой (Digitalis grandiflora Mill.) с помощью RAPD- и
ISSR-маркеров // Генетика. – 2007. – Т.43, №5. – С. 653-659.
3. Morsy A.A. Molecular Variations of Achillea fragrantissima (Forssk.) SCH. BIP.
Growing in Five Areas of South Sinai // Int. J. Agri. Biol.� 2007. �Vol. 9, No. 1 � P.
11-17.
Резюме
За допомогою RAPD маркерів досліджено генетичний поліморфізм двох ендемічних
видів деревію Achillea glaberrima Кlok. та Achillea leptophilla Bieb. Рівень поліморфізму
у A. leptophilla склав 75% і 46% - у A. glaberrima. В цілому отримані дані свідчать про
значно більший рівень поліморфізму у A. leptophilla, який має більш широкий, хоча і
диз'юнктивний ареал, у порівнянні з вузьколокальним ендеміком A. glaberrima.
При помощи RAPD маркеров исследован генетический полиморфизм двух эндемичных
видов тысячелистника Achillea glaberrima Кlok. и Achillea leptophilla Bieb. Уровень
полиморфизма у A. leptophilla составил 75% и 46% - у A. glaberrima. В целом,
полученные данные свидетельствуют о значительно большем уровне полиморфизма A.
leptophilla, который имеет более широкий, хотя и дизъюнктивный ареал, по сравнению
с узколокальным эндемиком A. glaberrima.
Genetic polymorphism of the two endemic species Achillea glaberrima Кlok. and Achillea
leptophilla Bieb. have been studied using RAPD markers. The level of genetic polymorphism
of A. leptophilla is 75% and A. glaberrima - 46%. Obtained data indicate that the endemic A.
leptophilla with wide disjunctive area have march more level of genetic polymorphism than
the narrow-local A. glaberrima.
ПОЛІЩУК Л.В.1, ЛУКЯНЧУК В.В.1, МАРІЄВСЬКИЙ В.Ф.2, РУБАН Н.М.2.
1 Інститут мікробіології і вірусології НАН України,
Україна, Д03680, Київ, вул. акад. Заболотного, 154, e-mail: Polischuk@serv.imv.kiev.ua
2 Інститут епідеміології та інфекційних хвороб АМН України,
Україна, 03038, Київ, вул. акад. Амосова, 5
ПЛАЗМІДИ ТРЬОХ КЛІНІЧНИХ ШТАМІВ ESCHERICHIA COLI
Як відомо, внутрішньо лікарняні інфекції (ВЛІ) стали однією з найбільш гострих
проблем сучасної системи охорони здоров‘я як в Україні, так і у всьому світі [1, 2, 7.
10]. Однією з характерних рис ВЛІ сьогодення є те, що її спалахи часто спричиняють
умовно-патогенні мікроорганізми [1, 2, 7]. До 50% випадків ВЛІ її збудниками є
бактерії родини Enterobacteriaceaе, однак найбільш часто їх спричиняють штами
Eschrichia coli, деякі види родів Kebsiella, Enterobacter, Proteus, Providencia та ряд
інших [7, 8].
Встановлено, що плазміди широко поширені серед представників цієї родини
мікроорганізмів [8, 12]. Позахромосомна ДНК виявлена у 25-75% всіх досліджених
штамів, в залежності від місця відбору зразка та родових особливостей бактерій [12].
Наявність плазмідних ДНК у патогенних та умовно патогенних мікроорганізмів має
особливо велике значення через детермінацію ними стійкості до антибіотиків чи
синтезу токсинів та можливість передачі цих властивостей патогенним
мікроорганізмам [11].
У трьох клінічних штамів Eschrichia coli було виявлено плазмідні ДНК. Метою
роботи було визначення їх молекулярного розміру та рестрикційний аналіз.
Матеріали і методи
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-176876 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 2219-3782 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-27T16:02:58Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Пірко, Я.В. Таранець, Л.П. Шакула, О.О. Коршиков, І.І. Блюм, Я.Б. 2021-02-08T18:07:31Z 2021-02-08T18:07:31Z 2009 Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів / Я.В. Пірко, Л.П. Таранець, О.О. Шакула, І.І. Коршиков, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2009. — Т. 7. — С. 34-36. — Бібліогр.: 3 назв. — укр. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/176876 За допомогою RAPD маркерів досліджено генетичний поліморфізм двох ендемічних видів деревію Achillea glaberrima Кlok. та Achillea leptophilla Bieb. Рівень поліморфізму у A. leptophilla склав 75% і 46% - у A. glaberrima. В цілому отримані дані свідчать про значно більший рівень поліморфізму у A. leptophilla, який має більш широкий, хоча і диз'юнктивний ареал, у порівнянні з вузьколокальним ендеміком A. glaberrima. При помощи RAPD маркеров исследован генетический полиморфизм двух эндемичных видов тысячелистника Achillea glaberrima Кlok. и Achillea leptophilla Bieb. Уровень полиморфизма у A. leptophilla составил 75% и 46% - у A. glaberrima. В целом, полученные данные свидетельствуют о значительно большем уровне полиморфизма A. leptophilla, который имеет более широкий, хотя и дизъюнктивный ареал, по сравнению с узколокальным эндемиком A. glaberrima. Genetic polymorphism of the two endemic species Achillea glaberrima Кlok. and Achillea leptophilla Bieb. have been studied using RAPD markers. The level of genetic polymorphism of A. leptophilla is 75% and A. glaberrima - 46%. Obtained data indicate that the endemic A. leptophilla with wide disjunctive area have march more level of genetic polymorphism than the narrow-local A. glaberrima. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Молекулярна структура та організація геномів Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів Article published earlier |
| spellingShingle | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів Пірко, Я.В. Таранець, Л.П. Шакула, О.О. Коршиков, І.І. Блюм, Я.Б. Молекулярна структура та організація геномів |
| title | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів |
| title_full | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів |
| title_fullStr | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів |
| title_full_unstemmed | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів |
| title_short | Дослідження генетичної мінливості Achillea glaberrima Klok. та Achillea leptophilla Bieb. за допомогою rapd маркерів |
| title_sort | дослідження генетичної мінливості achillea glaberrima klok. та achillea leptophilla bieb. за допомогою rapd маркерів |
| topic | Молекулярна структура та організація геномів |
| topic_facet | Молекулярна структура та організація геномів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/176876 |
| work_keys_str_mv | AT pírkoâv doslídžennâgenetičnoímínlivostíachilleaglaberrimakloktaachillealeptophillabiebzadopomogoûrapdmarkerív AT taranecʹlp doslídžennâgenetičnoímínlivostíachilleaglaberrimakloktaachillealeptophillabiebzadopomogoûrapdmarkerív AT šakulaoo doslídžennâgenetičnoímínlivostíachilleaglaberrimakloktaachillealeptophillabiebzadopomogoûrapdmarkerív AT koršikovíí doslídžennâgenetičnoímínlivostíachilleaglaberrimakloktaachillealeptophillabiebzadopomogoûrapdmarkerív AT blûmâb doslídžennâgenetičnoímínlivostíachilleaglaberrimakloktaachillealeptophillabiebzadopomogoûrapdmarkerív |