Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів

Aims. Bacteriophages are diverse group of bacterial parasites which have complex, but insuffi cient systematics. RB43-related bacteriophages have a specifi c genome type that clearly distinguishes them from other T4-like viruses. The main aim was to identify new Myoviridae phage Lw1 isolated as an...

Full description

Saved in:

Bibliographic Details
Published in:	Фактори експериментальної еволюції організмів
Date:	2015
Main Author:	Кушкіна, А.І.
Format:	Article
Language:	Ukrainian
Published:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2015
Subjects:	Еволюція геномів у природі та експерименті
Online Access:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177361
Tags:	Add Tag No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів / А.І. Кушкіна // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 55-57. — Бібліогр.: 7 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177361
record_format	dspace
spelling	Кушкіна, А.І. 2021-02-15T13:29:26Z 2021-02-15T13:29:26Z 2015 Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів / А.І. Кушкіна // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 55-57. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177361 578.811+578.56 Aims. Bacteriophages are diverse group of bacterial parasites which have complex, but insuffi cient systematics. RB43-related bacteriophages have a specifi c genome type that clearly distinguishes them from other T4-like viruses. The main aim was to identify new Myoviridae phage Lw1 isolated as an E. coli BL21 (DE3) contaminant. Methods. Microbiological, biophysical, molecular biology and bioinformatic methods were used to reach the aims. Results. Here we present main characteristics and complete genome sequence of a new lytic phage Lw1 which shares RB43-like genome organization, but it does not contain putative AP2-domain endonuclease genes. Conclusions. By genomic organization phage Lw1 belongs to subgroup of RB43- like pseudo T-even phages. Although the Lw1 genome does contain one T4-like phage endonuclease of the MobE family, there is a lack of AP2-domain-containing endonucleases, and the relative paucity of mobile elements indicates either recent loss events or the presence of limited sites for viable insertion in the genome compared to some other RB43-like phages. Keywords: T4-like phages, identifi cation, morphology, structural proteins, DNA pattern, genome organization, phagespecifi c nucleases, gene drift. Автор висловлює подяку А. М. Остапчуку за допомогу у виконанні ДСН-ПААГ, та Ф. І. Товкачу за планування експериментів та дискусію. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Еволюція геномів у природі та експерименті Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів Article published earlier
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
title	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів
spellingShingle	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів Кушкіна, А.І. Еволюція геномів у природі та експерименті
title_short	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів
title_full	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів
title_fullStr	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів
title_full_unstemmed	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів
title_sort	структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага lw1, нового представника псевдо т-парних фагів
author	Кушкіна, А.І.
author_facet	Кушкіна, А.І.
topic	Еволюція геномів у природі та експерименті
topic_facet	Еволюція геномів у природі та експерименті
publishDate	2015
language	Ukrainian
container_title	Фактори експериментальної еволюції організмів
publisher	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format	Article
description	Aims. Bacteriophages are diverse group of bacterial parasites which have complex, but insuffi cient systematics. RB43-related bacteriophages have a specifi c genome type that clearly distinguishes them from other T4-like viruses. The main aim was to identify new Myoviridae phage Lw1 isolated as an E. coli BL21 (DE3) contaminant. Methods. Microbiological, biophysical, molecular biology and bioinformatic methods were used to reach the aims. Results. Here we present main characteristics and complete genome sequence of a new lytic phage Lw1 which shares RB43-like genome organization, but it does not contain putative AP2-domain endonuclease genes. Conclusions. By genomic organization phage Lw1 belongs to subgroup of RB43- like pseudo T-even phages. Although the Lw1 genome does contain one T4-like phage endonuclease of the MobE family, there is a lack of AP2-domain-containing endonucleases, and the relative paucity of mobile elements indicates either recent loss events or the presence of limited sites for viable insertion in the genome compared to some other RB43-like phages. Keywords: T4-like phages, identifi cation, morphology, structural proteins, DNA pattern, genome organization, phagespecifi c nucleases, gene drift.
issn	2219-3782
url	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177361
citation_txt	Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів / А.І. Кушкіна // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 55-57. — Бібліогр.: 7 назв. — укр.
work_keys_str_mv	AT kuškínaaí strukturnítagenetičníosoblivostílítičnogobakteríofagalw1novogopredstavnikapsevdotparnihfagív
first_indexed	2025-12-07T19:26:48Z
last_indexed	2025-12-07T19:26:48Z
_version_	1850878835359219712

Структурні та генетичні особливості літичного бактеріофага Lw1, нового представника псевдо Т-парних фагів

Institution

Similar Items