Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.

Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.

Aims. White cabbage is characterized by high level of intraspecifi c heterogeneity due to some biological features that causes diffi culties for breeding at creation constant form and maintaining of their genetic typicality. Thus, we studied the effectiveness the set of SSR markers for both white...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Фактори експериментальної еволюції організмів
Дата:2015
Автори: Шаптуренко, М.Н., Печковская, Т.В., Вакула, С.И., Хотылева, Л.В.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2015
Теми:
Прикладна генетика і селекція
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177381
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L. / М.Н. Шаптуренко, Т.В. Печковская, С.И. Вакула, Л.В. Хотылева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 170-173. — Бібліогр.: 8 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177381
record_format dspace
spelling Шаптуренко, М.Н.
Печковская, Т.В.
Вакула, С.И.
Хотылева, Л.В.
2021-02-15T13:50:10Z
2021-02-15T13:50:10Z
2015
Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L. / М.Н. Шаптуренко, Т.В. Печковская, С.И. Вакула, Л.В. Хотылева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 170-173. — Бібліогр.: 8 назв. — рос.
2219-3782
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177381
635.342:57.015.3:577.21
Aims. White cabbage is characterized by high level of intraspecifi c heterogeneity due to some biological features that causes diffi culties for breeding at creation constant form and maintaining of their genetic typicality. Thus, we studied the effectiveness the set of SSR markers for both white cabbage diversity analysis and pure lines genotyping. Methods. Molecular-genetic studies were performed trough SSR PCR. Effectiveness the set of markers was evaluated by counting allelic richness, PICs, heterogeneity, allele frequencies using GenAlEx 6.5. To determine B.o.var capitata diversity with low and high variations, Jaccard dissimilarity index was estimated by Darwin software. Results. 15 microsatellite loci were characterized for the information content, allelic frequencies and heterogeneity level. The effective multiallelic markers (Bo20TR, BoDCTD4, BoPC34, BoPLD1, BoCalc) with high information content (PIC > 0.7) that could be successfully used for the analysis of inter- and intravarietal polymorphism B. oleracea var.capitata were defi ned. Based on the SSR-evaluation and subsequent clustering the genetic structure of breeding collection was established, which showed that most experimental forms have a common ancestral genetic basis, in spite of different origins. Conclusions. Proposed set of informative SSR markers is a useful tool for the selection of genetically constant material, as well as divergent cross combinations for the hybrid breeding. Identifi ed donors of rare SSR alleles potentially could be a source of valuable genetic segregation for further B. oleracea improvement. Keywords: Brassica oleracea var. capitata L. f. alba DC, genetic diversity, SSR.
Выражаем благодарность сотрудникам РУП Институт овощеводства НАН Беларуси за предоставленный для исследований селекционный материал капусты белокочанной.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Фактори експериментальної еволюції організмів
Прикладна генетика і селекція
Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
Comparative diversity simple sequence repeat loci from Brassica oleracea var. capitata L.
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
spellingShingle Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
Шаптуренко, М.Н.
Печковская, Т.В.
Вакула, С.И.
Хотылева, Л.В.
Прикладна генетика і селекція
title_short Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
title_full Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
title_fullStr Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
title_full_unstemmed Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L.
title_sort сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов brassica oleracea var. capitata l.
author Шаптуренко, М.Н.
Печковская, Т.В.
Вакула, С.И.
Хотылева, Л.В.
author_facet Шаптуренко, М.Н.
Печковская, Т.В.
Вакула, С.И.
Хотылева, Л.В.
topic Прикладна генетика і селекція
topic_facet Прикладна генетика і селекція
publishDate 2015
language Russian
container_title Фактори експериментальної еволюції організмів
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Comparative diversity simple sequence repeat loci from Brassica oleracea var. capitata L.
description Aims. White cabbage is characterized by high level of intraspecifi c heterogeneity due to some biological features that causes diffi culties for breeding at creation constant form and maintaining of their genetic typicality. Thus, we studied the effectiveness the set of SSR markers for both white cabbage diversity analysis and pure lines genotyping. Methods. Molecular-genetic studies were performed trough SSR PCR. Effectiveness the set of markers was evaluated by counting allelic richness, PICs, heterogeneity, allele frequencies using GenAlEx 6.5. To determine B.o.var capitata diversity with low and high variations, Jaccard dissimilarity index was estimated by Darwin software. Results. 15 microsatellite loci were characterized for the information content, allelic frequencies and heterogeneity level. The effective multiallelic markers (Bo20TR, BoDCTD4, BoPC34, BoPLD1, BoCalc) with high information content (PIC > 0.7) that could be successfully used for the analysis of inter- and intravarietal polymorphism B. oleracea var.capitata were defi ned. Based on the SSR-evaluation and subsequent clustering the genetic structure of breeding collection was established, which showed that most experimental forms have a common ancestral genetic basis, in spite of different origins. Conclusions. Proposed set of informative SSR markers is a useful tool for the selection of genetically constant material, as well as divergent cross combinations for the hybrid breeding. Identifi ed donors of rare SSR alleles potentially could be a source of valuable genetic segregation for further B. oleracea improvement. Keywords: Brassica oleracea var. capitata L. f. alba DC, genetic diversity, SSR.
issn 2219-3782
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177381
citation_txt Сравнительный анализ аллельного состава микросателлитных локусов Brassica oleracea var. capitata L. / М.Н. Шаптуренко, Т.В. Печковская, С.И. Вакула, Л.В. Хотылева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 170-173. — Бібліогр.: 8 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT šapturenkomn sravnitelʹnyianalizallelʹnogosostavamikrosatellitnyhlokusovbrassicaoleraceavarcapitatal
AT pečkovskaâtv sravnitelʹnyianalizallelʹnogosostavamikrosatellitnyhlokusovbrassicaoleraceavarcapitatal
AT vakulasi sravnitelʹnyianalizallelʹnogosostavamikrosatellitnyhlokusovbrassicaoleraceavarcapitatal
AT hotylevalv sravnitelʹnyianalizallelʹnogosostavamikrosatellitnyhlokusovbrassicaoleraceavarcapitatal
AT šapturenkomn comparativediversitysimplesequencerepeatlocifrombrassicaoleraceavarcapitatal
AT pečkovskaâtv comparativediversitysimplesequencerepeatlocifrombrassicaoleraceavarcapitatal
AT vakulasi comparativediversitysimplesequencerepeatlocifrombrassicaoleraceavarcapitatal
AT hotylevalv comparativediversitysimplesequencerepeatlocifrombrassicaoleraceavarcapitatal
first_indexed 2025-12-02T08:48:17Z
last_indexed 2025-12-02T08:48:17Z
_version_ 1850861946016890880

Схожі ресурси