Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине
The aim of this research was to conduct the comparative analysis of the karyotype of new human stem cell line 4BL at different stages of cultivation in vitro. Methods. The array CGH Oxford Gene Technology was used. Results. At the 120, 160 and 205 passages such the same aberrations were revealed: du...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Datum: | 2015 |
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2015
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177408 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине / А.К. Коляда, А.М. Вайсерман, Д.С. Красненков, Т.В. Плетнева, И.Н. Карабань // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 216-220. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1860067681634353152 |
|---|---|
| author | Коляда, А.К. Вайсерман, А.М. Красненков, Д.С. Плетнева, Т.В. Карабань, И.Н. |
| author_facet | Коляда, А.К. Вайсерман, А.М. Красненков, Д.С. Плетнева, Т.В. Карабань, И.Н. |
| citation_txt | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине / А.К. Коляда, А.М. Вайсерман, Д.С. Красненков, Т.В. Плетнева, И.Н. Карабань // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 216-220. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description | The aim of this research was to conduct the comparative analysis of the karyotype of new human stem cell line 4BL at different stages of cultivation in vitro. Methods. The array CGH Oxford Gene Technology was used. Results. At the 120, 160 and 205 passages such the same aberrations were revealed: duplications of 2q31.1-q33.1, 10 q22.1-q22.2 and q24.2-q26.11, 16 q12.1-q12.2 and q22.1-q24.3, 19 р13.3-р12 and deletions of 4 q24-q35.2, 10 p14-p12.1 and q26.11-q26.3, 12 p13.33-p11.1, 13 q12.11-q21.2, 17 q11.1-q21.31, Х p22.33 and q21.31-q21.32. Also at each passage some minor aberrations appears, which further were removed at the next stage, and so on. Conclusions. Obviously main genome rearrangements occurred until 120th passage, so stem cell line 4BL passed the establishment stage until this time and now is at the stabilization stage.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:08:40Z |
| format | Article |
| fulltext |
210 ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16
© КОЛЯДА А. К., ВАЙСЕРМАН А. М., КРАСНЕНКОВ Д. С., ПЛЕТНЕВА Т. В., КАРАБАНЬ И. Н.
Болезнь Паркинсона (БП) является вторым
по распространенности нейродегенеративным
заболеванием, которое встречается среди людей
старше 65 лет [1]. При данной патологии проис-
ходит гибель дофаминергических нейронов чер-
ной субстанции и накопление в межклеточном
пространстве агрегатов α-синуклеина и других
характерных белковых комплексов [2]. Феноти-
пическими проявлениями болезни являются тре-
мор покоя, брадикинезия и постуральные нару-
шения.
В развитии БП существенную роль игра-
ет генетический фактор. Так, семейные формы
заболевания составляют около 5–10 % случаев.
При этом болезнь характеризуется выраженной
генетической гетерогенностью. В настоящее вре-
мя выявлены 16 генов-кандидатов, полиморфиз-
мы которых ассоциированы с БП [3]. Кроме того,
продолжается активный поиск мутаций, которые
могут быть связаны с разными звеньями патоге-
неза заболевания. На молекулярном уровне мо-
ногенные формы БП являются генетически опо-
средованной патологией ряда митохондриальных
белков, компонентов убиквитин-протеасомного
комплекса или белков, замена конформации ко-
торых приводит к необратимым изменениям
в клетке с формированием нерастворимых вклю-
чений, что инициирует реакции окислительного
стресса и апоптоза. Также были проведены мно-
гочисленные эпидемиологические исследования
для выяснения влияния факторов окружающей
среды на развитие БП. Выявлено, что риск раз-
вития болезни растет при длительном контакте
с пестицидами [4]. Однако вопросы соотноше-
ния этих факторов, их популяционной специ-
фичности, а также профилактики до настоящего
времени разработаны не в полной мере. Целью
нашей работы было провести генотипирование
пациентов с БП и неврологически здоровых
людей по генам, вызывающим БП (GBA, SNCA,
LRRK2) и повышающим склонность к заболева-
УДК 575.113.2:616.858-008.6:616.8-056.76
КОЛЯДА А. К.1, ВАЙСЕРМАН А. М.1, КРАСНЕНКОВ Д. С.1, ПЛЕТНЕВА Т. В.1, 2,
КАРАБАНЬ И. Н.1
1 Государственное учреждение «Институт геронтологии им. Д.Ф. Чеботарёва НАМН Украины»,
Украина, 04114, г. Киев, ул. Вышгородская, 67, e-mail: alex.genetic@gmail.com
2 Частное высшее учебное заведение «Киевский медицинский университет УАНМ»,
Украина, 01004, г. Киев, ул. Льва Толстого, 9, e-mail: pletneva1706@gmail.com
ИЗУЧЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ
БОЛЕЗНИ ПАРКИНСОНА В УКРАИНЕ
нию (АРОЕ), а также определить длину теломер
в клетках буккального эпителия и лейкоцитах пе-
реферической крови.
Материалы и методы
Генотипирование проводили методом
ПДРФ-ПЦР. Использовали образцы крови 216
пациентов с БП (средний возраст 65,0 ± 0,7
лет, 116 мужчин и 100 женщин) и контрольной
группы из 300 человек (средний возраст 67,0 ±
0,4 лет, 200 мужчин и 100 женщин). Выделение
ДНК проводили из цельной крови с помощью
набора «ДНК-Сорб B» (Россия). Амплификацию
изученных локусов осуществляли с использова-
нием сайт-специфических праймеров на ампли-
фикаторе «CorbettResearch PCR ThermalCycler»
производства компании «Corbett LifeScience».
Рестрикцию полученных ампликонов проводили
в соответствии с рекомендациями фирмы-произ-
водителя специфических рестриктаз (Fermentas).
Результаты амплификации и рестрикции оцени-
вались путем проведения вертикального элек-
трофореза в 3 % агарозном геле.
Определение длины теломер в лизате кле-
ток проводили методом ПЦР с детекцией флу-
оресценции в реальном времени по методике
Cawthon, 2009 [5]. Для амплификации теломер-
ных последовательностей использовали прайме-
ры telg ACACTAAGGTTTGGGTTTGGGTTTG
GGTTTGGGTTAGTGT и telc TGTTAGGTATC
CCTATCCCTATCCCTATCCCTATCCCTAACA,
для амплификации однокопийного референсного
гена альбумина использовали праймеры albс CG
GCGGCGGGCGGCGCGGGCTGGGCGGAAAT
GCTGCACAGAATCCTTG и albd GCCCGGCCC
GCCGCGCCCGTCCCGCCGGAAAAGCATGGT
CGCCTGT.
Относительную длину теломер оценивали
по показателю T/S, который рассчитывали как
отношение числа копий теломерных повторов
к числу копий гена альбумина.
ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16 211
Èçó÷åíèå ìîëåêóëÿðíî-ãåíåòè÷åñêèõ ìàðêåðîâ áîëåçíè Ïàðêèíñîíà â Óêðàèíå
Математическую обработку результатов
проводили с использованием пакетов статисти-
ческих программ Statistica v.5.5 [StatSoft Inc.,
USA] и MS Excel 98. Степень ассоциаций оце-
нивали в значениях показателей отношения
шансов (odds ratio, OR). Фактическую (He) и те-
оретическую (Ho) гетерозиготность популяций
вычисляли при помощи метода Россета-Раймон-
да. Панмиктичность популяции рассчитывали
по формуле равновесия Харди-Вайнберга. Для
определения разницы между частотами аллелей
в контрольной и опытной группах использовали
критерий χ2. Статистическую значимость раз-
личий величины показателя T/S в контрольной
группе и у пациентов с БП определяли с помо-
щью t-критерия Стьюдента.
Результаты и обсуждение
Проведено генотипирование мутации
g.40734202G>A в 41-м экзоне гена LRRK2, ко-
торая приводит к замене остатка глицина на
остаток серина в позиции 219 кодируемого ге-
ном белка. По результатам генотипирования все
участники контрольной группы оказались носи-
телями аллеля А, носителей аллеля G обнару-
жено не было (табл.). Контрольная группа была
представлена носителями только одного геноти-
па — g.40734202GG, а генотипов g.40734202AA
и g.40734202AG не обнаружено. Оценка гетеро-
зиготности по методу Россета-Раймонда не дала
результатов, так как в контрольной группе не
было носителей AG генотипа.
В группе пациентов с БП обнаружены но-
сители аллеля g.40734202A (0,93 %). Таким об-
разом, в группе больных присутствовали как
гетерозиготы g.40734202AG (1,85 %), так и гомо-
зиготы по g.40734202G аллелю (98,15 %). Про-
верка по критерию χ2 показала, что различия
между контрольной и исследуемой группами
являются достоверными (df = 2, p < 0,05). С по-
мощью формулы равновесия Харди-Вайнберга
установлено, что группа является панмиктиче-
ской и может считаться репрезентативной.
Генотип g.40734202AА не был обнаружен
ни в контрольной группе, ни среди больных.
Сходные результаты получены в исследовани-
ях, проведенных и на других популяциях, что,
по-видимому, связано с низкой частотой данного
аллеля или летальностью генотипа АА [6]. Дан-
ная мутация является наиболее встречающейся
мутацией гена LRRK2. Ее частота в популяциях
Европы составляет до 4,6 % у больных споради-
ческой формой БП и 11,5 % у больных с семей-
ной формой БП. У евреев ашкенази частота му-
тации, по некоторым данным, достигает 13,3 %
у спорадических больных и 29,7 % у больных
с семейной формой БП. У жителей России она
выявляется у 13 % пациентов с семейной формой
и у 0,5 % — при спорадической форме [7]. У ара-
бов Северной Африки частота мутации состав-
ляет 40,8 % у спорадических больных и 37,0 %
у больных с семейной формой БП [8, 9]. В то
же время эта мутация крайне редко встречается
у монголоидов [10].
Таблица
Частоты встречаемости генотипов и аллелей генов в исследуемых группах
Ген Мутация Генотип Контроль БП χ2, р
(df = 2)
LRRK2
g.40734202G > A
GG 300 (100) 212 (98,15)
25,81,
p = 0,0034AG 0 4 (1,85)
AA 0 0
G 100 99,07
A 0 0,93
GBA
c.1226A > G
AA 300 (100) 211 (97,69)
26,40,
р = 0,008AG 0 5 (2,31)
GG 0 0
Частота аллелей A 100 98,84
G 0 1,16
GBA
c.483T > C
TT 300 (100) 212 (98,15)
25,81,
p = 0,0034TC 0 4 (1,85)
CC 0 0
Т 100 99,07
С 0 0,93
212 ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16
Êîëÿäà À. Ê., Âàéñåðìàí À. Ì., Êðàñíåíêîâ Ä. Ñ., Ïëåòíåâà Ò. Â., Êàðàáàíü È. Í.
Также исследован ген GBA, кодирующий
глюкоцереброзидазу. При недостатке данного
фермента лизосомальные макромолекулы на-
капливаются в различных клетках организма,
в особенности в нейронах. Накопление жировых
отложений в мозге нарушает его кровоснабже-
ние, что приводит к снижению функциональ-
ности и активности структур мозга. Многочис-
ленные данные свидетельствуют о повышенном
риске развития БП, ассоциированном с гетеро-
зиготным носительством мутаций в данном гене
[11]. Анализ контрольной группы показал, что
все исследуемые имеют c.483ТТ генотип, часто-
та аллеля Т составляет 100 %. 483С аллеля в кон-
трольной группе обнаружено не было.
В группе пациентов с БП частота встречаемо-
сти генотипа c.483ТС составила 1,83 ± 0,0042 %,
генотипа c.483ТТ — 98,15 ± 0,0042 %. В данной
группе выявлено 4 гетерозиготных носителя му-
тации с.483Т>С. Частота c.483Т аллеля для дан-
ной группы составила 0,93. Проверка по формуле
равновесия Харди-Вайнберга показала случайное
распределение генотипов, что подтверждает ре-
презентативность группы (df = 2, p < 0,05). При
помощи теста Россета-Раймонда были рассчитаны
фактическая (Не) и теоретическая (Но) гетерози-
готность. Эти показатели составили 0,78 и 0,77 %
соответственно. Следует отметить, что нами не
были выявлены гомозиготы по c.483С аллелю.
Это может быть связано с летальностью данного
генотипа из-за чрезмерного накопления жировых
масс еще до рождения [7].
Была также изучена частота встречаемо-
сти еще одной мутации гена GBA c.1226A>G
(N370S). В контрольной группе не было выявле-
но ни гомозигот, ни гетерозигот по данной мута-
ции. Эти данные совпадают с результатами ана-
логичных исследований, проведенных в других
популяциях [12]. В группе пациентов с БП гено-
тип c.1226AА встречался с частотой 97,68 %, а ге-
нотип c.1226AG — 2,32 %. Частоты аллелей со-
ставили: c.1226A — 98,84 % и c.1226G — 1,16 %.
Проверка при помощи теста Россета-Раймонда
на гетерозиготность показала аналогичные ре-
зультаты. Различие контрольной группы и груп-
пы пациентов с БП достоверно (df = 2, p < 0,05)
и подтверждается малым показателем диверген-
ции (0,00053 %), а также тем, что распределение
обеих исследованных групп, рассчитанное по
формуле равновесия Харди-Вайнберга, близко
к панмиктическому.
Данные по частоте встречаемости различ-
ных мутантных вариантов гена к настоящему
времени не были получены в популяции Украи-
ны, однако подобные исследования активно ве-
дутся в других странах. Так, среди евреев ашке-
нази гетерозиготные носители данной мутации
гена GBA составляют 10,7–31,3 % пациентов
с БП. Частота мутации у больных, принадлежа-
щих к другим этническим группам, составляет
2,3–9,4 % [13]. Среди семейных случаев БП у жи-
телей США носителями мутаций были 4,1 % по
сравнению с 1,1 % в группе здоровых людей [14].
Мутации в гене GBA найдены у 14,7 % пациентов
с семейной формой БП среди жителей Японии
[15].
Проведено также генотипирование по гену
SNCA. У пациентов с мутациями в этом гене пер-
вые признаки БП проявляются уже в возрасте до
50 лет, болезнь протекает очень быстро и часто
характеризуется снижением когнитивных функ-
ций [16]. Нами была изучена встречаемость му-
тации c.209G>A (A53T) в гене SNCA у пациентов
с БП и в контроле. В результате исследования
мутантных аллелей этого гена в обеих группах
обнаружено не было, что, по-видимому, связано
с чрезвычайно низкой частотой встречаемости
данной мутации или полным ее отсутствием
у жителей определенной территории. Подобные
результаты были получены и другими исследова-
телями на других популяциях [17]. Так как точеч-
ные мутации в данном гене являются достаточно
редкими, но в то же время продукт гена вовле-
чен непосредственно в патогенез заболевания,
перспективным, по-видимому, является поиск
мутаций в регуляторных участках гена, которые
являются пока малоизученными [18].
Также было проведено генотипирование по
гену, который, по данным литературы, может по-
вышать риск развития нейродегенеративных за-
болеваний — аполипопротеин Е, который явля-
ется лигандом рецепторов липопротеинов очень
низкой плотности, а также отвечает за миели-
низацию нервных волокон. Синтез этого белка
обусловливает экспрессия гена АРОЕ. Полимор-
физм Е 4/Е 4 данного гена приводит к наруше-
нию нервной проводимости. Частоты генотипов
по гену АРОЕ контрольной группы составили:
0,715 (Е 3/Е 3), 0,077 (Е 3/Е 4), 0,009 (Е 4/Е 4),
0,167 (Е 2/Е 3), 0,031 (Е 2/Е 4) и 0,000 (Е 2/Е 2).
А для группы пациентов с БП — 0,634 (Е 3/Е 3),
0,148 (Е 3/Е 4), 0,032 (Е 4/Е 4), 0,157 (Е 2/Е 3),
ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16 213
Èçó÷åíèå ìîëåêóëÿðíî-ãåíåòè÷åñêèõ ìàðêåðîâ áîëåçíè Ïàðêèíñîíà â Óêðàèíå
0,023 (Е 2/Е 4) и 0,000 (Е 2/Е 2). Частота встреча-
емости генотипа Е 3/Е 4 была существенно выше
в группе пациентов с БП, что, возможно, свиде-
тельствует о связи редкого аллеля Е 4 с риском
развития БП. Проверка популяции по критерию
Россета-Раймонда показала, что гетерозигот-
ность контрольной группы меньше, чем группы
пациентов (Но= 0,2987 ± 0,0291 и Не= 0,4801 ±
0,0291 соответственно), что дает основания по-
лагать, что гетерозиготность влияет на формиро-
вание исследуемого признака. Данные были до-
стоверны по критерию χ2 (df = 2, p < 0,05).
Исходя из полученных нами результатов,
риск возникновения заболевания повышен у но-
сителей аллеля έ2 (OR = 2,35, 95 % CI: 1,23, 3,16;
p = 0,0047) и έ4 (OR = 1,97, 95 % CI: 1,23, 3,16; p =
0,0047). Также показано, что у носителей геноти-
па Е 4/Е 4 шансы развития заболевания повыше-
ны в 3,48 раза (OR = 3,48, 95 % CI: 1,23, 3,16; p =
0,0047).
Нами был изучен еще один показатель — дли-
на теломер. Исследования показали, что в клетках
буккального эпителия длина теломер была короче
у пациентов с БП, чем в контроле (рис.). В лейко-
цитах длина теломер не различалась.
Эти данные свидетельствуют о том, что у па-
циентов с БП процесс возраст-зависимого уко-
рочения длины теломер в клетках буккального
эпителия ускорен. Длина теломер в этих клетках
может быть показателем системных нарушений,
которые возникают при БП, в том числе окисли-
тельного стресса и увеличения количества кле-
ток под действием различных факторов роста.
Отсутствие достоверных различий в длине тело-
мер в лейкоцитах можно объяснить гетерогенно-
стью популяции лейкоцитов в периферической
крови человека и возможной разнонаправленно-
стью происходящих в них процессов.
Возможную связь ускоренного укорочения
теломер и БП можно объяснить несколькими
факторами. Во-первых, теломеры укорачиваются
при старении и короткая длина теломер в лейко-
цитах наблюдается у пациентов с нейродегенера-
тивными расстройствами, в частности с БП [19].
Во-вторых, ряд работ показывает связь воспале-
ния (которое, как известно, сопровождает про-
цессы нейродегенерации при БП) с длиной тело-
мер [20]. В-третьих, показано, что оксидативный
стресс, который играет важнейшую роль в ней-
родегенерации, приводит к укорочению длины
теломер in vitro [21].
Результаты исследования позволяют пред-
положить, что более короткие теломеры в клет-
ках буккального эпителия могут быть следствием
оксидативного стресса и, следовательно, могут
использоваться в качестве маркера БП на ран-
них этапах заболевания. При этом длина теломер
в клетках крови непригодна для использования
в качестве маркера БП.
Выводы
1. Среди пациентов с БП обнаружены носи-
тели мутаций по генам LRRK2 и GBA.
2. В группе пациентов с БП частота встречае-
мости мутации g.40734202G>A в гене LRRK2 со-
ставила 1,85 %, мутаций гена GBA c.1226A>G —
2,31 % и c.483T>C — 1,85 %. В контрольной
группе аналогичные мутации не выявлены.
3. В гене SNCA не выявлены мутации
c.209G>A ни у людей с БП, ни в контрольной
группе.
4. В группе пациентов повышена частота
встречаемости аллеля έ4 гена АРОЕ по сравне-
нию с контрольной группой.
5. Длина теломер в клетках буккального
эпителия короче у пациентов с БП, чем в контро-
ле. В лейкоцитах длина теломер не различалась.
Рис. Относительная длина теломер (T/S) у пациентов
с БП и в контрольной группе. * — p < 0,05
ЛИТЕРАТУРА
1. Dawson T. M., Dawson V. L. Molecular pathways of neurodegeneration in Parkinson’s disease // Science. — 2003. —
302. — P. 819–822.
214 ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16
Êîëÿäà À. Ê., Âàéñåðìàí À. Ì., Êðàñíåíêîâ Ä. Ñ., Ïëåòíåâà Ò. Â., Êàðàáàíü È. Í.
2. Floris G., Cannas A., Solla P., Murru M. R., Tranquilli S., Corongiu D., Rolesu M., Cuccu S., Sardu C., Marrosu F.
Genetic analysis for fi ve LRRK2 mutations in a Sardinian parkinsonian population: Importance of G2019S and
R1441C mutations in sporadic Parkinson’s disease patients // Parkinsonism Relat. Disord. — 2008. — 47. — Р. 160–
164.
3. Багыева Г. Х. Клинико-генетический и биохимический анализ болезни Паркинсона: механизмы предрасполо-
женности, экспериментальные модели, подходы к терапии: дис. … канд. биол. наук. — М., 2009. — 230 с.
4. Punia S., Das M., Behari M., Dihana M., Govindappa S. T., Muthane U., Thelma B., Juyal R. Leads from xenobiotic
metabolism genes for Parkinson’s disease among north Indians // Pharmacogenet. Genomics. — 2011. — 21, N 12. —
P. 790–797.
5. Cawthon R. М. Telomere length measurement by a novel monochrome multiplex quantitative PCR method // Nucl.
Acids Res. — 2009. — 37. — P. 21.
6. Lesage S., Brice А. Parkinson’s disease: from monogenic forms to genetic susceptibility factors // Human Molecular
Genetics. — 2009. — 18. — Р. 48–59.
7. Illarioshkin S. N., Shadrina M. I., Slominsky P. A., Bespalova E. V., Zagorovskaya T. B., Bagyeva G. K., Markova E. D.,
Limborska S. A., Ivanova-Smolenskaya I. A. A common leucine-rich repeat kinase 2 gene mutation in familial and
sporadic Parkinson’s disease in Russia // Europ. J. Neurol. — 2007. — 14. — P. 413–417.
8. Lesage S., Dürr A., Tazir M., Lohmann E., Leutenegger A. L., Janin S., Pollak P., Brice A. LRRK2 G2019S as a cause
of Parkinson’s disease in North African Arabs // New Engl. J. Med. — 2006. — 354. — P. 422–423.
9. Ozelius L. J., Senthil G., Saunders-Pullman R., Ohmann E., Deligtisch A., Tagliati M., Hunt A. L., Klein C.,
Henick B., Hailpern S. M., Lipton R. B., Soto-Valencia J., Risch N., Bressman S. B. LRRK2 G2019S as a cause of
Parkinson’s disease in Ashkenazi Jewish // New Engl. J. Med. — 2006. — 354. — P. 424–425.
10. Tammachote R., Tongkobpetch S., Srichomthong C., Phipatthanananti K., Pungkanon S., Wattanasirichai goon D.,
Suphapeetiporn K., Shotelersuk V. A common and two novel GBA mutations in Thai patients with Gaucher disease //
Hum. Genet. — 2013. — 58, № 5. — Р. 594–599.
11. Kathleen S. Hruska, LaMarca M.E., Scott C. R., Sidransky E. Gaucher disease: mutation and polymorphism spectrum
in the glucocerebrosidase gene // Human mutation. — 2008. — 29, N 5. — Р. 567–583.
12. Asselta R., Rimoldi V., Siri C., Cilia R., Guella I., Tesei S., Soldà G., Pezzoli G., Duga S., Goldwurm S.
Glucocerebrosidase mutations in primary parkinsonism // Parkinsonism and related disorders. — 2014. — 20. —
P. 1215–1220.
13. Gan-Or Z., Giladi N., Rozovski U., Shifrin C., Rosner S., Gurevich T., Bar-Shira A., Orr-Urtreger A. Genotype-phenotype
correlations between GBA mutations and Parkinson disease risk and onset // Neurology. — 2008. — 7. — Р. 2277–
2283.
14. Nichols W.C., Pankratz N., Marek D.K., Pauciulo M.W., Elsaesser V. E., Halter C. A., Rudolph A., Wojcies zek J.,
Pfeiffer R. F., Foroud T. Mutations in GBA are associated with familial Parkinson disease susceptibility and age at
onset // Neurology. — 2009. — 72. — Р. 310–316.
15. Mitsui J., Mizuta I., Toyoda A., Ashida R., Takahashi Y., Goto J., Fukuda Y., Date H., Iwata A., Yamamoto M.,
Hattori N., Murata M., Toda T., Tsuji S. Mutations for Gaucher disease confer high susceptibility to Parkinson disease
// Arch. Neurol. — 2009. — 66. — Р. 571–576.
16. Satake W., Nakabayashi Y., Mizuta I., Hirota Y., Ito C., Kubo M., Kawaguchi T., Tsunoda T., Watanabe M., Takeda A.,
Tomiyama H., Nakashima K., Hasegawa K., Obata F., Yoshikawa T., Kawakami H., Sakoda S., Yamamoto M.,
Hattori N., Murata M., Nakamura Y., Toda T. Genome-wide association study identifi es common variants at four loci
as genetic risk factors for Parkinson’s disease // Nature Genetics. — 2009. — 41, N 12. — Р. 1303–1308.
17. Illarioshkin S. N., Ivanova-Smolenskaya I.A., Markova E. D., Zagorovskaya T. B., Brice A. Lack of alpha-synuclein
gene mutations in families with autosomal dominant Parkinson’s disease in Russia // J. Neurol. — 2000. — 247. —
P. 968–969.
18. Brighina L., Frigerio R., Schneider N. K., Lesnick T. G., de Andrade M., Cunningham J. M., Farrer M. J., Lincoln S. J.,
Checkoway H., Rocca W. A., Maraganore D. M. Alpha-synuclein, pesticides, and Parkinson disease: a case-control
study // Neurology. — 2008. — 70, N 16. — P. 1461–1469.
19. Thomas P., O’Callaghan N.J., Fenech M. Telomere length in white blood cells, buccal cells and brain tissue and its
variation with ageing and Alzheimer’s disease. Mech. Ageing Dev. — 2008. — 129. — P. 183–190.
20. Cipriano C., Tesei S., Malavolta M., Giacconi R., Muti E., Costarelli L., Piacenza F., Pierpaoli S., Galeaz zi R.,
Blasco M., Vera E., Canela A., Lattanzio F., Mocchegiani E. Accumulation of cells with short telomeres is associated
with impaired zinc homeostasis and infl ammation in old hypertensive participants // J. Gerontol. A Biol. Sci. Med.
Sci. — 2009. — 64. — P. 745–751.
21. Koliada A., Krasnenkov D., Vaiserman A. Telomeric aging: mitotic clock or stress indicator? // Front. Genet. —
2015. — 6. — P. 82. Doi: 10.3389/fgene.2015.00082.
ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16 215
Èçó÷åíèå ìîëåêóëÿðíî-ãåíåòè÷åñêèõ ìàðêåðîâ áîëåçíè Ïàðêèíñîíà â Óêðàèíå
KOLIADA A.K.1, VAISERMAN A.M.1, KRASNENKOV D.S.1, PLETNEVA T.V.1, 2, KARABAN I.N.1
1 D. F. Chebotarev State Institute of Gerontology NAMS of Ukraine,
Ukraine, 04114, Kyiv, Vyshgorodskaya str., 67, e-mail: alex.genetic@gmail.com
2 Private Higher Educational Establishment «Kyiv Medical University of UAFM»,
Ukraine, 01004, Kyiv, Lva Tolstogo str., 9, e-mail: pletneva1706@gmail.com
STUDY OF MOLECULAR AND GENETIC MARKERS OF PARKINSON’S DISEASE IN UKRAINIAN
POPULATION
Aims. Genetic factors play a major role in the development of Parkinson’s disease (PD). The study was conducted to
examine frequency of mutations in several genes associated with PD and assess telomeres length in control group and
in patients. Methods. Genotyping was performed by methods based on real-time PCR. Mutations in the genes GBA,
LRRK2, SNCA and APOE were genotyped. Results. Mutation g.40734202G>A in the LRRK2 gene was found only in
patients with PD. Two mutations in the GBA gene were studied. Among patients heterozygous s.483T>C carriers were
revealed. Mutation c.1226A>G was not detected in controls. While in the group of patients heterozygous carriers were
found. Mutation c.209G>A in the SNCA gene was not detected neither in patients nor in controls. The study of APOE
polymorphism was revealed signifi cantly higher frequency of E3/E4 genotype in patients. Telomere length in buccal cells
was shorter in patients with PD. Conclusions. Mutations in the genes GBA, LRRK2 and APOE can be used for diagnosis
of PD.
Keywords: Parkinson’s disease, genes LRRK2, GBA, SNCA, APOE.
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177408 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 2219-3782 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T17:08:40Z |
| publishDate | 2015 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Коляда, А.К. Вайсерман, А.М. Красненков, Д.С. Плетнева, Т.В. Карабань, И.Н. 2021-02-15T15:25:17Z 2021-02-15T15:25:17Z 2015 Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине / А.К. Коляда, А.М. Вайсерман, Д.С. Красненков, Т.В. Плетнева, И.Н. Карабань // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 216-220. — Бібліогр.: 12 назв. — рос. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177408 575.113:611.018.1712.4 The aim of this research was to conduct the comparative analysis of the karyotype of new human stem cell line 4BL at different stages of cultivation in vitro. Methods. The array CGH Oxford Gene Technology was used. Results. At the 120, 160 and 205 passages such the same aberrations were revealed: duplications of 2q31.1-q33.1, 10 q22.1-q22.2 and q24.2-q26.11, 16 q12.1-q12.2 and q22.1-q24.3, 19 р13.3-р12 and deletions of 4 q24-q35.2, 10 p14-p12.1 and q26.11-q26.3, 12 p13.33-p11.1, 13 q12.11-q21.2, 17 q11.1-q21.31, Х p22.33 and q21.31-q21.32. Also at each passage some minor aberrations appears, which further were removed at the next stage, and so on. Conclusions. Obviously main genome rearrangements occurred until 120th passage, so stem cell line 4BL passed the establishment stage until this time and now is at the stabilization stage. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Генетика людини та медична генетика Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине Study of molecular and genetic markers of Parkinson’s disease in ukrainian population Article published earlier |
| spellingShingle | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине Коляда, А.К. Вайсерман, А.М. Красненков, Д.С. Плетнева, Т.В. Карабань, И.Н. Генетика людини та медична генетика |
| title | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине |
| title_alt | Study of molecular and genetic markers of Parkinson’s disease in ukrainian population |
| title_full | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине |
| title_fullStr | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине |
| title_full_unstemmed | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине |
| title_short | Изучение молекулярно-генетических маркеров болезни Паркинсона в Украине |
| title_sort | изучение молекулярно-генетических маркеров болезни паркинсона в украине |
| topic | Генетика людини та медична генетика |
| topic_facet | Генетика людини та медична генетика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177408 |
| work_keys_str_mv | AT kolâdaak izučeniemolekulârnogenetičeskihmarkerovbolezniparkinsonavukraine AT vaisermanam izučeniemolekulârnogenetičeskihmarkerovbolezniparkinsonavukraine AT krasnenkovds izučeniemolekulârnogenetičeskihmarkerovbolezniparkinsonavukraine AT pletnevatv izučeniemolekulârnogenetičeskihmarkerovbolezniparkinsonavukraine AT karabanʹin izučeniemolekulârnogenetičeskihmarkerovbolezniparkinsonavukraine AT kolâdaak studyofmolecularandgeneticmarkersofparkinsonsdiseaseinukrainianpopulation AT vaisermanam studyofmolecularandgeneticmarkersofparkinsonsdiseaseinukrainianpopulation AT krasnenkovds studyofmolecularandgeneticmarkersofparkinsonsdiseaseinukrainianpopulation AT pletnevatv studyofmolecularandgeneticmarkersofparkinsonsdiseaseinukrainianpopulation AT karabanʹin studyofmolecularandgeneticmarkersofparkinsonsdiseaseinukrainianpopulation |