Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like
Методика транспозон-дисплея была выполнена на сирени обыкновенной. На основе полученных данных показано наличие полиморфных фрагментов предположительно, полиморфных сайтов интеграции ретротранспозонов в геноме сирени) для ряда сортов. Була випробувана методика транспозон-дисплею на бузку звичайному....
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Datum: | 2010 |
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2010
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177464 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like / Е.В. Борхерт А.М. Кудрявцев И.Б. Коновалов Ф.А. Окунева Д.В. Ребриков // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2010. — Т. 8. — С. 98-101. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177464 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Борхерт, Е.В. Кудрявцев, А.М. Окунева, И.Б. Коновалов, Ф.А. Ребриков, Д.В. 2021-02-15T19:12:59Z 2021-02-15T19:12:59Z 2010 Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like / Е.В. Борхерт А.М. Кудрявцев И.Б. Коновалов Ф.А. Окунева Д.В. Ребриков // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2010. — Т. 8. — С. 98-101. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177464 Методика транспозон-дисплея была выполнена на сирени обыкновенной. На основе полученных данных показано наличие полиморфных фрагментов предположительно, полиморфных сайтов интеграции ретротранспозонов в геноме сирени) для ряда сортов. Була випробувана методика транспозон-дисплею на бузку звичайному. На основі отриманих даних показана рiзниця мiж рядом сортів. Побудована дендрограма дозволила розділити сорти бузку, які брали участь в експерименті на 4 групи The transposon display technique has been tested for lilacs ordinary. On the basisof the received data distinction between a number of grades is shown ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Аналіз та оцінка генетичних ресурсів Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like |
| spellingShingle |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like Борхерт, Е.В. Кудрявцев, А.М. Окунева, И.Б. Коновалов, Ф.А. Ребриков, Д.В. Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| title_short |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like |
| title_full |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like |
| title_fullStr |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like |
| title_full_unstemmed |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like |
| title_sort |
генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (syringa vulgarisl.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы ty1 copia like |
| author |
Борхерт, Е.В. Кудрявцев, А.М. Окунева, И.Б. Коновалов, Ф.А. Ребриков, Д.В. |
| author_facet |
Борхерт, Е.В. Кудрявцев, А.М. Окунева, И.Б. Коновалов, Ф.А. Ребриков, Д.В. |
| topic |
Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| topic_facet |
Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| publishDate |
2010 |
| language |
Russian |
| container_title |
Фактори експериментальної еволюції організмів |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| description |
Методика транспозон-дисплея была выполнена на сирени обыкновенной. На основе полученных данных показано наличие полиморфных фрагментов предположительно, полиморфных сайтов интеграции ретротранспозонов в геноме сирени) для ряда сортов.
Була випробувана методика транспозон-дисплею на бузку звичайному. На основі отриманих даних показана рiзниця мiж рядом сортів. Побудована дендрограма дозволила розділити сорти бузку, які брали участь в експерименті на 4 групи
The transposon display technique has been tested for lilacs ordinary. On the basisof the received data distinction between a number of grades is shown
|
| issn |
2219-3782 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177464 |
| citation_txt |
Генетическое разнообразие сортов сирени обыкновенной (Syringa vulgarisL.) по сайтам интеграции ретротранспозонов группы TY1 copia like / Е.В. Борхерт А.М. Кудрявцев И.Б. Коновалов Ф.А. Окунева Д.В. Ребриков // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2010. — Т. 8. — С. 98-101. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
| work_keys_str_mv |
AT borhertev genetičeskoeraznoobraziesortovsireniobyknovennoisyringavulgarislposaitamintegraciiretrotranspozonovgruppyty1copialike AT kudrâvcevam genetičeskoeraznoobraziesortovsireniobyknovennoisyringavulgarislposaitamintegraciiretrotranspozonovgruppyty1copialike AT okunevaib genetičeskoeraznoobraziesortovsireniobyknovennoisyringavulgarislposaitamintegraciiretrotranspozonovgruppyty1copialike AT konovalovfa genetičeskoeraznoobraziesortovsireniobyknovennoisyringavulgarislposaitamintegraciiretrotranspozonovgruppyty1copialike AT rebrikovdv genetičeskoeraznoobraziesortovsireniobyknovennoisyringavulgarislposaitamintegraciiretrotranspozonovgruppyty1copialike |
| first_indexed |
2025-11-25T21:29:34Z |
| last_indexed |
2025-11-25T21:29:34Z |
| _version_ |
1850558073878347776 |
| fulltext |
98
3. Зубець М.В. Невідкладні завдання вчених-селекціонерів // Вісник аграрної
науки.— 2000.— №12.— С. 5–8.
4. Кудряшов И.Н. Посевная мозаика // Агробизнес.— 2003.— №5.— С. 15–16.
5. Романенко А.А. Новая сортовая политика и сортовая агротехника озимой
пшеницы / А.А. Романенко, Л.А. Беспалова, И.Н. Кудряшов и др.— Краснодар,
2005.— 224 с.
6. Eberhart S.A. Stability parameters for comparing varieties / Eberhart S.A., Rus-
sell W.A. // Crop. Sci.— 1966.— Vol.6.— №1.— Р. 36–40.
7. Базалій В.В. Оптимізація сортового складу озимої пшениці за параметрами
екологічної стійкості в умовах південного Степу України / В.В. Базалій, О.В. Ларчен-
ко, Г.Г. Базалій // Міжвідомчий тематичний науковий вісник “Селекція і насін-
ництво”, 2008.— Вип.96.— С. 361–369.
Резюме
Нині необхідна нова сортова політика, яка направлена на оптимізацію відповід-
ності генетичних особливостей сортів до умов їх вирощування. Використання пози-
тивного ефекту цієї взаємодії у виробничих умовах шляхом проведення сортового
складу до конкретних агротехнологічних умов, не викликає допоміжних витрат на ін-
тенсифікацію технологій і сортозміни, але здатне підвищити урожайність в господарствах.
Сейчас необходима новая сортовая политика, которая направлена на оптими-
зацию соответствия генетических особенностей сортов к условиям их возделывания.
Использование положительного эффекта этого взаимодействия в производственных
условиях путем проведения сортового состава к конкретным агротехнологическим
условиям, не вызывает дополнительных затрат на интенсификацию технологий и
сортосмены, но способное поднять урожайность в хозяйствах.
A new of high quality policy which is directed on optimization of accordance of genetic
features of sorts to the terms of their growing is presently needed. Use of positive effect of this
cooperation in production terms by the lead through of high quality composition to the concrete
agrarian tts terms, does not cause auxiliary charges on intensification of technologies and
changing of sorts, but it is able to promote the productivity in agricultural enterprise.
БОРХЕРТ Е.В1., КУДРЯВЦЕВ А.М.1, ОКУНЕВА И.Б.2, КОНОВАЛОВ Ф.А.1,
РЕБРИКОВ Д.В.1
1 Учреждение Российской Академии Наук Институт общей генетики
им. Н.И. Вавилова РАН,Россия, 119991, Москва, ул. Губкина, д.3, ГСП 1,
e-mail: sashai@inbox.ru
2Учреждение Российской академии наук Главный ботанический сад
им. Н.В. Цицина РАН, Россия, 127276, Москва, Ботаническая ул., д.4.
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ СОРТОВ СИРЕНИ
ОБЫКНОВЕННОЙ (SYRINGA VULGARIS L.) ПО САЙТАМ
ИНТЕГРАЦИИ РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ ГРУППЫ TY1 COPIA LIKE
Сирень обыкновенная (Syringa vulgaris L.) является широко распростра-
ненной декоративной культурой, в мире насчитывается порядка 1700 сортов
сирени обыкновенной. Несмотря на это сирень является генетически мало-
изученным растением.
99
Ранее нами было установлено наличие транспозонов группы TY-1 copia
like у сирени обыкновенной (1). По результатам работы с 7 возможными ком-
бинациями праймеров были получены фрагменты, которые соответствовали
теоретически ожидаемым длинам. С использованием методики genome
walking были получены последовательности фрагментов ретротранспозонов,
а затем и полные последовательности ретроэлементов.
На фоне практически полного отсутствия генетических маркеров сире-
ни обыкновенной, весьма сложно изучать биоразнообразие этого растения
и имеющиеся родственные связи. С целью создания эффективной системы
различения сортов сирени обыкновенной, на основе полученных нами
последовательностей ретротранспозонов был реализован метод транспозон-
дисплея (2).
Материалы и методы
В исследование взяли 138 сортов сирени обыкновенной из коллекции
Главного Ботанического Сада Академии Наук. Сбор проводили в фазу цве-
тения. ДНК экстрагировали по методике СТАВ-саркозил-бисульфат.
Рис.1. Профайлинг сортов сирени обыкновенной по методике транспозон-
дисплея: 1 — маркер длин, 2–42 — различные сорта сирени
100
Транспозон-дисплей проводили, как было описано ранее (2). Анализ
результатов транспозон-дисплея включал в себя сотавление таблицы, в
которую были занесены имеющиеся у каждого сорта уникальные фрагменты,
предстваленные полосами на электрофореграмме. Оценка проводилась по
32 специфичным фрагментам. На основе данных таблицы была построена
дендрограмма. Для построения дендрограммы сортов использовали програм-
му spliatstree 4.10.
Результаты и обсуждение
В ходе работы были впервые получены последовательности 2-х раз-
личных ретротранспозонов сирени (рис. 1). На основе полученных после-
довательностей были разработаны транспозон-специфичные праймеры и
реализован метод транспозон-дисплея для оценки сортоспецифичных мест
интеграции на 87 сортах сирени обыкновенной.
Полученные результаты показали существующие различия в сайтах
интергации ретротранспозона группы TY-1 copia like у данных сортов
сирени. Было выделено 32 полиморфных фрагмента. По результатам анализа
32 фрагментов была составлена матрица, данные которой позволили
провести кластеризацию по методу транспозон-дисплея (рис. 2)
Выводы
Получены последовательности 2-х ретротранспозонов сирени обыкно-
венной (включая концевые LTR). Последовательности ретротранспозонов
Рис. 2. Результаты кластеризации по методу транспозон-дисплея на 87 сортах
сирени обыкновенной: syr 1–87 — различные сорта сирени обыкновенной
101
использованы для проведения транспозон-дисплея, обнаружены 32 предпо-
лагаемых полиморфных сайта интеграции ретротранспозонов в геном си-
рени обыкновенной.
Литература
1.Борхерт Е.В, Кудрявцев А.М., Окунева И.Б., Ребриков Д.В. Ретротранспозоны
TY-1 copia like у сирени обыкновенной (Syringa vulgaris L.) // Алушта, 2009, том 7,
с. 5–6.
2. Konovalov F.A., Goncharov N.P., Goryunova S., Shaturova А., Proshlyakova Т.
and Kudryavtsev А. Molecular markers based on LTR retrotransposons BARE-1 and Jeli
uncover different strata of evolutionary relationships in diploid wheats // Molecular Gene-
tics and Genomics. 2010 in press.
3.Лунева З.С., Михайлов Е.А., Судакова Е.А. Сирень // Москва: Агропромиздат,
1989.— 256 с.
4.Мельникова Н.В., Борхерт Е.В.,Мартынов С.П., Окунева И.Б., Молкано-
ва О.И., Упелниек В.П., Кудрявцев А.М. Использование молекулярно-генетических
маркеров для верификации коллекций in vitro сирени обыкновенной (Syringa vul-
garis L.) // Москва: Генетика, 2009, том 45, №1, с. 97–103.
5. Shagin D.A., Lukyanov K.A., Vagner L.L., Matz M.V. Regulation of average length
of complex PCR product // Nucleic Acids Research, 1999, vol.27, №18.
6. Matz M., Shagin D., Bogdanova E., Britanova O., Lukyanov S., Diatchenko L.,
Chenchik A. Amplification of DNA ends based on template-switching effect and step-out
PCR // Nucleic Acids Research, 1999, vol.27, №6, p. 1558–1560.
7. Schulman A. H., P. K. Gupta and R.K.Varshney. Оrganization of retrotransposons
and microsatellites in cereal genomes. Cereal Genomics, 83–118. 2004 Kluwer Academic
Publishers.
Резюме
Методика транспозон-дисплея была выполнена на сирени обыкновенной. На
основе полученных данных показано наличие полиморфных фрагментов предпо-
ложительно, полиморфных сайтов интеграции ретротранспозонов в геноме сирени)
для ряда сортов.
Була випробувана методика транспозон-дисплею на бузку звичайному. На основі
отриманих даних показана рiзниця мiж рядом сортів. Побудована дендрограма дозво-
лила розділити сорти бузку, які брали участь в експерименті на 4 групи.
The transposon display technique has been tested for lilacs ordinary. On the basis
of the received data distinction between a number of grades is shown.
ВОЛКОВА Н.Е., ФИЛИПОНЕНКО Н.С., ГРИГОРЬЕВ Д.С., ВОРОБЬЁВА Л.И.
Харьковский национальный университет имени В.Н. Каразина,
Украина, 61077, Харьков, пл. Свободы 4, e-mail: volkova_natalya@bk.ru
ГЕТЕРОГЕННОСТЬ ПОПУЛЯЦИЙ DROSOPHILA MELANOGASTER
УКРАИНЫ ПО НЕКОТОРЫМ ПОВЕДЕНЧЕСКИМ ПРИЗНАКАМ
Существенное влияние на структуру популяции оказывают факторы
внешней среды; их сочетанное действие и, особенно, резкие изменения (на-
пример, природные и техногенные катастрофы) могут приводить к неожи-
данным биологическим эффектам [1]. Следствием техногенного пресса,
|