Реконструкція та верифікація просторової структури молекул тубулінів представників Diplomonadida, Kinetoplastida, Amoebida, Saccharomycetes та Microsporea

• Опубліковано в: : Фактори експериментальної еволюції організмів
• Дата: 2015
• Автори: Співак, С.І., Ожерєдов, С.П., Самофалова, Д.О., Раєвський, О.В., Карпов, П.А.
• Формат: Стаття
• Мова: Українська
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2015
• Теми: Молекулярна генетика та геноміка рослин
• Онлайн доступ: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177499
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Реконструкція та верифікація просторової структури молекул тубулінів представників Diplomonadida, Kinetoplastida, Amoebida, Saccharomycetes та Microsporea / С.І. Співак, С.П. Ожерєдов, Д.О. Самофалова, О.В. Раєвський, П.А. Карпов // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 92-96. — Бібліогр.: 10 назв. — укр.

Aims. The purpose of this study was a reconstruction and verification of spatial structures of tubulin molecules from
 representatives of Diplomonadida, Kinetoplastida, Amoebida, Saccharomycetes and Microsporea to determine differences
 in their spatial structures and clarify the mechanism of their interaction with antimitotic agents. Methods. The study was
 carried out with in silico approaches using UniProtКВ database, RCSB Protein Data Bank and on-line services: SWISSMODEL, I-TASSER and MolProbity. Results. 17 tubulin molecules with fully decoded primary structures were selected
 among representatives of such classes: Diplomonadida, Kinetoplastida, Amoebida, Saccharomycetes and Microsporea.
 For all these proteins accurate three dimentional structures were constructed with subsequent optimization and verification
 of protein geometry. Conclusions. Selected models of tubulin molecules were added to a CSModDB database within VO
 CSLabGrid for their future application in comparative analysis and a search of compounds with anti mitotic activity by
 means of high-throughput screening.
 Keywords: tubulin, antimitotic drugs, in silico.