In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2
The aims – to find of gvp-clasters in the genome of S. globisporus 1912-2. Methods. The programs BLASTN were used for in silico analysis of the S. globisporus 1912-2 contigs library. Results. Two gvp-clusters in the library of S. globisporus 1912-2 chromosome fragments were found. One gvp-cluster...
Saved in:
| Published in: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Date: | 2015 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2015
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177548 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | НазваниеIn silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 / Л.В. Поліщук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 325-329. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177548 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Поліщук, Л.В. 2021-02-16T12:41:28Z 2021-02-16T12:41:28Z 2015 НазваниеIn silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 / Л.В. Поліщук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 325-329. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177548 579.873.71 : 577.113.4 : 004.9 The aims – to find of gvp-clasters in the genome of S. globisporus 1912-2. Methods. The programs BLASTN were used for in silico analysis of the S. globisporus 1912-2 contigs library. Results. Two gvp-clusters in the library of S. globisporus 1912-2 chromosome fragments were found. One gvp-cluster was localized on Contig 264, the second cluster – on Contig 756 and Contig 781. Both gvp-clusters contain 10 genes in traditional order for streptomycetes cluster: gvpO - A - F - G - Y - Z - J - L - S - K. Conclusions. In silico analysis of the primary structures of two S. globisporus 1912-2 gvp-clusters did not find significant homology in their nucleotide sequences, therefore we could suggest that they were orthologous or significant changes in their primary structures occurred as a results of mutations after duplication. Keywords: Streptomyces globisporus 1912-2, gvp-claster, homology, chromosomal DNA. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Аналіз та оцінка генетичних ресурсів In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 In silico seaching of Streptomyces globisporus 1912-2 gvp-clasters Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 |
| spellingShingle |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 Поліщук, Л.В. Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| title_short |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 |
| title_full |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 |
| title_fullStr |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 |
| title_full_unstemmed |
In silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 |
| title_sort |
in silico пошук gvp-кластерів streptomyces globisporus 1912-2 |
| author |
Поліщук, Л.В. |
| author_facet |
Поліщук, Л.В. |
| topic |
Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| topic_facet |
Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| publishDate |
2015 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Фактори експериментальної еволюції організмів |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
In silico seaching of Streptomyces globisporus 1912-2 gvp-clasters |
| description |
The aims – to find of gvp-clasters in the genome of S. globisporus 1912-2. Methods. The programs BLASTN were used
for in silico analysis of the S. globisporus 1912-2 contigs library. Results. Two gvp-clusters in the library of S. globisporus
1912-2 chromosome fragments were found. One gvp-cluster was localized on Contig 264, the second cluster – on Contig
756 and Contig 781. Both gvp-clusters contain 10 genes in traditional order for streptomycetes cluster: gvpO - A - F - G
- Y - Z - J - L - S - K. Conclusions. In silico analysis of the primary structures of two S. globisporus 1912-2 gvp-clusters
did not find significant homology in their nucleotide sequences, therefore we could suggest that they were orthologous or
significant changes in their primary structures occurred as a results of mutations after duplication.
Keywords: Streptomyces globisporus 1912-2, gvp-claster, homology, chromosomal DNA.
|
| issn |
2219-3782 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177548 |
| citation_txt |
НазваниеIn silico пошук gvp-кластерів Streptomyces globisporus 1912-2 / Л.В. Поліщук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 325-329. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT políŝuklv insilicopošukgvpklasterívstreptomycesglobisporus19122 AT políŝuklv insilicoseachingofstreptomycesglobisporus19122gvpclasters |
| first_indexed |
2025-12-07T15:48:26Z |
| last_indexed |
2025-12-07T15:48:26Z |
| _version_ |
1850865097472212992 |