Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis
Aims Characterization of M. tuberculosis Beijing family in Kyiv’s clinical strains population by content of «modern» and «ancient» sublineages as defined by structure of NTF locus. Methods. Multiplex PCR of NTF locus, ETR-VNTR, and SNP-typing (katG463) of bacterial isolate DNA samples from Kyiv’s...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Дата: | 2015 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2015
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177549 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis / Ю.О. Чередник, О.В. Анопрієнко, А.І. Барбова, О.А. Журило // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 336-339. — Бібліогр.: 16 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859772853875900416 |
|---|---|
| author | Чередник, Ю.О. Анопрієнко, О.В. Барбова, А.І. Журило, О.А. |
| author_facet | Чередник, Ю.О. Анопрієнко, О.В. Барбова, А.І. Журило, О.А. |
| citation_txt | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis / Ю.О. Чередник, О.В. Анопрієнко, А.І. Барбова, О.А. Журило // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 336-339. — Бібліогр.: 16 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description | Aims Characterization of M. tuberculosis Beijing family in Kyiv’s clinical strains population by content of «modern» and
«ancient» sublineages as defined by structure of NTF locus. Methods. Multiplex PCR of NTF locus, ETR-VNTR, and
SNP-typing (katG463) of bacterial isolate DNA samples from Kyiv’s patients with pulmonary tuberculosis. Results. 19
clinical isolates of M. tuberculosis strains belonged to the PGG-1 by SNP-typing and to two of the most prevalent ETRVNTR Beijing genotypes (42435, 42434) showed NTF-locus structure characteristic to «modern» type. Conclusions.
More samples should be analyzed to determine the proportion of «ancient» Beijing subtypes in Kyiv M. tuberculosis
population. Alternative quick and convenient methods for detection of these sublineages could be considered for more
effective strategy of M. tuberculosis monitoring in Kyiv.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, molecular epidemiology, NTF-locus.
|
| first_indexed | 2025-12-02T07:08:17Z |
| format | Article |
| fulltext |
336 ISSN 2219-3782. Фактори експериментальної еволюції організмів. 2015. Том 17
©
Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium Tuberculosis
Ч
ер
ед
ни
к
Ю
.О
.,
А
но
пр
іє
нк
о
О
.В
.,
Б
ар
бо
ва
А
.І.
, Ж
ур
ил
о
О
.А
.
Штами Mycobacterium tuberculosis (M. tuber-
culosis) родини Beijing викликають найбільше за-
непокоєння епідеміологів та клініцистів завдяки
надзвичайно широкому розповсюдженню у всьо-
му світі та здатністю частіше, ніж інші штами
набувати лікарської стійкості до багатьох проти-
туберкульозних препаратів (ПТП). Велика кіль-
кість робіт присвячена опису спалахів туберку-
льозу, викликаного цим генотипом. Клінічні та
молекулярно-епідеміологічні дослідження доз-
волили зробити висновки про певні унікаль-
ні властивості у тому числі здатність долати за-
хисний ефект БЦЖ-вакцинації (BCG – Bacillus
Calmette-Guerin), більшу трансмісивність у по-
рівнянні з не-Beijing штамами, здатність швид-
ко прогресувати від стадії інфекції до активної
хвороби, та деякі інші патогенні властивості [1,
2]. Проте, загалом, штами родини Beijing демон-
струють досить широкий спектр вірулентних
властивостей, що може пояснюватись генетич-
ною гетерогенністю лінії у цілому.
У країнах колишнього Радянського Союзу
частка родини Beijing, яка визначалась за допо-
могою різних методів, таких як споліготипуван-
ня, VNTr (Varied Number of Tandem repeats) іно-
ді за різними наборами локусів та IS6110-ПДРФ
(Поліморфізм Довжини Рестрикційних Фрагмен-
тів), варіює від 34 % (Харківська область, Укра-
їна) до 71,6 % (Казахстан) [3, 4]. У м. Києві за
даними ETr-VNTr нами було встановлено,
що родина Beijing складає 46,7 % усіх клініч-
них ізолятів [5]. Штами родини складають що-
найменш 92,6 % штамів першої принципової
генотипової групи (ПГГ-1), яка є епідеміо-
логічно-значущою групою київської популя-
ції завдяки виявленій асоціації зі стійкістю
до ПТП першого ряду ізоніазиду. ETr-локу-
си, що були використані для генотипування шта-
мів M. tuberculosіs київської популяції, завдяки
своїй природі повторюваних елементів, харак-
теризуються вищим рівнем гомоплазії, ніж SNP-
та LSP-маркери. Ми вважаємо, що для вдоско-
налення стратегії дослідження структури роди-
© ЧЕРЕДНИК Ю.О., АНОПРІЄНКО О.В., БАРБОВА А.І., ЖУРИЛО О.А.
ни Beijing київської популяції M. tuberculosіs та
вивчення асоціацій між генотипом і клініко-епі-
деміологічними проявами доцільно застосувати
більш одного методу генотипування і використо-
вувати більш стабільні SNP- та LSP-маркери.
Одним зі специфічних генетичних маркерів
генотипу Beijing є регіон NTF, який може містити
інсерції мікобактеріального мобільного елемен-
ту IS6110. Три варіанти NTF з точки зору наяв-
ності або відсутності послідовності IS6110 були
виявлені у штамів Beijing, що дозволяє на даний
час поділити родину на три сублінії, які можливо
розташувати за принципом еволюційного похо-
дження (рис.) [6]. Більшість Російських штамів
відноситься до сублінії NTF::IS6110, або «сучас-
них/типових» і біля 7 % належить до «предково-
го/атипового» типу [6, 7]. У ряді робіт було по-
казано, що штами «сучасної» гілки проявляють
більші вірулентні властивості, ніж штами «пред-
ковї» сублінії [2].
Метою даної роботи є характеристика най-
більш розповсюдженої родини Beijing у київ-
ській популяції M. tuberculosis за часткою шта-
мів «сучасних» та «предкових» субліній, визна-
чених за структурою локусу NTF.
Матеріали і методи
Культури мікобактерій туберкульозного
комплексу (МТБК) були отримані від хворих на
легеневий туберкульоз (ЛТБ) пацієнтів, що про-
живають у м. Києві. Діагноз туберкульоз був
встановлений лікарями-фтизіатрами ДУ «Націо-
нальний інститут фтизіатрії і пульмонології іме-
ні Ф.Г. Яновського НАМН України» на підставі
рентгенологічних та клінічних обстежень. При
надходженні хворого в стаціонар зразки мокро-
тиння аналізувалися лікарями-лаборантами мі-
кроскопічним (забарвлення за Цілем-Нільсеном)
і мікробіологічними (посів на середовище Ле-
венштейна-Йенсена) методами за стандартни-
ми методиками згідно Наказу МОз України від
06.02.2002 р. № 45 [8].
УДК 616-002.5:579.253:579.873.21
ЧЕРЕДНИК Ю.О. 1, АНОПРІЄНКО О.В. 2, БАРБОВА А.І. 1, ЖУРИЛО О.А. 1
1 ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф.Г. Яновського НАМН України»,
Україна, 03680, Київ-680, вул. М. Амосова, 10, e-mail: yurach@ukr.net
2 Інститут молекулярної біології і генетики НАН України,
Україна, 03143, Київ-143, вул. Академіка Заболотного, 150
ВИЯВЛЕННЯ СУЧАСНИХ ТА ПРЕДКОВИХ СУБЛІНІй ШТАМІВ РОДИНИ
BEIjING У КИЇВСьКІй ПОПУЛЯЦІЇ mycoBAcTERium TuBERculosis
ISSN 2219-3782. Фактори експериментальної еволюції організмів. 2015. Том 17 337
Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis
M. tuberculosis родини Beijing в регіонах світу
показали, що ріст поширеності ТБ викликано-
го Beijing генотипом обумовлений саме штама-
ми сучасної сублінії, а не предковими штамами
[2, 12]. Раніше була висунута гіпотеза про асо-
ціацію географічного поширення всієї родини
з регіонами, де широко застосовували вакцина-
цію БЦЖ [13]. Вона згодом набула уточнень зав-
дяки дослідженням як глобальних, так і локаль-
них популяцій. Так, у Японії вивчення динаміки
популяційної структури виявило більш високий
рівень транс місії та здатність частіше вражати
осіб молодшої вікової групи для штамів «сучас-
ної» сублінії родини на відміну від «предкової»
гілки, що зв’язали з введенням у певний період
БЦЖ-вакцинації [11]. У Київській популяції M.
tuberculosis тенденція до більшої здатності вра-
жати пацієнтів молодшої вікової групи (16–24
роки) була виявлена в цілому для родини Beijing
(без поділу на сублінії), ніж для інших штамів [5,
14]. Таким чином, детальніше вивчення ліній та
субліній родини Beijing, розповсюджених на пев-
ній території, з використанням більшої кількості
маркерів може дати точнішу картину адаптивних
змін цих штамів .
Властивості «сучасних» та «предкових»
штамів родини Beijing, асоційованих з вірулент-
ністю, що дозволять порівнювати різні філогене-
тичні підгрупи цієї родини на більш глибокому
і предметному рівні, тільки починають дослід-
жуватись. Дані деяких робіт підтверджують гі-
потезу про те, що еволюція M. tuberculosis роди-
ни Beijing призвела до накопичення генетичних
поліморфізмів, що посилюють бактеріальну ві-
рулентність [2].
з методичної точки зору існує декілька аль-
тернативних і додаткових підходів до розділен-
ня груп «сучасних» та «предкових» штамів ро-
дини Beijing. Так, мутації у двох ймовірних ге-
нах «мутаторах» mutT2 та mutT4 відділяють «су-
часні» штами та розділяють «предкову» групу
на «більш предкову» («more ancient») та «сучас-
ну предкову» [2], які можна виявляти методами
SNP-типування. Метод «інвертованої» IS6110-
ПЛР було запропоновано для одночасного ти-
пування штамів і виявлення серед них двох за-
значених груп, оскільки генотипи репродуку-
вались достатньо стабільно [15]. При прове-
денні порівняльного MIrU-типування ізолятів
M. tuberculosis родини Beijing у Японії були ви-
явлені високополіморфні локуси (QUB-4156 та
Mtub21), які також були корисні для класифіка-
ції субліній, що виділялись на основі локусу NTF
ДНК виділяли за стандартною методикою,
інактивуючи культуру прогріванням при 80 °С
[9]. Ізоляти бактеріальних культур були геноти-
повані на основі ETr-VNTr (за локусами ETr
a, B, C, D, E) та SNP-типування групоспецифіч-
ного SNP katG463 [5, 10]. за стандартною схемою
ДНК-зразок характеризували сукупністю числа
копій кожного з 5 тандемних повторів (локуси
ETr a, B, C, D, E), що відображається у п’яти-
значному номері [10].
ПЛР-суміш містила 1од. DreamTaq DNa
Polyerase (Thermo Scientific), відповідний бу-
фер, 200 мкМ dNTP та 0,5 мкМ прямого та зво-
ротного праймерів. Мультиплексну ПЛР для ло-
кусу NTF виконували як вказано у першоджерелі
[11]. Праймери для контрольної ділянки мобіль-
ного елемента IS6110, які продукують ПЛР-фраг-
мент довжиною 523 п.н. на ДНК усіх штамів,
що містять IS6110 (для київської популяції шта-
мів M. tuberculosis не було знайдено тих, що не
містили цього елемента) брали у концентрації
0,3 мкМ, а інші у концентрації 0,5 мкМ.
Реакції ПЛР виконували на ампліфікато-
рі 2720Tc (applied Biosystems, США). Продукти
ПЛР розділяли в агарозному (1,5–3 %) гелі з за-
барвленням бромистим етидієм, візуалізуалізаці-
єю на УФ-трансілюмінаторі і подальшою архіва-
цією за допомогою системи аналізу результатів
BG62-a2010 Gel Doc system Felix 1010 (Biostep,
Німеччина).
Результати та обговорення
Першим етапом аналізу клінічних ізоля-
тів київської популяції M. tuberculosis було їх
SNP-типуваня за локусом katG463, яке дозволяє
встановити приналежість до генотипових груп
ПГГ-1 або ПГГ-2/3. Як було показано у попе-
редніх роботах щонайменш 92,6 % штамів ПГГ-1
складають штами родини Beijing [5]. з 28 про-
аналізованих зразків 19 виявили приналежність
до ПГГ-1. Надалі аналізували тільки цю гру-
пу. Більшість штамів (18) згідно з результатами
ETr-VNTr типування мали тип 42435 і один –
42434.
згідно результатам мультиплексної ПЛР ло-
кусу NTF усі штами мали структуру локусу, ха-
рактерну для «сучасного» типу (рис.). Таким чи-
ном, очевидно, необхідно продовжити аналіз
штамів M. tuberculosis родини Beijing для того,
щоб охопити генотипи, які зустрічаються рідше,
ніж найбільш поширений тип 42435.
Епідеміологічні дослідження, які вивча-
ють поширення різних філогенетичних груп
338 ISSN 2219-3782. Фактори експериментальної еволюції організмів. 2015. Том 17
Чередник Ю.О., Анопрієнко О.В., Барбова А.І., Журило О.А.
Висновки
Необхідним є збільшення кількості про-
аналізованих ізолятів для достовірної оцін-
ки співвідношення «сучасних» та «предкових»
штамів у київській популяції клінічних шта-
мів M. tuberculosis. Перспективним для більш
оптимального аналізу можуть бути альтернатив-
ні методи виявлення штамів цих ліній на осно-
ві SNP-типування, MIrU-типування або «інвер-
тованої» IS6110-ПЛР.
Робота виконана за державний кошт.
[16]. Будь який з цих методів можливо застосо-
вувати додатково й для характеристики київської
популяції штамів M. tuberculosis, у разі спрощен-
ня процедури або більшої загальної інформатив-
ності, наприклад, виявлення додаткових субліній
сімейства Beijing, які відрізняються певними ві-
рулентними властивостями.
Рис. Структура локусу NTF у геномах штамів трьох субліній родини Beijing M. tuberculosis та результат
мультиплексної ПЛР з праймерами до цього локусу на ДНК деяких ізолятів. А – схема інтеграції в геном
M. tuberculosis родини Beijing мобільних елементів IS6110 і напрямку еволюції субліній від «предкового» типу
до «сучасного» [6] та розташування вздовж геномної ділянки праймерів, що утворюють систему мультиплексної
ПЛР [11]. Б – електрофореграма результатів мультиплексної ПЛР на ДНК штамів родини Beijing (Bj) та кон-
трольних штамів МТБК M. tuberculosis H37rv і M. bovis BCG, ліворуч відмічено розмір смуг ДНК-маркеру,
праворуч – розміри відповідних ПЛР-фрагментів
ЛІТЕРАТУРА
1. Bifani P.J., Mathema B., Kurepina N.E., Kreiswirth B.N. Global dissemination of the Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family
strains // Trends Microbiol. – 2002. – 10, N 1. – P. 45–52.
2. ribeiro S.C., Gomes L.L., amaral E.P., andrade M.r., almeida F.M., rezende a.L., Lanes V.r., Carvalho E.C., Suffys P.N.,
Mokrousov I., Lasunskaia E.B. Mycobacterium tuberculosis strains of the modern sublineage of the beijing family are more likely
to display increased virulence than strains of the ancient sublineage // J. Clin. Microbiol. – 2014. – 52 – P. 2615–2624.
3. Dymova M.a., Liashenko O.O., Poteiko P.I., Krutko V.S., Khrapov E.a., Filipenko M.L. Genetic variation of Mycobacterium
tuberculosis circulating in Kharkiv Oblast, Ukraine // BMC Infect. Dis. – 2011 – 11. – P. 77–87.
4. Муминов Т.А., Бейсембаева Ш.А., Жакипбаева Б.Т. Молекулярно-эпидемиологические методы изучения распространенно-
сти возбудителей туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью в Казахстане // Молекулярно-генетические
методы исследования в медицине и биологии: мат. междунар. науч.-практ. конф. – Караганда, 2012. – С. 35.
ISSN 2219-3782. Фактори експериментальної еволюції організмів. 2015. Том 17 339
Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium Tuberculosis
5. Чередник Ю.О., Анопрієнко О.В., Горовенко Н.Г., Фещенко Ю.І. ETr-VNTr та групоспецифічне SNP-типування штамів
Mycobacterium tuberculosis, циркулюючих в м. Києві // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів – 2013. –
11, № 2. – С. 134–156.
6. Mokrousov I., Ly H.M., Otten T., Lan N.N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the
Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: Clues from human phylogeography // Genome. res. – 2005. – 5. – P. 1357–1364.
7. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Otten T., Vyshnevskiy B. Novel IS6110 insertion sites in the direct repeat locus
of Mycobacterium tuberculosis clinical strains from the St.Petersburg area of russia, and evolutionary and epidemiological
considerations // J. Clin. Microbiol. – 2002. – 40, N 4. – P. 1504–1507.
8. Фещенко Ю.І., Журило О.А., Клименко М.Т. Наказ МОз України № 5 від 06.02.2002 «Про затвердження інструкції з бак-
теріологічної діагностики туберкульозної інфекції» (складена під керівництвом, та ін.). – зб. норм.-директ. документів з
охорони здоров’я, 2002. – № 2. – 111 c.
9. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. – М.: Мир, 1984. –
397 с.
10. Frothingham r., Meeker-O’Connell W.a. Genetic diversity in the Mycobacterium tuberculosis complex based on variable numbers
of tandem DNa repeats // Microbiology. – 1998. – 144. –P. 1189–1196.
11. Plikaytis B.B., Marden J.L., Crawford J.T., Woodley C.L., Butler W.r., Shinnick T.M. Multiplex PCr assay specific for the
multidrug-resistant strain W of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. – 1994 – 32, N 6. – P. 1542–1546.
12. Iwamoto T., Fujiyama r., Yoshida S., Wada T., Shirai C., Kawakami Y. Population structure dynamics of Mycobacterium
tuberculosis Beijing strains during past decades in Japan // J. Clin. Microbiol. – 2009. – 47, N 10. – P. 3340–3343.
13. Курунов Ю.Н., Краснов В.А., Мокроусов И.В., Филипенко М.Л, Киншт В.Н., Норкина О.В. Генетическое разнообразие
Mycobacterium tuberculosis и оценка факторов риска распространения заболевания туберкулезом в сибирском регионе Рос-
сии методами молекулярной эпидемиологии // Мол. Ген. Микробиол. Вирусол. – 2003. – № 3. – С. 9–18.
14. Чередник Ю.О., Анопрієнко О.В., Горовенко Н.Г., Фещенко Ю.І. Генотипові та клініко-епідеміологічні характеристики
ізолятів Mycobacterium tuberculosis, що циркулюють в м. Києві // Проблеми біології і медицини – 2013. – 1, № 4. – С. 220–
225.
15. Mokrousov I., Jiao W.W., Valcheva V., Vyazovaya a., Otten T., Ly H.M., Lan N.N., Limeschenko E., Markova N., Vyshnevskiy
B., Shen a.D., Narvskaya O. rapid detection of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and its ancient and modern
sublineages by IS6110-based inverse PCr // J. Clin. Microbiol. – 2006. – 8 – P. 2851–2856.
16. Millet J., Miyagi-Shiohira C., Yamane N., Mokrousov I., rastogi N. High-resolution MIrU-VNTrs typing reveals the unique
nature of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Okinawa, Japan // Infection, Genetics and Evolution – 2012. – 12,
N 4. – P. 637–641.
CHEREDNYK YU.О. 1, ANOPRIYENKO O.V. 2, BARBOVA A.І. 1, ZHURYLO О.А. 1
1 State Institution National Institute of phthisiology and pulmonology named by F.G. Yanovsky of AMS of Ukraine,
Ukraine, 03680, Kyiv-680, N. Amosova str., 10, e-mail: yurach@ukr.net
2 Institute of molecular biology and genetics of NAS of Ukraine,
Ukraine, 03143, Kyiv-143, Akademika Zabolotnogo str., 150
IDENTIFICATION OF MODERN AND ANCIENT BEIjING STRAIN SUBLINEAGES IN KYIV’S
POPULATION OF mycoBAcTERium TuBERculosis
Aims Characterization of M. tuberculosis Beijing family in Kyiv’s clinical strains population by content of «modern» and
«ancient» sublineages as defined by structure of NTF locus. Methods. Multiplex PCr of NTF locus, ETr-VNTr, and
SNP-typing (katG463) of bacterial isolate DNa samples from Kyiv’s patients with pulmonary tuberculosis. Results. 19
clinical isolates of M. tuberculosis strains belonged to the PGG-1 by SNP-typing and to two of the most prevalent ETr-
VNTr Beijing genotypes (42435, 42434) showed NTF-locus structure characteristic to «modern» type. Conclusions.
More samples should be analyzed to determine the proportion of «ancient» Beijing subtypes in Kyiv M. tuberculosis
population. alternative quick and convenient methods for detection of these sublineages could be considered for more
effective strategy of M. tuberculosis monitoring in Kyiv.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, molecular epidemiology, NTF-locus.
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-177549 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 2219-3782 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-02T07:08:17Z |
| publishDate | 2015 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Чередник, Ю.О. Анопрієнко, О.В. Барбова, А.І. Журило, О.А. 2021-02-16T12:41:52Z 2021-02-16T12:41:52Z 2015 Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis / Ю.О. Чередник, О.В. Анопрієнко, А.І. Барбова, О.А. Журило // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 17. — С. 336-339. — Бібліогр.: 16 назв. — укр. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177549 616-002.5:579.253:579.873.21 Aims Characterization of M. tuberculosis Beijing family in Kyiv’s clinical strains population by content of «modern» and «ancient» sublineages as defined by structure of NTF locus. Methods. Multiplex PCR of NTF locus, ETR-VNTR, and SNP-typing (katG463) of bacterial isolate DNA samples from Kyiv’s patients with pulmonary tuberculosis. Results. 19 clinical isolates of M. tuberculosis strains belonged to the PGG-1 by SNP-typing and to two of the most prevalent ETRVNTR Beijing genotypes (42435, 42434) showed NTF-locus structure characteristic to «modern» type. Conclusions. More samples should be analyzed to determine the proportion of «ancient» Beijing subtypes in Kyiv M. tuberculosis population. Alternative quick and convenient methods for detection of these sublineages could be considered for more effective strategy of M. tuberculosis monitoring in Kyiv. Keywords: Mycobacterium tuberculosis, molecular epidemiology, NTF-locus. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Аналіз та оцінка генетичних ресурсів Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis Identification of modern and ancient Beijing strain sublineages in Kyiv’s population of Mycobacterium tuberculosis Article published earlier |
| spellingShingle | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis Чередник, Ю.О. Анопрієнко, О.В. Барбова, А.І. Журило, О.А. Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| title | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis |
| title_alt | Identification of modern and ancient Beijing strain sublineages in Kyiv’s population of Mycobacterium tuberculosis |
| title_full | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis |
| title_fullStr | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis |
| title_full_unstemmed | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis |
| title_short | Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis |
| title_sort | виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини beijing у київській популяції mycobacterium tuberculosis |
| topic | Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| topic_facet | Аналіз та оцінка генетичних ресурсів |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/177549 |
| work_keys_str_mv | AT čerednikûo viâvlennâsučasnihtapredkovihsublíníištamívrodinibeijingukiívsʹkíipopulâcíímycobacteriumtuberculosis AT anopríênkoov viâvlennâsučasnihtapredkovihsublíníištamívrodinibeijingukiívsʹkíipopulâcíímycobacteriumtuberculosis AT barbovaaí viâvlennâsučasnihtapredkovihsublíníištamívrodinibeijingukiívsʹkíipopulâcíímycobacteriumtuberculosis AT žurilooa viâvlennâsučasnihtapredkovihsublíníištamívrodinibeijingukiívsʹkíipopulâcíímycobacteriumtuberculosis AT čerednikûo identificationofmodernandancientbeijingstrainsublineagesinkyivspopulationofmycobacteriumtuberculosis AT anopríênkoov identificationofmodernandancientbeijingstrainsublineagesinkyivspopulationofmycobacteriumtuberculosis AT barbovaaí identificationofmodernandancientbeijingstrainsublineagesinkyivspopulationofmycobacteriumtuberculosis AT žurilooa identificationofmodernandancientbeijingstrainsublineagesinkyivspopulationofmycobacteriumtuberculosis |