Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Datum: | 2014 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178047 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862576224939802624 |
|---|---|
| author | Полищук, Л.В. Лукьянчук, В.В. |
| author_facet | Полищук, Л.В. Лукьянчук, В.В. |
| citation_txt | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description | Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about the aminoacid sequences of the enzymes from the available Internet databases was used in this study. In silico analysis of patterns structures was performed using the technical capaibilities of the program BLAST. Results. Degree of homology of enzymes structures (D-olivosyltransferases and L- rhodinyltransferases) within the same organism and different producers was determined. The amino acid structures of analogous glycosyltransferases (LanGT1/LndGT1/Orf27, LanGT2/LndGT2/Orf29 and LanGT4/LndGT4/Orf32) synthesizing carbohydrate chain of landomycin E all three producers were identical more than 75%, meanwhile there was less than 33% identity of enzymes strucrures (LanGT1/LanGT2/LanGT4, LndGT1/LndGT2/LndGT4, Orf27/Orf29/Orf32) within each particular microorganism. Conclusions. Evolutionary relationship between analogous enzymes was revealed: they are ortologs. Two enzymes (LanGT3 and LanGT1) of S. cyanogenus S136 were identified as paralogous ones.

Key words: structure, in silico analysis, homology, ortholog, paralog, glycosyltransferase.
|
| first_indexed | 2025-11-26T13:30:59Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-178047 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 2219-3782 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-26T13:30:59Z |
| publishDate | 2014 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Полищук, Л.В. Лукьянчук, В.В. 2021-02-17T18:17:55Z 2021-02-17T18:17:55Z 2014 Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178047 579.873.71:577.152.24:004.9 Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about the aminoacid sequences of the enzymes from the available Internet databases was used in this study. In silico analysis of patterns structures was performed using the technical capaibilities of the program BLAST. Results. Degree of homology of enzymes structures (D-olivosyltransferases and L- rhodinyltransferases) within the same organism and different producers was determined. The amino acid structures of analogous glycosyltransferases (LanGT1/LndGT1/Orf27, LanGT2/LndGT2/Orf29 and LanGT4/LndGT4/Orf32) synthesizing carbohydrate chain of landomycin E all three producers were identical more than 75%, meanwhile there was less than 33% identity of enzymes strucrures (LanGT1/LanGT2/LanGT4, LndGT1/LndGT2/LndGT4, Orf27/Orf29/Orf32) within each particular microorganism. Conclusions. Evolutionary relationship between analogous enzymes was revealed: they are ortologs. Two enzymes (LanGT3 and LanGT1) of S. cyanogenus S136 were identified as paralogous ones.
 
 Key words: structure, in silico analysis, homology, ortholog, paralog, glycosyltransferase. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Еволюція геномів в природі та експерименті Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов Primary structures homology of glycosyltransferases from landomycines synthetic ways of streptomyces Article published earlier |
| spellingShingle | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов Полищук, Л.В. Лукьянчук, В.В. Еволюція геномів в природі та експерименті |
| title | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| title_alt | Primary structures homology of glycosyltransferases from landomycines synthetic ways of streptomyces |
| title_full | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| title_fullStr | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| title_full_unstemmed | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| title_short | Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| title_sort | гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов |
| topic | Еволюція геномів в природі та експерименті |
| topic_facet | Еволюція геномів в природі та експерименті |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178047 |
| work_keys_str_mv | AT poliŝuklv gomologiâpervičnogostroeniâglikoziltransferazbiosintetičeskogoputilandomicinovustreptomicetov AT lukʹânčukvv gomologiâpervičnogostroeniâglikoziltransferazbiosintetičeskogoputilandomicinovustreptomicetov AT poliŝuklv primarystructureshomologyofglycosyltransferasesfromlandomycinessyntheticwaysofstreptomyces AT lukʹânčukvv primarystructureshomologyofglycosyltransferasesfromlandomycinessyntheticwaysofstreptomyces |