Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were d...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Фактори експериментальної еволюції організмів |
|---|---|
| Дата: | 2014 |
| Автори: | , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862658014810472448 |
|---|---|
| author | Підпала, О.В. Лукаш, Л.Л. |
| author_facet | Підпала, О.В. Лукаш, Л.Л. |
| citation_txt | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description | Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were defined by program TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites (ver 1.3) (http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html). Results. Composite clusteres in the introns 2 and 3 of human MGMT gene consist of Alu-repeat and fragments of LINE-elements. Both sequences are enriched promotorspecific elements including the TATA box, AP-1, Sp1, SREBP-1, Oct-1, HSF2 and others. Exept that fragments of the LINE-elements have sites binding for the glucocorticoid receptor and orphan hormone nuclear receptor. Conclusions. The obtained results allow to consider analyzed intron clusters of MGE as potential alternative promoters.

Key words: human О⁶-methylguanin-DNA methyltransferase gene, mobile genetic elements, composite cluster structures.
|
| first_indexed | 2025-12-02T07:48:28Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-178121 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 2219-3782 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-02T07:48:28Z |
| publishDate | 2014 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Підпала, О.В. Лукаш, Л.Л. 2021-02-17T21:21:59Z 2021-02-17T21:21:59Z 2014 Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр. 2219-3782 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121 575.21:577.2 Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were defined by program TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites (ver 1.3) (http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html). Results. Composite clusteres in the introns 2 and 3 of human MGMT gene consist of Alu-repeat and fragments of LINE-elements. Both sequences are enriched promotorspecific elements including the TATA box, AP-1, Sp1, SREBP-1, Oct-1, HSF2 and others. Exept that fragments of the LINE-elements have sites binding for the glucocorticoid receptor and orphan hormone nuclear receptor. Conclusions. The obtained results allow to consider analyzed intron clusters of MGE as potential alternative promoters.
 
 Key words: human О⁶-methylguanin-DNA methyltransferase gene, mobile genetic elements, composite cluster structures. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Фактори експериментальної еволюції організмів Генетика людини та медична генетика Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей Composite cluster structure of mobile genetic elements in the MGMT gene intron as a source of regulatory sequences Article published earlier |
| spellingShingle | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей Підпала, О.В. Лукаш, Л.Л. Генетика людини та медична генетика |
| title | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей |
| title_alt | Composite cluster structure of mobile genetic elements in the MGMT gene intron as a source of regulatory sequences |
| title_full | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей |
| title_fullStr | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей |
| title_full_unstemmed | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей |
| title_short | Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей |
| title_sort | композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена mgmt як джерело регуляторних послідовностей |
| topic | Генетика людини та медична генетика |
| topic_facet | Генетика людини та медична генетика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121 |
| work_keys_str_mv | AT pídpalaov kompozicíiníklasternístrukturimobílʹnihgenetičnihelementívuíntronahgenamgmtâkdžereloregulâtornihposlídovnostei AT lukašll kompozicíiníklasternístrukturimobílʹnihgenetičnihelementívuíntronahgenamgmtâkdžereloregulâtornihposlídovnostei AT pídpalaov compositeclusterstructureofmobilegeneticelementsinthemgmtgeneintronasasourceofregulatorysequences AT lukašll compositeclusterstructureofmobilegeneticelementsinthemgmtgeneintronasasourceofregulatorysequences |