Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей

Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей

Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were d...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Фактори експериментальної еволюції організмів
Datum:2014
Hauptverfasser: Підпала, О.В., Лукаш, Л.Л.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
Schlagworte:
Генетика людини та медична генетика
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-178121
record_format dspace
spelling Підпала, О.В.
Лукаш, Л.Л.
2021-02-17T21:21:59Z
2021-02-17T21:21:59Z
2014
Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр.
2219-3782
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121
575.21:577.2
Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were defined by program TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites (ver 1.3) (http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html). Results. Composite clusteres in the introns 2 and 3 of human MGMT gene consist of Alu-repeat and fragments of LINE-elements. Both sequences are enriched promotorspecific elements including the TATA box, AP-1, Sp1, SREBP-1, Oct-1, HSF2 and others. Exept that fragments of the LINE-elements have sites binding for the glucocorticoid receptor and orphan hormone nuclear receptor. Conclusions. The obtained results allow to consider analyzed intron clusters of MGE as potential alternative promoters. Key words: human О⁶-methylguanin-DNA methyltransferase gene, mobile genetic elements, composite cluster structures.
uk
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Фактори експериментальної еволюції організмів
Генетика людини та медична генетика
Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
Composite cluster structure of mobile genetic elements in the MGMT gene intron as a source of regulatory sequences
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
spellingShingle Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
Підпала, О.В.
Лукаш, Л.Л.
Генетика людини та медична генетика
title_short Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
title_full Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
title_fullStr Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
title_full_unstemmed Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей
title_sort композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена mgmt як джерело регуляторних послідовностей
author Підпала, О.В.
Лукаш, Л.Л.
author_facet Підпала, О.В.
Лукаш, Л.Л.
topic Генетика людини та медична генетика
topic_facet Генетика людини та медична генетика
publishDate 2014
language Ukrainian
container_title Фактори експериментальної еволюції організмів
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Composite cluster structure of mobile genetic elements in the MGMT gene intron as a source of regulatory sequences
description Aims. It was carried out analysis of the composite cluster structures MGE in intron 2 and 3 of human MGMT gene for the sequences homologous to binding sites of transcription factors. Methods. Searching and identifying MGE was realised by using CENSOR (http://www.girinst.org). Functional sites were defined by program TFSEARCH: Searching Transcription Factor Binding Sites (ver 1.3) (http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html). Results. Composite clusteres in the introns 2 and 3 of human MGMT gene consist of Alu-repeat and fragments of LINE-elements. Both sequences are enriched promotorspecific elements including the TATA box, AP-1, Sp1, SREBP-1, Oct-1, HSF2 and others. Exept that fragments of the LINE-elements have sites binding for the glucocorticoid receptor and orphan hormone nuclear receptor. Conclusions. The obtained results allow to consider analyzed intron clusters of MGE as potential alternative promoters. Key words: human О⁶-methylguanin-DNA methyltransferase gene, mobile genetic elements, composite cluster structures.
issn 2219-3782
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/178121
citation_txt Композиційні кластерні структури мобільних генетичних елементів у інтронах гена MGMT як джерело регуляторних послідовностей / О.В. Підпала, Л.Л. Лукаш // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 220-224. — Бібліогр.: 19 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT pídpalaov kompozicíiníklasternístrukturimobílʹnihgenetičnihelementívuíntronahgenamgmtâkdžereloregulâtornihposlídovnostei
AT lukašll kompozicíiníklasternístrukturimobílʹnihgenetičnihelementívuíntronahgenamgmtâkdžereloregulâtornihposlídovnostei
AT pídpalaov compositeclusterstructureofmobilegeneticelementsinthemgmtgeneintronasasourceofregulatorysequences
AT lukašll compositeclusterstructureofmobilegeneticelementsinthemgmtgeneintronasasourceofregulatorysequences
first_indexed 2025-12-02T07:48:28Z
last_indexed 2025-12-02T07:48:28Z
_version_ 1850861846047752192

Ähnliche Einträge