Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії
Мета дослідження — визначення статі плоду за даними генної експресії зчеплених з Y-хромосомою генів і з’ясування особливостей експресії генів статевих хромосом упродовж вагітності дівчинкою і хлопчиком. Визначено 27 диференційно експресованих генів статевих хромосом, за якими відрізняються зразки...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2021 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2021
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/180396 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії / O.K. Лихенко, М.Ю. Oболенська // Доповіді Національної академії наук України. — 2021. — № 1. — С. 100-109. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-180396 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Лихенко, O.K. Oболенська, М.Ю. 2021-09-20T16:02:15Z 2021-09-20T16:02:15Z 2021 Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії / O.K. Лихенко, М.Ю. Oболенська // Доповіді Національної академії наук України. — 2021. — № 1. — С. 100-109. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. 1025-6415 DOI: doi.org/10.15407/dopovidi2021.01.100 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/180396 577.218 Мета дослідження — визначення статі плоду за даними генної експресії зчеплених з Y-хромосомою генів і з’ясування особливостей експресії генів статевих хромосом упродовж вагітності дівчинкою і хлопчиком. Визначено 27 диференційно експресованих генів статевих хромосом, за якими відрізняються зразки з ХY і ХХ генотипами. Показано, що в більшості випадків експресія генів з Х-хромосом за перебігу вагітності дівчинкою вища, ніж у разі вагітності хлопчиком, але існують винятки з цієї закономірності, які потрібно враховувати під час широкомасштабних досліджень генної експресії. Характер різниці між експресією генів зберігається впродовж усього періоду вагітності як дівчинкою, так і хлопчиком (у кого більш або менш інтенсивна), а величина різниці може залишатися незмінною або спадати від першого до третього триместру. Урахування статевого диморфізму під час аналізу широкомасштабних даних генної експресії між триместрами вагітності забезпечує збільшення кількості диференційно експресованих генів, що поліпшує інформативність дослідження і важливе для з’ясування патогенезу ускладнень вагітності, пов’язаних з дисфункцією плаценти. The aim of the study was to determine the sex of the fetus in gene expression data lacking this information using expression of the Y-linked genes, and to elucidate the difference between sex-chromosomal-linked gene expression between placental samples with XX and XY genotypes during pregnacy. We have detected 27 differentially expressed sex-chromosomes-linked genes. We have shown that, in most cases, the expression of genes from X-chromosomes in pregnancy carrying baby girls is higher than in pregnancy carrying baby boys, but there are exceptions to this pattern, which must be taken into account in large-scale studies of gene expression. The nature of the difference in gene expression during pregnancy carrying baby girls and boys (positive or ne gative difference) persists during pregnancy, but the magnitude of the difference may remain unchanged or decrease from the first to the third trimester. Taking sex dimorphism into account when analyzing large-scale gene expression data between trimesters of pregnancy increases the number of differentially expressed genes, which improves the informative value of the study and is important for elucidating the pathogenesis of pregnancy complications associated with placental dysfunction. Дослідження проведено в рамках бюджетної теми № 2.2.4.18 і підтримано Національною академією наук України. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біологія Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії The knowledge of chromosomal sex is important for large-scale analysis of gene expression Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| spellingShingle |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії Лихенко, O.K. Oболенська, М.Ю. Біологія |
| title_short |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| title_full |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| title_fullStr |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| title_full_unstemmed |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| title_sort |
важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії |
| author |
Лихенко, O.K. Oболенська, М.Ю. |
| author_facet |
Лихенко, O.K. Oболенська, М.Ю. |
| topic |
Біологія |
| topic_facet |
Біологія |
| publishDate |
2021 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
The knowledge of chromosomal sex is important for large-scale analysis of gene expression |
| description |
Мета дослідження — визначення статі плоду за даними генної експресії зчеплених з Y-хромосомою генів
і з’ясування особливостей експресії генів статевих хромосом упродовж вагітності дівчинкою і хлопчиком.
Визначено 27 диференційно експресованих генів статевих хромосом, за якими відрізняються зразки з ХY
і ХХ генотипами. Показано, що в більшості випадків експресія генів з Х-хромосом за перебігу вагітності
дівчинкою вища, ніж у разі вагітності хлопчиком, але існують винятки з цієї закономірності, які потрібно
враховувати під час широкомасштабних досліджень генної експресії. Характер різниці між експресією генів
зберігається впродовж усього періоду вагітності як дівчинкою, так і хлопчиком (у кого більш або менш
інтенсивна), а величина різниці може залишатися незмінною або спадати від першого до третього триместру. Урахування статевого диморфізму під час аналізу широкомасштабних даних генної експресії між
триместрами вагітності забезпечує збільшення кількості диференційно експресованих генів, що поліпшує
інформативність дослідження і важливе для з’ясування патогенезу ускладнень вагітності, пов’язаних з
дисфункцією плаценти.
The aim of the study was to determine the sex of the fetus in gene expression data lacking this information using
expression of the Y-linked genes, and to elucidate the difference between sex-chromosomal-linked gene
expression between placental samples with XX and XY genotypes during pregnacy. We have detected 27 differentially
expressed sex-chromosomes-linked genes. We have shown that, in most cases, the expression of genes
from X-chromosomes in pregnancy carrying baby girls is higher than in pregnancy carrying baby boys, but
there are exceptions to this pattern, which must be taken into account in large-scale studies of gene expression.
The nature of the difference in gene expression during pregnancy carrying baby girls and boys (positive or
ne gative difference) persists during pregnancy, but the magnitude of the difference may remain unchanged or
decrease from the first to the third trimester. Taking sex dimorphism into account when analyzing large-scale
gene expression data between trimesters of pregnancy increases the number of differentially expressed genes,
which improves the informative value of the study and is important for elucidating the pathogenesis of pregnancy
complications associated with placental dysfunction.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/180396 |
| citation_txt |
Важливість параметра "стать” для широкомасштабного аналізу генної експресії / O.K. Лихенко, М.Ю. Oболенська // Доповіді Національної академії наук України. — 2021. — № 1. — С. 100-109. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT lihenkook važlivístʹparametrastatʹdlâširokomasštabnogoanalízugennoíekspresíí AT obolensʹkamû važlivístʹparametrastatʹdlâširokomasštabnogoanalízugennoíekspresíí AT lihenkook theknowledgeofchromosomalsexisimportantforlargescaleanalysisofgeneexpression AT obolensʹkamû theknowledgeofchromosomalsexisimportantforlargescaleanalysisofgeneexpression |
| first_indexed |
2025-12-07T18:26:32Z |
| last_indexed |
2025-12-07T18:26:32Z |
| _version_ |
1850875044613324800 |