Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів

• Published in: Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів
• Date: 2009
• Main Authors: Шельов, А.В., Спиридонов, В.Г., Парій, М.Ф., Мельничук, С.Д.
• Format: Article
• Language: Ukrainian
• Published: Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова 2009
• Subjects: Оригінальні статті
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/18918
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів / А.В. Шельов, В.Г. Спиридонов, М.Ф. Парій, С.Д. Мельничук // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2009. — Т. 7, № 2. — С. 257-261. — Бібліогр.: 10 назв. — укр.

В роботі на основі аналізу 40 голів Української верхової породи коней з використанням панелі 14 SSR-маркерів показано можливість генотипування тварин з високим ступенем достовірності. Всі використані локуси показали високий рівень поліморфізму, кількість ідентифікованих алелей коливалась від 5 до 12 з індексом поліморфізму (PIC) від 0,482 – до 0,879. На основі проведеного дослідження визначено випадковий збіг алелей (СРЕ), який становить 99,999 %. Отримані дані свідчать про те, що для генетичного аналізу коней УВП найінформативнішими є 6 маркерів: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 та ASB17. Панель із 6 наведених маркерів достатня для ідентифікації тварин досліджуваної породи, у відповідності із вимогами ISBC. В работе на основе анализа 40 голов лошадей Украинской верховой породы, с использованием панели из 14 SSR-маркеров, показано возможность генотипирования животных с высокой степенью достоверности. Все изученные локусы показали высокий уровень полиморфизма, количество идентифицированных аллелей варьировало от 5 до 12 с индексом полиморфизма (PIC) от 0,482 – до 0,879. На основе анализа полученных данных определена вероятность случайного совпадения аллелей (СРЕ), которое составляет 99,999%. Это свидетельствует о том, что для генетического анализа лошадей УВП наиболее информативными являются 6 маркеров: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 и ASB17. Панель из 6 указанных маркеров является достаточной для идентификации животных исследуемой породы, в соответствии с требованиями ISBC. The present study was to evaluate a parentage verification system for Ukrainian Rider horse breed using 14 SSR- markers. A total number of 40 Ukrainian Rider horse including 13 foals for parentage verification were genotyped. The microsatellite loci showed extensive polymorphism with allele numbers ranging from 5 to 12 and polymorphism information content (PIC) values in the range 0.482 – 0.879. The analysis of these loci also revealed that they had a 99,999 % combined probability of exclusion (CPE) of false parentage. This study suggests that the DNA typing method has high potential for parentage testing and individual identification of Ukrainian Rider horse breed.