Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів
В роботі на основі аналізу 40 голів Української верхової породи коней з використанням панелі 14 SSR-маркерів показано можливість генотипування тварин з високим ступенем достовірності. Всі використані локуси показали високий рівень поліморфізму, кількість ідентифікованих алелей коливалась від 5 до 12...
Saved in:
| Published in: | Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів |
|---|---|
| Date: | 2009 |
| Main Authors: | , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова
2009
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/18918 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів / А.В. Шельов, В.Г. Спиридонов, М.Ф. Парій, С.Д. Мельничук // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2009. — Т. 7, № 2. — С. 257-261. — Бібліогр.: 10 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1860194675259867136 |
|---|---|
| author | Шельов, А.В. Спиридонов, В.Г. Парій, М.Ф. Мельничук, С.Д. |
| author_facet | Шельов, А.В. Спиридонов, В.Г. Парій, М.Ф. Мельничук, С.Д. |
| citation_txt | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів / А.В. Шельов, В.Г. Спиридонов, М.Ф. Парій, С.Д. Мельничук // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2009. — Т. 7, № 2. — С. 257-261. — Бібліогр.: 10 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів |
| description | В роботі на основі аналізу 40 голів Української верхової породи коней з використанням панелі 14 SSR-маркерів показано можливість генотипування тварин з високим ступенем достовірності. Всі використані локуси показали високий рівень поліморфізму, кількість ідентифікованих алелей коливалась від 5 до 12 з індексом поліморфізму (PIC) від 0,482 – до 0,879. На основі проведеного дослідження визначено випадковий збіг алелей (СРЕ), який становить 99,999 %. Отримані дані свідчать про те, що для генетичного аналізу коней УВП найінформативнішими є 6 маркерів: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 та ASB17. Панель із 6 наведених маркерів достатня для ідентифікації тварин досліджуваної породи, у відповідності із вимогами ISBC.
В работе на основе анализа 40 голов лошадей Украинской верховой породы, с использованием панели из 14 SSR-маркеров, показано возможность генотипирования животных с высокой степенью достоверности. Все изученные локусы показали высокий уровень полиморфизма, количество идентифицированных аллелей варьировало от 5 до 12 с индексом полиморфизма (PIC) от 0,482 – до 0,879. На основе анализа полученных данных определена вероятность случайного совпадения аллелей (СРЕ), которое составляет 99,999%. Это свидетельствует о том, что для генетического анализа лошадей УВП наиболее информативными являются 6 маркеров: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 и ASB17. Панель из 6 указанных маркеров является достаточной для идентификации животных исследуемой породы, в соответствии с требованиями ISBC.
The present study was to evaluate a parentage verification system for Ukrainian Rider horse breed using 14 SSR- markers. A total number of 40 Ukrainian Rider horse including 13 foals for parentage verification were genotyped. The microsatellite loci showed extensive polymorphism with allele numbers ranging from 5 to 12 and polymorphism information content (PIC) values in the range 0.482 – 0.879. The analysis of these loci also revealed that they had a 99,999 % combined probability of exclusion (CPE) of false parentage. This study suggests that the DNA typing method has high potential for parentage testing and individual identification of Ukrainian Rider horse breed.
|
| first_indexed | 2025-12-07T18:07:40Z |
| format | Article |
| fulltext |
ISSN 18107834. ³ñí. Óêð. тоââà ãåíåтèê³â ³ ñåëåêö³оíåð³â. 2009, том 7, № 2 257
© à.â. Øåëüîâ, â.ã. ñПèðèäîÍîâ, ì.Ô.ПàðІЙ, ñ.ä. ìåëüÍè×óê, 2009
óäê 575.082.13:636.1.001.32
ГеÍÎÒипувАÍÍя кÎÍей укрАїÍÑькÎї верхÎвÎї
пÎрÎди Ç викÎриÑÒАÍÍяÌ пАÍел² ssR‑ÌАркер²в
à.â. Øåëüîâ, â.ã. ñПèðèäîÍîâ, ì.Ô.ПàðІЙ, ñ.ä. ìåëüÍè×óê
óêðà¿íñьêà ëàáîðàòîð³ÿ ÿêîñò³ ³ áåçïåêè ïðîäуêö³¿ àПê,
óêðà¿íà, 08162, êèºâîñâÿòîøèíñьêèé ðí, ñìò ×àáàíè, âуë. ìàøèíîáуä³âíèê³â, 7
email: receptions@quality.ua
Ó ðобот³ íà оñíоâ³ àíàë³çó 40 ãоë³â Óêðàїíñüêої âåðõоâої ïоðоäè êоíåé ç âèêоðèñтàííÿм
ïàíåë³ 14 SSRмàðêåð³â ïоêàçàíо моæëèâ³ñтü ãåíотèïóâàííÿ тâàðèí ³ç âèñоêèм ñтóïå
íåм äоñтоâ³ðíоñт³. Âñ³ âèêоðèñтàí³ ëоêóñè ïоêàçàëè âèñоêèé ð³âåíü ïоë³моðô³çмó, ê³ëü
ê³ñтü ³äåíтèô³êоâàíèõ àëåëåé êоëèâàëàñü â³ä 5 äо 12 ç ³íäåêñом ïоë³моðô³çмó (PIC) â³ä
0,482 – äо 0,879. Íà оñíоâ³ ïðоâåäåíоãо äоñë³äæåííÿ âèçíà÷åíо âèïàäêоâèé çб³ã àëå
ëåé (ÑÐÅ), ÿêèé ñтàíоâèтü 99,999 %. Îтðèмàí³ äàí³ ñâ³ä÷àтü ïðо тå, що äëÿ ãåíåтè÷íоãо
àíàë³çó êоíåé ÓÂÏ íàé³íôоðмàтèâí³øèмè º 6 мàðêåð³â: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20,
HMS07 тà ASB17. Ïàíåëü ³ç 6 íàâåäåíèõ мàðêåð³â äоñтàтíÿ äëÿ ³äåíтèô³êàö³ї тâàðèí äо
ñë³äæóâàíої ïоðоäè, ó â³äïоâ³äíоñт³ ³ç âèмоãàмè ISBC.
Êëþ÷оâ³ ñëоâà: óêðàїíñüêà âåðõоâà ïоðоäà êоíåé, SSRмàðêåðè, ãåíотèïóâàííÿ, âèçíà
÷åííÿ äоñтоâ³ðíоñт³ ïоõоäæåííÿ.
вñòуп. â³äêðèòòÿ ïîë³ìîðô³çìу êîðîòêèõ òàíäåìíèõ ïîâòîð³â äÍê (ì³êðî
ñàòåë³ò³â) òà âèêîðèñòàííÿ ïîë³ìåðàçíî¿ ëàíöþãîâî¿ ðåàêö³¿ (Пëð) ñïðèÿëî
ðîçðîáö³ уí³âåðñàëьíîãî ³íñòðуìåíòу äëÿ ³íäèâ³äуàëьíî¿ ³äåíòèô³êàö³¿ òà âñòà
íîâëåííÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ у ëþäåé òà òâàðèí [1, 2]. ì³êðîñàòåë³òè ìà
þòь ïðîñòèé òà ñòàá³ëьíèé ìåõàí³çì уñïàäêуâàííÿ, ÿêèé ïðîñòåæуºòьñÿ â³ä îä
í³º¿ ãåíåðàö³¿ äî ³íøî¿, òîìу ¿õ çàñòîñîâуþòь äëÿ âñòàíîâëåííÿ ïîõîäæåííÿ çà
ð³çíèìè íàïðÿìêàìè ðîäèííèõ â³äíîñèí. äëÿ êîíåé âèÿâëåíî âåëèêу ê³ëьê³ñòь
ì³êðîñàòåë³òíèõ ìàðêåð³â, àëå íå âñ³ âîíè º îäíàêîâî ³íôîðìàòèâíèìè äëÿ ð³ç
íèõ ïîïуëÿö³é òà ïîð³ä êîíåé, ñàìå òîìу êîì³òåòîì ç ãåíåòèêè êîíåé ì³æíàðîä
íîãî òîâàðèñòâà ãåíåòèêè òâàðèí (ISAG) áуëî âèä³ëåíî 9 äÍêìàðêåð³â (AHT04,
AHT05, ASB02, HMS03, HMS06, HMS07, HTG04, HTG10 òà VHL20) ÿê ì³æíà
ðîäíу ñòàíäàðòíу ïàíåëь ì³êðîñàòåë³òíèõ ìàðêåð³â [3–6]. Зà ðåêîìåíäàö³ºþ
êîì³òåòу âèçíà÷åííÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ êîíåé ïîâèííî ñïèðàòèñь íà
âèêëþ÷åííÿ çá³ãу äâîõ àáî á³ëьøå ìàðêåð³â, îñê³ëьêè âèêëþ÷åííÿ çá³ãу ëèøå çà
îäíèì ìàðêåðîì ìîæå áуòè ñïðè÷èíåíå íåâèçíà÷åí³ñòþ àáî ìуòàö³éíèì ïðî
öåñîì [7].
×èñåëьí³ñòь êîíåé óâП â óêðà¿í³ ñòàíîâèòь áëèçьêî 2779 ãîë³â, â òîìу ÷èñ
ë³: æåðåáö³ïë³äíèêè – 90 ãîë³â, êîíåìàòêè – 1248, ìîëîäíÿê ð³çíîãî â³êу –
1129 òà êîí³ â ñïîðò³ – 312 ãîë³â. êîí³ óâП â³äð³çíÿþòьñÿ ïîðîäí³ñòþ, ÿñêðàâèì
åêñòåð’ºðîì, äîáðîíðàâí³ñòþ, ñëуõíÿí³ñòþ, âèñîêîþ âèòðèâàë³ñòþ òà íåâèáà
ãëèâ³ñòþ ùîäî уìîâ уòðèìàííÿ. óêðà¿íñьêу âåðõîâу ïîðîäу êîíåé (óâП) âèâå
äåíî ìåòîäîì ñêëàäíîãî â³äòâîðíîãî ñõðåùуâàííÿ ì³ñöåâèõ òà çàïðÿæíèõ êî
íåé ³ç çàõ³äíîºâðîïåéñьêèìè ê³íьìè òðàêåíñьêî¿, ãàíîâåðñьêî¿, уãîðñьêî¿ òà ÷è
ISSN 18107834. ³ñí. Óêð. тоââà ãåíåтèê³â ³ ñåëåêö³оíåð³â. 2009, том 7, № 2258
А.В. Шеëüов, В.Г. Спèðèдоíов, М.Ф.Пàð³й, С.Д. Меëüíèчук
íî ³íñòðуêö³é âèðîáíèêà. äëÿ äîñë³äæåííÿ
âèêîðèñòîâуâàëè êðîâ 40 êîíåé óâП ç â³äî
ìèì ðîäîâîäîì, íàäàíèõ àñîö³àö³ºþ ñïðè
ÿííÿ ðîçâèòêу ê³ííîãî ñïîðòу óêðà¿íè.
×îòèðíàäöÿòь ì³êðîñàòåë³òíèõ äÍê
ìàðêåð³â (òàáë. 1) áуëî â³ä³áðàíî çã³äíî
ðåêîìåíäàö³é ì³æíàðîäíîãî êîì³òåòу òî
âàðèñòâà ãåíåòèêè òâàðèí (ISAG). Пîë³
ìåðàçíу ëàíöþãîâу ðåàêö³þ (Пëð) çàñòî
ñîâуâàëè äëÿ àìïë³ô³êàö³¿ ì³êðîñàòåë³ò
íèõ ìàðêåð³â êîíåé â ñòàíäàðòíèõ уìîâàõ.
Пðîäуêòè Пëð äåíàòуðуâàëè ôîðìàì³äîì
(Sigma) òà ðîçä³ëÿëè ìåòîäîì êàï³ëÿðíî
ãî åëåêòðîôîðåçу íà ãåíåòè÷íîìу àíàë³
çàòîð³ “ABI Prizm 3130” Genetic Analyzer
(Applied Biosystem, ñØà). âèçíà÷åí
íÿ ðîçì³ð³â àëåëåé çä³éñíþâàëè çà äîïî
ìîãîþ ïðîãðàìíîãî çàáåçïå÷åííÿ “Gene
Maðper 3.7” (Applied Biosystem, ñØà) ³ç
âèêîðèñòàííÿì ñòàíäàðòу “GenescanLIZ
500” (Applied Biosystem, ñØà). âèçíà÷åí
íÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ òâàðèí áуëî
çä³éñíåíî çã³äíî ïðèíöèï³â уñïàäêîâуâàí
íÿ êîäîì³íàíòíèõ ìàðêåð³â: у ëîøàòè ïî
âèíåí âèÿâëÿòèñь îäèí àëåëь â³ä êîáèëè
ìàòåð³, ³íøèé â³ä æåðåáöÿáàòьêà.
ê³ëьê³ñòь òà ÷àñòîòè ³äåíòèô³êîâàíèõ
àëåëåé îö³íþâàëè çà äîïîìîãîþ áåçïîñå
ðåäíьîãî ï³äðàõуíêу òà àíàë³çу îäåðæàíèõ
ãåíîòèï³â, ³íäåêñè ãåòåðîçèãîòíîñò³ (Hobs,
Hexp), ïîë³ìîðô³çìу (ðІñ) òà â³ðîã³äí³ñòь
âèêëþ÷åííÿ ïîìèëêîâîãî çá³ãу àëåëåé
(ðå) áуëî âèçíà÷åíî çà äîïîìîãîþ ïðî
ãðàìíîãî çàáåçïå÷åííÿ Cervus 3.0.3 [9] òà
PowerStatsV12 (Promega).
рåзуëüòàòè òà îáãîâîðåííÿ
â ðåçуëьòàò³ ïðîâåäåíî¿ ðîáîòè, íåçâà
æàþ÷è íà íåâåëèêу ÷èñåëьí³ñòь äîñë³äæу
âàíèõ òâàðèí, âèÿâëåíî âèñîêèé ñòуï³íь
ïîë³ìîðô³çìу ì³êðîñàòåë³òíèõ ìàðêåð³â у
êîíåé óâП (òàáë. 1).
ê³ëьê³ñòь âèÿâëåíèõ àëåëåé ñòàíîâèëà
â³ä 5òè äëÿ ìàðêåð³â HTG04 òà HTG07 äî
12òè – äëÿ HTG10. ñâ³ä÷åííÿì äîñòàòíьî
ñòîêðîâíî¿ âåðõîâî¿ ïîðîäè ³ ÿê ñàìîñò³éíу
çàòâåðäæåíî â æîâòí³ 1990 ðîêу, ïðè öьî
ìу ðîáîòà ç ¿¿ ñòâîðåííÿ ðîçïî÷àëàñь ùå
â 1945 ðîö³ ç ìåòîþ îòðèìàííÿ âåðõîâî
çàïðÿæíèõ êîíåé.
ñьîãîäí³ â çâ’ÿçêу ³ç òèì, ùî ïåðåâàæíà
á³ëьø³ñòь âèñîêîö³ííèõ òâàðèí çíàõîäèòь
ñÿ â ïðèâàòí³é âëàñíîñò³, âèñîêîþ âàðò³ñòþ
ïëåì³ííèõ òâàðèí, çá³ëьøåííÿì åêñïîðòу
òà ³ìïîðòу, у÷àñòþ â ì³æíàðîäíèõ çìàãàí
íÿõ, à òàêîæ çàñòîñуâàííÿì á³îòåõíîëîã³÷
íèõ ìåòîä³â ïðè â³äòâîðåíí³, íåîáõ³äí³ñòь
íàä³éíî¿ ñèñòåìè ³äåíòèô³êàö³¿ ³ êîíòðîëþ
ïîõîäæåííÿ êîíåé ñòຠíàäçâè÷àéíî àêòу
àëьíîþ [7]. äî ïðè÷èí, ùî îáуìîâëþþòь
íåâ³äïîâ³äí³ñòь çàïèñ³â у ðîäîâîäàõ ðåàëь
íîìу ïîõîäæåííþ òâàðèí, ìîæíà â³äíåñòè
òàê³: íàâìèñíà ôàëьñèô³êàö³ÿ, íåäáàë³ñòь
ïðè îïèñ³ â³äì³òèí ³ òàâðуâàíí³, ïîêðèòòÿ
êîáèëè äâîìà æåðåáöÿìè, âèïàäêîâ³ ñïà
ðîâуâàííÿ. Єäèíèì åôåêòèâíèì ñïîñî
áîì êîíòðîëþ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ
é ³äåíòèô³êàö³¿ òâàðèí º ãåíîòèïуâàííÿ çà
äîïîìîãîþ SSRìàðêåð³â [8].
ìåòîþ íàøî¿ ðîáîòè áуëî âèçíà÷èòè
äîñòîâ³ðí³ñòь ïîõîäæåííÿ êîíåé óêðà¿í
ñьêî¿ âåðõîâî¿ ïîðîäè (óâП) çà äîïîìîãîþ
ì³êðîñàòåë³òíèõ äÍêìàðêåð³â, ðîçðàõу
âàòè ÷àñòîòè âèÿâëåíèõ àëåëåé, ³íäåêñè ¿õ
íьî¿ ãåòåðîçèãîòíîñò³ (Hobs, Hexp), ïîë³ìîð
ô³çìу (polymorphic information contents,
ðІñ), à òàêîæ, â³ðîã³äí³ñòь âèêëþ÷åííÿ âè
ïàäêîâîãî çá³ãу àëåëåé (probability of
exclusion, ðå). Íà ïðèêëàä³ ãðуïè òâàðèí
³ç â³äîìèì ðîäîâîäîì ïîêàçàòè ïðàêòè÷
íå çàñòîñуâàííÿ ì³êðîñàòåë³òíèõ äÍê
ìàðêåð³â äëÿ âñòàíîâëåííÿ äîñòîâ³ðíîñò³
ïîõîäæåííÿ òà âèçíà÷åííÿ ³íäèâ³äуàëьíèõ
äÍêïðîô³ë³â äëÿ êîæíî¿ ç äîñë³äæуâàíèõ
òâàðèí.
Ìàòåð³àëè ³ ìåòîäè
ãåíîìíу äÍê áуëî ³çîëьîâàíî ç ïåðèôå
ð³éíî¿ êðîâ³ êîíåé ³ç âèêîðèñòàííÿì íàáî
ð³â “QIAamp® DNA Mini Kit” (Qiagen), çã³ä
ISSN 18107834. ³ñí. Óêð. тоââà ãåíåтèê³â ³ ñåëåêö³оíåð³â. 2009, том 7, № 2 259
Геíоòèпувàííя коíей укðàїíñüкої веðхової поðодè з вèкоðèñòàííям пàíеë³ ssr-мàðкеð³в
ì³êðîñàòåë³òíèõ äÍêìàðêåð³â â уñ³õ âè
ïàäêàõ áåç âèêëþ÷åíь.
âèçíà÷åííÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåí
íÿ ïëåì³ííèõ êîíåé çà äîïîìîãîþ SSR
ìàðêåð³â º íåâ³ä’ºìíîþ ÷àñòèíîþ ãåíå
òè÷íî¿ åêñïåðòèçè, ÿêà â ñâîþ ÷åðãу, çã³äíî
Íàêàçу № 197 ì³í. àПê (â³ä 1.06.2004 ð.),
º ñêëàäîâîþ ïëåì³ííî¿ ñïðàâè у êîíÿðñòâ³
òà ïðîâîäèòьñÿ ç ìåòîþ êîíòðîëþ äîñòî
â³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ ïëåì³ííèõ òâàðèí,
³äåíòèô³êàö³¿ òâàðèí ³ çàáåçïå÷åííÿ äîñòî
â³ðíîñò³ ðîäîâîä³â ïëåì³ííèõ òâàðèí, ùî
ñïðèÿº ï³äâèùåííþ åôåêòèâíîñò³ ìåòîä³â
ñåëåêö³¿ òà âèÿâëåííÿ ïëåì³ííèõ òâàðèí,
ùî º íîñ³ÿìè ãåíåòè÷íèõ àíîìàë³é, ³ âèëу
÷åííÿ ¿õ ³ç ñåëåêö³éíîãî ïðîöåñу.
вèñíîâêè
îòðèìàí³ äàí³ ñâ³ä÷àòь ïðî òå, ùî äëÿ
ãåíåòè÷íîãî àíàë³çу êîíåé óâП íàé³íôîð
ìàòèâí³øèìè º 6 ìàðêåð³â: ASB23, HTG06,
HTG10, VHL20, HMS07 òà ASB17 ³ç ñåðåä
í³ìè ïîêàçíèêàìè ðІñ — 0,804 òà ðå —
âèñîêîãî ð³âíÿ ãåòåðîãåííîñò³ äîñë³äæуâà
íî¿ ïîïуëÿö³¿ áуëà âèÿâëåíà ãåòåðîçèãîò
í³ñòь (Hobs) (òàáëèöÿ 1), ÿêà çíàõîäèëèñь â
ìåæàõ â³ä 0,60 (CA425 òà HMS03) äî 0,96
(VHL20), ïðè öьîìу î÷³êуâàíà ãåòåðîçèãîò
í³ñòь (Hexp) ñòàíîâèëà â³ä 0,585 (HTG04) äî
0,908 (HTG10). Іíäåêñ ïîë³ìîðô³çìу (PIC)
áуâ ð³çíèì ³ êîëèâàâñÿ â³ä 0,482 (HTG04)
äî 0,879 (HTG10). Íà îñíîâ³ îòðèìàíèõ äà
íèõ ï³äðàõîâàíî â³ðîã³äí³ñòь âèêëþ÷åííÿ
âèïàäêîâîãî çá³ãу àëåëåé (PE), ÿêà ñêëà
äàëà â³ä 0,291 (CA425 òà HMS03) äî 0,919
(VHL20). êîìá³íîâàíà â³ðîã³äí³ñòь âèêëþ
÷åííÿ âèïàäêîâîãî çá³ãу àëåëåé (ñðå) ñòà
íîâèëà 0,99999, àáî 99,999 %. öå ñâ³ä
÷èòь ïðî âèñîêèé ð³âåíь ³íôîðìàòèâíîñò³
îáðàíî¿ ïàíåë³ ì³êðîñàòåë³òíèõ ìàðêåð³â
äëÿ äîñë³äæåííÿ êîíåé уêðà¿íñьêî¿ âåðõî
âî¿ ïîðîäè.
ñë³ä çàуâàæèòè, ùî ðåçуëьòàòè âèçíà
÷åííÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ 13 ãîë³â
³ç â³äîìèì ðîäîâîäîì áуëî ïîâí³ñòþ ï³ä
òâåðäæåíî ³ç âèêîðèñòàííÿì ïàíåë³ ç 14
òàáëèöÿ 1. Іíäåêñè ãåòåðîçèãîòíîñò³, ïîë³ìîðô³çìу òà â³ðîã³äí³ñòь âèêëþ÷åííÿ âèïàäêîâîãî çá³ãу àëå
ëåé äëÿ ì³êðîñàòåë³òíèõ ìàðêåð³â êîíåé óâП
Íàçâà ëî
êуñу
ëîêàë³çàö³ÿ â
õðîìîñîì³
âèÿâëåíà ê³ëь
ê³ñòь àëåëåé
Hobs Hexp PIC PE
HTG04 9 5 0,64 0,585 0,482 0,342
HMS06 4 6 0,76 0,752 0,692 0,527
HMS02 10 6 0,68 0,695 0,636 0,398
AHT04 24 8 0,84 0,689 0,625 0,675
ASB23 3 8 0,80 0,808 0,763 0,599
HTG07 4 5 0,76 0,667 0,601 0,527
HTG06 15 8 0,84 0,810 0,766 0,675
CA425 28 9 0,60 0,807 0,762 0,291
HTG10 21 12 0,92 0,908 0,879 0,836
VHL20 30 10 0,96 0,841 0,805 0,919
AHT05 8 8 0,72 0,781 0,738 0,460
HMS03 9 7 0,60 0,723 0,662 0,291
HMS07 1 9 0,80 0,831 0,792 0,599
ASB17 2 10 0,92 0,856 0,819 0,836
CPE 0,9999998
ISSN 18107834. ³ñí. Óêð. тоââà ãåíåтèê³â ³ ñåëåêö³оíåð³â. 2009, том 7, № 2260
А.В. Шеëüов, В.Г. Спèðèдоíов, М.Ф.Пàð³й, С.Д. Меëüíèчук
9. Marshall T.C., Slate J., Kruuk L., Pember
ton J.M. Statistical confidence for likeli
hoodbased paternity inference in natural
populations // Mol. Ecol. – 1998. – Vol. 7,
№ 5. – P. 639–655.
10. Tozaki T., Kakoi H., Mashima S., Hirota K.I.,
Hasegawa T., Ishida N., Miura N., Choi
Miura N.H., Tomita M. Population study
and validation of paternity testing for Thor
oughbred horses by 15 microsatellite loci //
J. Vet. Med. Sci. – 2001. – Vol. 63, № 11. –
P. 1191–1197.
Ïðåäñтàâëåíо ².Î. Àíäðººâèм
Íàä³éøëà 8.10.2009
ãåÍîòèПèðîâàÍèå ëîØàäåЙ
óêðàèÍñêîЙ âåðõîâîЙ ПîðîäЫ
ñ èñПîëüЗîâàÍèåì ПàÍåëè
SSRìàðêåðîâ
À.Â. Øåëёâ, Â.Ã. Ñïèðèäоíоâ, M.Ô. Ïàðèé,
Ñ.Ä. Ìåëüíè÷óê
óêðàèíñêàÿ ëàáîðàòîðèÿ êà÷åñòâà è áåçîïàñíî
ñòè ïðîäуêöèè àПê
óêðàèíà, 08162, êèåâîCâÿòîøèíñêèé ðí, ïãò
×àáàíû, уë. ìàøèíîñòðîèòåëåé, 7
email: receptions@quality.ua
â ðàáîòå íà îñíîâå àíàëèçà 40 ãîëîâ ëîøàäåé
óêðàèíñêîé âåðõîâîé ïîðîäû, ñ èñïîëьçîâàíè
åì ïàíåëè èç 14 SSRìàðêåðîâ, ïîêàçàíî âîç
ìîæíîñòь ãåíîòèïèðîâàíèÿ æèâîòíûõ ñ âûñîêîé
ñòåïåíьþ äîñòîâåðíîñòè. âñå èçу÷åííûå
ëîêуñû ïîêàçàëè âûñîêèé уðîâåíь ïîëèìîð
ôèçìà, êîëè÷åñòâî èäåíòèôèöèðîâàííûõ àë
ëåëåé âàðьèðîâàëî îò 5 äî 12 ñ èíäåêñîì ïîëè
ìîðôèçìà (PIC) îò 0,482 – äî 0,879. Íà îñíî
âå àíàëèçà ïîëу÷åííûõ äàííûõ îïðåäåëåíà
âåðîÿòíîñòь ñëу÷àéíîãî ñîâïàäåíèÿ àëëåëåé
(ñðå), êîòîðîå ñîñòàâëÿåò 99,999%. Эòî ñâè
äåòåëьñòâуåò î òîì, ÷òî äëÿ ãåíåòè÷åñêîãî àíà
ëèçà ëîøàäåé óâП íàèáîëåå èíôîðìàòèâíûìè
ÿâëÿþòñÿ 6 ìàðêåðîâ: ASB23, HTG06, HTG10,
VHL20, HMS07 è ASB17. Пàíåëь èç 6 уêàçàííûõ
ìàðêåðîâ ÿâëÿåòñÿ äîñòàòî÷íîé äëÿ èäåíòè
ôèêàöèè æèâîòíûõ èññëåäуåìîé ïîðîäû, â ñî
îòâåòñòâèè ñ òðåáîâàíèÿìè ISBC.
Êëþ÷оâ³ ñëоâà: уêðàèíñêàÿ âåðõîâàÿ ïîðî
äà ëîøàäåé, SSRìàðêåðû, ãåíîòèïèðîâàíèå,
îïðåäåëåíèå äîñòîâåðíîñòè ïðîèñõîæäåíèÿ.
0,739. âèêîðèñòàííÿ ëèøå öèõ 6òè ìàð
êåð³â äëÿ ãåíåòè÷íîãî àíàë³çу êîíåé óâП
äîçâîëÿº ïðîâîäèòè ¿õíþ ³äåíòèô³êàö³þ
³ç â³ðîã³äí³ñòþ 99,98%, ùî ïåðåâèùуº â³
ðîã³äí³ñòь 99,95%, ðåêîìåíäîâàíу ì³æíà
ðîäíèì êîì³òåòîì ðîäîâ³äíèõ êíèã (ISBC)
äëÿ âèçíà÷åííÿ äîñòîâ³ðíîñò³ ïîõîäæåííÿ
ïëåì³ííèõ òâàðèí.
пåðåë³ê ë³òåðàòуðè
1. Litt M., Luty J.A. A hypervariable microsatel
lite revealed by in vitro amplification of a di
nucleotide repeat within the cardiac muscle
actin gene // Am. J. Hum. Genet. – 1989. –
Vol. 44, № 3. – P. 397–401.
2. Weber J.L., May P.E. Abundant class of hu
man DNA polymorphisms which can be
typed using the polymerase chain reaction //
Am. J. Hum. Genet. – 1989. – Vol. 44, № 3. –
P. 388–396.
3. Ellegren H., Johansson M., Sandberg K.,
Andersson L. Cloning of highly polymorphic
microsatellites in the horse // Anim. Genet. –
1992. – Vol. 23, № 2 – P. 133–142.
4. Guerin G., Bertaud M., Amigues Y. Charac
terization of seven new horse microsatel
lites: HMS1, HMS2, HMS3, HMS5, HMS6,
HMS7 and HMS8 // Anim. Genet. – 1994. –
Vol. 25, № 1. – P. 62.
5. Marklund S., Ellegren H., Eriksson S., Sand
berg K., Andersson L. Parentage testing and
linkage analysis in the horse using a set of
highly polymorphic microsatellites // Anim.
Genet. – 1994. – Vol. 25, № 1 – P. 19–23.
6. Van Haeringen H., Bowling A.T., Stott M.L.,
Lenstra J.A., Zwaagstra K.A. A highly poly
morphic horse microsatellite locus: VHL20 //
Anim. Genet. – 1994. – Vol. 25, № 3 – P. 207.
7. Binns M.M., uolmes N.G., Holliman A.M.
The identification of polymorphic microsat
ellite loci in the horse and their use in thor
oughbred parentage testing // Brit. Vet. J. –
1995. – Vol. 151, № 1. – P. 9–15.
8. Siegal M. UC Davis Book of Horses: A Com
plete Medical Reference Guide for Hors
es and Foals. – Haper Collins, New York,
1996. – P. 126–134.
ISSN 18107834. ³ñí. Óêð. тоââà ãåíåтèê³â ³ ñåëåêö³оíåð³â. 2009, том 7, № 2 261
Геíоòèпувàííя коíей укðàїíñüкої веðхової поðодè з вèкоðèñòàííям пàíеë³ ssr-мàðкеð³в
for parentage verification were genotyped.
The microsatellite loci showed extensive
polymorphism with allele numbers ranging from
5 to 12 and polymorphism information content
(PIC) values in the range 0.482 – 0.879. The
analysis of these loci also revealed that they had
a 99,999 % combined probability of exclusion
(CPE) of false parentage. This study suggests
that the DNA typing method has high potential for
parentage testing and individual identification of
Ukrainian Rider horse breed.
Key words: Ukrainian Rider horse breed, SSR
markers, genotyping, parentage verification.
GENOTYPING OF UKRAINIAN RIDER HORSE
BREED USING PANEL OF SSRMARKERS
A.V. Shelyov, V.G. Spyrydonov, M.F. Parii,
S.D. Melnychuk
Ukrainian Laboratory of Quality and Safety of AIC
products,
Ukraine, 08162, KievoSvyatoshinskiy district,
Chabany village, Mashinobudivnykiv str., 7,
email: receptions@quality.ua
The present study was to evaluate a parentage
verification system for Ukrainian Rider horse
breed using 14 SSR markers. A total number
of 40 Ukrainian Rider horse including 13 foals
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-18918 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1810-7834 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T18:07:40Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова |
| record_format | dspace |
| spelling | Шельов, А.В. Спиридонов, В.Г. Парій, М.Ф. Мельничук, С.Д. 2011-04-11T21:27:56Z 2011-04-11T21:27:56Z 2009 Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів / А.В. Шельов, В.Г. Спиридонов, М.Ф. Парій, С.Д. Мельничук // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. — 2009. — Т. 7, № 2. — С. 257-261. — Бібліогр.: 10 назв. — укр. 1810-7834 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/18918 575.082.13:636.1.001.32 В роботі на основі аналізу 40 голів Української верхової породи коней з використанням панелі 14 SSR-маркерів показано можливість генотипування тварин з високим ступенем достовірності. Всі використані локуси показали високий рівень поліморфізму, кількість ідентифікованих алелей коливалась від 5 до 12 з індексом поліморфізму (PIC) від 0,482 – до 0,879. На основі проведеного дослідження визначено випадковий збіг алелей (СРЕ), який становить 99,999 %. Отримані дані свідчать про те, що для генетичного аналізу коней УВП найінформативнішими є 6 маркерів: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 та ASB17. Панель із 6 наведених маркерів достатня для ідентифікації тварин досліджуваної породи, у відповідності із вимогами ISBC. В работе на основе анализа 40 голов лошадей Украинской верховой породы, с использованием панели из 14 SSR-маркеров, показано возможность генотипирования животных с высокой степенью достоверности. Все изученные локусы показали высокий уровень полиморфизма, количество идентифицированных аллелей варьировало от 5 до 12 с индексом полиморфизма (PIC) от 0,482 – до 0,879. На основе анализа полученных данных определена вероятность случайного совпадения аллелей (СРЕ), которое составляет 99,999%. Это свидетельствует о том, что для генетического анализа лошадей УВП наиболее информативными являются 6 маркеров: ASB23, HTG06, HTG10, VHL20, HMS07 и ASB17. Панель из 6 указанных маркеров является достаточной для идентификации животных исследуемой породы, в соответствии с требованиями ISBC. The present study was to evaluate a parentage verification system for Ukrainian Rider horse breed using 14 SSR- markers. A total number of 40 Ukrainian Rider horse including 13 foals for parentage verification were genotyped. The microsatellite loci showed extensive polymorphism with allele numbers ranging from 5 to 12 and polymorphism information content (PIC) values in the range 0.482 – 0.879. The analysis of these loci also revealed that they had a 99,999 % combined probability of exclusion (CPE) of false parentage. This study suggests that the DNA typing method has high potential for parentage testing and individual identification of Ukrainian Rider horse breed. uk Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів Оригінальні статті Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів Генотипирование лошадей Украинской верховой породы с использованием панели SSR-маркеров Genotyping of Ukrainian rider horse breed using panel of SSR-markers Article published earlier |
| spellingShingle | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів Шельов, А.В. Спиридонов, В.Г. Парій, М.Ф. Мельничук, С.Д. Оригінальні статті |
| title | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів |
| title_alt | Генотипирование лошадей Украинской верховой породы с использованием панели SSR-маркеров Genotyping of Ukrainian rider horse breed using panel of SSR-markers |
| title_full | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів |
| title_fullStr | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів |
| title_full_unstemmed | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів |
| title_short | Генотипування коней Української верхової породи з використанням панелі SSR-маркерів |
| title_sort | генотипування коней української верхової породи з використанням панелі ssr-маркерів |
| topic | Оригінальні статті |
| topic_facet | Оригінальні статті |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/18918 |
| work_keys_str_mv | AT šelʹovav genotipuvannâkoneiukraínsʹkoíverhovoíporodizvikoristannâmpanelíssrmarkerív AT spiridonovvg genotipuvannâkoneiukraínsʹkoíverhovoíporodizvikoristannâmpanelíssrmarkerív AT paríimf genotipuvannâkoneiukraínsʹkoíverhovoíporodizvikoristannâmpanelíssrmarkerív AT melʹničuksd genotipuvannâkoneiukraínsʹkoíverhovoíporodizvikoristannâmpanelíssrmarkerív AT šelʹovav genotipirovanielošadeiukrainskoiverhovoiporodysispolʹzovaniempanelissrmarkerov AT spiridonovvg genotipirovanielošadeiukrainskoiverhovoiporodysispolʹzovaniempanelissrmarkerov AT paríimf genotipirovanielošadeiukrainskoiverhovoiporodysispolʹzovaniempanelissrmarkerov AT melʹničuksd genotipirovanielošadeiukrainskoiverhovoiporodysispolʹzovaniempanelissrmarkerov AT šelʹovav genotypingofukrainianriderhorsebreedusingpanelofssrmarkers AT spiridonovvg genotypingofukrainianriderhorsebreedusingpanelofssrmarkers AT paríimf genotypingofukrainianriderhorsebreedusingpanelofssrmarkers AT melʹničuksd genotypingofukrainianriderhorsebreedusingpanelofssrmarkers |