Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.)
Доповідь присвячено демонстрації можливостей застосування методів in silico для розроблення нових терапевтичних сполук. Наведено приклад створення прототипу антитромботичного препарату на основі пептидів-міметиків суперспіральної ділянки молекули фібрин(оген)у. Функціонально активні сайти молекули і...
Saved in:
| Published in: | Вісник НАН України |
|---|---|
| Date: | 2024 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2024
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202136 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) / О.О. Грабовський // Вісник Національної академії наук України. - 2024. - № 12. - С. 88-93. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862650501428936704 |
|---|---|
| author | Грабовський, О.О. |
| author_facet | Грабовський, О.О. |
| citation_txt | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) / О.О. Грабовський // Вісник Національної академії наук України. - 2024. - № 12. - С. 88-93. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вісник НАН України |
| description | Доповідь присвячено демонстрації можливостей застосування методів in silico для розроблення нових терапевтичних сполук. Наведено приклад створення прототипу антитромботичного препарату на основі пептидів-міметиків суперспіральної ділянки молекули фібрин(оген)у. Функціонально активні сайти молекули і відповідну послідовність пептидів було передбачено in silico, а дослідження синтезованих пептидів in vitro повністю підтвердили їхню ефективну інгібіторну дію на полімеризацію фібрину. Методи докінгу та молекулярної динаміки було також використано для передбачення структури пептидів — похідних N-кінцевого фрагменту стафілокоагулази, який має здатність неензиматично активувати протромбін.
This study explores the use of in silico methods for developing novel therapeutic compounds, showcasing the design of a prototype antithrombotic drug based on peptide mimetics from the superspiral region of the fibrin(ogen) molecule. Functional sites on the molecule were identified in silico, leading to the selection of peptide sequences that were subsequently synthesized and tested. In vitro studies confirmed the peptides’ potent inhibitory effects on fibrin polymerization. Additionally, docking and molecular dynamics simulations were employed to model derivatives of the N-terminal fragment of staphylocoagulase, known for its capacity to non-enzymatically activate prothrombin. The continuation of these approaches holds significant potential for the development of both novel antithrombotic agents and unique blood coagulation activators for rapid hemorrhage control.
|
| first_indexed | 2025-12-01T17:18:37Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-202136 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1027-3239 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-01T17:18:37Z |
| publishDate | 2024 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Грабовський, О.О. 2025-03-01T18:10:11Z 2024 Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) / О.О. Грабовський // Вісник Національної академії наук України. - 2024. - № 12. - С. 88-93. — Бібліогр.: 7 назв. — укр. 1027-3239 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202136 DOI: doi.org/10.15407/visn2024.12.088 Доповідь присвячено демонстрації можливостей застосування методів in silico для розроблення нових терапевтичних сполук. Наведено приклад створення прототипу антитромботичного препарату на основі пептидів-міметиків суперспіральної ділянки молекули фібрин(оген)у. Функціонально активні сайти молекули і відповідну послідовність пептидів було передбачено in silico, а дослідження синтезованих пептидів in vitro повністю підтвердили їхню ефективну інгібіторну дію на полімеризацію фібрину. Методи докінгу та молекулярної динаміки було також використано для передбачення структури пептидів — похідних N-кінцевого фрагменту стафілокоагулази, який має здатність неензиматично активувати протромбін. This study explores the use of in silico methods for developing novel therapeutic compounds, showcasing the design of a prototype antithrombotic drug based on peptide mimetics from the superspiral region of the fibrin(ogen) molecule. Functional sites on the molecule were identified in silico, leading to the selection of peptide sequences that were subsequently synthesized and tested. In vitro studies confirmed the peptides’ potent inhibitory effects on fibrin polymerization. Additionally, docking and molecular dynamics simulations were employed to model derivatives of the N-terminal fragment of staphylocoagulase, known for its capacity to non-enzymatically activate prothrombin. The continuation of these approaches holds significant potential for the development of both novel antithrombotic agents and unique blood coagulation activators for rapid hemorrhage control. Автор висловлює щиру подяку академіку НАН України С.В. Комісаренку. Планування досліджень здійснювалося разом із науковим керівником доктором біологічних наук В.О. Чернишенком, ідею неензиматичної активації протромбіну пептидами сформульовано та апробовано спільно з О.Ю. Цуварєвим (Інститут високих технологій Київського національного університету імені Тараса Шевченка). uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Вісник НАН України Молоді вчені Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) How to explore and exploit blood coagulation mechanisms using an in silico approach (According to the materials of report at the meeting of the Presidium of the NAS of Ukraine, October 30, 2024) Article published earlier |
| spellingShingle | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) Грабовський, О.О. Молоді вчені |
| title | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) |
| title_alt | How to explore and exploit blood coagulation mechanisms using an in silico approach (According to the materials of report at the meeting of the Presidium of the NAS of Ukraine, October 30, 2024) |
| title_full | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) |
| title_fullStr | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) |
| title_full_unstemmed | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) |
| title_short | Як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 30 жовтня 2024 р.) |
| title_sort | як розкрити та підкорити механізми коагуляції за допомогою методів in silico (за матеріалами наукового повідомлення на засіданні президії нан україни 30 жовтня 2024 р.) |
| topic | Молоді вчені |
| topic_facet | Молоді вчені |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202136 |
| work_keys_str_mv | AT grabovsʹkiioo âkrozkrititapídkoritimehanízmikoagulâcíízadopomogoûmetodívinsilicozamateríalaminaukovogopovídomlennânazasídanníprezidíínanukraíni30žovtnâ2024r AT grabovsʹkiioo howtoexploreandexploitbloodcoagulationmechanismsusinganinsilicoapproachaccordingtothematerialsofreportatthemeetingofthepresidiumofthenasofukraineoctober302024 |