Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів

Досліджено молекулярно-генетичне різноманіття рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) українського походження за допомогою методів оцінювання поліморфізму довжини першого інтрону генів β-тубуліну (tubulin-based polymorphism (TBP)) та аналізу мікросателітних послідовностей (simple se...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Доповіді НАН України
Date:2023
Main Authors: Сахарова, В.Г., Блюм, Р.Я., Рабоконь, А.М., Пірко, Я.В., Блюм, Я.Б.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2023
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202222
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів / В.Г. Сахарова, Р.Я. Блюм, А.М. Рабоконь, Я.В. Пірко, Я.Б. Блюм // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 4. — С. 85-94. — Бібліогр.: 17 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862638792813314048
author Сахарова, В.Г.
Блюм, Р.Я.
Рабоконь, А.М.
Пірко, Я.В.
Блюм, Я.Б.
author_facet Сахарова, В.Г.
Блюм, Р.Я.
Рабоконь, А.М.
Пірко, Я.В.
Блюм, Я.Б.
citation_txt Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів / В.Г. Сахарова, Р.Я. Блюм, А.М. Рабоконь, Я.В. Пірко, Я.Б. Блюм // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 4. — С. 85-94. — Бібліогр.: 17 назв. — укр.
collection DSpace DC
container_title Доповіді НАН України
description Досліджено молекулярно-генетичне різноманіття рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) українського походження за допомогою методів оцінювання поліморфізму довжини першого інтрону генів β-тубуліну (tubulin-based polymorphism (TBP)) та аналізу мікросателітних послідовностей (simple sequence repeats (SSR)). На основі отриманих ДНК-профілів досліджених зразків встановлено міжгенотипові генетичні відмінності рижію дрібноплідного і порівняно ефективність застосованих методів. Зроблено висновок про вищу ефективність TBP-методу для аналізу гербарних зразків у разі лімітованості рослинного матеріалу та високого ступеня пошкодженості ДНК через тривале зберігання. The molecular genetic diversity of Ukrainian little-pod false flax (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) was assessed using two methods: tubulin-based polymorphism (TBP), which is based on length polymorphism of the first intron of β-tubulin genes, and microsatellite sequences (SSR — simple sequence repeats). The study was aimed to investigate the genetic diversity among the analyzed little-pod false flax accessions and determine the comparative effectiveness of the employed molecular methods. Furthermore, the suitability of prioritizing the TBP method for the analysis of herbarium specimens, considering the limited plant material and potential DNA damage caused by long-term storage, was demonstrated.
first_indexed 2025-12-01T00:42:12Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-202222
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 1025-6415
language Ukrainian
last_indexed 2025-12-01T00:42:12Z
publishDate 2023
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
record_format dspace
spelling Сахарова, В.Г.
Блюм, Р.Я.
Рабоконь, А.М.
Пірко, Я.В.
Блюм, Я.Б.
2025-03-06T16:55:03Z
2023
Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів / В.Г. Сахарова, Р.Я. Блюм, А.М. Рабоконь, Я.В. Пірко, Я.Б. Блюм // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 4. — С. 85-94. — Бібліогр.: 17 назв. — укр.
1025-6415
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202222
575.2 :577.29:633.85
DOI: doi.org/10.15407/dopovidi2023.04.085
Досліджено молекулярно-генетичне різноманіття рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) українського походження за допомогою методів оцінювання поліморфізму довжини першого інтрону генів β-тубуліну (tubulin-based polymorphism (TBP)) та аналізу мікросателітних послідовностей (simple sequence repeats (SSR)). На основі отриманих ДНК-профілів досліджених зразків встановлено міжгенотипові генетичні відмінності рижію дрібноплідного і порівняно ефективність застосованих методів. Зроблено висновок про вищу ефективність TBP-методу для аналізу гербарних зразків у разі лімітованості рослинного матеріалу та високого ступеня пошкодженості ДНК через тривале зберігання.
The molecular genetic diversity of Ukrainian little-pod false flax (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) was assessed using two methods: tubulin-based polymorphism (TBP), which is based on length polymorphism of the first intron of β-tubulin genes, and microsatellite sequences (SSR — simple sequence repeats). The study was aimed to investigate the genetic diversity among the analyzed little-pod false flax accessions and determine the comparative effectiveness of the employed molecular methods. Furthermore, the suitability of prioritizing the TBP method for the analysis of herbarium specimens, considering the limited plant material and potential DNA damage caused by long-term storage, was demonstrated.
Дослідження проведені в рамках проєкту для дослідницьких груп молодих вчених НАН України «Генетичне різноманіття та популяційно генетична структура рижію дрібноплідного в українській частині його центру походження» (2022—2023 рр.) (державний реєстраційний № 0122U002196). Автори роботи висловлюють вдячність співробітникам Інституту ботаніки імені М.Г. Холодного НАН України чл.-кор. НАН України С.Л. Мосякіну (директор Інституту) та канд. біол. наук Н.М. Шиян (куратор гербарію Інституту, KW) за практичні консультації та допомогу під час виконання досліджень.
uk
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Доповіді НАН України
Біологія
Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
Efficiency of genetic diversity assessment of little-pod false flax (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) in Ukraine using SSR and TBP marker systems
Article
published earlier
spellingShingle Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
Сахарова, В.Г.
Блюм, Р.Я.
Рабоконь, А.М.
Пірко, Я.В.
Блюм, Я.Б.
Біологія
title Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
title_alt Efficiency of genetic diversity assessment of little-pod false flax (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) in Ukraine using SSR and TBP marker systems
title_full Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
title_fullStr Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
title_full_unstemmed Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
title_short Ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (Camelina microcarpa Andrz. ex DC.) в Україні за допомогою SSR- та TBP-маркерів
title_sort ефективність оцінювання генетичної різноманітності рижію дрібноплідного (camelina microcarpa andrz. ex dc.) в україні за допомогою ssr- та tbp-маркерів
topic Біологія
topic_facet Біологія
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/202222
work_keys_str_mv AT saharovavg efektivnístʹocínûvannâgenetičnoíríznomanítnostírižíûdríbnoplídnogocamelinamicrocarpaandrzexdcvukraínízadopomogoûssrtatbpmarkerív
AT blûmrâ efektivnístʹocínûvannâgenetičnoíríznomanítnostírižíûdríbnoplídnogocamelinamicrocarpaandrzexdcvukraínízadopomogoûssrtatbpmarkerív
AT rabokonʹam efektivnístʹocínûvannâgenetičnoíríznomanítnostírižíûdríbnoplídnogocamelinamicrocarpaandrzexdcvukraínízadopomogoûssrtatbpmarkerív
AT pírkoâv efektivnístʹocínûvannâgenetičnoíríznomanítnostírižíûdríbnoplídnogocamelinamicrocarpaandrzexdcvukraínízadopomogoûssrtatbpmarkerív
AT blûmâb efektivnístʹocínûvannâgenetičnoíríznomanítnostírižíûdríbnoplídnogocamelinamicrocarpaandrzexdcvukraínízadopomogoûssrtatbpmarkerív
AT saharovavg efficiencyofgeneticdiversityassessmentoflittlepodfalseflaxcamelinamicrocarpaandrzexdcinukraineusingssrandtbpmarkersystems
AT blûmrâ efficiencyofgeneticdiversityassessmentoflittlepodfalseflaxcamelinamicrocarpaandrzexdcinukraineusingssrandtbpmarkersystems
AT rabokonʹam efficiencyofgeneticdiversityassessmentoflittlepodfalseflaxcamelinamicrocarpaandrzexdcinukraineusingssrandtbpmarkersystems
AT pírkoâv efficiencyofgeneticdiversityassessmentoflittlepodfalseflaxcamelinamicrocarpaandrzexdcinukraineusingssrandtbpmarkersystems
AT blûmâb efficiencyofgeneticdiversityassessmentoflittlepodfalseflaxcamelinamicrocarpaandrzexdcinukraineusingssrandtbpmarkersystems