Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК
На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдооберта...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2010 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2010
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862720166977077248 |
|---|---|
| author | Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. |
| author_facet | Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. |
| citation_txt | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдообертання фуранозного кільця і syn-орієнтацією нуклеотидної основи. Охарактеризовано ''тонкі'' конформаційні параметри, що описують непланарність кільця нуклеотидної основи і деяких його бічних груп.
The full set of 2'-deoxycytidilic acid molecule conformers has been obtained by ab initio quantum mechanical calculations at the MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) theory level. The distributions of torsion angles are analyzed and compared with those of a 2'-deoxycytidine molecule. The strong correlation between the sugar puckering amplitude and the syn-orientation of the nucleotide base unit is revealed. 'Fine' conformational parameters defining a nonplanarity of the base ring and its side groups are characterized.
|
| first_indexed | 2025-12-07T18:23:32Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-30409 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T18:23:32Z |
| publishDate | 2010 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. 2012-02-02T19:45:26Z 2012-02-02T19:45:26Z 2010 Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 539.194 На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдообертання фуранозного кільця і syn-орієнтацією нуклеотидної основи. Охарактеризовано ''тонкі'' конформаційні параметри, що описують непланарність кільця нуклеотидної основи і деяких його бічних груп. The full set of 2'-deoxycytidilic acid molecule conformers has been obtained by ab initio quantum mechanical calculations at the MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) theory level. The distributions of torsion angles are analyzed and compared with those of a 2'-deoxycytidine molecule. The strong correlation between the sugar puckering amplitude and the syn-orientation of the nucleotide base unit is revealed. 'Fine' conformational parameters defining a nonplanarity of the base ring and its side groups are characterized. Автори висловлюють щиру вдячнiсть Р.О. Журакiвському (Iнститут молекулярної бiологiї i генетики НАН України) за наданi поради щодо пошуку повного сiмейства конформерiв; а також корпорацiї “Gaussian Inc.” (США) за люб’язно наданий Д.М. Говоруну грант — пакет “GAUSSIAN03” для платформи win32. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК Quantum-mechanical conformational analysis of 2'-deoxycytidilic acid molecule — the DNA structural unit Article published earlier |
| spellingShingle | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_alt | Quantum-mechanical conformational analysis of 2'-deoxycytidilic acid molecule — the DNA structural unit |
| title_full | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_fullStr | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_full_unstemmed | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_short | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_sort | квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки днк |
| topic | Біофізика |
| topic_facet | Біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 |
| work_keys_str_mv | AT níkolaênkotû kvantovomehaníčniikonformacíiniianalízmolekuli2dezoksicitidilovoíkislotistrukturnoílankidnk AT govorundm kvantovomehaníčniikonformacíiniianalízmolekuli2dezoksicitidilovoíkislotistrukturnoílankidnk AT níkolaênkotû quantummechanicalconformationalanalysisof2deoxycytidilicacidmoleculethednastructuralunit AT govorundm quantummechanicalconformationalanalysisof2deoxycytidilicacidmoleculethednastructuralunit |