Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК
На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдооберта...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Datum: | 2010 |
| Hauptverfasser: | , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Ukrainian |
| Veröffentlicht: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2010
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-30409 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. 2012-02-02T19:45:26Z 2012-02-02T19:45:26Z 2010 Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 539.194 На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдообертання фуранозного кільця і syn-орієнтацією нуклеотидної основи. Охарактеризовано ''тонкі'' конформаційні параметри, що описують непланарність кільця нуклеотидної основи і деяких його бічних груп. The full set of 2'-deoxycytidilic acid molecule conformers has been obtained by ab initio quantum mechanical calculations at the MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) theory level. The distributions of torsion angles are analyzed and compared with those of a 2'-deoxycytidine molecule. The strong correlation between the sugar puckering amplitude and the syn-orientation of the nucleotide base unit is revealed. 'Fine' conformational parameters defining a nonplanarity of the base ring and its side groups are characterized. Автори висловлюють щиру вдячнiсть Р.О. Журакiвському (Iнститут молекулярної бiологiї i генетики НАН України) за наданi поради щодо пошуку повного сiмейства конформерiв; а також корпорацiї “Gaussian Inc.” (США) за люб’язно наданий Д.М. Говоруну грант — пакет “GAUSSIAN03” для платформи win32. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК Quantum-mechanical conformational analysis of 2'-deoxycytidilic acid molecule — the DNA structural unit Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| spellingShingle |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title_short |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_full |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_fullStr |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_full_unstemmed |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК |
| title_sort |
квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки днк |
| author |
Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. |
| author_facet |
Ніколаєнко, Т.Ю. Говорун, Д.М. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2010 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Quantum-mechanical conformational analysis of 2'-deoxycytidilic acid molecule — the DNA structural unit |
| description |
На рівні теорії MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) вперше отримано повне сімейство конформерів молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти. Проаналізовано розподіли значень її торсійних кутів і порівняно з такими в молекулі 2'-дезоксицитидину. Виявлено кореляцію між амплітудою псевдообертання фуранозного кільця і syn-орієнтацією нуклеотидної основи. Охарактеризовано ''тонкі'' конформаційні параметри, що описують непланарність кільця нуклеотидної основи і деяких його бічних груп.
The full set of 2'-deoxycytidilic acid molecule conformers has been obtained by ab initio quantum mechanical calculations at the MP2/6-311G++(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) theory level. The distributions of torsion angles are analyzed and compared with those of a 2'-deoxycytidine molecule. The strong correlation between the sugar puckering amplitude and the syn-orientation of the nucleotide base unit is revealed. 'Fine' conformational parameters defining a nonplanarity of the base ring and its side groups are characterized.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/30409 |
| citation_txt |
Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 2'-дезоксицитидилової кислоти — структурної ланки ДНК / Т.Ю. Ніколаєнко, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2010. — № 9. — С. 173-184. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT níkolaênkotû kvantovomehaníčniikonformacíiniianalízmolekuli2dezoksicitidilovoíkislotistrukturnoílankidnk AT govorundm kvantovomehaníčniikonformacíiniianalízmolekuli2dezoksicitidilovoíkislotistrukturnoílankidnk AT níkolaênkotû quantummechanicalconformationalanalysisof2deoxycytidilicacidmoleculethednastructuralunit AT govorundm quantummechanicalconformationalanalysisof2deoxycytidilicacidmoleculethednastructuralunit |
| first_indexed |
2025-12-07T18:23:32Z |
| last_indexed |
2025-12-07T18:23:32Z |
| _version_ |
1850874855595966464 |