Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT

Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в пе...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Доповіді НАН України
Date:2011
Main Authors: Жураківський, Р.О., Говорун, М.Д.
Format: Article
Language:Ukrainian
Published: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2011
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-37251
record_format dspace
spelling Жураківський, Р.О.
Говорун, М.Д.
2012-09-30T19:25:06Z
2012-09-30T19:25:06Z
2011
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр.
1025-6415
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251
577.3
Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в перiодичну структуру дволанцюгової ДНК i є твiрними її B- i A-форм вiдповiдно. Наведено основнi геометричнi, енергетичнi та полярнi характеристики всiх стiйких конформерiв, а також конформацiйнi рiвноваги за нормальних умов. Методом аналiзу топологiї електронної густини отримано данi щодо внутрiшньомолекулярних Н-зв’язкiв.
The full conformational analysis of a 1′,2′-dideoxyribose molecule is performed at the MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) theory level. It is established that among 55 possible conformers only two of them — one of the N-type and one of the S-type — might be incorporated into the double-stranded periodic DNA structure and from its B- and A-forms, respectively. Main geometric, energetic, and polar characteristics of all stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal contidions. By the quantum mechanical electron density topology analysis, the data on intramolecular hydrogen bonds are obtained.
Автори висловлюють вдячнiсть корпорацiї “GAUSSIAN” (США) за наданий Д.М. Говоруну грант — програмний пакет “GAUSSIAN03” для платформи Win32.
uk
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Доповіді НАН України
Біофізика
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
Conformational properties of 1′,2′-dideoxyribose — the model sugar residue of deoxynucleosides: comparison of MP2 and DFT results
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
spellingShingle Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
Жураківський, Р.О.
Говорун, М.Д.
Біофізика
title_short Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
title_full Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
title_fullStr Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
title_full_unstemmed Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
title_sort конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами mp2 та dft
author Жураківський, Р.О.
Говорун, М.Д.
author_facet Жураківський, Р.О.
Говорун, М.Д.
topic Біофізика
topic_facet Біофізика
publishDate 2011
language Ukrainian
container_title Доповіді НАН України
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
format Article
title_alt Conformational properties of 1′,2′-dideoxyribose — the model sugar residue of deoxynucleosides: comparison of MP2 and DFT results
description Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в перiодичну структуру дволанцюгової ДНК i є твiрними її B- i A-форм вiдповiдно. Наведено основнi геометричнi, енергетичнi та полярнi характеристики всiх стiйких конформерiв, а також конформацiйнi рiвноваги за нормальних умов. Методом аналiзу топологiї електронної густини отримано данi щодо внутрiшньомолекулярних Н-зв’язкiв. The full conformational analysis of a 1′,2′-dideoxyribose molecule is performed at the MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) theory level. It is established that among 55 possible conformers only two of them — one of the N-type and one of the S-type — might be incorporated into the double-stranded periodic DNA structure and from its B- and A-forms, respectively. Main geometric, energetic, and polar characteristics of all stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal contidions. By the quantum mechanical electron density topology analysis, the data on intramolecular hydrogen bonds are obtained.
issn 1025-6415
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251
citation_txt Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр.
work_keys_str_mv AT žurakívsʹkiiro konformacíinívlastivostí12didezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkudezoksiribonukleozidívporívnânnârezulʹtatívotrimanihmetodamimp2tadft
AT govorunmd konformacíinívlastivostí12didezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkudezoksiribonukleozidívporívnânnârezulʹtatívotrimanihmetodamimp2tadft
AT žurakívsʹkiiro conformationalpropertiesof12dideoxyribosethemodelsugarresidueofdeoxynucleosidescomparisonofmp2anddftresults
AT govorunmd conformationalpropertiesof12dideoxyribosethemodelsugarresidueofdeoxynucleosidescomparisonofmp2anddftresults
first_indexed 2025-12-07T18:06:21Z
last_indexed 2025-12-07T18:06:21Z
_version_ 1850873774854897664