Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT
Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в пе...
Saved in:
| Published in: | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Date: | 2011 |
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2011
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-37251 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Жураківський, Р.О. Говорун, М.Д. 2012-09-30T19:25:06Z 2012-09-30T19:25:06Z 2011 Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251 577.3 Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в перiодичну структуру дволанцюгової ДНК i є твiрними її B- i A-форм вiдповiдно. Наведено основнi геометричнi, енергетичнi та полярнi характеристики всiх стiйких конформерiв, а також конформацiйнi рiвноваги за нормальних умов. Методом аналiзу топологiї електронної густини отримано данi щодо внутрiшньомолекулярних Н-зв’язкiв. The full conformational analysis of a 1′,2′-dideoxyribose molecule is performed at the MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) theory level. It is established that among 55 possible conformers only two of them — one of the N-type and one of the S-type — might be incorporated into the double-stranded periodic DNA structure and from its B- and A-forms, respectively. Main geometric, energetic, and polar characteristics of all stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal contidions. By the quantum mechanical electron density topology analysis, the data on intramolecular hydrogen bonds are obtained. Автори висловлюють вдячнiсть корпорацiї “GAUSSIAN” (США) за наданий Д.М. Говоруну грант — програмний пакет “GAUSSIAN03” для платформи Win32. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT Conformational properties of 1′,2′-dideoxyribose — the model sugar residue of deoxynucleosides: comparison of MP2 and DFT results Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT |
| spellingShingle |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT Жураківський, Р.О. Говорун, М.Д. Біофізика |
| title_short |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT |
| title_full |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT |
| title_fullStr |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT |
| title_full_unstemmed |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT |
| title_sort |
конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами mp2 та dft |
| author |
Жураківський, Р.О. Говорун, М.Д. |
| author_facet |
Жураківський, Р.О. Говорун, М.Д. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2011 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Доповіді НАН України |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Conformational properties of 1′,2′-dideoxyribose — the model sugar residue of deoxynucleosides: comparison of MP2 and DFT results |
| description |
Квантово-механiчним методом ab initio на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) проведено повний конформацiйний аналiз молекули 1′,2′-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку рибонуклеозидiв. Встановлено, що з 55 можливих її конформерiв лише два — S i N типу — можуть бути залученi в перiодичну структуру дволанцюгової ДНК i є твiрними її B- i A-форм вiдповiдно. Наведено основнi геометричнi, енергетичнi та полярнi характеристики всiх стiйких конформерiв, а також конформацiйнi рiвноваги за нормальних умов. Методом аналiзу топологiї електронної густини отримано данi щодо внутрiшньомолекулярних Н-зв’язкiв.
The full conformational analysis of a 1′,2′-dideoxyribose molecule is performed at the MP2/6-311++G(d,p)//MP2/6-31G(d,p) theory level. It is established that among 55 possible conformers only two of them — one of the N-type and one of the S-type — might be incorporated into the double-stranded periodic DNA structure and from its B- and A-forms, respectively. Main geometric, energetic, and polar characteristics of all stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal contidions. By the quantum mechanical electron density topology analysis, the data on intramolecular hydrogen bonds are obtained.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37251 |
| citation_txt |
Конформаційні властивості 1',2'-дидезоксирибози — модельного цукрового залишку дезоксирибонуклеозидів: порівняння результатів, отриманих методами MP2 та DFT / Р.О. Журакiвський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 3. — С. 172-179. — Бібліогр.: 13 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT žurakívsʹkiiro konformacíinívlastivostí12didezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkudezoksiribonukleozidívporívnânnârezulʹtatívotrimanihmetodamimp2tadft AT govorunmd konformacíinívlastivostí12didezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkudezoksiribonukleozidívporívnânnârezulʹtatívotrimanihmetodamimp2tadft AT žurakívsʹkiiro conformationalpropertiesof12dideoxyribosethemodelsugarresidueofdeoxynucleosidescomparisonofmp2anddftresults AT govorunmd conformationalpropertiesof12dideoxyribosethemodelsugarresidueofdeoxynucleosidescomparisonofmp2anddftresults |
| first_indexed |
2025-12-07T18:06:21Z |
| last_indexed |
2025-12-07T18:06:21Z |
| _version_ |
1850873774854897664 |