Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека

Вперше описано модель основного сигналу поліаденілування про-мРНК ВІЛ-1. Показано, що ''нижній'' елемент (DSE) полі(А)-сигналу розташований у апікальній петлі шпильки завдовжки 26 нт, яку названо шпилькою DSE. Адекватність моделі підтверджено передбаченням вторинної структури обл...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :	Доповіді НАН України
Дата:	2011
Автори:	Зарудная, М.И., Потягайло, А.Л., Отенко, В.В., Коломиец, И.Н., Говорун, Д.Н.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2011
Теми:	Біофізика
Онлайн доступ:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37392
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека / М.И. Зарудная, А.Л. Потягайло, В.В. Отенко, И.Н. Коломиец, Д.Н. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 4. — С. 170-176. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-37392
record_format	dspace
spelling	Зарудная, М.И. Потягайло, А.Л. Отенко, В.В. Коломиец, И.Н. Говорун, Д.Н. 2012-10-09T18:10:55Z 2012-10-09T18:10:55Z 2011 Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека / М.И. Зарудная, А.Л. Потягайло, В.В. Отенко, И.Н. Коломиец, Д.Н. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 4. — С. 170-176. — Бібліогр.: 10 назв. — рос. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37392 577.21.5 Вперше описано модель основного сигналу поліаденілування про-мРНК ВІЛ-1. Показано, що ''нижній'' елемент (DSE) полі(А)-сигналу розташований у апікальній петлі шпильки завдовжки 26 нт, яку названо шпилькою DSE. Адекватність моделі підтверджено передбаченням вторинної структури області, яка включає шпильки TAR, polyA та DSE, для 414 ізолятів ВІЛ-1 різних субтипів та рекомбінантних форм. Вперше наведено також моделі вторинної структури 3'-кінця 3'-нетрансльованої ділянки про-мРНК ВІЛ-1 для ізолятів різних субтипів. Висловлено припущення, що U5(U)-шпилька домену PBS поряд з участю у зворотній транскрипції геномної РНК ВІЛ-1 може також брати участь у процесі поліаденілування про-мРНК, забезпечуючи доступність DSE для білкового апарату поліаденілування під час транскрипції провірусної ДНК. A model of core polyadenylation signal of HIV-1 pre-mRNA has been first presented. Downstream sequence element (DSE) of poly(A) signal has been shown to be located in the apical loop of 26 nt hairpin which we named DSE hairpin. The proposed model is supported by the secondary structure prediction of a genomic RNA region encompassing TAR, polyA and DSE hairpins for 414 HIV-1 isolates of different subtypes and recombinant forms. Models of the secondary structure of 3' end of HIV-1 pre-mRNA 3' untranslated region for isolates of different subtypes have been also first presented. U5(U) hairpin of PBS domain has been supposed to take part in the polyadenylation process alongside with participation in reverse transcription. This hairpin provides the DSE exposure to the protein polyadenylation machinery during the proviral DNA transcription. Исследование выполнено при частичной поддержке гранта Украинского научно-технологического центра (проект 4302). ru Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека The secondary structure of сore poly(A) signal of human immunodeficiency virus pre-mRNA Article published earlier
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
title	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека
spellingShingle	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека Зарудная, М.И. Потягайло, А.Л. Отенко, В.В. Коломиец, И.Н. Говорун, Д.Н. Біофізика
title_short	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека
title_full	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека
title_fullStr	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека
title_full_unstemmed	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека
title_sort	вторичная структура основного поли(а)-сигнала про-мрнк вируса иммунодефицита человека
author	Зарудная, М.И. Потягайло, А.Л. Отенко, В.В. Коломиец, И.Н. Говорун, Д.Н.
author_facet	Зарудная, М.И. Потягайло, А.Л. Отенко, В.В. Коломиец, И.Н. Говорун, Д.Н.
topic	Біофізика
topic_facet	Біофізика
publishDate	2011
language	Russian
container_title	Доповіді НАН України
publisher	Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
format	Article
title_alt	The secondary structure of сore poly(A) signal of human immunodeficiency virus pre-mRNA
description	Вперше описано модель основного сигналу поліаденілування про-мРНК ВІЛ-1. Показано, що ''нижній'' елемент (DSE) полі(А)-сигналу розташований у апікальній петлі шпильки завдовжки 26 нт, яку названо шпилькою DSE. Адекватність моделі підтверджено передбаченням вторинної структури області, яка включає шпильки TAR, polyA та DSE, для 414 ізолятів ВІЛ-1 різних субтипів та рекомбінантних форм. Вперше наведено також моделі вторинної структури 3'-кінця 3'-нетрансльованої ділянки про-мРНК ВІЛ-1 для ізолятів різних субтипів. Висловлено припущення, що U5(U)-шпилька домену PBS поряд з участю у зворотній транскрипції геномної РНК ВІЛ-1 може також брати участь у процесі поліаденілування про-мРНК, забезпечуючи доступність DSE для білкового апарату поліаденілування під час транскрипції провірусної ДНК. A model of core polyadenylation signal of HIV-1 pre-mRNA has been first presented. Downstream sequence element (DSE) of poly(A) signal has been shown to be located in the apical loop of 26 nt hairpin which we named DSE hairpin. The proposed model is supported by the secondary structure prediction of a genomic RNA region encompassing TAR, polyA and DSE hairpins for 414 HIV-1 isolates of different subtypes and recombinant forms. Models of the secondary structure of 3' end of HIV-1 pre-mRNA 3' untranslated region for isolates of different subtypes have been also first presented. U5(U) hairpin of PBS domain has been supposed to take part in the polyadenylation process alongside with participation in reverse transcription. This hairpin provides the DSE exposure to the protein polyadenylation machinery during the proviral DNA transcription.
issn	1025-6415
url	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37392
citation_txt	Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека / М.И. Зарудная, А.Л. Потягайло, В.В. Отенко, И.Н. Коломиец, Д.Н. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 4. — С. 170-176. — Бібліогр.: 10 назв. — рос.
work_keys_str_mv	AT zarudnaâmi vtoričnaâstrukturaosnovnogopoliasignalapromrnkvirusaimmunodeficitačeloveka AT potâgailoal vtoričnaâstrukturaosnovnogopoliasignalapromrnkvirusaimmunodeficitačeloveka AT otenkovv vtoričnaâstrukturaosnovnogopoliasignalapromrnkvirusaimmunodeficitačeloveka AT kolomiecin vtoričnaâstrukturaosnovnogopoliasignalapromrnkvirusaimmunodeficitačeloveka AT govorundn vtoričnaâstrukturaosnovnogopoliasignalapromrnkvirusaimmunodeficitačeloveka AT zarudnaâmi thesecondarystructureofsorepolyasignalofhumanimmunodeficiencyviruspremrna AT potâgailoal thesecondarystructureofsorepolyasignalofhumanimmunodeficiencyviruspremrna AT otenkovv thesecondarystructureofsorepolyasignalofhumanimmunodeficiencyviruspremrna AT kolomiecin thesecondarystructureofsorepolyasignalofhumanimmunodeficiencyviruspremrna AT govorundn thesecondarystructureofsorepolyasignalofhumanimmunodeficiencyviruspremrna
first_indexed	2025-12-07T15:48:03Z
last_indexed	2025-12-07T15:48:03Z
_version_	1850865073413685248

Вторичная структура основного поли(А)-сигнала про-мРНК вируса иммунодефицита человека

Репозитарії

Схожі ресурси