Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК
Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукро...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Доповіді НАН України |
|---|---|
| Дата: | 2011 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2011
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37807 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862559649450950656 |
|---|---|
| author | Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. |
| author_facet | Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. |
| citation_txt | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Доповіді НАН України |
| description | Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукрово-фосфатного кістяка A-подібних форм ДНК. Не виявлено модельних A-подібних форм ДНК з нативними значеннями торсійних кутів. Зафіксовано 62 твірних конформера цукрово-фосфатного кістяка B-подібних форм ДНК, 11 з яких мають ідентичний до природного набір номенклатурних торсійних кутів α, β, γ, δ, ε та ζ. Виявлено 803 твірні конформери цукрово-фосфатного кістяка P-подібних форм ДНК з цукрами C2'-endo та C3'-endo. Решта 1160 структур мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C2'-exo.
The complete conformation analysis of a low-molecular compound which simulates the electroneutral sugar-phosphate frame of DNA is performed by a quantum-mechanical method at the MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) level of the theory. It is shown that only 107 from all 14495 possible conformers can be formative for the sugar-phosphate frame of A-like DNA forms. No modeled DNA A-forms with native values of torsion angles were registered. 62 formative conformers of sugar-phosphate frame of B- like DNA forms are found, and 11 of them have a set of nomenclatural torsion angles α, β, γ, δ, ε, and ζ, which are identical to natural ones. The 803 formative conformers of sugar-phosphate frame of P-like DNA forms with sugars C2'-endo and C3'-endo were determined. Other 1160 remaining compounds have a wide spectrum of sugar's conformations among which the most numerous are C1'-exo and C2'-exo.
|
| first_indexed | 2025-11-25T22:50:03Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-37807 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1025-6415 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-25T22:50:03Z |
| publishDate | 2011 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. 2012-10-22T17:03:55Z 2012-10-22T17:03:55Z 2011 Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37807 577.32 Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукрово-фосфатного кістяка A-подібних форм ДНК. Не виявлено модельних A-подібних форм ДНК з нативними значеннями торсійних кутів. Зафіксовано 62 твірних конформера цукрово-фосфатного кістяка B-подібних форм ДНК, 11 з яких мають ідентичний до природного набір номенклатурних торсійних кутів α, β, γ, δ, ε та ζ. Виявлено 803 твірні конформери цукрово-фосфатного кістяка P-подібних форм ДНК з цукрами C2'-endo та C3'-endo. Решта 1160 структур мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C2'-exo. The complete conformation analysis of a low-molecular compound which simulates the electroneutral sugar-phosphate frame of DNA is performed by a quantum-mechanical method at the MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) level of the theory. It is shown that only 107 from all 14495 possible conformers can be formative for the sugar-phosphate frame of A-like DNA forms. No modeled DNA A-forms with native values of torsion angles were registered. 62 formative conformers of sugar-phosphate frame of B- like DNA forms are found, and 11 of them have a set of nomenclatural torsion angles α, β, γ, δ, ε, and ζ, which are identical to natural ones. The 803 formative conformers of sugar-phosphate frame of P-like DNA forms with sugars C2'-endo and C3'-endo were determined. Other 1160 remaining compounds have a wide spectrum of sugar's conformations among which the most numerous are C1'-exo and C2'-exo. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Доповіді НАН України Біофізика Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК Complete conformation analysis of a low-molecular electroneutral model of sugar-phosphate DNA chain Article published earlier |
| spellingShingle | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_alt | Complete conformation analysis of a low-molecular electroneutral model of sugar-phosphate DNA chain |
| title_full | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_fullStr | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_full_unstemmed | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_short | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_sort | повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга днк |
| topic | Біофізика |
| topic_facet | Біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/37807 |
| work_keys_str_mv | AT voitešenkoís povniikonformacíiniianalíznizʹkomolekulârnoíelektroneitralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT žurakívsʹkiiro povniikonformacíiniianalíznizʹkomolekulârnoíelektroneitralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT bulavínla povniikonformacíiniianalíznizʹkomolekulârnoíelektroneitralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT govorundm povniikonformacíiniianalíznizʹkomolekulârnoíelektroneitralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT voitešenkoís completeconformationanalysisofalowmolecularelectroneutralmodelofsugarphosphatednachain AT žurakívsʹkiiro completeconformationanalysisofalowmolecularelectroneutralmodelofsugarphosphatednachain AT bulavínla completeconformationanalysisofalowmolecularelectroneutralmodelofsugarphosphatednachain AT govorundm completeconformationanalysisofalowmolecularelectroneutralmodelofsugarphosphatednachain |