Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини

Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6– 31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over the full number of...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Datum:2008
Hauptverfasser: Жураківський, Р.О., Говорун, Д.М.
Format: Artikel
Sprache:Ukrainian
Veröffentlicht: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2008
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-4078
record_format dspace
spelling Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
2009-07-15T11:28:31Z
2009-07-15T11:28:31Z
2008
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp.
1025-6415
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078
577.3
Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6– 31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over the full number of 112 may be incorporated into the periodic structure of a two-strand RNA molecule. The main geometric, energetic, and polar characteristics of all 112 stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal conditions. By the quantum mechanical electron density topology analysis method (Bader’s Atoms-in-Molecules theory), as many as six types of intramolecular hydrogen bonds are established in all possible conformers of the isolated 1′-deoxyribose molecule. Namely, these are C1′H2 . . . O5′, C2′H . . . O5′, O2′H . . . O3′, O3′H . . . O2′, O3′H . . . O5′, and O5′H . . . O3′.
uk
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
Біофізика
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
spellingShingle Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
Біофізика
title_short Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
title_full Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
title_fullStr Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
title_full_unstemmed Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
title_sort конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
author Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
author_facet Жураківський, Р.О.
Говорун, Д.М.
topic Біофізика
topic_facet Біофізика
publishDate 2008
language Ukrainian
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
format Article
description Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6– 31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over the full number of 112 may be incorporated into the periodic structure of a two-strand RNA molecule. The main geometric, energetic, and polar characteristics of all 112 stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal conditions. By the quantum mechanical electron density topology analysis method (Bader’s Atoms-in-Molecules theory), as many as six types of intramolecular hydrogen bonds are established in all possible conformers of the isolated 1′-deoxyribose molecule. Namely, these are C1′H2 . . . O5′, C2′H . . . O5′, O2′H . . . O3′, O3′H . . . O2′, O3′H . . . O5′, and O5′H . . . O3′.
issn 1025-6415
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078
citation_txt Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp.
work_keys_str_mv AT žurakívsʹkiiro konformacíinívlastivostí1dezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkuribonukleozidívkvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalagustini
AT govorundm konformacíinívlastivostí1dezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkuribonukleozidívkvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalagustini
first_indexed 2025-11-28T18:09:31Z
last_indexed 2025-11-28T18:09:31Z
_version_ 1850854053160943616