Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини
Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6– 31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over the full number of...
Saved in:
| Date: | 2008 |
|---|---|
| Main Authors: | , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2008
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-4078 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. 2009-07-15T11:28:31Z 2009-07-15T11:28:31Z 2008 Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp. 1025-6415 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078 577.3 Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6– 31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over the full number of 112 may be incorporated into the periodic structure of a two-strand RNA molecule. The main geometric, energetic, and polar characteristics of all 112 stable conformers are presented, as well as conformational equilibria under normal conditions. By the quantum mechanical electron density topology analysis method (Bader’s Atoms-in-Molecules theory), as many as six types of intramolecular hydrogen bonds are established in all possible conformers of the isolated 1′-deoxyribose molecule. Namely, these are C1′H2 . . . O5′, C2′H . . . O5′, O2′H . . . O3′, O3′H . . . O2′, O3′H . . . O5′, and O5′H . . . O3′. uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Біофізика Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| spellingShingle |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. Біофізика |
| title_short |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| title_full |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| title_fullStr |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| title_full_unstemmed |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| title_sort |
конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : квантово-механічне дослідження методом функціонала густини |
| author |
Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. |
| author_facet |
Жураківський, Р.О. Говорун, Д.М. |
| topic |
Біофізика |
| topic_facet |
Біофізика |
| publishDate |
2008 |
| language |
Ukrainian |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| description |
Full conformational analysis of 1′-deoxyribose the model sugar residue of ribonucleosides is
performed by means of density functional theory at MP2/6–311++G (d, p) // DFT B3LYP/6–
31G (d, p) level. It is established that only four conformers (three of S- and one of N-type) over
the full number of 112 may be incorporated into the periodic structure of a two-strand RNA
molecule. The main geometric, energetic, and polar characteristics of all 112 stable conformers
are presented, as well as conformational equilibria under normal conditions. By the quantum
mechanical electron density topology analysis method (Bader’s Atoms-in-Molecules theory), as
many as six types of intramolecular hydrogen bonds are established in all possible conformers
of the isolated 1′-deoxyribose molecule. Namely, these are C1′H2 . . . O5′, C2′H . . . O5′, O2′H
. . . O3′, O3′H . . . O2′, O3′H . . . O5′, and O5′H . . . O3′.
|
| issn |
1025-6415 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/4078 |
| citation_txt |
Конформаційні властивості 1′-дезоксирибози, модельного цукрового залишку рибонуклеозидів : Квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Р.О. Жураківський, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2008. — № 3. — С. 167-176. — Бібліогр.: 12 назв. — укp. |
| work_keys_str_mv |
AT žurakívsʹkiiro konformacíinívlastivostí1dezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkuribonukleozidívkvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalagustini AT govorundm konformacíinívlastivostí1dezoksiribozimodelʹnogocukrovogozališkuribonukleozidívkvantovomehaníčnedoslídžennâmetodomfunkcíonalagustini |
| first_indexed |
2025-11-28T18:09:31Z |
| last_indexed |
2025-11-28T18:09:31Z |
| _version_ |
1850854053160943616 |