Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients
The article presents a case study of Maldi-Tof (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight) data analysis and classification. Row mass spectrometry data are preprocessed and decomposed with Gaussian Mixture Model. Gaussian mask is calculated and put at all spectra separately. In fu...
Saved in:
| Published in: | Штучний інтелект |
|---|---|
| Date: | 2010 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут проблем штучного інтелекту МОН України та НАН України
2010
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/56172 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients / Małgorzata Plechawska // Штучний інтелект. — 2010. — № 3. — С. 45-52. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-56172 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Małgorzata Plechawska 2014-02-13T00:20:30Z 2014-02-13T00:20:30Z 2010 Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients / Małgorzata Plechawska // Штучний інтелект. — 2010. — № 3. — С. 45-52. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. 1561-5359 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/56172 65.011 The article presents a case study of Maldi-Tof (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight) data analysis and classification. Row mass spectrometry data are preprocessed and decomposed with Gaussian Mixture Model. Gaussian mask is calculated and put at all spectra separately. In further dimension reduction RFE, PLS and T test are used. The classification is done with Support Vector Machine (SVM) method with Gaussian Radial Basis Function kernel. Запропонована класифікація мас-спектрометричних даних медичних досліджень Maldi-Tof, алгоритми та програми комп’ютерного моделювання, які використовуються в проблематиці діагностики і лікування ракових захворювань. Предложена классификация масс-спектрометрических данных медицинских исследований Maldi-Tof, алгоритмы и программы компьютерного моделирования, которые используются в проблемах диагностики и лечения раковых заболеваний. en Інститут проблем штучного інтелекту МОН України та НАН України Штучний інтелект Алгоритмическое и программное обеспечение параллельных вычислительных интеллектуальных систем Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients Класифікація Maldi-Tof мас-спектрометричних даних у дослідженнях онкологічних хворих Классификация Maldi-Tof масс-спектрометрических данных в исследованиях онкологических больных Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients |
| spellingShingle |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients Małgorzata Plechawska Алгоритмическое и программное обеспечение параллельных вычислительных интеллектуальных систем |
| title_short |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients |
| title_full |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients |
| title_fullStr |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients |
| title_full_unstemmed |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients |
| title_sort |
classification of maldi-tof mass spectrometry data in the analysis of cancer patients |
| author |
Małgorzata Plechawska |
| author_facet |
Małgorzata Plechawska |
| topic |
Алгоритмическое и программное обеспечение параллельных вычислительных интеллектуальных систем |
| topic_facet |
Алгоритмическое и программное обеспечение параллельных вычислительных интеллектуальных систем |
| publishDate |
2010 |
| language |
English |
| container_title |
Штучний інтелект |
| publisher |
Інститут проблем штучного інтелекту МОН України та НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Класифікація Maldi-Tof мас-спектрометричних даних у дослідженнях онкологічних хворих Классификация Maldi-Tof масс-спектрометрических данных в исследованиях онкологических больных |
| description |
The article presents a case study of Maldi-Tof (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization – Time Of Flight) data analysis and classification. Row mass spectrometry data are preprocessed and decomposed with Gaussian Mixture Model. Gaussian mask is calculated and put at all spectra separately. In further dimension reduction RFE, PLS and T test are used. The classification is done with Support Vector Machine (SVM) method with Gaussian Radial Basis Function kernel.
Запропонована класифікація мас-спектрометричних даних медичних досліджень Maldi-Tof, алгоритми та програми комп’ютерного моделювання, які використовуються в проблематиці діагностики і лікування ракових захворювань.
Предложена классификация масс-спектрометрических данных медицинских исследований Maldi-Tof, алгоритмы и программы компьютерного моделирования, которые используются в проблемах диагностики и лечения раковых заболеваний.
|
| issn |
1561-5359 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/56172 |
| citation_txt |
Classification of Maldi-tof Mass Spectrometry Data in the Analysis of Cancer Patients / Małgorzata Plechawska // Штучний інтелект. — 2010. — № 3. — С. 45-52. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
| work_keys_str_mv |
AT małgorzataplechawska classificationofmalditofmassspectrometrydataintheanalysisofcancerpatients AT małgorzataplechawska klasifíkacíâmalditofmasspektrometričnihdanihudoslídžennâhonkologíčnihhvorih AT małgorzataplechawska klassifikaciâmalditofmassspektrometričeskihdannyhvissledovaniâhonkologičeskihbolʹnyh |
| first_indexed |
2025-12-07T18:23:34Z |
| last_indexed |
2025-12-07T18:23:34Z |
| _version_ |
1850874857788538880 |