Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1
Проаналізовано геном ВІЛ-1 у ділянці гена pol 64 зразків крові ВІЛ-інфікованих осіб із використанням методу визначення нуклеотидної послідовності нуклеїнової кислоти. Встановлено, що домінуючим серед досліджених зразків ВІЛ-1 виявився субтип А, а значна кількість зразків належить до циркулюючих реко...
Saved in:
| Date: | 2009 |
|---|---|
| Main Authors: | , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2009
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5636 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 / Н.С. Пукіш, А.М. Щербінська, Н.О. Бабій, В.П. Поліщук // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 50-55. — Бібліогр.: 18 назв. — укp. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859734411402018816 |
|---|---|
| author | Пукіш, Н.С. Щербінська, А.М. Бабій, Н.О. Поліщук, В.П. |
| author_facet | Пукіш, Н.С. Щербінська, А.М. Бабій, Н.О. Поліщук, В.П. |
| citation_txt | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 / Н.С. Пукіш, А.М. Щербінська, Н.О. Бабій, В.П. Поліщук // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 50-55. — Бібліогр.: 18 назв. — укp. |
| collection | DSpace DC |
| description | Проаналізовано геном ВІЛ-1 у ділянці гена pol 64 зразків крові ВІЛ-інфікованих осіб із використанням методу визначення нуклеотидної послідовності нуклеїнової кислоти. Встановлено, що домінуючим серед досліджених зразків ВІЛ-1 виявився субтип А, а значна кількість зразків належить до циркулюючих рекомбінантних форм ВІЛ-1. За результатами аналізу наявних мутацій знайдено лише одну, пов'язану з розвитком резистентності ВІЛ-1 до антиретровірусних препаратів. У більшості зразків визначено поліморфічні заміни нуклеотидів у досліджуваній ділянці геному ВІЛ-1.
Analysis of HIV-1 genome in the region of pol gene was performed by sequencing virus genome using 64 samples of blood from HIV-infected persons. Subtype a HIV-1 revealed to be dominating among investigated samples and a great number of samples belonged to a circulating recombinant forms of HIV-1. Analysis of mutations showed only one mutation connected with development of HIV-1 resistance to antiretroviral treatment. Most samples included polymorphic substitutions of nucleotides in the virus genome region studied.
|
| first_indexed | 2025-12-01T14:35:22Z |
| format | Article |
| fulltext |
Àíàë³ç ìî ëå êó ëÿð íèõ îñîá ëè âîñ òåé óêð à¿íñüêèõ
³çî ëÿò³â ²Ë-1
Í. Ñ. Ïóê³ø, À. Ì. Ùåðá³íñüêà1, Í. Î. Áàá³é1, Â. Ï. Ïîë³ùóê
Êè¿âñüêèé íàö³îíàëü íèé óí³âåð ñè òåò ³ìåí³ Òà ðà ñà Øåâ ÷åí êî
Âóë. Âî ëî äè ìè ðñüêà, 64, Êè¿â, Óêðà¿ íà, 01033
1Óêð à¿íñüêèé öåíòð ïðîô³ëàê òè êè òà áî ðîòü áè ç³ ÑͲÄîì ÌÎÇ Óêðà¿ íè
Âóë. Ìè êî ëè Àìîñîâà, 5, Êè¿â, Óêðà¿ íà, 03038
pukishn@ukr.net
Ïðî âå äå íî àíàë³ç ãå íî ìó ²Ë-1 ó ä³ëÿíö³ ãåíà pol 64 çðàçê³â êðîⳠ²Ë-³íô³êî âà íèõ îñ³á ç âè êî ðèñ òàí -
íÿì ìå òî äó âèç íà ÷åí íÿ íóê ëå î òèä íî¿ ïîñë³äîâ íîñò³ íóê ëå¿ íî âî¿ êèñ ëî òè. Âñòà íîâ ëå íî, ùî äîì³íó þ -
÷èì ñå ðåä äîñë³äæå íèõ çðàçê³â ²Ë-1 âè ÿ âèâ ñÿ ñóá òèï À, à çíà÷ íà ê³ëüê³ñòü çðàçê³â íà ëåæèòü äî
öèð êó ëþ þ ÷èõ ðå êîìá³íà íòíèõ ôîðì ²Ë-1. Çà ðå çóëü òà òà ìè àíàë³çó íà ÿâ íèõ ìó òàö³é çíàé äå íî ëèøå
îäíó, ïî â’ÿ çàíó ç ðîç âèò êîì ðå çèñ òåí òíîñò³ ²Ë-1 äî àí òè ðåò ðîâ³ðóñ íèõ ïðå ïà ðàò³â. Ó á³ëüøîñò³
çðàçê³â âèç íà ÷å íî ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè íóê ëå î òèä³â ó äîñë³äæó âàí³é ä³ëÿíö³ ãå íî ìó ²Ë-1.
Êëþ ÷îâ³ ñëî âà: â³ðóñ ³ìó íî äåô³öèòó ëþ äè íè-1, ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè, ìó òàö³¿ ðå çèñ òåí òíîñò³, ðå -
êîìá³íà íòí³ ôîð ìè ²Ë-1, ñóá òèï ²Ë-1.
Âñòóï. dz âñ³õ ³íôåêö³éíèõ õâî ðîá, âè ÿâ ëå íèõ óïåð -
øå â 20-ìó ñòîë³òò³, ñèí äðîì íà áó òî ãî ³ìó íî -
äåô³öèòó ëþ äè íè (ÑͲÄ) íå ëèøå êàð äè íàëü íî
âïëè íóâ íà çäî ðîâ ’ÿ ëþ äñòâà, àëå é ïîâí³ñòþ
çì³íèâ ïî ãëÿ äè òà ñòàâ ëåí íÿ ñâ³òî âî¿ ñï³ëüíî òè äî
³íôåêö³éíèõ õâî ðîá. Õî÷à ÑÍ²Ä íå ðåºñòðó âà ëè ÿê
îêðå ìå çà õâî ðþ âàí íÿ äî 1981 ðîêó, à â³ðóñ ³ìó íî -
äåô³öèòó ëþ äè íè (²Ë) ëèøå â 1983 ðîö³ âèç íà ÷å íî
éîãî åò³îëîã³÷íèì àãåí òîì [1], öÿ õâî ðî áà ñòà ëà
ïðè ÷è íîþ ñìåðò³ á³ëüøå 16 ìëí ëþ äåé â óñüî ìó
ñâ³ò³ ç ïî ÷àò êó åï³äå쳿 òà á³ëüøå í³æ 50 ìëí îñ³á íà
ñüî ãîäí³ º ³íô³êî âà íè ìè Â²Ë [2].
Äî âëàñ òè âîñ òåé ²Ë, ùî äîç âî ëÿ þòü éî ìó
øâèä êî åâî ëþö³îíó âà òè òà çì³íþ âà òè ñâ³é ãå íîì, à
òà êîæ ôîð ìó âà òè âè ñî êî ãå òå ðî ãåí íó ïî ïó ëÿö³þ,
íà ëå æàòü, ñå ðåä ³íøèõ, ñóòòºâèé ð³âåíü ðîç ìíî -
æåí íÿ â³ðó ñó in vivo; âå ëè êà ê³ëüê³ñòü ïî ìè ëîê ó ãå -
íîì³ â³ðó ñó (1/104 íà ñàéò) [3–5]; çíà÷ íà éìîâ³ð-
í³ñòü ôîð ìó âàí íÿ ðå êîìá³íà íòíèõ øòàì³â ²Ë-1
[6]. Öå äîç âî ëÿº ïðè ïóñ òè òè, ùî øâèäê³ñòü åâî -
ëþö³¿ â³ðó ñó ³ìó íî äåô³öè òó ëþ äè íè º îäí³ºþ ç íà é -
âè ùèõ. Ñè òó àö³ÿ óñêëàä íþºòüñÿ òèì, ùî ó
â³äïîâ³äü íà çà ñòî ñó âàí íÿ àí òè ðåò ðîâ³ðóñ íèõ ïðå -
ïà ðàò³â (ÀÐÂÏ) Â²Ë ìî æå ñå ëåêö³îíó âà òè ïåâí³ ìó -
òàö³¿, ÿê³ ÷àñòî ïðèçâîäÿòü äî ôîðìóâàííÿ øòàì³â
²Ë, ñò³éêèõ äî îêðåìîãî êëàñó ÀÐÂÏ [7].
Ìó òàö³¿, ùî âè íè êà þòü àáî ñå ëåê òó þòü ñÿ ï³ä
âïëè âîì ÀРòå ðàﳿ, äîç âî ëÿ þòü â³ðó ñó óíè êà òè
ïðè ãí³÷ó þ ÷î ãî âïëè âó ïðå ïà ðà òó íà ðåïë³êàö³þ
â³ðó ñó. Êë³í³÷íà çíà ÷óù³ñòü ìó òàö³é, ÿê³ ç’ÿâ ëÿ þòü -
ñÿ ïåð øè ìè (ïåð âèíí³), òà òèõ, ùî âè íè êà þòü
ï³çí³øå (âòî ðèíí³, äî ïîì³æí³), äî ñüî ãîäí³ äèñ êó -
òóºòüñÿ.  ö³ëî ìó ä³ÿ áà ãàòü îõ ³ç çãà äà íèõ ìó òàö³é
ìî æå ïå ðå êðè âà òè ñÿ ÷è äîïîâíþâàòè îäíà îäíó
(òàáë. 1) [8].
Ìè ïî ñòà âè ëè çà äà ÷ó ïðî äîâ æè òè âèâ ÷åí íÿ ìî -
ëå êó ëÿð íèõ îñîá ëè âîñ òåé ²Ë, ðîç ïî ÷à òå ðàí³øå:
ïðî à íàë³çó âà òè îñîá ëè âîñò³ ñóá òè ïî âî¿ ñòðóê òó ðè
50
ISSN 0233-7657. Á³îïîë³ìåðè ³ êë³òèíà. 2009. Ò. 25. ¹ 1
Ó ²íñòè òóò ìî ëå êó ëÿð íî¿ á³îëî㳿 ³ ãå íå òè êè ÍÀÍ Óêðà¿ íè, 2009
²Ë-1 ó ïåâ íèõ ðåã³îíàõ Óêðà¿ íè, äîñë³äè òè îñîá -
ëè âîñò³ íà êî ïè ÷åí íÿ ìó òàö³é ðå çèñ òåí òíîñò³ òà ïî-
ë³ìîðô³÷íèõ çàì³í ó ãå íîì³ Â²Ë; îö³íè òè ð³âåíü
ïåð âèí íî¿ ðå çèñ òåí òíîñò³ Â²Ë â Îäåñüê³é òà Êè¿â-
ñüê³é îá ëàñ òÿõ, äå äîñâ³ä çà ñòî ñó âàí íÿ ÀÐÂ-òå ðàﳿ
íà é äîâ øèé (ç ñå ðå äè íè 90-õ ðîê³â ìè íó ëî ãî ñòî-
ë³òòÿ) òà íà é ìà ñîâ³øèé ïîð³âíÿ íî ç ³íøè ìè ðåã³î-
íà ìè êðà¿ íè. Âèâ ÷åí íÿ çàçíà÷åíèõ ïè òàíü äàñòü
çìîãó âèç íà ÷è òè ìî ëå êó ëÿðí³ õà ðàê òå ðèñ òè êè ²Ë-
1, ùî öèðêóëþº â äàíèé ÷àñ íà òåðèòî𳿠Óêðà¿íè.
Ìà òåð³àëè ³ ìå òî äè. Ìà òåð³àëîì äëÿ äà íî ãî
äîñë³äæåí íÿ ñòà ëè 32 çðàç êè êðîⳠ²Ë-³íô³êî âà -
íèõ ïàö³ºíò³â Îäåñü êî¿ îá ëàñò³ òà 32 çðàç êè êðîâ³
²Ë-³íô³êî âà íèõ ïàö³ºíò³â ì. Êèºâà. Âñ³ ïàö³ºíòè,
âêëþ ÷åí³ â äîñë³äæåí íÿ, í³êî ëè ïî ïå ðåä íüî íå îò -
ðè ìó âà ëè ÀÐÂ-ïðå ïà ðàò³â òà áó ëè ³íô³êîâàí³ íå
á³ëüøå 1 ðîêó.
Äëÿ àíàë³çó ãå íî ìó ²Ë-1 ó äîñë³äæó âà íèõ
çðàç êàõ âè êî ðèñ òà íî ãå íî òè ïî âèé ï³äõ³ä – àíàë³ç
íóê ëå î òèä íî¿ ïî ñë³äîâ íîñò³ ãå íà pol ²Ë-1 ó ä³ëÿí -
êàõ, ÿê³ êî äó þòü á³ëêè ïðî òå à çè ²Ë-1 (àíàë³ç âñüî -
ãî ãå íà ïðî òå à çè â êî äî íàõ 1–99), òà çâî ðîò íî¿
òðàíñ êðèï òà çè (àíàë³ç äâîõ òðåò³õ ÷àñ òèí ãå íà â êî -
äî íàõ 1–335). Äîñë³äæåí íÿ ïðî âî äè ëè ç âè êî ðèñ -
òàí íÿì òåñò-ñèñ òå ìè ViroSeqTM HIV-1 Genotyping
System v.2.0 ô³ðìè «Abbott» (ÑØÀ). Àíàë³òè÷ íà
÷óò ëèâ³ñòü òåñò-ñèñ òå ìè ñòà íî âèòü 2 × 103 êîï³é ÐÍÊ
Â²Ë â 1 ìë.
Àíàë³ç íóê ëå î òèä íî¿ ïî ñë³äîâ íîñò³ ²Ë-1
âêëþ ÷ຠê³ëüêà îñíîâ íèõ åòàï³â:
– âèä³ëåí íÿ òî òàëü íî¿ ÐÍÊ ìå òî äîì îñàä æåí íÿ
¿¿ ³çîï ðî ïà íî ëîì: öåí òðè ôó ãó âàí íÿ ïëàç ìè/ñè ðî -
âàò êè êðîâ³ ïðè 25000 g ïðî òÿ ãîì 1 ãîä çà òåì ïå ðà -
òó ðè 2–8 îÑ; äî äà âàí íÿ ë³çó þ ÷î ãî áó ôå ðó ç ãó -
àí³äèíò³îö³àíà òîì; äî äà âàí íÿ 100 %-ãî ðîç÷èíó
³çîï ðî ïà íî ëó, öåí òðè ôó ãó âàí íÿ ïðè 15 000 g óïðî -
äîâæ 15 õâ çà ê³ìíàò íî¿ òåì ïå ðà òó ðè; äî äà âàí íÿ
70 %-ãî åòà íî ëó, öåí òðè ôó ãó âàí íÿ, àñï³ðàö³ÿ ÐÍÊ
òà ðîç âå äåí íÿ ¿¿ ó ä³ëþ åíò³;
– åòàï çâî ðîò íî¿ òðàíñ êðèïö³¿ îò ðè ìà íî¿ ÐÍÊ
íà êÄÍÊ çà äî ïî ìî ãîþ çâî ðîò íî¿ òðàíñ êðèï òà çè
Recombinant Murine Leukemia Virus Reverse
Transcriptase (MuLV Reverse Transcriptase);
– àìïë³ô³êàö³ÿ ö³ëüî âî ãî ôðàã ìåí òà ²Ë-1 çà
äî ïî ìî ãîþ ôåð ìåí òó ïîë³ìå ðà çè AmpliTaq Gold®
DNA Polymerase òà ñïå öèô³÷íèõ ïðàé ìåð³â íà
àìïë³ô³êà òîð³ 2700 Thermal cycler («Applied Bio-
Systems», ÑØÀ. Íà äà íî ìó åòàï³ ñèí òå çóºòüñÿ
ôðàã ìåíò ÄÍÊ äîâ æè íîþ 1,8 òèñ. ï. í., ùî âêëþ ÷àº
âåñü ãåí ïðî òå à çè òà äâ³ òðåòèíè ãå íà çâî ðîò íî¿
òðàíñ êðèï òà çè ²Ë-1;
– î÷è ùåí íÿ òà âèç íà ÷åí íÿ êîí öåí òðàö³¿ îò ðè -
ìà íî ãî ïðî äóê òó àìïë³ô³êàö³¿ çà äî ïî ìî ãîþ ãî ðè -
çîí òàëü íî ãî åëåê òðî ôî ðå çó ÍÊ â àãà ðîç íî ìó ãåë³ ç
âè êî ðèñ òàí íÿì ìàð êå ðà ìî ëå êó ëÿð íî¿ ìàñè ÄÍÊ
(2; 1,2; 0,8 íã);
– àìïë³ô³êàö³ÿ ñå ìè ö³ëüî âèõ ôðàã ìåíò³â ç
òåðì³íà òî ðà ìè BigDye® Terminators, ÿê³ ïðà öþ þòü
çà ïðè íöè ïîì Çàí ãå ðà, íà àìïë³ô³êà òîð³ 2700
Thermal cycler («Applied BioSystems»);
– î÷è ùåí íÿ îò ðè ìà íî ãî ïðî äóê òó àìïë³ô³êàö³¿
çà äî ïî ìî ãîþ 70 %-ãî ðîç ÷è íó ³çîï ðî ïà íî ëó;
– âèç íà ÷åí íÿ íóê ëå î òèä íî¿ ïî ñë³äîâ íîñò³ îò ðè -
ìàíî ãî ïðî äóê òó ÄÍÊ çà äî ïî ìî ãîþ ãå íå òè÷ íî ãî
àíàë³çà òî ðà 3100 Genetic Analyzer («Applied Bio-
Systems»);
ÀÍÀË²Ç ÌÎ ËÅ ÊÓ ËßÐ ÍÈÕ ÎÑÎÁ ËÈ ÂÎÑ ÒÅÉ ÓÊÐ À¯ÍÑÜÊÈÕ ²ÇÎ ËßҲ ²Ë-1
51
Ìó òàö³¿ ðå çèñ òåí òíîñò³ Ïåð âèíí³ ìó òàö³¿ Âòî ðèíí³ (äî ïîì³æí³) ìó òàö³¿
Äî íóê ëå î çèä íèõ ³íã³á³òîð³â ÇÒ Â²Ë-1
M41L, K65NR, Ins 69, L74VI, V75TM,
Y115F, Q151M, T215FY*
K43EQN, V118I, D67N, K70R,L210W,
K219QE, K70EG, A62V, V75I, F77L,
F116Y*
Äî íå íóê ëå î çèä íèõ ³íã³á³òîð³â ÇÒ Â²Ë-1
L100I, K101EP, K103NS, V106AM,
Y188LHC, G190SE, M230L, K238NT*
K101NH, K103TH,V108I, F227LC,
G190QCTV, K103R, L318F*
Äî ³íã³á³òîð³â ïðî òå à çè ²Ë-1
L90M, N88DS, I84I, V82ATFS, L76V,
G73ST, I54LMVT, G48VM, I47VA,
M46IL*
L24F, L33I, M46V, F53Y, I54S, G73CA,
V82MC, L10IV, I13V, K20RMI, M36I,
D60*
*Äàí³ ïðî âïëèâ ìó òàö³é íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ ïîñò³éíî ïî íîâ ëþ þòü ñÿ.
Òàá ëè öÿ 1
Îñíîâí³ ìó òàö³¿ ó ãå íîì³ Â²Ë-1, ïî â’ÿ çàí³ ç ðîç âèò êîì ðå çèñ òåí òíîñò³ ²Ë-1
– îäåð æàí íÿ êîí ñåí ñóñ íî¿ ïî ñë³äîâ íîñò³ ðîç ì³-
ðîì 1,3 òèñ. ï. í. ç âè êî ðèñ òàí íÿì ïðî ãðà ìè Viro-
Seq Genotyping System Software v.2.6 òà ¿¿ àíàë³ç.
Äëÿ âñòà íîâ ëåí íÿ ñóá òè ïó â³ðó ñó êî ðèñ òó âà ëè -
ñÿ ì³æíà ðîä íîþ áà çîþ äà íèõ Ñòåí ô îðäñüêî ãî
óí³âåð ñè òå òó (http://hivdb6.stanford.edu), à äëÿ ïî -
âíî ãî àíàë³çó ìó òàö³é òà âèç íà ÷åí íÿ ¿õíüî ãî çâ’ÿç -
êó ç ðîç âèò êîì ðå çèñ òåí òíîñò³ êîí ñåí ñóñí³ ïî ñë³-
äîâ íîñò³ àíàë³çó âà ëè, çà äî ïî ìî ãîþ ê³ëüêîõ ð³çíèõ
àë ãî ðèòì³â (GRADE_4/2007, ANRS_07/2006,
HIVDB_4.3.0.2 òà REGA_V7.1.1) (http://www.hiv-
grade.de/grade/deployed/grade.pl?program=hivalg) òà
ïðî ãðàì íî ãî çà áåç ïå ÷åí íÿ ViroSeq Genotyping
System Software v.2.6. Îòðè ìàí³ ïî ñë³äîâ íîñò³ äëÿ
öüîãî ïîð³âíþâàëè ç ðåôåðåíòíèì øòàìîì ²Ë-1
HXB-2.
Ðå çóëü òà òè ³ îá ãî âî ðåí íÿ. Ñóá òè ïî âó ñòðóê -
òó ðó îò ðè ìà íèõ ïî ñë³äîâ íîñ òåé âèâ ÷à ëè, âèç íà ÷à -
þ÷è íóê ëå î òèä íó ïî ñë³äîâí³ñòü óñ³õ äîñë³äæó âà -
íèõ çðàçê³â ó ãåí³ pol ²Ë-1. Ïî êà çà íî, ùî ñóá òèï À
²Ë-1 äîì³íóº ñå ðåä çðàçê³â ³ âè ÿâ ëå íèé ó 53,1 %
âè ïàäê³â, ó òîé ÷àñ ÿê ñóá òèï  – ò³ëüêè â ÷î òèðü îõ
çðàçêàõ, ùî ñòàíîâèòü 6,3 % (ðèñóíîê).
Ö³êà âèì âè ÿ âè ëî ñÿ òå, ùî ïðè áëèç íî 40 % óñ³õ
äîñë³äæå íèõ çðàçê³â áó ëè íå «÷èñ òè ìè» ñóá òè ïà ìè
²Ë-1 (ðè ñó íîê). Òàê, 23, 4 % íà ëå æà ëè äî ñóá òè ïó
À, âèç íà ÷å íî ìó çà ãå íîì ïðî òå à çè, òà äî öèð êó ëþ -
þ ÷î¿ ðå êîìá³íà íòíî¿ ôîð ìè ²Ë-1 (circulating
recombinant form – CRF) ÑRF01_AE, âèç íà ÷å íî¿ çà
ãå íîì ÇÒ. Îñòàí íÿ º íà é ðîç ïîâ ñþä æåí³øîþ ó
ϳâäåí íî-Ñõ³äí³é À糿, çîê ðå ìà â Òà¿ ëàíä³ [10]. Òà -
êîæ âè ÿâ ëå íî ÷î òè ðè çðàç êè (6,3 %), ùî íà ëå æàòü
äî ÑRF01_AE ²Ë-1, òà ï’ÿòü (7,8 %) – äî
ÑRF01_AE ²Ë-1, âèç íà ÷å íî ìó çà ãå íîì ïðî òå à çè,
òà äî ãå íî òè ïó À, âèç íà ÷å íî ìó çà ãå íîì ÇÒ. Äî òî ãî
æ çíàé äå íî ïî îä íî ìó çðàç êó CRF02_AG/H ²Ë-1 ³
CRF02_AG/À ²Ë-1. Ðå êîìá³íà íò CRF02_AG ²Ë-
1 º õà ðàê òåð íèì äëÿ Çàõ³äíî¿ òà Öåí òðàëü íî¿
Àôðèêè. ²ñíó þòü äàí³ ïðî òå, ùî, ì³ãðó âàâ øè äî
ªâðî ïè, CRF02_AG ²Ë-1 íà ñüî ãîäí³ º äî ñèòü ïî -
øè ðå íèì ó Ôðàíö³¿, Áåëü㳿, ²òà볿 òà Âå ëèê³é Áðè -
òàí³¿, òîä³ ÿê ñóá òèï Í õà ðàê òåð íèé äëÿ êðà¿í
Áóðê³íà-Ôà ñî, Ìàë³, ͳãåð³ÿ, Ãà áîí, Êîí ãî, çâ³äêè
äà íèé ðå êîìá³íà íò ²Ë-1 ì³ãðó âàâ äî ϳâäåí íî¿
ªâðî ïè òà À糿 [10].
ßê ³ â ïî ïå ðåäí³õ äîñë³äæåí íÿõ, ïðî âå äå íèõ ó
2000–2002 ðð. â ð³çíèõ ðåã³îíàõ Óêðà¿ íè, äîì³íó þ -
÷èì íà ñüî ãîäí³ â Óêðà¿í³ º ñóá òèï À ²Ë-1 [11, 12].
Äî ñóá òè ïó  íà ëåæèòü ëè øå 6,3 % ç äîñë³äæå íèõ
íà ìè çðàçê³â, ó òîé ÷àñ ÿê ó çðàç êàõ 2000–2002 ðð.
íà ÷àñ òêó ñóá òè ïó  ïðè ïà äà ëî 30 %. Îêð³ì öüî ãî,
ïðè âåð òຠóâà ãó ïî ÿ âà ðå êîìá³íà íòíèõ öèð êó ëþ þ -
÷èõ ôîðì ²Ë-1, à îñîá ëè âî ÑRF01_AE, ÿêèõ íå
ñïî ñòåð³ãàëè ó ïîïåðåäí³õ äîñë³äæåííÿõ.
Òà êèì ÷è íîì, ìîæ íà ïðè ïóñ òè òè, ùî çà ïåð³îä
îñòàíí³õ 4–5 ðîê³â â³äáó ëàñÿ ïåâ íà çì³íà ñóá òè ïî -
âî¿ ñòðóê òó ðè ²Ë-1, ùî öèð êó ëþº â Óêðà¿í³. ×àñ -
òêà ñóá òè ïó  ñóòòºâî çìåí øè ëà ñÿ ïîð³âíÿ íî ç
2000–2002 ðî êà ìè, îäíàê â³äñî òîê ðå êîìá³íà íòíèõ
ôîðì ð³çêî ï³äâèùèâñÿ.
Äîñë³äæåí íÿ íóê ëå î òèä íèõ ïî ñë³äîâ íîñ òåé
²Ë-1 äëÿ âè ÿâ ëåí íÿ ìó òàö³é ðå çèñ òåí òíîñò³ ïî êà -
çà ëî, ùî ëèøå îäèí ç 64 äîñë³äæó âà íèõ çðàçê³â
ì³ñòèòü â³ðóñ ç ìó òàö³ºþ, ïî â’ÿ çà íîþ ç âè ñî êèì
ð³âíåì ðîç âèò êó ñò³éêîñò³ (òàáë. 2).  ãåí³ ÇÒ Â²Ë ó
ïî çèö³¿ 75 âè ÿâ ëå íî çàì³íó àì³íî êèñ ëî òè âàë³íó íà
ìåò³îí³í (V75M), ùî íà ëå æèòü äî ïåð âèí íèõ ìó -
òàö³é [13].
Ïåð âèíí³, òîá òî îñíîâí³ ìó òàö³¿, – öå ìó òàö³¿,
ùî ñïðè ÷è íÿ þòü ³ñòîòíå çíè æåí íÿ ÷óò ëè âîñò³ â³ðó -
ñó äî ïåâ íî ãî àí òè ðåò ðîâ³ðóñ íî ãî ïðåïàðàòó.
Âòî ðèíí³, äî ïîì³æí³, ìó òàö³¿ ìî æóòü äà âà òè
ì³í³ìàëü íèé åôåêò àáî çîâñ³ì íå ÷è íè òè âïëèâó íà
ð³âåíü ðå çèñ òåí òíîñò³, ïðî òå çà íà ÿâ íîñò³ ïåð âèí -
íèõ ìó òàö³é ð³çêî ï³äâè ùó þòü çäàòí³ñòü â³ðó ñó äî
ôîð ìó âàí íÿ ñò³éêîñò³ [8].
Óñ³ ³íø³ ìó òàö³¿, âè ÿâ ëåí³ â ïðî öåñ³ àíàë³çó, íà -
ëå æàòü äî âòî ðèí íèõ ÷è äî ïîì³æíèõ ìó òàö³é àáî æ
äî ïðè ðîä íèõ ïîë³ìîðô³÷íèõ çàì³í.
ÏÓÊ²Ø Í. Ñ. ÒÀ ²Í.
52
Ñóá òè ïî âà ñòðóê òó ðà ²Ë-1 ó äîñë³äæó âà íèõ çðàç êàõ
 îä íî ìó ç äîñë³äæå íèõ çðàçê³â çíàé äå íî ìó -
òàö³þ V179D ³ç çàì³íîþ àì³íî êèñ ëî òè âàë³íó íà àñ -
ïà ðàã³íî âó êèñ ëî òó â ä³ëÿíö³ ÇÒ ó ïî çèö³¿ 179.
Îö³íêà âïëè âó äà íî¿ ìó òàö³¿ íà ðîç âè òîê ðå çèñ -
òåíòíîñò³ â³ðó ñó äî ÀÐÂÏ º íå îäíîç íà÷ íîþ ïðè çà -
ñòî ñó âàíí³ ð³çíèõ àëãîðèòì³â (òàáë. 2).
Äâà çðàç êè âè ÿ âè ëè ñÿ ç ìó òàö³ºþ V118I â
ä³ëÿíö³ ãå íà ÇÒ ó ïî çèö³¿ 118. Ùå îäèí äîñë³äæó âà -
íèé çðà çîê ì³ñòèâ ìó òàö³þ À62V. Ìó òàö³þ V106Q
âèç íà ÷å íî â îä íî ìó ç äîñë³äæå íèõ çðàçê³â òà
K101Q – ó äâîõ çðàç êàõ ó ãåí³ ÇÒ (òàáë. 1).
Äî ïîì³æí³ ìó òàö³¿ â ãåí³ ïðî òå à çè, ÿê³ ï³äñè ëþ -
þòü ä³þ ïåð âèí íèõ ìó òàö³é ðå çèñ òåí òíîñò³ ³ âè ÿâ -
ëåí³ ó íà øî ìó äîñë³äæåíí³, ìîæ íà ðîçä³ëè òè íà
ïîë³ìîðô³÷í³ (L10I, I13V, K20I, M36I) òà íå -
ïîë³ìîðô³÷í³ (K43T, T74S), ùî âè íè êà þòü ³ ñå -
ëåêö³îíó þòü ñÿ ï³ä âïëè âîì ÀÐÂ-òå ðàﳿ. Çà â³äñóò -
íîñò³ ìó òàö³é, ÿê³ ñïðè ÷è íÿ þòü ðå çèñ òåíòí³ñòü
²Ë, ÿê ó íà øî ìó âè ïàä êó, âèçíà÷åí³ ìó òàö³¿ íå
âïëè âà þòü íà çì³íó ÷óò ëè âîñò³ Â²Ë äî ÀÐÂÏ [15,
16] ( òàáë. 2).
Îêð³ì öüî ãî, íà ìè çíàé äå íî íèç êó ìó òàö³é, ÿê³
çóñòð³÷à þòü ñÿ ìàé æå â óñ³õ äîñë³äæå íèõ çðàç êàõ ÿê
ó ãåí³ ïðî òå à çè, òàê ³ â ãåí³ çâî ðîò íî¿ òðàíñ êðèï òà -
çè. Ñå ðåä íèõ ïå ðå âàæ íî ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè, ìó -
òàö³¿, ùî âè íè êà þòü òà ñå ëåê òó þòü ñÿ íå ï³ä âïëè -
âîì ÀÐÂÏ. Ó ãåí³ ïðî òå à çè – öå ìó òàö³¿ E35D,
M36I, R41K, H69K, L89M, à â ãåí³ ÇÒ – V35T,
K122E, D123S, K173LSA, Q207A, R211S,
V245MTK, A272P, T286A, E291D, I293V, T294T,
I326V. Îäíàê âàð òî â³äì³òè òè, ùî äó æå áà ãà òî
ðîá³ò ³ñíóº íà ñüî ãîäí³ ñà ìå çà âèâ ÷åí íÿ âïëè âó
ïîë³ìîðô³÷íèõ çàì³í íà ÷óò ëèâ³ñòü ²Ë-1 äî ÀÐÂÏ
[17] (òàáë. 2, òàáë. 3).
Îòæå, ïðî âå äå íè ìè äîñë³äæåí íÿ ìè ìî ëå êó ëÿð -
íî¿ ñòðóê òó ðè ²Ë-1, ÿê³ öèð êó ëþ þòü â Óêðà¿í³, ïî -
êà çà íî, ùî äîì³íó þ ÷èì ñóá òè ïîì ²Ë-1 çà ëè -
øàºòüñÿ ñóá òèï À. Íå îáõ³äíî çâåð íó òè óâà ãó íà
ð³çêå çíè æåí íÿ ÷àñ òêè ñóá òè ïó  ²Ë-1 ó
ïîð³âíÿíí³ ç ïî ïå ðåäí³ìè ðî êà ìè.  ë³òå ðà òóð³ º
äàí³ ïðî òå, ùî ïå ðåõ³ä â³ä êîí öåí òðî âà íî¿ ôà çè
åï³äå쳿 Â²Ë íà ïåâí³é òå ðè òî𳿠(òîá òî åï³äå쳿, îá -
ÀÍÀË²Ç ÌÎ ËÅ ÊÓ ËßÐ ÍÈÕ ÎÑÎÁ ËÈ ÂÎÑ ÒÅÉ ÓÊÐ À¯ÍÑÜÊÈÕ ²ÇÎ ËßҲ ²Ë-1
53
Ìó òàö³¿, âè ÿâ ëåí³ ó äîñë³äæó âà íèõ çðàç êàõ Åôåêò ìó òàö³é íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ ²Ë-1 äî ÀÐÂÏ
V75M
Ïåð âèí íà ìó òàö³ÿ
ñïðè ÷èíÿº ðîç âèò îê ñò³éêîñò³ Â²Ë äî ³íã³á³òîð³â ÇÒ, à ñà ìå – äî ñòà âó äè íó
(d4T) òà, ìîæ ëè âî, ä³äà íî çè íó (ddI) [13]
Âòî ðèíí³ ìó òàö³¿
V179D íå çì³íþº ÷óò ëè âîñò³ â³ðó ñó äî ÀÐÂÏ (ANRS òà Rega_V7.1.1 àë ãî ðèò ìè)
ìî æå âèê ëè êà òè îá ìå æå íó ÷óò ëèâ³ñòü äî ê³ëüêîõ ïðå ïà ðàò³â êëà ñó
íå íóê ëå î çèä íèõ ³íã³á³òîð³â ÇÒ (ãðó ïà GRADE)
ïðè çâî äèòü äî ïî òåíö³é íî íèç ü êî ãî ð³âíÿ ðå çèñ òåí òíîñò³ äî ÀÐÂÏ (ãðó ïà
HIVDB)
Âòî ðèíí³ ìó òàö³¿
V118I
äî ïîì³æíà ìó òàö³ÿ, ñå ëåêö³îíóºòüñÿ ï³ä âïëè âîì ÀÐÂÏ çà ïðè ñóò íîñò³
îñíîâ íèõ ìó òàö³é ðå çèñ òåí òíîñò³ ï³äñè ëþº ¿õíþ ä³þ òà â êîì ïëåêñ³ ñïðè ÷è íÿº
çíè æåí íÿ ÷óò ëè âîñò³ Â²Ë äî á³ëüøîñò³ íóê ëå î çèä íèõ ³íã³á³òîð³â [14]; çà
â³äñóò íîñò³ ïåð âèí íèõ ìó òàö³é åôåêò ìó òàö³¿ º íåâ³äî ìèì
À62V
âõî äèòü äî êîì ïëåê ñó ìó òàö³é Q151Ì, ùî ïðè çâî äÿòü äî ðîç âèò êó
ìóëü òè ðå çèñ òåí òíîñò³ Â²Ë äî íóê ëå î çèä íèõ ³íã³á³òîð³â ÇÒ [15]; ñàìà æ ìó òàö³ÿ
íå âïëè âຠíà çì³íó ÷óò ëè âîñò³ Â²Ë äî ÀÐÂÏ
V106Q, K101Q, V35T, K122E, D123S,
K173LSA, Q207A, R211S, V245MTK,
A272P, T286A, E291D, I293V, T294T, I326V
ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè ç ì³í³ìàëü íèì ÷è çîâñ³ì áåç áóäü-ÿêî ãî âïëè âó íà
ñò³éê³ñòü â³ðó ñó, çóñòð³÷à þòü ñÿ ó ð³âíî ìó ñï³ââ³äíî øåíí³ ó ðàç³ âïëè âó ÀÐÂÏ
íà ãå íîì â³ðó ñó àáî áåç òà êî ãî
Òàá ëè öÿ 2
Âïëèâ âè ÿâ ëå íèõ ìó òàö³é ó ãåí³ çâî ðîò íî¿ òðàíñ êðèï òà çè (ÇÒ) ²Ë-1 íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ â³ðóñó äî
àí òè ðåò ðîâ³ðóñ íèõ ïðå ïà ðàò³â (ÀÐÂÏ)
ìå æåíî¿ ïåâ íîþ ãðó ïîþ ðè çè êó, íà ïðèê ëàä, ñå ðåä
ñïî æè âà÷³â ³í’ºêö³éíèõ íà ðêî òèê³â) äî ãå íå ðàë³çî -
âà íî¿ ôà çè (êî ëè åï³äåì³ÿ âè õî äèòü çà ìåæ³ ãðóï ðè -
çè êó) ïî â’ÿ çàíèé ç³ çì³íîþ ñóá òè ïó  ²Ë-1 íà íå-Â
ñóá òè ïè [18], ùî é ñïîñ òåð³ãàºòüñÿ ó ðî áî òàõ ³íøèõ
àâ òîð³â òà íà øèõ äîñë³äæåí íÿõ. Îêð³ì öüî ãî, ïî -
òð³áíî çà çíà ÷è òè, ùî äî âîë³ âå ëè êà ÷àñ òêà ïðè ïà -
äຠíà ðå êîìá³íà íòí³ öèð êó ëþ þ÷³ ôîð ìè ²Ë-1, ÿê³
íå âè ÿâ ëÿ ëè ñÿ ðàí³øå.
Ó ãå íîì³ á³ëüøîñò³ âèâ ÷å íèõ çðàçê³â ²Ë-1 âè -
ÿâ ëå íî ÿê äî ïîì³æí³, òàê ³ ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè
íóê ëå î òèä³â. Íà ñüî ãîäí³ ïè òàí íÿ çâ’ÿç êó äà íèõ
ìó òàö³¿ ³ç ðîç âèò êîì ðå çèñ òåí òíîñò³ çà ëè øàºòüñÿ
â³äêðèòèì.
Îñê³ëüêè çíàé äå íî ëè øå îäèí çðà çîê, ùî
ì³ñòèòü â³ðóñ, ðå çèñ òåí òíèé äî ÀÐÂÏ, íàø³
äîñë³äæåí íÿ äîç âî ëÿ þòü ïðè ïóñ òè òè, ùî íà äà íî -
ìó åòàï³ ðîç âèò êó åï³äå쳿 ²Ë/ÑͲÄó â Óêðà¿í³
ðîç ïî ÷è íà þòü ñÿ ôîð ìó âàí íÿ òà ïî øè ðåí íÿ ðå çèñ -
òåí òíèõ øòàì³â ²Ë-1, ïðî òå ð³âåíü ïå ðå äà÷³ öèõ
â³ðóñ³â äî ïàö³ºíò³â, ÿê³ íå îò ðè ìó þòü ÀÐÂÏ, º äî -
ñèòü íèç ü êèì. Ìåæ³ ïî øè ðåí íÿ ðå çèñ òåí òíèõ
øòàì³â ìî æóòü áó òè ïî â’ÿ çàí³ ç ïåð³îäîì çà ñòî ñó -
âàí íÿ ÀÐÂ-òå ðàﳿ íà ïåâí³é òå ðè òîð³¿, îõîï ëåí íÿì
òå ðàﳺþ ²Ë-ïî çè òèâ íî ãî íà ñå ëåí íÿ, îñîá ëè âîñ -
òÿ ìè çà ñòî ñó âàí íÿ ÀÐÂÏ òà ç åôåê òèâí³ñòþ
ïðîô³ëàê òè÷ íèõ çà õîä³â. Òàê, ïî êà çà íî, ùî Âå ëè êà
Áðè òàí³ÿ ìຠîäèí ç íà é âè ùèõ ð³âí³â ðîç ïîâ ñþä æå -
íîñò³ ïåð âèí íî¿ ðå çèñ òåí òíîñò³ äî ÀÐÂÏ (14 %) ó
ïîð³âíÿíí³ ³ç ÑØÀ (8–10 %), Ôðàíö³ºþ (9 %) òà
³íøè ìè ªâðî ïå éñüêè ìè êðà¿ íà ìè [9]. Äåð æà âè
ªâðî ïè òà ÑØÀ ñòà ëè ïåð øè ìè ó çà ñòî ñó âàíí³
ÀÐÂ-òå ðàﳿ äëÿ ²Ë-³íô³êîâàíèõ ïàö³ºíò³â, ùî é
ìîæå îáóìîâëþâàòè âèñîêèé ñòóï³íü ðîç âèò êó ðå -
çèñ òåí òíèõ øòàì³â ó äàíèõ êðà¿íàõ.
Âè ùå âèê ëà äå íå îá ãðóí òî âóº äîö³ëüí³ñòü ³ íå -
îáõ³äí³ñòü ïðî âå äåí íÿ ùîð³÷íî ãî ìîí³òî ðèí ãó çà
ðîç âèò êîì ìó òàö³é ðå çèñ òåí òíîñò³ ²Ë-1 òà ðîç ïîâ -
ñþä æåí íÿì ¿õ ñåðåä íàñåëåííÿ.
N. S. Pukish, A. M. Shcherbinska, N. O. Babij, V. P. Polishchuk
Analysis of molecular features of the ukrainian isolates of HIV-1
Summary
Analysis of HIV-1 genome in the region of pol gene was performed
by sequencing virus genome using 64 samples of blood from
HIV-infected persons. Subtype a HIV-1 revealed to be dominating
among investigated samples and a great number of samples
belonged to a circulating recombinant forms of HIV-1. Analysis of
mutations showed only one mutation connected with development
of HIV-1 resistance to antiretroviral treatment. Most samples in-
cluded polymorphic substitutions of nucleotides in the virus genome
region studied.
Keywords: human immunodeficiency virus 1, polymorphic
substitutions, resistance mutations, recombinant forms of HIV-1,
subtype of HIV-1.
Í. Ñ. Ïó êèø, À. Ì. Ùåð áèí ñêàÿ, Í. Î. Áà áèé, Â. Ï. Ïî ëè ùóê
Àíàëèç ìî ëå êó ëÿð íûõ îñî áåí íîñ òåé óêðà èí ñêèõ èçî ëÿ òîâ
ÂÈ×-1
Ðå çþ ìå
Ïðî âå äåí àíà ëèç ãå íî ìà ÂÈ×-1 â îá ëàñ òè ãåíà pol 64 îá ðàç öîâ
êðî âè ÂÈ×-èí ôè öè ðî âàí íûõ ëèö ñ èñ ïîëü çî âà íè åì ìå òî äà
îïðå äå ëå íèÿ íóê ëå î òèä íîé ïî ñëå äî âà òåëü íîñ òè íóê ëå è íî âîé
êèñ ëî òû. Óñòà íîâ ëå íî, ÷òî äî ìè íè ðó þ ùèì ñðå äè èñ ñëå äî âàí -
íûõ îá ðàç öîâ îêà çàë ñÿ ñóá òèï À, à çíà ÷è òåëü íîå êî ëè ÷åñ òâî
èçî ëÿ òîâ îò íî ñèò ñÿ ê öèð êó ëè ðó þ ùèì ðå êîì áè íàí òíûì ôîð -
ìàì ÂÈ×-1.  ðå çóëü òà òå àíà ëè çà îá íà ðó æå íà îäíà ìó òà öèÿ,
ñâÿ çàí íàÿ ñ ðàç âè òè åì ðå çèñ òåí òíîñ òè ÂÈ×-1 ê àí òè ðåò ðî -
âè ðóñ íûì ïðå ïà ðà òàì. Â áîëü øè íñòâå îá ðàç öîâ âû ÿâ ëå íû ïî -
ëè ìîð ôè ÷åñ êèå èç ìå íå íèÿ íóê ëå î òè äîâ â èñ ñëå äî âàí íîì
ó÷àñ òêå ãåíîìà ÂÈ×-1.
Êëþ ÷å âûå ñëî âà: âè ðóñ èì ìó íî äå ôè öè òà ÷å ëî âå êà-1, ïî ëè -
ìîð ôè ÷åñ êèå èç ìå íå íèÿ, ìó òà öèè ðå çèñ òåí òíîñ òè, ðå êîì áè -
íàí òíûå ôîð ìû ÂÈ×-1, ñóá òèï ÂÈ×-1.
ÏÓÊ²Ø Í. Ñ. ÒÀ ²Í.
54
Ìó òàö³¿, âè ÿâ ëåí³ ó äîñë³äæó âà íèõ çðàç êàõ Åôåêò ìó òàö³é íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ ²Ë-1 äî ÀÐÂÏ
L10I, I13V, K20I, M36I Äî ïîì³æí³ ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè
K43T, T74S Äî ïîì³æí³ íå ïîë³ìîðô³÷í³ çàì³íè
Íå âïëè âà þòü íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ Â²Ë -1 äî ÀÐÂÏ
çà â³äñóò íîñò³ ïåð âèí íèõ ìó òàö³é
Òàá ëè öÿ 3
Âïëèâ ìó òàö³é ó ãåí³ ïîë³ìå ðà çè ²Ë-1 íà ðîç âè òîê ðå çèñ òåí òíîñò³ â³ðóñó äî àí òè ðåò ðîâ³ðóñ íèõ ïðå ïà ðàò³â (ÀÐÂÏ)
ÏÅÐÅË²Ê Ë²ÒÅÐÀÒÓÐÈ
1. Gallo R. C., MontagnierL. The discovery of HIV as the cause
of AIDS // New Engl. J. Med.–2003.–349, N 24.–P. 2283–
2285.
2. UNAIDS. AIDS Epidemic Update: December 2007.
3. Requejo H. Worldwide molecular epidemiology of HIV //
Rev. Saude Publica.–2006.–40, N 2.–P. 331–345.
4. Peters M., Sharp R. M. Genetic diversity of HIV-1: the mo-
ving target // AIDS.–2000.–14, ¹ 3.–P. 129–140.
5. McCutchan F. E. Understanding the genetic diversity of HIV-
1 // AIDS.–2000.–14, ¹ 3.–P. 31–44.
6. Barlet J., Galant J. Clinical aspects of HIV-infection.–Ì.:
EnRus, 2007.–557 p.
7. de Ronde A., van Dooren M., van der Hoek L., Bouwhuis D.,
de Rooij E., van Gemen B., de Boer R., Goudsmit J. Esteblish-
ment of new transmissible and drug sensitive human im-
munodeficiency virus type 1 wild types due to transmission of
nucleoside analogue-resistant virus // J. Virol.–2001.–75.–
P. 595–602.
8. Clavel F., Hance A. HIV drug resistance // New Engl. J.
Med.–2004.–350, N 10.–P. 1023–1035.
9. Vijver D., Wensing A., Boucher C. The epidemiology of
transmission of drug resistant HIV-1. Sequence compendium
2006/2007.–Los Alamos, 2007.–P. 17–36.
10. Tatt I., Barlow K., Nicoll A., Clewley J. The public health sig-
nificance of HIV-1 subtypes // AIDS.–2001.–15, N 24.–
P. 59–71.
11. Saad M., Shcherbinskaya A., Nadai Y., Kruglov Y., Antonen-
ko S., Lyullchuk M., Kravchenko O., Earhart K., Sanchez J.,
Birx D., Carr J. Molecular epidemiology of HIV type 1 in
Ukraine: birthplace of an epidemic // AIDS Res. and Hum.
Retroviruses.–2006.–22, N 8.–P. 709–714.
12. Nabatov A., Kravchenko O., Lyulchuk M., Shcherbinskaya
A., Lukashov V. Simultaneous introduction of HIV type 1
subtype A and B viruses into injecting drug users in southern
Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet
Union // AIDS Res. and Hum. Retroviruses.– 2002.–18,
N 12.–P. 891–895.
13. Johnson V., Vezinet F., Clotet B., Gunthart H., Kuritzkes D.,
Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of drug resistance
mutations in HIV-1: 2007 // Top. HIV Med.–2007.–15, N 4.–
P. 119–125.
14. Johnson V., Brun-Vezinet F., Cloet B., Gunthart H., Kuritz-
kes D., Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of Drug Re-
sistance Mutations in HIV-1: 2006 // Top. HIV
Med.–2006.–14, N 3.–P. 125–130.
15. Shafer R., Rhee S., Pillay D., Miller V., Sandstrom P., Shapi-
ro J., Kuritzkes D., Bennet D. HIV-1 protease and reverse
transcriptase mutations for drug resistance surveillance //
AIDS.–2007.–21.–P. 215–223.
16. HIV drug resistance mutations by drug class (January 28,
2008) – http://hivdb.standford.edu.
17. Sukasem C., Churdboonchart V., Sukeepaisarncharoen W.,
Piroj W., Inwisai T., Tiensuwan M., Chantratita W. Geno-
typic resistance profiles in antiretroviral-naVve HIV-1
infections before and after initiation of first-line HAART:
impact of polymorphism on resistance to therapy // Int. J.
Antimicrob. Agents.–2008.–31, N 3.–P. 277–281.
18. Hu D., Subbarao S., Vanichseni S., Mock P., Ramos A., Ngu-
yen L., Chaowanachan T., Griensven F., Choopanya K., Mas-
tro T., Tappero J. Frequency of HIV-1 dual subtype
infections, including intersubtype infections, among injec-
tion drug users in Bangkok, Thailand // AIDS.–2001.–19,
N 3.–P. 303–308.
ÓÄÊ 587.828
Íàä³éøëà äî ðå äàêö³¿ 03.09.08
ÀÍÀË²Ç ÌÎ ËÅ ÊÓ ËßÐ ÍÈÕ ÎÑÎÁ ËÈ ÂÎÑ ÒÅÉ ÓÊÐ À¯ÍÑÜÊÈÕ ²ÇÎ ËßҲ ²Ë-1
55
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-5636 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-01T14:35:22Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Пукіш, Н.С. Щербінська, А.М. Бабій, Н.О. Поліщук, В.П. 2010-02-01T13:05:55Z 2010-02-01T13:05:55Z 2009 Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 / Н.С. Пукіш, А.М. Щербінська, Н.О. Бабій, В.П. Поліщук // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 50-55. — Бібліогр.: 18 назв. — укp. 0233-7657 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5636 587.828 Проаналізовано геном ВІЛ-1 у ділянці гена pol 64 зразків крові ВІЛ-інфікованих осіб із використанням методу визначення нуклеотидної послідовності нуклеїнової кислоти. Встановлено, що домінуючим серед досліджених зразків ВІЛ-1 виявився субтип А, а значна кількість зразків належить до циркулюючих рекомбінантних форм ВІЛ-1. За результатами аналізу наявних мутацій знайдено лише одну, пов'язану з розвитком резистентності ВІЛ-1 до антиретровірусних препаратів. У більшості зразків визначено поліморфічні заміни нуклеотидів у досліджуваній ділянці геному ВІЛ-1. Analysis of HIV-1 genome in the region of pol gene was performed by sequencing virus genome using 64 samples of blood from HIV-infected persons. Subtype a HIV-1 revealed to be dominating among investigated samples and a great number of samples belonged to a circulating recombinant forms of HIV-1. Analysis of mutations showed only one mutation connected with development of HIV-1 resistance to antiretroviral treatment. Most samples included polymorphic substitutions of nucleotides in the virus genome region studied. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Віруси і клітина Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 Анализ молекулярных особенностей украинских изолятов ВИЧ-1 Analysis of molecular features of the ukrainian isolates of HIV-1 Article published earlier |
| spellingShingle | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 Пукіш, Н.С. Щербінська, А.М. Бабій, Н.О. Поліщук, В.П. Віруси і клітина |
| title | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 |
| title_alt | Анализ молекулярных особенностей украинских изолятов ВИЧ-1 Analysis of molecular features of the ukrainian isolates of HIV-1 |
| title_full | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 |
| title_fullStr | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 |
| title_full_unstemmed | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 |
| title_short | Аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів ВІЛ-1 |
| title_sort | аналіз молекулярних особливостей українських ізолятів віл-1 |
| topic | Віруси і клітина |
| topic_facet | Віруси і клітина |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5636 |
| work_keys_str_mv | AT pukíšns analízmolekulârnihosoblivosteiukraínsʹkihízolâtívvíl1 AT ŝerbínsʹkaam analízmolekulârnihosoblivosteiukraínsʹkihízolâtívvíl1 AT babíino analízmolekulârnihosoblivosteiukraínsʹkihízolâtívvíl1 AT políŝukvp analízmolekulârnihosoblivosteiukraínsʹkihízolâtívvíl1 AT pukíšns analizmolekulârnyhosobennosteiukrainskihizolâtovvič1 AT ŝerbínsʹkaam analizmolekulârnyhosobennosteiukrainskihizolâtovvič1 AT babíino analizmolekulârnyhosobennosteiukrainskihizolâtovvič1 AT políŝukvp analizmolekulârnyhosobennosteiukrainskihizolâtovvič1 AT pukíšns analysisofmolecularfeaturesoftheukrainianisolatesofhiv1 AT ŝerbínsʹkaam analysisofmolecularfeaturesoftheukrainianisolatesofhiv1 AT babíino analysisofmolecularfeaturesoftheukrainianisolatesofhiv1 AT políŝukvp analysisofmolecularfeaturesoftheukrainianisolatesofhiv1 |