Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини
Мета. Для дослідження механізму зв’язування кисню гемом розглянуто три моделі геометричної структури комплексу ферум(ІІ)-порфіну з молекулою О2 : молекула кисню розташована перпендикулярно до макроциклу порфіну, паралельно і під кутом. Методи. Квантово-хімічним методом теорії функціоналу густини на...
Збережено в:
| Дата: | 2009 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2009
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5686 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини / Б.П. Мінаєв, В.О. Мінаєва, О.М. Обушко, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 4. — С. 298-306. — Бібліогр.: 22 назв. — укp. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862711051097735168 |
|---|---|
| author | Мінаєв, Б.П. Мінаєва, В.О. Обушко, О.М. Говорун, Д.М. |
| author_facet | Мінаєв, Б.П. Мінаєва, В.О. Обушко, О.М. Говорун, Д.М. |
| citation_txt | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини / Б.П. Мінаєв, В.О. Мінаєва, О.М. Обушко, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 4. — С. 298-306. — Бібліогр.: 22 назв. — укp. |
| collection | DSpace DC |
| description | Мета. Для дослідження механізму зв’язування кисню гемом розглянуто три моделі геометричної структури комплексу ферум(ІІ)-порфіну з молекулою О2 : молекула кисню розташована перпендикулярно до макроциклу порфіну, паралельно і під кутом. Методи. Квантово-хімічним методом теорії функціоналу густини на рівні UB3LYP/6-311G проведено розрахунок моделей комплексів ферум(ІІ)-порфіну з молекулою кисню. Результати. Описано геометричні та електронні структури, а також інфрачервоні спектри поглинання комплексів у високоспіновому (септетному) стані. Висновки. Зроблено припущення стосовно того, що основний механізм виявлення спін-орбітальної взаємодії у ході приєднання O2 до гему пов’язаний з особливостями електронної структури молекули O2.
Aim. To study a mechanism of molecular oxygen binding to heme three models of geometry structure of the complex are considered: the axis of O2 molecule is situated perpendicularly to the porphin macrocycle, parallel, and angularly. Methods. The Fe(II) porphin complexes with dioxygen are calculated by the quantum-chemical method of density functional theory with the UB3LYP/6-311G approximation. Results. The optimized geometry and electron structures as well as the absorption IR spectra of the complexes in the high-spin (septet) state are described. Conclusions. It is shown that the main mechanism of spin-orbit coupling during the O2 binding to heme is connected with peculiarity of the O2 molecule electronic structure.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:27:57Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-5686 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T17:27:57Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Мінаєв, Б.П. Мінаєва, В.О. Обушко, О.М. Говорун, Д.М. 2010-02-02T11:29:18Z 2010-02-02T11:29:18Z 2009 Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини / Б.П. Мінаєв, В.О. Мінаєва, О.М. Обушко, Д.М. Говорун // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 4. — С. 298-306. — Бібліогр.: 22 назв. — укp. 0233-7657 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5686 577.175.6:544.18:543.422 Мета. Для дослідження механізму зв’язування кисню гемом розглянуто три моделі геометричної структури комплексу ферум(ІІ)-порфіну з молекулою О2 : молекула кисню розташована перпендикулярно до макроциклу порфіну, паралельно і під кутом. Методи. Квантово-хімічним методом теорії функціоналу густини на рівні UB3LYP/6-311G проведено розрахунок моделей комплексів ферум(ІІ)-порфіну з молекулою кисню. Результати. Описано геометричні та електронні структури, а також інфрачервоні спектри поглинання комплексів у високоспіновому (септетному) стані. Висновки. Зроблено припущення стосовно того, що основний механізм виявлення спін-орбітальної взаємодії у ході приєднання O2 до гему пов’язаний з особливостями електронної структури молекули O2. Aim. To study a mechanism of molecular oxygen binding to heme three models of geometry structure of the complex are considered: the axis of O2 molecule is situated perpendicularly to the porphin macrocycle, parallel, and angularly. Methods. The Fe(II) porphin complexes with dioxygen are calculated by the quantum-chemical method of density functional theory with the UB3LYP/6-311G approximation. Results. The optimized geometry and electron structures as well as the absorption IR spectra of the complexes in the high-spin (septet) state are described. Conclusions. It is shown that the main mechanism of spin-orbit coupling during the O2 binding to heme is connected with peculiarity of the O2 molecule electronic structure. uk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Молекулярна біофізика Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини Исследование моделей связывания кислорода при помощи теории функционала плотности Study on models of oxygen binding to heme using density functional theory Article published earlier |
| spellingShingle | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини Мінаєв, Б.П. Мінаєва, В.О. Обушко, О.М. Говорун, Д.М. Молекулярна біофізика |
| title | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| title_alt | Исследование моделей связывания кислорода при помощи теории функционала плотности Study on models of oxygen binding to heme using density functional theory |
| title_full | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| title_fullStr | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| title_full_unstemmed | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| title_short | Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| title_sort | дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини |
| topic | Молекулярна біофізика |
| topic_facet | Молекулярна біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/5686 |
| work_keys_str_mv | AT mínaêvbp doslídžennâmodeleizvâzuvannâkisnûgemomzadopomogoûteoríífunkcíonalugustini AT mínaêvavo doslídžennâmodeleizvâzuvannâkisnûgemomzadopomogoûteoríífunkcíonalugustini AT obuškoom doslídžennâmodeleizvâzuvannâkisnûgemomzadopomogoûteoríífunkcíonalugustini AT govorundm doslídžennâmodeleizvâzuvannâkisnûgemomzadopomogoûteoríífunkcíonalugustini AT mínaêvbp issledovaniemodeleisvâzyvaniâkislorodapripomoŝiteoriifunkcionalaplotnosti AT mínaêvavo issledovaniemodeleisvâzyvaniâkislorodapripomoŝiteoriifunkcionalaplotnosti AT obuškoom issledovaniemodeleisvâzyvaniâkislorodapripomoŝiteoriifunkcionalaplotnosti AT govorundm issledovaniemodeleisvâzyvaniâkislorodapripomoŝiteoriifunkcionalaplotnosti AT mínaêvbp studyonmodelsofoxygenbindingtohemeusingdensityfunctionaltheory AT mínaêvavo studyonmodelsofoxygenbindingtohemeusingdensityfunctionaltheory AT obuškoom studyonmodelsofoxygenbindingtohemeusingdensityfunctionaltheory AT govorundm studyonmodelsofoxygenbindingtohemeusingdensityfunctionaltheory |