Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої
Найважливішим етапом у будь-якому протеомному дослідженні є екстрагування та приготування білкових зразків. Краща розчинність білків забезпечує якісніше їх розділення в гелі й, відповідно, ідентифікацію більшої кількості поліпептидів, а відтак — точніше виявлення відмінностей в експресії генів, що ї...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Физиология и биохимия культурных растений |
|---|---|
| Дата: | 2013 |
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Iнститут фізіології рослин і генетики НАН України
2013
|
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66481 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої / Ю.Ю. Кондратюк, П.М. Маменко, А.С. Левішко, Г.М. Дрозденко, С.Я. Коць // Физиология и биохимия культурных растений. — 2013. — Т. 45, № 3. — С. 222-229. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862631217713643520 |
|---|---|
| author | Кондратюк, Ю.Ю. Маменко, П.М. Левішко, А.С. Дрозденко, Г.М. Коць, С.Я. |
| author_facet | Кондратюк, Ю.Ю. Маменко, П.М. Левішко, А.С. Дрозденко, Г.М. Коць, С.Я. |
| citation_txt | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої / Ю.Ю. Кондратюк, П.М. Маменко, А.С. Левішко, Г.М. Дрозденко, С.Я. Коць // Физиология и биохимия культурных растений. — 2013. — Т. 45, № 3. — С. 222-229. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Физиология и биохимия культурных растений |
| description | Найважливішим етапом у будь-якому протеомному дослідженні є екстрагування та приготування білкових зразків. Краща розчинність білків забезпечує якісніше їх розділення в гелі й, відповідно, ідентифікацію більшої кількості поліпептидів, а відтак — точніше виявлення відмінностей в експресії генів, що їх кодують. Проте низка методичних труднощів, пов’язаних насамперед зі складністю організації рослинної клітини, змушує добирати методи отримання препаратів білків у кожному конкретному випадку. В зв’язку з цим було проведено моніторинг методів отримання та електрофоретичного розділення білкових екстрактів із коренів і бульбочок сої, вирощеної за інокуляції Tn5-мутантами Bradyrhizobium japonicum на фоні різного азотного забезпечення. Відібрано найефективніші методи для подальшого виявлення кількісних та якісних змін білкових профілів сої.
Важнейшим этапом в любом протеомном исследовании является экстракция и приготовление белковых образцов. Лучшая растворимость белков обеспечивает более качественное их разделение в геле и, соответственно, идентификацию большего количества полипептидов, а поэтому — более точное выявление различий в экспрессии генов, которые их кодируют. Однако ряд методических трудностей, связанных прежде всего со сложностью организации растительной клетки, вынуждает подбирать методы получения препаратов белков в каждом конкретном случае. В связи с этим был проведен мониторинг методов получения и электрофоретического разделения белковых экстрактов из корней и клубеньков сои, выращенной при инокуляции Tn5-мутантами Bradyrhizobium japonicum на фоне различного азотного обеспечения. Отобраны наиболее эффективные методы для дальнейшего выявления количественных и качественных изменений белковых профилей сои.
The most critical step in any proteomics study is protein extraction and sample preparation. Better solubilization increases the separation and resolution of gels allowing identification of a higher number of proteins and more accurate quantification of differences in gene expression. However, a number of methodological difficulties related to complexity of plant cells leads to necessity of choose the proteomic studies conditions in each case. The monitoring of methods for extraction and electrophoretic separation of proteins of roots and nodules of soybean grown under inoculation of Tn5-mutants of Bradyrhizobium japonicum and under different nitrogen supply was conducted. The most effective methods for further identification of quantitative and qualitative changes in soybean protein profiles were selected.
|
| first_indexed | 2025-11-30T10:56:38Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66481 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0522-9310 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-30T10:56:38Z |
| publishDate | 2013 |
| publisher | Iнститут фізіології рослин і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Кондратюк, Ю.Ю. Маменко, П.М. Левішко, А.С. Дрозденко, Г.М. Коць, С.Я. 2014-07-16T16:21:34Z 2014-07-16T16:21:34Z 2013 Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої / Ю.Ю. Кондратюк, П.М. Маменко, А.С. Левішко, Г.М. Дрозденко, С.Я. Коць // Физиология и биохимия культурных растений. — 2013. — Т. 45, № 3. — С. 222-229. — Бібліогр.: 21 назв. — укр. 0522-9310 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66481 581.557:579.22 Найважливішим етапом у будь-якому протеомному дослідженні є екстрагування та приготування білкових зразків. Краща розчинність білків забезпечує якісніше їх розділення в гелі й, відповідно, ідентифікацію більшої кількості поліпептидів, а відтак — точніше виявлення відмінностей в експресії генів, що їх кодують. Проте низка методичних труднощів, пов’язаних насамперед зі складністю організації рослинної клітини, змушує добирати методи отримання препаратів білків у кожному конкретному випадку. В зв’язку з цим було проведено моніторинг методів отримання та електрофоретичного розділення білкових екстрактів із коренів і бульбочок сої, вирощеної за інокуляції Tn5-мутантами Bradyrhizobium japonicum на фоні різного азотного забезпечення. Відібрано найефективніші методи для подальшого виявлення кількісних та якісних змін білкових профілів сої. Важнейшим этапом в любом протеомном исследовании является экстракция и приготовление белковых образцов. Лучшая растворимость белков обеспечивает более качественное их разделение в геле и, соответственно, идентификацию большего количества полипептидов, а поэтому — более точное выявление различий в экспрессии генов, которые их кодируют. Однако ряд методических трудностей, связанных прежде всего со сложностью организации растительной клетки, вынуждает подбирать методы получения препаратов белков в каждом конкретном случае. В связи с этим был проведен мониторинг методов получения и электрофоретического разделения белковых экстрактов из корней и клубеньков сои, выращенной при инокуляции Tn5-мутантами Bradyrhizobium japonicum на фоне различного азотного обеспечения. Отобраны наиболее эффективные методы для дальнейшего выявления количественных и качественных изменений белковых профилей сои. The most critical step in any proteomics study is protein extraction and sample preparation. Better solubilization increases the separation and resolution of gels allowing identification of a higher number of proteins and more accurate quantification of differences in gene expression. However, a number of methodological difficulties related to complexity of plant cells leads to necessity of choose the proteomic studies conditions in each case. The monitoring of methods for extraction and electrophoretic separation of proteins of roots and nodules of soybean grown under inoculation of Tn5-mutants of Bradyrhizobium japonicum and under different nitrogen supply was conducted. The most effective methods for further identification of quantitative and qualitative changes in soybean protein profiles were selected. uk Iнститут фізіології рослин і генетики НАН України Физиология и биохимия культурных растений Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої Сравнительный анализ методов экстракции и разделения белков для протеомного исследования белковых профилей корней и клубеньков сои Comparative analysis of methods for protein extraction and separation for proteomic investigation of soybean roots and nodules proteins Article published earlier |
| spellingShingle | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої Кондратюк, Ю.Ю. Маменко, П.М. Левішко, А.С. Дрозденко, Г.М. Коць, С.Я. |
| title | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| title_alt | Сравнительный анализ методов экстракции и разделения белков для протеомного исследования белковых профилей корней и клубеньков сои Comparative analysis of methods for protein extraction and separation for proteomic investigation of soybean roots and nodules proteins |
| title_full | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| title_fullStr | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| title_full_unstemmed | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| title_short | Порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| title_sort | порівняльний аналіз методів екстрагування та розділення білків для протеомного дослідження білкових профілів коренів і бульбочок сої |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66481 |
| work_keys_str_mv | AT kondratûkûû porívnâlʹniianalízmetodívekstraguvannâtarozdílennâbílkívdlâproteomnogodoslídžennâbílkovihprofílívkorenívíbulʹbočoksoí AT mamenkopm porívnâlʹniianalízmetodívekstraguvannâtarozdílennâbílkívdlâproteomnogodoslídžennâbílkovihprofílívkorenívíbulʹbočoksoí AT levíškoas porívnâlʹniianalízmetodívekstraguvannâtarozdílennâbílkívdlâproteomnogodoslídžennâbílkovihprofílívkorenívíbulʹbočoksoí AT drozdenkogm porívnâlʹniianalízmetodívekstraguvannâtarozdílennâbílkívdlâproteomnogodoslídžennâbílkovihprofílívkorenívíbulʹbočoksoí AT kocʹsâ porívnâlʹniianalízmetodívekstraguvannâtarozdílennâbílkívdlâproteomnogodoslídžennâbílkovihprofílívkorenívíbulʹbočoksoí AT kondratûkûû sravnitelʹnyianalizmetodovékstrakciiirazdeleniâbelkovdlâproteomnogoissledovaniâbelkovyhprofileikorneiiklubenʹkovsoi AT mamenkopm sravnitelʹnyianalizmetodovékstrakciiirazdeleniâbelkovdlâproteomnogoissledovaniâbelkovyhprofileikorneiiklubenʹkovsoi AT levíškoas sravnitelʹnyianalizmetodovékstrakciiirazdeleniâbelkovdlâproteomnogoissledovaniâbelkovyhprofileikorneiiklubenʹkovsoi AT drozdenkogm sravnitelʹnyianalizmetodovékstrakciiirazdeleniâbelkovdlâproteomnogoissledovaniâbelkovyhprofileikorneiiklubenʹkovsoi AT kocʹsâ sravnitelʹnyianalizmetodovékstrakciiirazdeleniâbelkovdlâproteomnogoissledovaniâbelkovyhprofileikorneiiklubenʹkovsoi AT kondratûkûû comparativeanalysisofmethodsforproteinextractionandseparationforproteomicinvestigationofsoybeanrootsandnodulesproteins AT mamenkopm comparativeanalysisofmethodsforproteinextractionandseparationforproteomicinvestigationofsoybeanrootsandnodulesproteins AT levíškoas comparativeanalysisofmethodsforproteinextractionandseparationforproteomicinvestigationofsoybeanrootsandnodulesproteins AT drozdenkogm comparativeanalysisofmethodsforproteinextractionandseparationforproteomicinvestigationofsoybeanrootsandnodulesproteins AT kocʹsâ comparativeanalysisofmethodsforproteinextractionandseparationforproteomicinvestigationofsoybeanrootsandnodulesproteins |