Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине

Проведен ПЦР-анализ межродового и межвидового полиморфизма сорго, сориза и их ближайших сородичей (кукуруза, рис). Уровень полиморфизма в пределах выборки составил 100 %, межвидовой полиморфизм (виды сорго и сориза) – 96,2 %, что свидетельствует о широкой изменчивости исследуемых образцов. Кластериз...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2009
Автори:	Шевчук, А.Ю., Кожухова, Н.Э., Сиволап, Ю.М.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2009
Назва видання:	Цитология и генетика
Теми:	Оригинальные работы
Онлайн доступ:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66632
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине / А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап // Цитология и генетика. — 2009. — Т. 43, № 2. — С. 47-53. — Бібліогр.: 17 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66632
record_format	dspace
spelling	nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-666322025-02-23T18:19:19Z Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине Молекулярно-генетичний аналіз форм сорго, що вирощуються в Україні Molecular analysis of the genotypes of sorghum cultivated in Ukraine Шевчук, А.Ю. Кожухова, Н.Э. Сиволап, Ю.М. Оригинальные работы Проведен ПЦР-анализ межродового и межвидового полиморфизма сорго, сориза и их ближайших сородичей (кукуруза, рис). Уровень полиморфизма в пределах выборки составил 100 %, межвидовой полиморфизм (виды сорго и сориза) – 96,2 %, что свидетельствует о широкой изменчивости исследуемых образцов. Кластеризация генотипов произошла согласно их видовой принадлежности. Проведено ПЛР-аналіз міжродового та міжвидового поліморфізму сорго, сорізу та їх найближчих родичів (кукурудза, рис). Рівень поліморфізму в межах вибірки склав 100 %, міжвидовий поліморфізм (види сорго та сорізу) – 96,2 %, що свідчить про широку мінливість досліджуваних зразків. Кластеризація генотипів здійснилась згідно з їх видовою належністю. PCR-analysis of intraspecific and interspecific polymorphism of sorghum, soryz and their nearest relatives (maize, rice) has been conducted. The level of polymorphism within the sample was 100 %. Interspecific polymorphism (species of sorghum and soryz) was 96,2 % that testifies the wide changeability of the analyzed samples. Clasterisation of the genotypes occurred according to their species. Авторы выражают глубокую благодарность д-ру с.-х. наук Г.К. Дремлюку и канд. биол. наук В.Л. Гамандию за предоставленный материал и обсуждение результатов исследования. 2009 Article Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине / А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап // Цитология и генетика. — 2009. — Т. 43, № 2. — С. 47-53. — Бібліогр.: 17 назв. — рос. 0564-3783 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66632 577.21.582.542.2 ru Цитология и генетика application/pdf Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
language	Russian
topic	Оригинальные работы Оригинальные работы
spellingShingle	Оригинальные работы Оригинальные работы Шевчук, А.Ю. Кожухова, Н.Э. Сиволап, Ю.М. Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине Цитология и генетика
description	Проведен ПЦР-анализ межродового и межвидового полиморфизма сорго, сориза и их ближайших сородичей (кукуруза, рис). Уровень полиморфизма в пределах выборки составил 100 %, межвидовой полиморфизм (виды сорго и сориза) – 96,2 %, что свидетельствует о широкой изменчивости исследуемых образцов. Кластеризация генотипов произошла согласно их видовой принадлежности.
format	Article
author	Шевчук, А.Ю. Кожухова, Н.Э. Сиволап, Ю.М.
author_facet	Шевчук, А.Ю. Кожухова, Н.Э. Сиволап, Ю.М.
author_sort	Шевчук, А.Ю.
title	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине
title_short	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине
title_full	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине
title_fullStr	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине
title_full_unstemmed	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине
title_sort	молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в украине
publisher	Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
publishDate	2009
topic_facet	Оригинальные работы
url	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66632
citation_txt	Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине / А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап // Цитология и генетика. — 2009. — Т. 43, № 2. — С. 47-53. — Бібліогр.: 17 назв. — рос.
series	Цитология и генетика
work_keys_str_mv	AT ševčukaû molekulârnogenetičeskijanalizformsorgovozdelyvaemyhvukraine AT kožuhované molekulârnogenetičeskijanalizformsorgovozdelyvaemyhvukraine AT sivolapûm molekulârnogenetičeskijanalizformsorgovozdelyvaemyhvukraine AT ševčukaû molekulârnogenetičnijanalízformsorgoŝoviroŝuûtʹsâvukraíní AT kožuhované molekulârnogenetičnijanalízformsorgoŝoviroŝuûtʹsâvukraíní AT sivolapûm molekulârnogenetičnijanalízformsorgoŝoviroŝuûtʹsâvukraíní AT ševčukaû molecularanalysisofthegenotypesofsorghumcultivatedinukraine AT kožuhované molecularanalysisofthegenotypesofsorghumcultivatedinukraine AT sivolapûm molecularanalysisofthegenotypesofsorghumcultivatedinukraine
first_indexed	2025-11-24T08:07:57Z
last_indexed	2025-11-24T08:07:57Z
_version_	1849658365415784448
fulltext	УДК 577.21.582.542.2 А.Ю. ШЕВЧУК, Н.Э. КОЖУХОВА, Ю.М. СИВОЛАП Южный биотехнологический центр в растениеводстве УААН, Овидиопольская дор. 3, Одесса, 65036, Украина E/mail: genom2005@ukr.net МОЛЕКУЛЯРНО�ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ФОРМ СОРГО, ВОЗДЕЛЫВАЕМЫХ В УКРАИНЕ Проведен ПЦР�анализ межродового и межвидового полиморфизма сорго, сориза и их ближайших сородичей (кукуруза, рис). Уровень полиморфизма в пределах вы� борки составил 100 %, межвидовой полиморфизм (виды сорго и сориза) – 96,2 %, что свидетельствует о широ� кой изменчивости исследуемых образцов. Кластеризация генотипов произошла согласно их видовой принадлеж� ности. Введение. Повышение продуктивности сель� скохозяйственных растений и улучшение ка� чества синтезируемой продукции является од� ной из важнейших задач генетико�селекцион� ных исследований. Наряду с созданием новых с высоким потенциалом продуктивности ви� дов растений, таких как тритикале [1], прово� дится работа по изменению качественных признаков внутри вида. Это селекция на такие показатели зерна пшеницы, как hard�soft [2], Wx [3], компонентный состав запасных белков глиадинов и глютенинов [4] и др. В селекции крупяных культур значительным событием является создание рисовидной формы сорго (сориза), обладающего ценными питательны� ми свойствами. Сорго (Sorghum bicolor M.) – одна из пяти наиболее важных злаковых культур, культиви� руется в 85 странах мира. Выращивают сорго в полузасушливых зонах благодаря толерантнос� ти к неблагоприятным условиям окружающей среды (высокая засухоустойчивость, жаростой� кость, солевыносливость, неприхотливость к почвам) [5]. Сорго характеризуется большим эколого�географическим и сортовым разнооб� разием, множеством промежуточных форм, что существенно затрудняет классификацию. Име� ющаяся таксономия основана на двух подхо� дах: ботаническом (оценка основных морфо� логических признаков сорго) и практическом (описание хозяйственных признаков). При классификации рода Sorghum Moench [6] наибо� лее часто используют второй подход. В послед� нее время в ряде центров Украины и Молдовы создана новая культура – сорго рисозерное, кратко – сориз (Sorghum orysoidum), которая имеет высокую пищевую ценность и исполь� зуется для получения высококачественных кру� пяных изделий. Зерну сориза свойственна хо� рошая стекловидность, высокая твердость эн� досперма и в связи с этим высокая экструзив� ная способность, хорошие вкусовые качества, устойчивость к болезням [7]. Происхождение и классификация сориза в настоящий момент недостаточно изучены и понятны, поскольку идентификация осущест� вляется на основе описания морфологических или агрономических признаков. В литературе можно найти предположение о том, что сориз представляет собой гибридную форму от скре� щивания хлебного сорго с дикими рисовидны� ми формами [7]. Выращивание крупяных куль� ІSSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 2 47 © А.Ю. ШЕВЧУК, Н.Э. КОЖУХОВА, Ю.М. СИВОЛАП, 2009 тур в зоне рискованного земледелия Украины находится значительно ниже необходимого уровня, поэтому селекция сориза для юга Укра� ины является важной задачей. Использование молекулярных маркеров в оценке вариабельности видов и сортов расте� ний позволяет выявить генетические взаимо� отношения между ними и уточнить системати� ку родов растений, включающих виды важней� ших сельскохозяйственных культур [8–10]. В этом плане ДНК�технологии и маркеры, гене� рируемые в результате полимеразной цепной реакции (ПЦР), могут оказаться важным вспо� могательным инструментом при классифика� ции сорго. Для оценки генетических взаимоотношений между видами и установления внутривидовой вариабельности используют, как правило, моно� и полилокусные варианты ПЦР�анализа: ПЦР� анализ произвольно праймированной ДНК (ПП�ПЦР) является полилокусным, биаллель� ным, доминантным и позволяет одновременно тестировать различные участки генома. Мик� росателлитные маркеры монолокусны, поли� аллельны, кодоминантны, что разрешает их использование в качестве генетических мар� керов для анализа аллельного состояния локу� сов у близких видов растений, в том числе и сорго [11]. Первый вариант ПЦР�анализа дает возможность обнаружить малые генетические различия в результате сканирования большей части генома, чем при использовании других систем ДНК�профилирования [12]. Использо� вание молекулярных маркеров позволяет уточнить происхождение сорта [13]. Целью нашего исследования явилось изучение филогенетических взаимоотношений между видами сорго, включая сориз, и на этой основе оп� ределение его возможного происхождения. Материалы и методы. Материалом для иссле� дования служили 15 самоопыленных линий пя� ти видов: сорго зерновой, сорго сахарный, сор� го веничный, суданка, сориз, а также кукуруза и рис (табл. 1). Материал любезно предоставлен канд. биол. наук В.Л. Гамандием, сотрудником отдела селекции сорго СГИ – Национальный центр семеноведения и сортоизучения. ДНК выделяли согласно протоколу с ис� пользованием протеиназы К [14]. ПЦР�анализ проводили на термоциклере «Терцик» («ДНК�технология», Россия). ПП�ПЦР выполняли в следующем режиме: начальная денатурация – 93 °С, 2 мин; далее 30 циклов: 93 °С, 30 с; 55 °С, 30 с; 72 °С, 1 мин; заключительная элонгация – 72 °С, 2 мин. SSR�ПЦР осуществляли при более высокой температуре денатурации: 96 °С, 2 мин; 30 цик� лов: 94 °С, 1 мин; 55 °С, 30 с; 72 °С, 1 мин, за� ключительная элонгация – 72 °С, 2 мин. Реакционная смесь объемом 20 мкл содер� жала: буфер (50 мM KCl; 20 мM трис�HCl pH 8,4 (25 °С), 2 мM MgCl2, 0,01 % твин�20); 0,2 мM каждого dNTP; 0,2 мкM праймера; 20 нг ДНК; 1 ед. ДНК�полимеразы Taq. На реакционную смесь наслаивали 20 мкл минерального масла. Последовательности SSR� и произвольных праймеров представлены в табл. 2 [5, 15]. Продукты амплификации разделяли при помощи электрофореза в горизонтальных «подводных» 2%� и 3%�ных агарозных гелях размером 20,0 � 15,0 � 0,5 см в приборе фирмы «Hofer Scientific Instruments» (США) в 1�TBE� буфере в течение 4 ч при напряжении 100 В и ISSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 248 А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап Таблица 1 Список генотипов, исследованных в работе Вид Линия Зерновое сорго (S. bicolor) Сахарное сорго (S. saccharatum) Веничное сорго (S. technicus) Суданка (S. sydanense) Сориз (S. orysoidum) Кукуруза (Zea mays) Рис (Oryza sativa) НК�180 К 35�Е5 НК�5418 НК�2517 НК�1486 Одесский 1800 1969 Буджак Одесский 2111 Одесский 2113 2179 Буджак 2645 Буджак 2806 Буджак 2778 Буджак 2810 Буджак Суданка 1 4005 Буджак 2265 Буджак 721/I 1/II Одесский 302 ГК 26 Украина комнатной температуре. ДНК визуализировали окрашиванием бромистым этидием; гели фо� тографировали с использованием светофильтра ОС�12 в ультрафиолетовом свете (300 нм) на пленку «Микрат�300». Электрофоретические профили амплифицированной ДНК оценивали визуально и кодировали бинарно: присутствие/ отсутствие полосы отмечали «1/0» соответст� венно. Видеоизображение электрофоретичес� ких профилей амплифицированной ДНК по� лучали с помощью системы документации и анализа электрофорезных гелей Image Master VDS («Amersham Pharmacia Biotech», Велико� британия). Расчет генетических дистанций между ли� ниями как по многолокусным, так и по одно� локусным данным и их кластерный анализ UPGMA проведены с помощью компьютер� ной программы «TREE 4.0» [16]. Уровень полиморфизма оценивали в про� центах как отношение полиморфных ПЦР� ампликонов к общему числу детектированных ПЦР�ампликонов по формуле P = np/np+ nnp · 100 %, где np – число полиморфных ПЦР�амплико� нов, а nnp – число неполиморфных ПЦР�амп� ликонов. Для каждого SSR�локуса определяли индекс полиморфности Polymorphic Index Content (PIC) по формуле, PIC = 1– fi 2, где fi 2 – частота i�го аллеля. Результаты исследования и их обсуждение. ПП�ПЦР�анализ для дифференциации и иден� тификации линий сорго и сориза. ПЦР�анализ с использованием десяти произвольных прай� меров позволил дифференцировать образцы сорго, сориза и их ближайших сородичей. Спектры амплификации ДНК исследованной выборки включали от 14 до 23 компонентов. Проанализировано 183 ампликона. Учитыва� ли только мажорные фрагменты, воспроизво� димые при повторной амплификации. Уро� вень полиморфизма между образцами выбор� ки, принадлежащими к различным родам и видам, составил 100 %. По суммарным данным ПЦР�анализа про� веден расчет генетических дистанций и клас� теризация исследуемых видов (рисунок). Зна� чение генетических дистанций варьировало от 0,111 до 0,993. На дендрограмме представлены образцы, принадлежащие к трем родам: Sorghum bicolor M., Zea mays L., Oryza sativa L. Генетичес� кая дистанция между выборкой, состоящей из образцов рода Sorghum, и кластером, включаю� щим представителей рода Zea и Oryza, состав� ляет 0,989. В свою очередь Zea и Oryza отдале� ны друг от друга с коэффициентом 0,800. Это демонстрирует генетическую удаленность рода Sorghum от кукурузы и риса. Род Sorghum пред� ставлен выборкой из 20 образцов, пять из ко� торых составляют Sorghum orysoidum, сформи� ровавших основной кластер дендрограммы, внутри которого уровень молекулярно�гене� ІSSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 2 49 Молекулярно�генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине Таблица 2 Список праймеров Праймер Последовательность (5'�3') p 13 p 32 p 37 p 39 p 43 p 44 p 48 p 49 p 57 p 83 Sb4�32 Sb4�12 Sb6�36 Sb6�57 Sb6�84 Xtxp 18 Xtxp 250 Xtxp 400 Xtxp 406 tgt gag tag agg aga cct cac att tcg tcg atc gcg ctg ccc agc c cca gtt cgc c agt cag ctg c gga ccc cgc c gcg gtg ctc g gac agc cta c tca gga cga tac gcc gtg aag cct gat gcc F: ctc ggc ggt tag cac agt cac R: gcc cat aga cag aca gca aag cc F: gaa aaa tct ccg tca atc cca aaa taa R: cgc tga aca acg aaa gga ata agt g F: aac agc at aat gcc aca c R: tag ctt ggt aga gaa ctt gct ttc F: aca ggg ctt tag gga aat cg R: cca tca ccg tcg gca tct F: cgc tct cgg gat gaa tga R: taa cgg acc act aac aaa tga tt F: act gtc tag aac aac ctg cg R: ttg ctc tag cta ggc att tc F: gca cat cct cta aaa cta ctt agt R: gaa cag gac gat gtg ata gat F: cta gag acc gac gcg tgt ata gt R: gca tct atc ttc act ccg att ct F: ggc ctg aat ctc agt gtt aag R: agt tgc ctg ctt cga cac tt F – forward (прямой); ** R – reverse (обратный). тического полиморфизма равен 96,2 %. В клас� тере образцы сорго распределились в два суб� кластера (А и В). Первый субкластер (А) состоял из трех групп. В первую группу вошли образцы сахарного сорго (Одесский 1820, 1969 Буджак, 2179 Буджак, Одесский 2111 и 2113), вторая группа включала зерновое сорго (НК�180, К35� Е5, НК�5418, НК�2517, НК�1486) и одного представителя веничного – 2645 Буджак. Тре� тью группу образовали представители суданки и сориза (4005 Буджак и Одесский 302). Во второй субкластер (В) вошли веничное сорго (2778 и 2806 Буджак), суданка (2810 Буджак) и сориз (2265 Буджак, 721/I и 1/II). Кластериза� ция генотипов по данным ПП�ПЦР�анализа отобразила принадлежность образцов указан� ной выборки к группам, соответствующим иден� тификации по хозяйственным признакам, и позволила выявить близкородственность со� риза с зерновым сорго. На основании молеку� ISSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 250 А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап Дендрограмма филогенетических взаимоотношений исследованых образцов по данным ПП�ПЦР�анализа лярно�генетического анализа можно сделать вывод о том, что сориз является формой сорго и не несет фрагментов ДНК, полученных от отдаленной гибридизации. В этом случае гене� тические дистанции между соризом и другими формами сорго были бы больше, чем внутри� видовые. Выделение сориза в вид Sorghum orysoidum связано не с генетическими, а с хо� зяйственно ценными особенностями. SSR�анализ. Для идентификации исследуе� мых образцов использовали микросателлитные маркеры, разработанные для сорго. Факт амп� лификации ДНК сориза с праймерами, разра� ботанными для сорго, подтверждает их гене� тическую близость. На основании молекулярно�генетического анализа девяти микросателлитных локусов для каждого генотипа получен индивидуаль� ный набор аллелей, что позволило составить генетические формулы. Буквой латинского алфавита обозначен код локуса, в нижнем ин� дексе приведена молекулярная масса аллеля (табл. 4). Гомозиготное состояние анализируе� мых линий подтверждается данными SSR� анализа (табл. 3). Наши данные о молекулярно�генетическом полиморфизме сорго находятся в соответствии с исследованиями филогенетического разнооб� разия сорго, проведенными Agrama et al. [5], которые с использованием RAPD и SSR ПЦР изучили 22 генотипа сорго с важными агроно� мическими признаками. Анализ генетического разнообразия видов сорго показал высокий уровень полиморфизма, основанный на геогра� фическом происхождении и расовой класси� фикации. В работе Folkertsma et al. [17] с ис� пользованием SSR праймеров показано гене� тическое разнообразие между популяциями об� разцов сорго из десяти африканских стран, представленных четырьмя эко�географически� ми регионами, и Индией (Южная Азия). Вы� явлено 123 аллеля с коэффициентом схожести 0,37 среди 4,95 пар исследованных образцов, у которых приблизительно 50 % аллелей встре� чались редко [17]. Формы сорго украинской селекции несколь� ко отличаются от форм из традиционных зон возделывания более коротким вегетационным периодом и другими показателями [7]. В то же время за период селекции сорго в этой зоне соз� ІSSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 2 51 Молекулярно�генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине Таблица 3 Кодировка и аллельная характеристика исследованных SSR�локусов Локус Код локуса Длина аллелей Встречаемость Sb4�32 Sb4�121 Sb6�57 Sb6�84 Xtxp 18 Xtxp 250 Xtxp 400 Xtxp 406 Sb6�36 A B C D E F G H I 195 198 201 204 207 185 188 191 194 197 200 203 206 290 293 296 299 302 177 180 183 186 189 192 128 131 134 137 140 406 409 412 415 418 421 338 441 444 447 450 453 456 459 370 373 376 160 163 166 169 0,05 0,20 0,60 0,05 0,10 0,05 0,10 0,10 0,05 0,05 0,05 0,10 0,50 0,15 0,25 0,15 0,20 0,25 0,15 0,15 0,15 0,25 0,15 0,15 0,05 0,10 0,40 0,10 0,35 0,20 0,25 0,20 0,15 0,15 0,05 0,05 0,05 0,30 0,15 0,05 0,05 0,15 0,20 0,60 0,25 0,15 0,60 0,25 0,05 0,10 дан разнообразный генетический материал, по� зволяющий вести планомерное улучшение этой культуры. В нашей работе исследованы пять линий сориза разной селекции: три линии (Одесский 302, 721/ I и 1/ II), по морфологи� ческим и агрономическим признакам отлича� ющиеся от сорго, и две линии (4005 Буджак и 2265 Буджак), подобные по морфологии. По данным ПП�ПЦР�анализа пять линий вошли в разные кластеры. Национальный стандарт Одесский 302 и 4005 Буджак распределились в первый кластер (А), что помогло нам выявить их близкородственность с зерновым сорго и суданкой. Два других генотипа (2265 Буджак, 721/ I и 1/ II) образовали субкластер и вошли во второй кластер (В), который представлен, кроме сориза, суданкой и веничным сорго. Молекулярно�генетический анализ свидетель� ствует о том, что сориз является формой сор� го, а не продуктом отдаленной гибридизации. Технологические качества зерна сориза, напо� минающие качества зерна риса, являются ре� зультатом того, что многие гены злаков имеют общее происхождение и сходное расположе� ние в геноме. Авторы вырожают глубокую благодарность д�ру с.�х. наук Г.К. Дремлюку и канд. биол. наук В.Л. Гамандию за предоставленный материал и обсуждение результатов исследования. A.Yu. Shevchuk, N.E. Kozhukhova, Yu.M. Sivolap MOLECULAR ANALYSIS OF THE GENOTYPES OF SORGHUM CULTIVATED IN UKRAINE PCR�analysis of intraspecific and interspecific polymor� phism of sorghum, soryz and their nearest relatives (maize, rice) has been conducted. The level of polymorphism within the sample was 100 %. Interspecific polymorphism (species of sorghum and soryz) was 96,2 % that testifies the wide changeability of the analyzed samples. Clasterisation of the genotypes occurred according to their species. Г.Ю. Шевчук, Н.Є. Кожухова, Ю.М. Сиволап МОЛЕКУЛЯРНО�ГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ ФОРМ СОРГО, ЩО ВИРОЩУЮТЬСЯ В УКРАЇНІ Проведено, ПЛР�аналіз міжродового та міжвидо� вого поліморфізму сорго, сорізу та їх найближчих ро� дичів (кукурудза, рис). Рівень поліморфізму в межах вибірки склав 100 %, міжвидовий поліморфізм (види сорго та сорізу) – 96,2 %, що свідчить про широку мінливість досліджуваних зразків. Кластеризація ге� нотипів здійснилась згідно з їх видовою належністю. ISSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 252 А.Ю. Шевчук, Н.Э. Кожухова, Ю.М. Сиволап Таблица 4 Генетические формулы линий исследованных генотипов Линия Формула НК�180 К35�Е5 НК�5418 НК�2517 НК�1486 Одесский 1800 1969 Буджак Одесский 2111 Одесский 2113 2179 Буджак 2645 Буджак 2806 Буджак 2778 Буджак 2810 Буджак Суданка 1 4005 Буджак 2265 Буджак 721/I 1/II Одесский 302 A201, B203, C293, D180, E128, F418, G338, H370, I169 A195, B203, C293, D180, E128, F418, G338, H370, I169 A201, B200, C299, D183, E128, F418, G338, H370, I169 A201, B200, C293, D180, E131, F418, G338, H373, I169 A201, B206, C293, D189, E134, F412, G453, H373, I160 A201, B197, C299, D177, E140, F412, G450, H373, I169 A201, B194, C296, D186, E134, F415, G447, H376, I169 A201, B191, C296, D186, E134, F415, G444, H376, I169 A204, B185, C293, D192, E134, F415, G441, H376, I169 A204, B185, C296, D189, E128, F421, G441, H373, I166 A204, B185, C302, D192, E131, F421, G441, H370, I166 A207, B185, C299, D189, E134, F415, G450, H370, I166 A201, B185, C299, D177, E134, F415, G450, H370, I166 A198, B185, C302, D183, E186, F421, G456, H370, I166 A201, B185, C293, D192, E137, F415, G453, H373, I163 A204, B185, C290, D186, E134, F409, G453, H370, I169 A201, B185, C290, D183, E134, F409, G453, H370, I169 A201, B185, C290, D183, E128, F409, G453, H370, I169 A201, B185, C290, D180, E128, F412, G453, H370, I169 A195, B185, C290, D177, E128, F406, G459, H370, I160 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 1. Шулындин А.Ф. Тритикале – новая зерновая и кор� мовая культура. – Киев : Урожай, 1981. – 47 с. 2. Чеботар С.В., Хохлов О.М., Куракіна К., Сиволап Ю.М. Аналіз алельного стану генів Pina�D1 та Pinb�D1 в ге� нотипах української пшениці // Вісн. СГІ. – 2007. – № 9. – С. 140–149. 3. Петрова И.В., Чеботарь С.В., Рыбалка А.И., Сиво� лап Ю.М. Идентификация Wx генотипов среди различных сортов мягкой озимой пшеницы // Ци� тология и генетика. – 2007. – 41, № 6. – С. 11–17. 4. Созинов А.А. Полиморфизм белков и его значение в генетике и селекции. – М.: Наука, 1985. – 272 с. 5. Agrama H.A., Tuinstra M.R. Phylogenetic diversity and relationships among sorghum accessions using SSRs and RAPDs // African J. Biotechnol. – 2003. – 2, № 10. – P. 334–340. 6. Иванюкович Л.К., Доронина Ю.А. Обзор классифи� кации сорго Sorghum Moench // Тр. по приклад. бо� танике, генетике и селекции. – 1980. – 69, вып. 1. – С. 18–27. 7. Дремлюк Г.К. Сориз – культура третьего тысячеле� тия. – Одесса, 1998. –121 с. 8. Сиволап Ю.М, Календарь Р.Н. Генетический поли� морфизм ячменя, выявляемый ПЦР с произволь� ными праймерами // Генетика. – 1995. – 31, № 10. – С. 1358–1364. 9. Кожухова Н.Э., Сиволап Ю.М. Молекулярные мар� керы в генетико�селекционных исследованиях ку� курузы // Цитология и генетика. – 2006. – 40, № 5. – С. 82–93. 10. Сиволап Ю.М., Волкодав В.В., Бальвінська М.С., Ко� жухова Н.Е., Солоденко А.Є., Чеботар С.В. Ідентифі� кація і реєстрація генотипів м’якої пшениці (Triticum aestivum L.), ячменю (Hordeum vulgare L.), кукуруд� зи (Zea mays L.), соняшника (Helianthus annuus L.) за допомогою аналізу мікросателітних локусів : Метод. рекомендації. – Одесса, 2004. – 14 с. 11. Taramino G., Tarchini R. Characterization and map� ping of simple sequence repeats (SSRs) in Sorghum bicolor // Theor. and Appl. Genet. – 1997. – 95, № 1/2. – P. 66–72. 12. Календарь Р.Н., Сиволап Ю.М. Полимеразная цепная реакция с произвольными праймерами // Биопо� лимеры и клетка. – 1995. – № 3/4. – С. 55–65. 13. Сиволап Ю.М., Галаев А.В., Нестерец В.Г. Диффе� ренциация и идентификация сортов пшеницы и тритикале при помощи ДНК�типирования // Вісн. Укр. товариства генетиків і селекціонерів. – 2004. – 2, № 1. – С. 3–15. 14. Использование ПЦР�анализа в генетико�селекци� онных исследованиях (научно�методическое руко� водство) / Под ред. Ю.М. Сиволапа. – К.: Аграр. наука, 1998. – 156 с. 15. Klein R., Klein P., Mullet J., Minx P., Rooney W., Schertz K. Fertility restorer locus Rf1 of sorghum (Sorghum bicolor L.) encodes a pantatricopeptide repeat protein not present in the collinear region of rice chromosome 12 // Theor. аnd Appl. Genet. – 2005. – 111. – P. 994–1012. 16. Календарь Р.Н. Компьютерная программа для по� строения эволюционных деревьев на основе элек� трофореграмм ДНК и белков // Молекулярно�ге� нетические маркеры и селекция растений : Мате� риалы конф. – К., 1994. – С. 25–26. 17. Folkertsma R., Frederick H., Raju G., Hash C. The pat� tern of genetic diversity of Guinea�race Sorghum bicolor (L.) Moench landraces as revealed with SSR markers // Theor. and Appl. Genet. – 2005. – 111. – P. 399– 409. Поступила 14.01.08 ІSSN 0564–3783. Цитология и генетика. 2009. № 2 53 Молекулярно�генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине

Молекулярно-генетический анализ форм сорго, возделываемых в Украине

Репозитарії

Схожі ресурси