Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН...
Saved in:
| Published in: | Цитология и генетика |
|---|---|
| Date: | 2010 |
| Main Author: | |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2010
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66675 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Лиманська, О.Ю. 2014-07-20T14:25:20Z 2014-07-20T14:25:20Z 2010 Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос. 0564-3783 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675 577.2:573.6 Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН можуть утворювати потрійні спіралі. Один з цих фрагментів (локалізований у гені gag ВЛ ВРХ) може існувати і як частина хрестоподібної структури. Експериментально існування триплексів підтверджено за допомогою атомно-силової мікроскопії шляхом візуалізації суперспіральної ДНК pGEMEX, у геномі якої знайдено шість дзеркально-симетричних фрагментів, необхідних для утворення внутрішньомолекулярних триплексів. Створено карти локалізації триплексів (які є одним з ланцюгів сигнальних механізмів функціонування геному) на геномі ретровірусів ВРХ. Определены совершенные межцепочечные триплексы, которые потенциально могут возникать в провирусной ДНК широко распространенных ретровирусов крупного рогатого скота (КРС) – вируса лейкоза (ВЛ) и вируса иммунодефицита (ВИ). В геноме ВЛ КРС и ВИ КРС найдено 5 и 10 фрагментов соответственно, которые при кислых значениях рН могут образовывать тройные спирали. Один из этих фрагментов (локализованный в гене gag ВЛ КРС), может существовать и как часть крестообразной структуры. Экспериментально существование триплексов подтверждено с помощью атомно-силовой микроскопии посредством визуализации суперспиральной ДНК pGEMEX, в геноме которой найдено шесть зеркально-симметричных фрагментов, необходимых для образования внутримолекулярных триплексов. Созданы карты локализации триплексов (которые являются одной из цепей сигнальных механизмов функционирования генома) на геноме ретровирусов КРС. Perfect interstranded triplexes that can potentially arise in the proviral DNA of wide-spread bovine retroviruses like as bovine leukemia virus (BLV) and bovine immunodeficiency virus (BIV) have been determined. In the BLV and BIV genomes 2 and 5 fragments respectively were found to form triple helixes under acidic conditions. One of those fragments that is localized on the BLV gag gene can exist as cruciform structure too. Experimentally the existence of triplexes is confirmed by atomic force microscopic visualization of supercoiled pGEMEX DNA for which genome 6 fragments are found with mirror symmetry that is necessary for intramolecular triplex formation. The diagrams of triplexes (one of the elements of signaling genome function) localization on the genome of bovine retroviruses are obtained. Автор висловлює подяку О.П. Лиманському (ДУ «Інститут мікробіології та імунології ім. І.І. Мечникова АМН України») за дискусії та допомогу при підготовці статті. Автор щиро вдячний рецензенту за конструктивні зауваження, направлені на покращення статті. Робота частково підтримана грантом АМН 72/2007 від Академії медичних наук України. uk Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України Цитология и генетика Оригинальные работы Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби Полипуриновые/полипиримидиновые последовательности с потенциалом образования триплексов в провирусной ДНК ретровирусов крупного рогатого скота Polypurine/polypyrimidine sequences with potential of forming triplexes in the proviral DNA of bovine retroviruses Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби |
| spellingShingle |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби Лиманська, О.Ю. Оригинальные работы |
| title_short |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби |
| title_full |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби |
| title_fullStr |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби |
| title_full_unstemmed |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби |
| title_sort |
поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній днк ретровірусів великої рогатої худоби |
| author |
Лиманська, О.Ю. |
| author_facet |
Лиманська, О.Ю. |
| topic |
Оригинальные работы |
| topic_facet |
Оригинальные работы |
| publishDate |
2010 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Цитология и генетика |
| publisher |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Полипуриновые/полипиримидиновые последовательности с потенциалом образования триплексов в провирусной ДНК ретровирусов крупного рогатого скота Polypurine/polypyrimidine sequences with potential of forming triplexes in the proviral DNA of bovine retroviruses |
| description |
Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН можуть утворювати потрійні спіралі. Один з цих фрагментів (локалізований у гені gag ВЛ ВРХ) може існувати і як частина хрестоподібної структури. Експериментально існування триплексів підтверджено за допомогою атомно-силової мікроскопії шляхом візуалізації суперспіральної ДНК pGEMEX, у геномі якої знайдено шість дзеркально-симетричних фрагментів, необхідних для утворення внутрішньомолекулярних триплексів. Створено карти локалізації триплексів (які є одним з ланцюгів сигнальних механізмів функціонування геному) на геномі ретровірусів ВРХ.
Определены совершенные межцепочечные триплексы, которые потенциально могут возникать в провирусной ДНК широко распространенных ретровирусов крупного рогатого скота (КРС) – вируса лейкоза (ВЛ) и вируса иммунодефицита (ВИ). В геноме ВЛ КРС и ВИ КРС найдено 5 и 10 фрагментов соответственно, которые при кислых значениях рН могут образовывать тройные спирали. Один из этих фрагментов (локализованный в гене gag ВЛ КРС), может существовать и как часть крестообразной структуры. Экспериментально существование триплексов подтверждено с помощью атомно-силовой микроскопии посредством визуализации суперспиральной ДНК pGEMEX, в геноме которой найдено шесть зеркально-симметричных фрагментов, необходимых для образования внутримолекулярных триплексов. Созданы карты локализации триплексов (которые являются одной из цепей сигнальных механизмов функционирования генома) на геноме ретровирусов КРС.
Perfect interstranded triplexes that can potentially arise in the proviral DNA of wide-spread bovine retroviruses like as bovine leukemia virus (BLV) and bovine immunodeficiency virus (BIV) have been determined. In the BLV and BIV genomes 2 and 5 fragments respectively were found to form triple helixes under acidic conditions. One of those fragments that is localized on the BLV gag gene can exist as cruciform structure too. Experimentally the existence of triplexes is confirmed by atomic force microscopic visualization of supercoiled pGEMEX DNA for which genome 6 fragments are found with mirror symmetry that is necessary for intramolecular triplex formation. The diagrams of triplexes (one of the elements of signaling genome function) localization on the genome of bovine retroviruses are obtained.
|
| issn |
0564-3783 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675 |
| citation_txt |
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос. |
| work_keys_str_mv |
AT limansʹkaoû polípurinovípolípírimídinovíposlídovnostízpotencíalomutvorennâtripleksívuprovírusníidnkretrovírusívvelikoírogatoíhudobi AT limansʹkaoû polipurinovyepolipirimidinovyeposledovatelʹnostispotencialomobrazovaniâtripleksovvprovirusnoidnkretrovirusovkrupnogorogatogoskota AT limansʹkaoû polypurinepolypyrimidinesequenceswithpotentialofformingtriplexesintheproviraldnaofbovineretroviruses |
| first_indexed |
2025-12-07T19:13:08Z |
| last_indexed |
2025-12-07T19:13:08Z |
| _version_ |
1850877975720886272 |