Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби

Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Цитология и генетика
Дата:2010
Автор: Лиманська, О.Ю.
Формат: Стаття
Мова:Українська
Опубліковано: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2010
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862729139746766848
author Лиманська, О.Ю.
author_facet Лиманська, О.Ю.
citation_txt Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.
collection DSpace DC
container_title Цитология и генетика
description Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН можуть утворювати потрійні спіралі. Один з цих фрагментів (локалізований у гені gag ВЛ ВРХ) може існувати і як частина хрестоподібної структури. Експериментально існування триплексів підтверджено за допомогою атомно-силової мікроскопії шляхом візуалізації суперспіральної ДНК pGEMEX, у геномі якої знайдено шість дзеркально-симетричних фрагментів, необхідних для утворення внутрішньомолекулярних триплексів. Створено карти локалізації триплексів (які є одним з ланцюгів сигнальних механізмів функціонування геному) на геномі ретровірусів ВРХ. Определены совершенные межцепочечные триплексы, которые потенциально могут возникать в провирусной ДНК широко распространенных ретровирусов крупного рогатого скота (КРС) – вируса лейкоза (ВЛ) и вируса иммунодефицита (ВИ). В геноме ВЛ КРС и ВИ КРС найдено 5 и 10 фрагментов соответственно, которые при кислых значениях рН могут образовывать тройные спирали. Один из этих фрагментов (локализованный в гене gag ВЛ КРС), может существовать и как часть крестообразной структуры. Экспериментально существование триплексов подтверждено с помощью атомно-силовой микроскопии посредством визуализации суперспиральной ДНК pGEMEX, в геноме которой найдено шесть зеркально-симметричных фрагментов, необходимых для образования внутримолекулярных триплексов. Созданы карты локализации триплексов (которые являются одной из цепей сигнальных механизмов функционирования генома) на геноме ретровирусов КРС. Perfect interstranded triplexes that can potentially arise in the proviral DNA of wide-spread bovine retroviruses like as bovine leukemia virus (BLV) and bovine immunodeficiency virus (BIV) have been determined. In the BLV and BIV genomes 2 and 5 fragments respectively were found to form triple helixes under acidic conditions. One of those fragments that is localized on the BLV gag gene can exist as cruciform structure too. Experimentally the existence of triplexes is confirmed by atomic force microscopic visualization of supercoiled pGEMEX DNA for which genome 6 fragments are found with mirror symmetry that is necessary for intramolecular triplex formation. The diagrams of triplexes (one of the elements of signaling genome function) localization on the genome of bovine retroviruses are obtained.
first_indexed 2025-12-07T19:13:08Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66675
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0564-3783
language Ukrainian
last_indexed 2025-12-07T19:13:08Z
publishDate 2010
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
record_format dspace
spelling Лиманська, О.Ю.
2014-07-20T14:25:20Z
2014-07-20T14:25:20Z
2010
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби / О.Ю. Лиманська // Цитология и генетика. — 2010. — Т. 44, № 1. — С. 10-18. — Бібліогр.: 35 назв. — рос.
0564-3783
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675
577.2:573.6
Визначено досконалі міжланцюгові триплекси, які потенційно можуть виникати у провірусній ДНК широко розповсюджених ретровірусів великої рогатої худоби (ВРХ) – вірусу лейкозу (ВЛ) та вірусу імунодефіциту (ВІ). У геномі ВЛ ВРХ та ВІ ВРХ знайдено 5 та 10 фрагментів відповідно, які за кислих значень рН можуть утворювати потрійні спіралі. Один з цих фрагментів (локалізований у гені gag ВЛ ВРХ) може існувати і як частина хрестоподібної структури. Експериментально існування триплексів підтверджено за допомогою атомно-силової мікроскопії шляхом візуалізації суперспіральної ДНК pGEMEX, у геномі якої знайдено шість дзеркально-симетричних фрагментів, необхідних для утворення внутрішньомолекулярних триплексів. Створено карти локалізації триплексів (які є одним з ланцюгів сигнальних механізмів функціонування геному) на геномі ретровірусів ВРХ.
Определены совершенные межцепочечные триплексы, которые потенциально могут возникать в провирусной ДНК широко распространенных ретровирусов крупного рогатого скота (КРС) – вируса лейкоза (ВЛ) и вируса иммунодефицита (ВИ). В геноме ВЛ КРС и ВИ КРС найдено 5 и 10 фрагментов соответственно, которые при кислых значениях рН могут образовывать тройные спирали. Один из этих фрагментов (локализованный в гене gag ВЛ КРС), может существовать и как часть крестообразной структуры. Экспериментально существование триплексов подтверждено с помощью атомно-силовой микроскопии посредством визуализации суперспиральной ДНК pGEMEX, в геноме которой найдено шесть зеркально-симметричных фрагментов, необходимых для образования внутримолекулярных триплексов. Созданы карты локализации триплексов (которые являются одной из цепей сигнальных механизмов функционирования генома) на геноме ретровирусов КРС.
Perfect interstranded triplexes that can potentially arise in the proviral DNA of wide-spread bovine retroviruses like as bovine leukemia virus (BLV) and bovine immunodeficiency virus (BIV) have been determined. In the BLV and BIV genomes 2 and 5 fragments respectively were found to form triple helixes under acidic conditions. One of those fragments that is localized on the BLV gag gene can exist as cruciform structure too. Experimentally the existence of triplexes is confirmed by atomic force microscopic visualization of supercoiled pGEMEX DNA for which genome 6 fragments are found with mirror symmetry that is necessary for intramolecular triplex formation. The diagrams of triplexes (one of the elements of signaling genome function) localization on the genome of bovine retroviruses are obtained.
Автор висловлює подяку О.П. Лиманському (ДУ «Інститут мікробіології та імунології ім. І.І. Мечникова АМН України») за дискусії та допомогу при підготовці статті. Автор щиро вдячний рецензенту за конструктивні зауваження, направлені на покращення статті. Робота частково підтримана грантом АМН 72/2007 від Академії медичних наук України.
uk
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
Полипуриновые/полипиримидиновые последовательности с потенциалом образования триплексов в провирусной ДНК ретровирусов крупного рогатого скота
Polypurine/polypyrimidine sequences with potential of forming triplexes in the proviral DNA of bovine retroviruses
Article
published earlier
spellingShingle Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
Лиманська, О.Ю.
Оригинальные работы
title Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
title_alt Полипуриновые/полипиримидиновые последовательности с потенциалом образования триплексов в провирусной ДНК ретровирусов крупного рогатого скота
Polypurine/polypyrimidine sequences with potential of forming triplexes in the proviral DNA of bovine retroviruses
title_full Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
title_fullStr Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
title_full_unstemmed Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
title_short Поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній ДНК ретровірусів великої рогатої худоби
title_sort поліпуринові/поліпіримідинові послідовності з потенціалом утворення триплексів у провірусній днк ретровірусів великої рогатої худоби
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66675
work_keys_str_mv AT limansʹkaoû polípurinovípolípírimídinovíposlídovnostízpotencíalomutvorennâtripleksívuprovírusníidnkretrovírusívvelikoírogatoíhudobi
AT limansʹkaoû polipurinovyepolipirimidinovyeposledovatelʹnostispotencialomobrazovaniâtripleksovvprovirusnoidnkretrovirusovkrupnogorogatogoskota
AT limansʹkaoû polypurinepolypyrimidinesequenceswithpotentialofformingtriplexesintheproviraldnaofbovineretroviruses