Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой

Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой

На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмацион...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Цитология и генетика
Datum:2011
Hauptverfasser: Самофалова, Д.А., Карпов, П.А., Ныпорко, А.Ю., Блюм Я.Б.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2011
Schlagworte:
Оригинальные работы
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66840
record_format dspace
spelling Самофалова, Д.А.
Карпов, П.А.
Ныпорко, А.Ю.
Блюм Я.Б.
2014-07-23T07:59:48Z
2014-07-23T07:59:48Z
2011
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос.
0564-3783
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840
577.212:004
На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana.
На підставі відомих просторових структур протеїнфосфатаз 1 та 2А з Homo sapiens виконано профільне моделювання їхніх рослинних гомологів з Arabidopsis thaliana. Якість побудованих моделей підтверджена значеннями середньоквадратичних відхилень між атомами, а також даними конформаційного аналізу. За результатами порівняльного аналізу і молекулярної динаміки ідентифіковано і підтверджено сайти зв’язування окадаїнової кислоти молекулами протеїнфосфатаз типів 1 і 2А з A. thaliana.
The homology modeling, based on known temple structures of Homo sapiens protein phosphatase type-1 and -2А was implemented. The spatial structures of the human protein phosphatases and their plant homologs from Arabidopsis thaliana was predicted. The quality of models was confirmed by conformational analysis and root mean square deviations. The sites of okadaic acid binding in molecules of plant protein phosphatases (type-1 and -2А) were proved by the data of comparative analysis and molecular dynamics.
Настоящая работа выполнена в рамках проекта УНТЦ № 5215: «Поиск эффективных ингибиторов протеинфосфатаз при помощи нанохимических подходов и оценка их биологической эффективности in silico» при использовании вычислительных возможностей и ресурсов Украинского Академического Грида (УАГ – http:// uag.bitp.kiev.ua/index.php).
ru
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
Реконструкція просторової структури комплексів рослинних протеїнфосфатаз типу 1 та 2а з окадаїновою кислотою
Reconstruction of spatial structure of plant protein phosphatase type-1 and -2А in complex with okadaic acid
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
spellingShingle Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
Самофалова, Д.А.
Карпов, П.А.
Ныпорко, А.Ю.
Блюм Я.Б.
Оригинальные работы
title_short Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
title_full Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
title_fullStr Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
title_full_unstemmed Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
title_sort реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2а с окадаиновой кислотой
author Самофалова, Д.А.
Карпов, П.А.
Ныпорко, А.Ю.
Блюм Я.Б.
author_facet Самофалова, Д.А.
Карпов, П.А.
Ныпорко, А.Ю.
Блюм Я.Б.
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2011
language Russian
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt Реконструкція просторової структури комплексів рослинних протеїнфосфатаз типу 1 та 2а з окадаїновою кислотою
Reconstruction of spatial structure of plant protein phosphatase type-1 and -2А in complex with okadaic acid
description На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana. На підставі відомих просторових структур протеїнфосфатаз 1 та 2А з Homo sapiens виконано профільне моделювання їхніх рослинних гомологів з Arabidopsis thaliana. Якість побудованих моделей підтверджена значеннями середньоквадратичних відхилень між атомами, а також даними конформаційного аналізу. За результатами порівняльного аналізу і молекулярної динаміки ідентифіковано і підтверджено сайти зв’язування окадаїнової кислоти молекулами протеїнфосфатаз типів 1 і 2А з A. thaliana. The homology modeling, based on known temple structures of Homo sapiens protein phosphatase type-1 and -2А was implemented. The spatial structures of the human protein phosphatases and their plant homologs from Arabidopsis thaliana was predicted. The quality of models was confirmed by conformational analysis and root mean square deviations. The sites of okadaic acid binding in molecules of plant protein phosphatases (type-1 and -2А) were proved by the data of comparative analysis and molecular dynamics.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840
citation_txt Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT samofalovada rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi
AT karpovpa rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi
AT nyporkoaû rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi
AT blûmâb rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi
AT samofalovada rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû
AT karpovpa rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû
AT nyporkoaû rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû
AT blûmâb rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû
AT samofalovada reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid
AT karpovpa reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid
AT nyporkoaû reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid
AT blûmâb reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid
first_indexed 2025-12-01T17:44:17Z
last_indexed 2025-12-01T17:44:17Z
_version_ 1850860694468034561

Ähnliche Einträge