Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмацион...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Цитология и генетика |
|---|---|
| Дата: | 2011 |
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2011
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862650175112085504 |
|---|---|
| author | Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. |
| author_facet | Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. |
| citation_txt | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Цитология и генетика |
| description | На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana.
На підставі відомих просторових структур протеїнфосфатаз 1 та 2А з Homo sapiens виконано профільне моделювання їхніх рослинних гомологів з Arabidopsis thaliana. Якість побудованих моделей підтверджена значеннями середньоквадратичних відхилень між атомами, а також даними конформаційного аналізу. За результатами порівняльного аналізу і молекулярної динаміки ідентифіковано і підтверджено сайти зв’язування окадаїнової кислоти молекулами протеїнфосфатаз типів 1 і 2А з A. thaliana.
The homology modeling, based on known temple structures of Homo sapiens protein phosphatase type-1 and -2А was implemented. The spatial structures of the human protein phosphatases and their plant homologs from Arabidopsis thaliana was predicted. The quality of models was confirmed by conformational analysis and root mean square deviations. The sites of okadaic acid binding in molecules of plant protein phosphatases (type-1 and -2А) were proved by the data of comparative analysis and molecular dynamics.
|
| first_indexed | 2025-12-01T17:44:17Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66840 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0564-3783 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-01T17:44:17Z |
| publishDate | 2011 |
| publisher | Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. 2014-07-23T07:59:48Z 2014-07-23T07:59:48Z 2011 Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. 0564-3783 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840 577.212:004 На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana. На підставі відомих просторових структур протеїнфосфатаз 1 та 2А з Homo sapiens виконано профільне моделювання їхніх рослинних гомологів з Arabidopsis thaliana. Якість побудованих моделей підтверджена значеннями середньоквадратичних відхилень між атомами, а також даними конформаційного аналізу. За результатами порівняльного аналізу і молекулярної динаміки ідентифіковано і підтверджено сайти зв’язування окадаїнової кислоти молекулами протеїнфосфатаз типів 1 і 2А з A. thaliana. The homology modeling, based on known temple structures of Homo sapiens protein phosphatase type-1 and -2А was implemented. The spatial structures of the human protein phosphatases and their plant homologs from Arabidopsis thaliana was predicted. The quality of models was confirmed by conformational analysis and root mean square deviations. The sites of okadaic acid binding in molecules of plant protein phosphatases (type-1 and -2А) were proved by the data of comparative analysis and molecular dynamics. Настоящая работа выполнена в рамках проекта УНТЦ № 5215: «Поиск эффективных ингибиторов протеинфосфатаз при помощи нанохимических подходов и оценка их биологической эффективности in silico» при использовании вычислительных возможностей и ресурсов Украинского Академического Грида (УАГ – http:// uag.bitp.kiev.ua/index.php). ru Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України Цитология и генетика Оригинальные работы Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой Реконструкція просторової структури комплексів рослинних протеїнфосфатаз типу 1 та 2а з окадаїновою кислотою Reconstruction of spatial structure of plant protein phosphatase type-1 and -2А in complex with okadaic acid Article published earlier |
| spellingShingle | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. Оригинальные работы |
| title | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
| title_alt | Реконструкція просторової структури комплексів рослинних протеїнфосфатаз типу 1 та 2а з окадаїновою кислотою Reconstruction of spatial structure of plant protein phosphatase type-1 and -2А in complex with okadaic acid |
| title_full | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
| title_fullStr | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
| title_full_unstemmed | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
| title_short | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
| title_sort | реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2а с окадаиновой кислотой |
| topic | Оригинальные работы |
| topic_facet | Оригинальные работы |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66840 |
| work_keys_str_mv | AT samofalovada rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi AT karpovpa rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi AT nyporkoaû rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi AT blûmâb rekonstrukciâprostranstvennoistrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovoikislotoi AT samofalovada rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû AT karpovpa rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû AT nyporkoaû rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû AT blûmâb rekonstrukcíâprostorovoístrukturikompleksívroslinnihproteínfosfataztipu1ta2azokadaínovoûkislotoû AT samofalovada reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid AT karpovpa reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid AT nyporkoaû reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid AT blûmâb reconstructionofspatialstructureofplantproteinphosphatasetype1and2aincomplexwithokadaicacid |