Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding

Bread wheat (Triticum aestivum L.) germplasm consisting of 45 genotypes were clustered phenotypically using ten morphological traits and Area Under Disease Progress Curve (AUDPC) as measure of stripe rust resistance. The clustering was ratified by using twenty three molecular markers (SSR, EST and S...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Цитология и генетика
Datum:2011
Hauptverfasser: Muhammad Irfaq Khan, Mir Ajab Khan, Abdul Jabbar Khan, Gul Sanat Shah Khattak, Tila Mohammad, Mushtaq Ahmad
Format: Artikel
Sprache:English
Veröffentlicht: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2011
Schlagworte:
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66869
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding / Muhammad Irfaq Khan, Mir Ajab Khan, Abdul Jabbar Khan, Gul Sanat Shah Khattak, Tila Mohammad, Mushtaq Ahmad // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 6. — С. 10-27. — Бібліогр.: 25 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-66869
record_format dspace
spelling Muhammad Irfaq Khan
Mir Ajab Khan
Abdul Jabbar Khan
Gul Sanat Shah Khattak
Tila Mohammad
Mushtaq Ahmad
2014-07-24T10:07:26Z
2014-07-24T10:07:26Z
2011
Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding / Muhammad Irfaq Khan, Mir Ajab Khan, Abdul Jabbar Khan, Gul Sanat Shah Khattak, Tila Mohammad, Mushtaq Ahmad // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 6. — С. 10-27. — Бібліогр.: 25 назв. — англ.
0564-3783
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66869
Bread wheat (Triticum aestivum L.) germplasm consisting of 45 genotypes were clustered phenotypically using ten morphological traits and Area Under Disease Progress Curve (AUDPC) as measure of stripe rust resistance. The clustering was ratified by using twenty three molecular markers (SSR, EST and STS) linked to stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) resistant QTLs. The aim was to asses the extent of genetic variability among the genotypes in order to select the parents for crossing between the resistant and susceptible genotypes with respect to stripe rust. The Euclidian dissimilarity values resulted from phenotypic data regarding morphological traits and AUDPC were used to construct a dendrogram for clustering the accessions. Using un-weighted pair group method with arithmetic means, another dendrogram resulted from the similarity coefficient values was used to distinguish the genotypes with respect to stripe rust. Clustering based on phenotypic data produced two major groups and five clusters (with Euclidian dissimilarity ranging from 2.44 to 16.16) whereas genotypic data yielded two major groups and four clusters (with percent similarity coefficient values ranging from 0.1 to 46.0) to separate the gene pool into highly resistant, resistant, moderately resistant, moderately susceptible and susceptible genotypes. With few exceptions, the outcome of both type of clustering was almost similar and resistant as well as susceptible genotypes came in the same clusters of molecular genotyping as yielded by phenotypic clustering. As a result seven genotypes (Bakhtawar-92, Frontana, Saleem 2000, Tatara, Inqilab-91, Fakhre Sarhad and Karwan) of diverse genetic background were selected for pyramiding stripe rust resistant genes as well as some other agronomic traits after hybridization.
45 генотипов мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) были фенотипически кластеризованы по десяти морфологическим признакам и Area Under Disease Progress Curve (AUDPC) как показателя устойчивости к желтой ржавчине. Кластеризация была подтверждена использованием 23 молекулярных маркеров (SSR, EST and STS), связанных с QTL локусами устойчивости к Puccinia striiformis f. sp. tritici. Целью работы было оценить степень генетической изменчивости, чтобы отобрать родителей для скрещиваний между устойчивыми и чувствительными к желтой ржавчине генотипами. Показатели отклонения, полученные из анализа морфологических признаков и AUDPC, были исполь-зованы для построения дендрограмм для кластеризации образцов. С использованием невзвешенного попарно-группового метода со среднеарифметическими значениями другая дендрограмма, полученная на основе сходства значений коэффициентов, была использована для того, чтобы отличить генотипы по устойчивости к желтой ржавчине. Кластеризация по фенотипическим признакам дала в результате две основные группы и пять кластеров, в то время как генотипические данные дали две основные группы и четыре кластера, что позволило выделить высокоустойчивые, устойчивые, среднеустойчивые, среднечувствительные и чувствительные генотипы. За некоторыми исключениями, результат обоих способов кластеризации был почти одинаков: устойчивые и чувствительные генотипы попали в одни и те же кластеры как в результате молекулярного генотипирования, так и фенотипической кластеризации. В итоге было отобрано семь генотипов (Bakhtawar-92, Frontana, Saleem-2000, Tatara, Inqilab-91, Fakhre Sarhad and Karwan) с разным генетическим фоном для генов устойчивости к желтой ржавчине и некоторых других агрономических признаков после гибридизации.
en
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
Отбор родителей для скрещиваний, основанных на генотипировании и фенотипировании устойчивости к желтой ржавчине злаков (puccinia striiformis) и агрономических признаков, в селекции мягкой пшеницы
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
spellingShingle Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
Muhammad Irfaq Khan
Mir Ajab Khan
Abdul Jabbar Khan
Gul Sanat Shah Khattak
Tila Mohammad
Mushtaq Ahmad
Оригинальные работы
title_short Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
title_full Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
title_fullStr Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
title_full_unstemmed Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
title_sort selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding
author Muhammad Irfaq Khan
Mir Ajab Khan
Abdul Jabbar Khan
Gul Sanat Shah Khattak
Tila Mohammad
Mushtaq Ahmad
author_facet Muhammad Irfaq Khan
Mir Ajab Khan
Abdul Jabbar Khan
Gul Sanat Shah Khattak
Tila Mohammad
Mushtaq Ahmad
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2011
language English
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt Отбор родителей для скрещиваний, основанных на генотипировании и фенотипировании устойчивости к желтой ржавчине злаков (puccinia striiformis) и агрономических признаков, в селекции мягкой пшеницы
description Bread wheat (Triticum aestivum L.) germplasm consisting of 45 genotypes were clustered phenotypically using ten morphological traits and Area Under Disease Progress Curve (AUDPC) as measure of stripe rust resistance. The clustering was ratified by using twenty three molecular markers (SSR, EST and STS) linked to stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) resistant QTLs. The aim was to asses the extent of genetic variability among the genotypes in order to select the parents for crossing between the resistant and susceptible genotypes with respect to stripe rust. The Euclidian dissimilarity values resulted from phenotypic data regarding morphological traits and AUDPC were used to construct a dendrogram for clustering the accessions. Using un-weighted pair group method with arithmetic means, another dendrogram resulted from the similarity coefficient values was used to distinguish the genotypes with respect to stripe rust. Clustering based on phenotypic data produced two major groups and five clusters (with Euclidian dissimilarity ranging from 2.44 to 16.16) whereas genotypic data yielded two major groups and four clusters (with percent similarity coefficient values ranging from 0.1 to 46.0) to separate the gene pool into highly resistant, resistant, moderately resistant, moderately susceptible and susceptible genotypes. With few exceptions, the outcome of both type of clustering was almost similar and resistant as well as susceptible genotypes came in the same clusters of molecular genotyping as yielded by phenotypic clustering. As a result seven genotypes (Bakhtawar-92, Frontana, Saleem 2000, Tatara, Inqilab-91, Fakhre Sarhad and Karwan) of diverse genetic background were selected for pyramiding stripe rust resistant genes as well as some other agronomic traits after hybridization. 45 генотипов мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) были фенотипически кластеризованы по десяти морфологическим признакам и Area Under Disease Progress Curve (AUDPC) как показателя устойчивости к желтой ржавчине. Кластеризация была подтверждена использованием 23 молекулярных маркеров (SSR, EST and STS), связанных с QTL локусами устойчивости к Puccinia striiformis f. sp. tritici. Целью работы было оценить степень генетической изменчивости, чтобы отобрать родителей для скрещиваний между устойчивыми и чувствительными к желтой ржавчине генотипами. Показатели отклонения, полученные из анализа морфологических признаков и AUDPC, были исполь-зованы для построения дендрограмм для кластеризации образцов. С использованием невзвешенного попарно-группового метода со среднеарифметическими значениями другая дендрограмма, полученная на основе сходства значений коэффициентов, была использована для того, чтобы отличить генотипы по устойчивости к желтой ржавчине. Кластеризация по фенотипическим признакам дала в результате две основные группы и пять кластеров, в то время как генотипические данные дали две основные группы и четыре кластера, что позволило выделить высокоустойчивые, устойчивые, среднеустойчивые, среднечувствительные и чувствительные генотипы. За некоторыми исключениями, результат обоих способов кластеризации был почти одинаков: устойчивые и чувствительные генотипы попали в одни и те же кластеры как в результате молекулярного генотипирования, так и фенотипической кластеризации. В итоге было отобрано семь генотипов (Bakhtawar-92, Frontana, Saleem-2000, Tatara, Inqilab-91, Fakhre Sarhad and Karwan) с разным генетическим фоном для генов устойчивости к желтой ржавчине и некоторых других агрономических признаков после гибридизации.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/66869
citation_txt Selection of parents for crossing based on genotyping and phenotyping for stripe rust (Puccinia striiformis) resistance and agronomic traits in bread wheat breeding / Muhammad Irfaq Khan, Mir Ajab Khan, Abdul Jabbar Khan, Gul Sanat Shah Khattak, Tila Mohammad, Mushtaq Ahmad // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 6. — С. 10-27. — Бібліогр.: 25 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT muhammadirfaqkhan selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT mirajabkhan selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT abduljabbarkhan selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT gulsanatshahkhattak selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT tilamohammad selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT mushtaqahmad selectionofparentsforcrossingbasedongenotypingandphenotypingforstriperustpucciniastriiformisresistanceandagronomictraitsinbreadwheatbreeding
AT muhammadirfaqkhan otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
AT mirajabkhan otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
AT abduljabbarkhan otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
AT gulsanatshahkhattak otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
AT tilamohammad otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
AT mushtaqahmad otborroditeleidlâskreŝivaniiosnovannyhnagenotipirovaniiifenotipirovaniiustoičivostikželtoiržavčinezlakovpucciniastriiformisiagronomičeskihpriznakovvselekciimâgkoipšenicy
first_indexed 2025-12-07T16:44:18Z
last_indexed 2025-12-07T16:44:18Z
_version_ 1850868612732026880