Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України
Проведено ПЛР аналіз восьми мікросателітних локусів (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) у тринадцяти видів Vincetoxicum Wolf, що поширені в Україні Визначено чотири мікросателітні локуси (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) за якими наявний повноцінний ПЛР-продукт. Ш...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Промышленная ботаника |
|---|---|
| Дата: | 2012 |
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Українська |
| Опубліковано: |
Донецький ботанічний сад НАН України
2012
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/67445 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України / А.Є. Демкович // Промышленная ботаника. — 2012. — Вип. 12. — С. 152-156. — Бібліогр.: 20 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1859662510009876480 |
|---|---|
| author | Демкович, А.Є. |
| author_facet | Демкович, А.Є. |
| citation_txt | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України / А.Є. Демкович // Промышленная ботаника. — 2012. — Вип. 12. — С. 152-156. — Бібліогр.: 20 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Промышленная ботаника |
| description | Проведено ПЛР аналіз восьми мікросателітних локусів (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) у тринадцяти видів Vincetoxicum Wolf, що поширені в Україні Визначено чотири мікросателітні локуси (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) за якими наявний повноцінний ПЛР-продукт. Шляхом електрофорезу в поліакриламідному гелі встановлено розмір ПЛР-продукту та кількість алелів (25 алелів за локусом Vinc5, 8 за локусом Vinc104, 11 алелів за локусом Vinc123, та 20 алелів за локусом Vinc124). Підтверджено придатність мікросателітних локусів Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 для оцінювання внутрішньо- та міжвидового поліморфізму видів роду Vincetoxicum флори України.
A PCR analysis of eight microsatellite loci (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) in thirteen Vincetoxicum Wolf species, spread in Ukraine, has been performed. There were identified four microsatellite loci (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) which presented complete PCR products. Using polyacrylamide gel electrophoresis, we have measured PCR products sizes and the number of alleles (25 alleles at Vinc5 locus, 8 alleles at Vinc104 locus, 11 alleles at Vinc123 locus, and 20 alleles at Vinc124 locus). The study proved the applicability of Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 microsatellite loci to the assessment of intra- and interspecific polymorphism in Vincetoxicum species of Ukrainian flora.
|
| first_indexed | 2025-11-30T10:30:22Z |
| format | Article |
| fulltext |
ISSN 1728-6204 Промышленная ботаника. 2012, вып. 12152
УДК 581.522:582.938(477)
А.Є. Демкович
ВИКОРИСТАННЯ МІКРОСАТЕЛІТНИХ ЛОКУСІВ
В МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОМУ АНАЛІЗІ ВИДІВ
РОДУ VINceTOxIcUM WOLF ФЛОРИ УКРАЇНИ
Vincetoxicum Wolf, SSR, поліморфізм, молекулярно-генетичний аналіз
Рід Vincetoxicum Wolf містить більш ніж 100 видів, поширених на території Євразії [11].
Система роду по цей час не розроблена [19]. В Україні нараховується біля 15 видів роду [13],
більшість з яких є рідкісними в окремих регіонах України – V. cretaceum (Pobed.) Wissjul.,
V. donetzicum Ostapko, V. flavum Ostapko, V. intermedium Taliev, V. maeoticum (Kleopow) Barbar.,
V. rossicum (Kleopow) Barbar., V. ucrainicum Ostapko та потребують охорони [6, 7, 11]. При цьо-
му, наявність ефективного вегетативного розмноження, значне розповсюдження апоміксису, вод-
ночас із здатністю до міжвидового схрещування, ускладнюють як встановлення таксономічних
меж, так і розробку заходів щодо збереження окремих видів. У різних не споріднених груп ви-
дів спостерігаються паралелізми у мінливості, складна систематика роду стимулює опис нових
таксонів, обґрунтованість яких потребує додаткових досліджень з використанням молекулярно-
генетичних методів [2, 3].
Мета та завдання роботи
Для використання в популяційно-генетичних дослідженнях українських видів роду
Vincetoxicum було проведено модифікацію та впровадження методики мікросателітного аналізу,
відбір SSR локусів для отримання первинних даних молекулярно-генетичного поліморфізму та
визначення їх придатності до популяційно-генетичного і філогенетичного аналізу на основі пер-
винних оцінок поліморфізму.
Об’єкти та методи досліджень
Досліджували 13 видів роду Vincetoxicum флори Південного Сходу України. Для отри-
мання ДНК використовували матеріал семи рослин V. maeoticum, шести рослин V. scandens
Sommier & Levier і V. hirundinaria Medik., п'яти – V. laxum (Bartl.) Gren. & Godr., чотирьох рослин
V. intermedium, двох – V. steposum (Pobed.) A. Löve & D. Löve, V. jalicola Juz., V. flavum, по одній
рослині V. ucrainicum, V. rossicum, V.donetzicum, V.cretaceum, V. albovianum (Kusn.) Pobed. Також
аналізували Cynanchum acutum L. (раніше усіх представників роду Vincetoxicum відносили до
роду Cynanchum L.).
ДНК виділяли за допомогою комерційних наборів для виділення ДНК з тваринних тканин
«Diatom DNA prep» (Ізоген, Росія). Для сорбції фенольних сполук з рослинних тканин викорис-
тано високомолекулярний полівінілпіролідон (ПВП, К90).
Для вивчення молекулярно-генетичного поліморфізму мікросателітних локусів використо-
вували вісім пар праймерів, підібраних до Vincetoxicum atratum Morr. et Dence. [17] (табл. 1).
Температура відпалу, що наведена в таблиці, є оптимізованою для українських видів роду при
використанні для полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) набору «GenePak PCR Core» (Ізоген,
Росія). Оптимальну температуру відпалу знаходили, варіюючи її з шагом 0,2°С, починаючи
з приведеної для V. atratum і орієнтуючись на якісний характер ампліконів – наявність множин-
них смуг при занадто низькій температурі і зменшення кількості продукту при перевищенні
оптимальної температури.
Для кожного із аналізованих зразків ДНК було проведено ПЛР за попередньо оптимі-
зованої температури із кожною парою праймерів до відповідного мікросателітного локусу.
© А.Є. Демкович
ISSN 1728-6204 Промышленная ботаника. 2012, вып. 12 153
Таблиця 1. Послідовності праймерів, оптимізована для українських видів роду Vincetoxicum Wolf
температура відпалу та діапазон довжин ампліконів для мікросателітних локусів.
Праймер Послідовність Температура
відпалу
Діапазон
довжин фрагментів
у V. atratum,
та у українських видів
роду Vincetoxicum
Vinc5(F) GTGGGAGTGAGAAATTGTAGC 62 273–287*
Vinc5(R) CTTCTGAACTGCATCTGACC 62 257–339**
Vinc101(F) GCCAGAAACTCAGTTAGCTTCA 65 120–126*
Vinc101(R) GCAAATGATGCGGAAGATTCT 65 –
Vinc102(F) GAGCTATAGGTGACACGAGA 62 97–125*
Vinc102(R) CCTTCTAGTACTTGGGAAGT 62 –
Vinc104(F) TGCTCCATTGATCACCTACT 59 172–180*
Vinc104(R) TAACTGATCAGAAGCTCTGT 59 150–165**
Vinc107(F) CCACTACGGGAAGTATTCAC 65 287–305*
Vinc107(R) CCTTTGGATGGCTGCCAAAT 65 –
Vinc118(F) GTCCTTTTGCAAGGAGGAATCA 68 167–235*
Vinc118(R) GATGCCTCTATCCAAATCCCA 68 –
Vinc123(F) CCCGTCATATTCAACGAGAA 59 127–137*
Vinc123(R) CGGGAGAGAGAGTGACTTTT 59 121–144**
Vinc124(F) GACAAAAGGGTGAGAAGATA 59 299–399*
Vinc124(R) GGTGATATAGTGGAGAGCAGA 59 308–461**
П р и м і т к и: F – пряма послідовність праймера, R – зворотна; * – діапазон довжин фрагментів
у V. atratum; ** – діапазон довжин фрагментів у українських видів роду Vincetoxicum.
Отримані амплікони розділяли у вертикальному неденатуруючому 7%-му поліакриламідному
гелі із наступним забарвленням нітратом срібла за модифікованою методикою Т. Бенбуза [14].
В якості стандарта молекулярної ваги використовували ДНК маркер SM1323 O'Range ruler
20 bp (Fermentas). Зображення гелів, отримані за допомогою цифрового фотоапарата або ска-
нера обробляли за допомогою вільно доступної програми «GelAnalyser 2010a» [9] (рис.). Розпо-
дільна здатність методу становила близько 1 п.н. Статистичну обробку молекулярно-генетичних
даних проводили за допомогою вільно доступного програмного забезпечення «GenAlEx» [15],
«PopGen» [20] та в середовищі аналізу даних «R» [16], використовуючи стандартні популяційно-
генетичні оцінки [1, 5, 8].
Результати досліджень та їх обговорення
Серед восьми мікросателітних локусів, використаних у роботі, за чотирма локусами
не було отримано повноцінного ПЛР-продукту у жодного з аналізованих видів роду Vincetoxicum.
У C. acutum взагалі не утворилося ПЛР-продукту за жодним з SSR локусів, що досліджували.
Це може бути пов'язаним з його більш віддаленим систематичним положенням. Разом з тим амп-
лікони за чотирма локусами (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc102) було виявлено у більшості аналі-
зованих видів. Ампліконів не було виявлено у V. donetzicum, V. rossicum, V. cretaceum за локусами
Vinc5 і Vinc124. Розширивши аналізовану вибірку, можна буде встановити, чи дійсно у цих видів
ISSN 1728-6204 Промышленная ботаника. 2012, вып. 12154
відсутні два локуси. Загалом для всіх проаналізованих видів за чотирма мікросателітними ло-
кусами вдалося ідентифікувати 64 алелі, в середньому 16 алелів на локус. Найменша кількість
алелів – 8 спостерігалася за локусом Vinc104, а найбільша – 25 – за локусом Vinc5. Для локусів
Vinc123 та Vinc124 було виявлено 11 і 20 алелів відповідно. Результати перенесення відібраних
для одного виду мікросателітних локусів на інші, за якого задовільно ампліфікувалися і були по-
ліморфними чотири мікросателітні локуси із восьми випробуваних, можна вважати успішними.
Так, в аналогічному дослідженні з міжвидового перенесення 276 мікросателітних локусів у деся-
ти видів роду Pinus L. лише 23 (8%) локусів були вдало ампліфіковані у всіх десяти видів, а по-
ліморфними серед них виявилися взагалі п'ять локусів (2%) [18]. У нашому випадку у більшості
видів були вдало ампліфіковані і водночас виявилися поліморфними 50% випробуваних локусів.
а б
Рис. Результати проведення електрофорезу та їх обробка в програмі «GelAnalyser 2010a»:
а) Зображення електрофоретичного гелю в програмі «GelAnalyser 2010a» (доріжки № 1, 2, 11 – маркер
молекулярної ваги, інші доріжки – амплікони мультиплекс-ПЛР за локусами Vinc104, Vinc123, Vinc124;
горизонтальні лінії – стартова лінія та градуювання фронту електрофорезу за маркерами молекулярної
ваги; крапки – виявлені фрагменти ДНК; б) Стандарт молекулярної ваги та калібрування молекулярної
ваги ампліконів на основі відомого стандарту в програмі «GelAnalyser 2010a».
Розміри ампліконів, виявлених за чотирма проаналізованими локусами, не в повній мірі спів-
падали із наведеними для V. atratum (табл. 1). Локуси Vinc5 і Vinc123 характеризувалися біль-
шим розмахом довжин ампліконів (257–339 і 121–144 п.н. порівняно із 273–287 і 127–137 п.н.
у V. atratum відповідно), локус Vinc104 – меншим розмахом (150–165 п.н., порівняно із
172–180 п.н.), а локус Vinc124 у досліджуваних видів мав амплікони декілька більшої довжини,
ніж у V. atratum (308–461 п.н. порівняно із 299–399 п.н.). Така картина цілком звичайна при між-
видовому перенесенні мікросателітних локусів. Локусам Vinc104, Vinc123, Vinc124 був власти-
вий розподіл з двома – трьома предомінантними алелями, частоти яких знаходились у межах
0,135–0,230 для менш частих алелів і 0,311–0,474 для більш частих алелів. Натомість, інші але-
лі за цими трьома локусами зустрічались з частотою не вище 0,095, як правило, – 0,016–0,064
(5 алелів за локусом Vinc104, 8 – за Vinc123 і 18 – за Vinc124). Для локусу Vinc5, навпаки, була
характерною відсутність предомінантних алелів. Частота зустрічальності для семи найбільш
ISSN 1728-6204 Промышленная ботаника. 2012, вып. 12 155
частих алелів цього локусу складала 0,065–0,113, а частота інших 18 алелів варіювала від 0,016
до 0,048. Локус Vinc5 відрізняється характером розподілу частот алелів від інших трьох. Для ньо-
го сукупність семи найбільш частих алелів склала 0,581, а для Vinc124 доля двох предомінантних
алелів в їх загальній сукупності складає 0,517, тоді як за іншими алелями кумулятивна частота
становила 0,419 і 0,483 для локусів Vinc5 і Vinc124 відповідно.
Таким чином, чотири досліджені мікросателітні локуси є нерівноцінними за показниками
варіабельності та мають різний розподіл генетичної мінливості. Це робить їх сукупність придат-
ною і достатньою для аналізу міжвидових відносин видів роду Vincetoxicum на території України
за умови використання вибірок достатнього обсягу.
Висновки
1. Вперше проведено ПЛР аналіз за вісьмома мікросателітними локусами (Vinc5, Vinc101,
Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) тринадцяти видів роду Vincetoxicum
з української частини ареалу. Визначено чотири мікросателітні локуси (Vinc5, Vinc104, Vinc123,
Vinc124), за якими наявний повноцінний ПЛР-продукт.
2. Встановлено розмір ПЛР-продукту та кількість алелів шляхом електрофорезу в поліакри-
ламідному гелі (25 алелів за локусом Vinc5, 8 – за локусом Vinc104, 11 алелів за локусом Vinc123,
та 20 алелів за локусом Vinc124).
3. Встановлено основні показники поліморфізму мікросателітних локусів Vinc5, Vinc104,
Vinc123, Vinc124 та проведено аналіз розподілу їхньої алельної різноманітності, внаслідок чого
виявлено суттєві її відмінності за окремими локусами.
4. Підтверджено придатність мікросателітних локусів Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124
для оцінювання внутрішньо- та міжвидового поліморфізму видів роду Vincetoxicum на території
України.
1. Алтухов Ю.П. Генетические процессы в популяциях / Юрий Петрович Алтухов. – [3-е изд.]. – М.:
Академкнига, 2003. – 431 c.
2. Молекулярно-генетичні маркери в аналізі генетичної структури та філогенетичних зв’язків для збере-
ження рідкісних видів роду Vincetoxicum N. M. Wolf. / А.Є. Демкович, Т.В. Зубцова, С.М. Приваліхін
[та ін.] // Перша міжнар. конф. «Біологія рослин та біотехнологія» (м. Біла Церква, 5–7 жовт. 2011 р.).
– Біла Церква, 2011. – С. 59.
3. Необходимость использования молекулярно-генетических методов в изучении и сохранении би-
оразнообразия рода Vincetoxicum N.M. Wolf / В.М. Остапко, А.З. Глухов, С.А. Приходько [и др.] //
Відновлення порушених природних екосистем: Матер. IV міжнар. наук. конф. (м. Донецьк, 18–21 жовтня
2011 р. – Донецьк, 2011. – С. 423–425.
4. Остапко В.М. Рід Vincetoxicum N.M. Wolf на південному сході України / В.М. Остапко // Укр. ботан.
журн. – 1995. – Т. 52, №3. – С. 388–394.
5. Хедрик Ф. Генетика популяций: Пер с англ. / Ф. Хедрик. – М.: Техносфера, 2003. – 592 с.
6. Червона книга Донецької області: рослинний світ (рослини, що підлягають охороні в Донецькій об-
ласті) / [під заг. ред. В.М. Остапка]. – Донецьк.: Новая печать, 2010. – 432 с.
7. Червона книга України. Рослинний світ / [під заг. ред. Я.П. Дідуха]. – К.: Глобалконсалтинг, 2009. – 900 с.
8. Eriksson G. An introduction to forest genetics / G. Eriksson, I. Ekderg, D. Clapham // Swedish Univ. of Agric.
Sciences (SLU), Uppsala, Sweden. – 2006. – 186 р.
9. GelAnalyser – [ел. рес.]. – Режим доступу: http://www.GelAnalyser.com /downloads/ users_
manual_2010.pdf
10. Gilbert M.G. Notes on the Asclepiadaceae of China / M.G. Gilbert, W.D. Stevens, P.T. Li // Novon. – 1995. –
Vol. 5. – P. 1–16.
11. Liede S. Cynanchum – Rhodostegiella – Vincetoxicum – Tylophora (Asclepiadaceae): new considerations on
an old problem / S. Liede // Taxon. – 1996. – Vol. 45, № 2. – P. 193–211.
12. Molecular phylogeny of Vincetoxicum (Apocynaceae-Asclepiadoideae) based on the nucleotide sequences
of cpDNA and nrDNA / [T. Yamashiro, T. Fukuda, J. Yokoyama, M. Maki] // Molecular Phylogenetics and
Evolution. – 2004. – Vol. 31. – P. 689–700.
13. Mosyakin S.L. Vascular plants of Ukraine: a nomenclatural cheklist / S.L. Mosyakin, M.M. Fedoronchuk;
[editor S.L. Mosyakin]. Kiev: M.G. Kholodny Inst. of Botany; Missouri Botan. Gard, 1999. – 346 p.
ISSN 1728-6204 Промышленная ботаника. 2012, вып. 12156
14. Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in
polyacrylamide gels / [H. Benbouza, J.-M. Jacquemin, J.-P. Baudoin, G. Mergeai] // Biotechnol. Agron. Soc.
Environ. – 2006. – Vol. 10, № 2. – P. 77–81.
15. Peakall R. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research /
R. Peakall, P.E. Smouse // Mol. Ecol. Notes. – 2006. – Vol. 6. – P. 288–295.
16. R Development Core Team (2010). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for
Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL http://www.R-project.org/.
17. Tada F. Development of microsatellite markers for the endangered grassland perennial herb Vincetoxicum
atratum (Apocynaceae-Asclepiadoideae) / F. Tada, T. Yamashiro, M. Maki // Conserv. Genet. – 2009. –
Vol. 10. – P. 1057–1059.
18. Xiang-Xiang F. Identification of seeds Pinus species by microsatellite markers / F. Xiang-Xiang, S. Ji-sen //
J. For. Res. – 2005. – Vol. 16, № 4. – P. 281–284.
19. Yamazaki T. Asclepiadaceae / T.Yamazaki // Flora of Japan, [Iwatsuki, K., Yamazaki T., Boufford. D.E.,
Ohba, H., (Eds.)]. – Kodansha: Tokyo, 1993. – Vol. 3. – P. 168–182.
20. Yeh F.C. PopGene Version 1.31. Microsoft Windows-based freeware for population genetic analysis //
F.C. Yeh., T.J.B. Boyle. – 1997. – vol. 129. – P. 157.
Донецький ботанічний сад НАН України Надійшла 20.09.2012
УДК 581.522:582.938(477)
ВИКОРИСТАННЯ МІКРОСАТЕЛІТНИХ ЛОКУСІВ В МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОМУ АНАЛІЗІ
ВИДІВ РОДУ VINCETOXICUM WOLF ФЛОРИ УКРАЇНИ
А.Є. Демкович
Донецький ботанічний сад НАН України
Проведено ПЛР аналіз восьми мікросателітних локусів (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118,
Vinc123, Vinc124) у тринадцяти видів Vincetoxicum Wolf, що поширені в Україні Визначено чотири мікро-
сателітні локуси (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) за якими наявний повноцінний ПЛР-продукт. Шляхом
електрофорезу в поліакриламідному гелі встановлено розмір ПЛР-продукту та кількість алелів (25 алелів
за локусом Vinc5, 8 за локусом Vinc104, 11 алелів за локусом Vinc123, та 20 алелів за локусом Vinc124).
Підтверджено придатність мікросателітних локусів Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 для оцінювання вну-
трішньо- та міжвидового поліморфізму видів роду Vincetoxicum флори України.
UDC 581.522:582.938(477)
USE OF MICROSATELLITE LOCI IN MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS OF VINCETOXICUM WOLF
SPECIES OF THE UKRAINIAN FLORA
A.Ye. Demkovych
Donetsk Botanical Garden of the National Academy of Sciences of Ukraine
A PCR analysis of eight microsatellite loci (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123,
Vinc124) in thirteen Vincetoxicum Wolf species, spread in Ukraine, has been performed. There were identified
four microsatellite loci (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) which presented complete PCR products. Using
polyacrylamide gel electrophoresis, we have measured PCR products sizes and the number of alleles (25 alleles
at Vinc5 locus, 8 alleles at Vinc104 locus, 11 alleles at Vinc123 locus, and 20 alleles at Vinc124 locus). The study
proved the applicability of Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 microsatellite loci to the assessment of intra- and
interspecific polymorphism in Vincetoxicum species of Ukrainian flora.
|
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-67445 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1728-6204 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-11-30T10:30:22Z |
| publishDate | 2012 |
| publisher | Донецький ботанічний сад НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Демкович, А.Є. 2014-09-06T11:57:14Z 2014-09-06T11:57:14Z 2012 Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України / А.Є. Демкович // Промышленная ботаника. — 2012. — Вип. 12. — С. 152-156. — Бібліогр.: 20 назв. — укр. 1728-6204 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/67445 581.522:582.938(477) Проведено ПЛР аналіз восьми мікросателітних локусів (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) у тринадцяти видів Vincetoxicum Wolf, що поширені в Україні Визначено чотири мікросателітні локуси (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) за якими наявний повноцінний ПЛР-продукт. Шляхом електрофорезу в поліакриламідному гелі встановлено розмір ПЛР-продукту та кількість алелів (25 алелів за локусом Vinc5, 8 за локусом Vinc104, 11 алелів за локусом Vinc123, та 20 алелів за локусом Vinc124). Підтверджено придатність мікросателітних локусів Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 для оцінювання внутрішньо- та міжвидового поліморфізму видів роду Vincetoxicum флори України. A PCR analysis of eight microsatellite loci (Vinc5, Vinc101, Vinc102, Vinc104, Vinc107, Vinc118, Vinc123, Vinc124) in thirteen Vincetoxicum Wolf species, spread in Ukraine, has been performed. There were identified four microsatellite loci (Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124) which presented complete PCR products. Using polyacrylamide gel electrophoresis, we have measured PCR products sizes and the number of alleles (25 alleles at Vinc5 locus, 8 alleles at Vinc104 locus, 11 alleles at Vinc123 locus, and 20 alleles at Vinc124 locus). The study proved the applicability of Vinc5, Vinc104, Vinc123, Vinc124 microsatellite loci to the assessment of intra- and interspecific polymorphism in Vincetoxicum species of Ukrainian flora. uk Донецький ботанічний сад НАН України Промышленная ботаника Генетические и физиолого-биохимические особенности растений в антропогенно трансформированной среде Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України Использование микросателлитных локусов в молекулярно-генетическом анализе видов рода Vincetoxicum Wolf флоры Украины Use of microsatellite loci in molecular-genetic analysis of Vincetoxicum wolf species of the Ukrainian flora Article published earlier |
| spellingShingle | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України Демкович, А.Є. Генетические и физиолого-биохимические особенности растений в антропогенно трансформированной среде |
| title | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України |
| title_alt | Использование микросателлитных локусов в молекулярно-генетическом анализе видов рода Vincetoxicum Wolf флоры Украины Use of microsatellite loci in molecular-genetic analysis of Vincetoxicum wolf species of the Ukrainian flora |
| title_full | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України |
| title_fullStr | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України |
| title_full_unstemmed | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України |
| title_short | Використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду Vincetoxicum Wolf флори України |
| title_sort | використання мікросателітних локусів у молекулярно-генетичному аналізі видів роду vincetoxicum wolf флори україни |
| topic | Генетические и физиолого-биохимические особенности растений в антропогенно трансформированной среде |
| topic_facet | Генетические и физиолого-биохимические особенности растений в антропогенно трансформированной среде |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/67445 |
| work_keys_str_mv | AT demkovičaê vikoristannâmíkrosatelítnihlokusívumolekulârnogenetičnomuanalízívidívroduvincetoxicumwolffloriukraíni AT demkovičaê ispolʹzovaniemikrosatellitnyhlokusovvmolekulârnogenetičeskomanalizevidovrodavincetoxicumwolffloryukrainy AT demkovičaê useofmicrosatellitelociinmoleculargeneticanalysisofvincetoxicumwolfspeciesoftheukrainianflora |